Enzimler Flashcards
Hayat için 2 temel koşul?
Canlı kendi kendini kopya etmeli,
–Hücre bölünmesi.
*Organizma kimyasal reaksiyonları etkin ve seçici bir şekilde katalize etmeli.
–Enzimatik reaksiyonlar
Bir şeker rafta H2O ve CO2’ye dönüşmeden yıllarca kalabilir, peki canlı hücrelerde nasıl parçalanmaktadır?
Enzimlerle kataliz edilmeleri sayesinde.
İzoenzim nedir? Ve iki örnek ver.
Protein yapıları farklı fakat katalizledikleri reaksiyonları aynı olan enzimlerdir. Kalpteki ve kastaki Laktat Dehidrogenaz enzimi örnektir.
Hekzokinaz (glukokinaz) glukozun glikoliz olmasının başlangıcında glukoz C6 atomunu fosforlayarak glukoz-6-fosfata çevirir. Karaciğer ve böbrekte farklı izoenzimleri var
Statin (yüksek kolestrol ilacının çalışma mekanizması nedir? (yarışmalı inhibasyon)
Vücudun kolesterol yapmak için kullandığı enzimin(HMG CoA redüktaz) üretimini bloke ederek çalışırlar. İlaç o enzimin substratını veriyor aslında ve enzimler onunla uğraşırken karaciğerden kolesterol salgılanamıyor.
HMG Coa redüktaz kolesterol üretiminde hız kısıtlayıcı enzimdir. hız kısıtlayıcı enzim nedir?
Tüm yolaktaki reaksiyon hızını sınırlayan en yavaş adımdan sorumlu olan enzimdir.
Tüm enzimler protein yapılı mıdır?
Katalitik RNAlar harici evet.
Prostatik grup nedir?
Bir koenzim veya metal iyonu enzim proteinine çok sıkı bağlandığı zaman bu şekilde adlandırılır.
Holoenzim nedir?
Katalitik olarak aktif enzimle ona bağlı olan koenzim ve/veya metal iyonları birlikte holoenzim olarak adlandırılır.
Böyle bir enzimin portein kısmı da apoenzim ya da apoprotein olarak adlandırılır.
Koenzimin özgün işlevi nedir?
İşlevsel grupların bir yerden bir yere taşınmasında rol oynar.
Enzim komisyon numarasını açıkla.
EC 2.7.1.1
2:enzimin sınıfı (transferaz)
7:alt sınıfı (fosfotransferaz)
1: fosfotransferazın alıcı olduğunu ve alıcı grubun -OH olduğunu
1: fosforil grubunun alıcısının D-glukoz olduğunu
Enzimlerin tarihçesi?
1850li yıllarda Pateur mayalar tarafından şekerin alkole fermentesi.
1897de Eduard Bucher fermentasyonun hücreler uzaklaştırıldığında bazı moleküllerce yapıldığını saptıyor.
Frederick Kühne bu moleküllere enzim diyor.
1926 yılında James Sumner, üreaz enzimini kristal halde elde etti ve bütün enzimlerin protein olduğunu iddaa etti ileride bu kabul gördü.
Enzimler 3 boyutlu yapılarını kaybederlerse çalışırlar mı?
Hayır.
Enzimlerin katalitik aktiviteleri doğal protein konformasyonlarına bağlıdır. sekonder tersiyer, kuaterner…
Suda çözünen vitaminler?
1.Thiamin (B1)
2.Riboflavin (B2)
3.Niacin (B3)
4.PantothenicAcid (B5)
5.Pyridoxal, Pyridoxamine, Pyridoxine (B6)
6.Biotin
7.Cobalamin(B12)
8.Folic Acid
9.Ascorbic Acid
Enzim sınıfları nelerdir?
1 oksidoredüktazlar
2 transferazlar
3 hidrolazlar
4 liyazlar
5 izomerazlar
6 ligazlar
oksidoredüktazlar?
elektron transferi (hidrid iyonları veya H atomları)
transferazlar?
Grup transfer reaksiyonları
hidrolazlar
Hidroliz reaksiyonları (suya fonsiyonel grupların suya transferi)
liyazlar?
Çift bağlı grupların ilavesi, veya grupların uzaklaştırılmasıyla çift bağların oluşturulması.
izomerazlar?
Molekül içine grupların transferi ile izomerik formların oluşturulması.
ligazlar?
ATP hidrolizi ile C-C, C-S, C-O, ve C-N bağlarının oluşumu.
Transisyon durumu nedir?
ya da Geçiş durumu. Grafikteki yüksek enerji bariyerine denir. Bağ oluşumu ve bağ kırılması için geçerli enerji seviyesidir.
Aynı zamandda moleküllerin geçmesi için gerekli olan bu enerji aktivasyon enerjisidir. (delta G+)
Enzim subtratla birleştiğinde konformasyonunu değiştirir. Doğru/yanlış?
Doğru
Aktivasyon enerjisi yüksek olursa nolur?
Rxn yavaş gerçekleşir.
Bağlanma enerjisi nedir?
enzim-substrat kompleksindeki her bir zayıf etkileşimin oluşumu sırasında açığa çıkan ve bu etkileşimlere belirli bir stabilite sağlayan serbest enerjidir.
Bu enerji, yalnızca enzim-substrat etkileşiminin stabilizasyonuyla sınırlı kalmaz; aynı zamanda enzimlerin reaksiyonların aktivasyon enerjisini düşürmek için kullandıkları serbest enerjinin başlıca kaynağıdır.