Enzimler Flashcards

1
Q

Hayat için 2 temel koşul?

A

Canlı kendi kendini kopya etmeli,
–Hücre bölünmesi.
*Organizma kimyasal reaksiyonları etkin ve seçici bir şekilde katalize etmeli.
–Enzimatik reaksiyonlar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Bir şeker rafta H2O ve CO2’ye dönüşmeden yıllarca kalabilir, peki canlı hücrelerde nasıl parçalanmaktadır?

A

Enzimlerle kataliz edilmeleri sayesinde.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

İzoenzim nedir? Ve iki örnek ver.

A

Protein yapıları farklı fakat katalizledikleri reaksiyonları aynı olan enzimlerdir. Kalpteki ve kastaki Laktat Dehidrogenaz enzimi örnektir.

Hekzokinaz (glukokinaz) glukozun glikoliz olmasının başlangıcında glukoz C6 atomunu fosforlayarak glukoz-6-fosfata çevirir. Karaciğer ve böbrekte farklı izoenzimleri var

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Statin (yüksek kolestrol ilacının çalışma mekanizması nedir? (yarışmalı inhibasyon)

A

Vücudun kolesterol yapmak için kullandığı enzimin(HMG CoA redüktaz) üretimini bloke ederek çalışırlar. İlaç o enzimin substratını veriyor aslında ve enzimler onunla uğraşırken karaciğerden kolesterol salgılanamıyor.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

HMG Coa redüktaz kolesterol üretiminde hız kısıtlayıcı enzimdir. hız kısıtlayıcı enzim nedir?

A

Tüm yolaktaki reaksiyon hızını sınırlayan en yavaş adımdan sorumlu olan enzimdir.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Tüm enzimler protein yapılı mıdır?

A

Katalitik RNAlar harici evet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Prostatik grup nedir?

A

Bir koenzim veya metal iyonu enzim proteinine çok sıkı bağlandığı zaman bu şekilde adlandırılır.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Holoenzim nedir?

A

Katalitik olarak aktif enzimle ona bağlı olan koenzim ve/veya metal iyonları birlikte holoenzim olarak adlandırılır.
Böyle bir enzimin portein kısmı da apoenzim ya da apoprotein olarak adlandırılır.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Koenzimin özgün işlevi nedir?

A

İşlevsel grupların bir yerden bir yere taşınmasında rol oynar.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Enzim komisyon numarasını açıkla.

A

EC 2.7.1.1
2:enzimin sınıfı (transferaz)
7:alt sınıfı (fosfotransferaz)
1: fosfotransferazın alıcı olduğunu ve alıcı grubun -OH olduğunu
1: fosforil grubunun alıcısının D-glukoz olduğunu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Enzimlerin tarihçesi?

A

1850li yıllarda Pateur mayalar tarafından şekerin alkole fermentesi.
1897de Eduard Bucher fermentasyonun hücreler uzaklaştırıldığında bazı moleküllerce yapıldığını saptıyor.
Frederick Kühne bu moleküllere enzim diyor.
1926 yılında James Sumner, üreaz enzimini kristal halde elde etti ve bütün enzimlerin protein olduğunu iddaa etti ileride bu kabul gördü.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Enzimler 3 boyutlu yapılarını kaybederlerse çalışırlar mı?

A

Hayır.
Enzimlerin katalitik aktiviteleri doğal protein konformasyonlarına bağlıdır. sekonder tersiyer, kuaterner…

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Suda çözünen vitaminler?

A

1.Thiamin (B1)
2.Riboflavin (B2)
3.Niacin (B3)
4.PantothenicAcid (B5)
5.Pyridoxal, Pyridoxamine, Pyridoxine (B6)
6.Biotin
7.Cobalamin(B12)
8.Folic Acid
9.Ascorbic Acid

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Enzim sınıfları nelerdir?

A

1 oksidoredüktazlar
2 transferazlar
3 hidrolazlar
4 liyazlar
5 izomerazlar
6 ligazlar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

oksidoredüktazlar?

A

elektron transferi (hidrid iyonları veya H atomları)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

transferazlar?

A

Grup transfer reaksiyonları

17
Q

hidrolazlar

A

Hidroliz reaksiyonları (suya fonsiyonel grupların suya transferi)

18
Q

liyazlar?

A

Çift bağlı grupların ilavesi, veya grupların uzaklaştırılmasıyla çift bağların oluşturulması.

19
Q

izomerazlar?

A

Molekül içine grupların transferi ile izomerik formların oluşturulması.

20
Q

ligazlar?

A

ATP hidrolizi ile C-C, C-S, C-O, ve C-N bağlarının oluşumu.

21
Q

Transisyon durumu nedir?

A

ya da Geçiş durumu. Grafikteki yüksek enerji bariyerine denir. Bağ oluşumu ve bağ kırılması için geçerli enerji seviyesidir.
Aynı zamandda moleküllerin geçmesi için gerekli olan bu enerji aktivasyon enerjisidir. (delta G+)

22
Q

Enzim subtratla birleştiğinde konformasyonunu değiştirir. Doğru/yanlış?

22
Q

Aktivasyon enerjisi yüksek olursa nolur?

A

Rxn yavaş gerçekleşir.

23
Q

Bağlanma enerjisi nedir?

A

enzim-substrat kompleksindeki her bir zayıf etkileşimin oluşumu sırasında açığa çıkan ve bu etkileşimlere belirli bir stabilite sağlayan serbest enerjidir.
Bu enerji, yalnızca enzim-substrat etkileşiminin stabilizasyonuyla sınırlı kalmaz; aynı zamanda enzimlerin reaksiyonların aktivasyon enerjisini düşürmek için kullandıkları serbest enerjinin başlıca kaynağıdır.

24
Enzimlerde bulunabilecek katalitik gruplar nelerdir ve ne işe yararlar?
Rxnun daha hızlı olmasını sağlarlar. -asit baz katalitik grupları -kovalent bağlı katalitikler -metal iyonları (Enzimin aktif bölgesine bağlanarak, enzime bağlanacak substratın kolay proton alıp vermesini sağlar.)
25
Desolvantation nedir?
Enzim substratla ilişkiye girdiğinde substratın suyla etkileşime girme özelliği azalır
26
Enzimler rekasiyonu ne kadar hızlandırır?
10 üzeri 5 ve 10 üzeri 17 kadar.
27
Kompetetif inhibasyonda Km ve Vmax değişimi?
Km artar, çünkü substratın enzime bağlanma yeteneği azalır. Vmax değişmez, çünkü yeterince yüksek substrat konsantrasyonu inhibitörü yerinden çıkarabilir.
28
kompetetif inhibasyonda inhibatör neye bağlanır?
Enzimin aktif bölgesine bağlanır ve substratla yarışır.
29
unkompetetif inhibasyonda Km ve Vmax değişimi?
Km azalır, çünkü substratın enzime bağlanma etkinliği artar. Vmax azalır, çünkü inhibitör, ürün oluşumunu sınırlar.
30
unkompetetif inhibasyonda inhibatör neye bağlanır?
yalnızca enzim-substrat kompleksine bağlanır
31
Rxn hızını etkileyen etkenler:
Sıcaklık *pH *Substrat konsantrasyonu *İnhibitor varlığı *Bazı iyonların varlığı ve konsantrasyonu *Enzim konsantrasyonu *Zaman *Fiziksel etkenler
32
Enzimler
Tüm substratlar, kofaktörler, ürünler ve düzenleyiciler belirlenmelidir. Enzim-bağlı reaksiyon ara ürünlerinin oluşma sırası belirlenmelidir. Her bir ara ürün ve geçiş halinin yapısı anlaşılmalıdır. Ara ürünler arasındaki dönüşüm hızları belirlenmelidir. Enzim ve ara ürünler arasındaki yapısal ilişki tanımlanmalıdır. Tepkimeye katılan tüm grupların enerji katkısı anlaşılmalıdır.
33
Enolaz napıyor?
Enolaz, glikoliz sürecinde 2-fosfogliseratın (2-PGA) fosfoenolpiruvata (PEP) dönüştürülmesini katalizler.
34