Enzimek Flashcards

1
Q

DNS módosító enzimek?

A

Nukleázok
DNS polimeráz
DNS molekula végződését módosító
Ligáz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Mik a nukleázok?

A

Nukleinsavak nukleotid egységek közötti foszfodiészter kötéseit hasítják

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Mik a DNS polimerázok?

A

Létező nukleinsav templátról szintetizálnak új, komplementer polinukleotid szálat
dNTP építőköveket használ

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Mik a DNS molekula végződését módosító?

A

Polinukleotid kináz, alkalikus foszfatáz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Mik a ligázok?

A

Nukleotid egységeket tudnak összekapcsolni foszfodiészter kötés kialakításával

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Mi véd az endonukleáz hasítástól?

A

DNS metilálás

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Milyen elemei vannak a restrikciós modifikációs rendszernek?

A

Restrikciós endonukleáz

annak megfelelő DNS metiláz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Metiláz enzimek típusai?

A

dam metiláz

dcm metiláz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Nukleázok csoportosítás (hatás,hasítás,szubsztrát,szubsztrát szál, végődés)

A
Hatás: exo vagy endo
Hasítás irány: 5'->3', 3'->5'
Szubsztrát típus: DNS vagy RNS
Szubsztrát szál: egyszálú vagy kétszálú DNS
Végződés: 3'-OH, 5'-OH
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Mik a palindrom szekvenciák?

A

Restrikciós enzimek felismerési helyei, rövidebb vagy hosszabb szekvenciák
Géza kék az ég

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Mi keletkezik egy DNS molekulából?

A

2 kisebb DNS, hasítási helynél foszfát az 5’-n, OH-3’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Restrikciós enzimek típusai?

A

I-es típus
III-as típus
II-es típus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

I-es típus jellemzői

A

Restrikciós és metiltranszferáz aktivitás
3 alegység
Mg ion kell a működéshez
Hasítóhely távol a felismerésitől

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

II-es típus jellemzői

A

Restrikciós funkció
Mg ion
Hasítóhely felismerőben vagy közvetlen közelben
Felismerőhely palindrom szekvencia és 4-8 bázis hosszú
Hasítás eredményezhet ragadós vagy tompa véget

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

III-as típus jellemzői

A

Hidrolizáló és metiláló alegység
Mg ion
Hasítóhely felismerés közelében
Nem palindrom

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Mi a tompa vég?

A

Mindkét szál azonos helyen lett hasítva

17
Q

Mi a ragadós vég?

A

Szimmetrikusan de nem középen lett hasítva, rövid egyszálú vég az eredmény

18
Q

Mik az izoschizomerek?

A

Egyforma a hasító és felismerőhely

19
Q

Mik a neoschizomerek?

A

Felismerőhely megegyezik de a hasítóhely nem

20
Q

S1-nukleáz jellemzői

A

Egyszálú DNS-t vagy RNS-t bont
Kofaktora Zn ion
pH optimuma sava

21
Q

DNáz I jellemzői

A
1 és 2 szálú DNS bontás
Ca-Mg-mangán-ion
EDTA-val gátolható
Felhasználható: Sanger szekvenálás, jelölt DNS létrehozás
Része a Klenow fragmentum
22
Q

Polimerázok típusai

A

Templát-függő: templát alapján készít másolatot

Templát-független

23
Q

Polimeráz működése

A

Kell egy rövid kétszálú szakasz (természetben ez RNS primer)
Képesek láncbontásra is:
- 3’->5’ exonukleáz aktivitás, visszafele haladva eltávolít =proofreadin
- 5’->3’ exonuk ak., előre haladva képes a templáttal komplementer szálat bontani

24
Q

DNS polimeráz I jellemzői

A
Minden prokariótában megvan, eltáolítja az RNS primert, Okazakit összeköti
4 enzimaktivitás:
- 5'3' DNS függő DNS polimeráz
-3'5' exonukleáz
-5'3' exonukleáz
-5'3' RNS függő DNS polimeráz
25
Q

T4 DNS-polimeráz jellemzői

A

2 enzimaktivitás:
- 5’3’ DNS függő DNS polimeráz
-3’5’ exonukleáz
Tompa vég

26
Q

T7 DNS polimeráz

A

2 enzimaktivitás:
- 5’3’ DNS függő DNS polimeráz
-3’5’ exonukleáz
Sequenase forma: nincs exonuk

27
Q

Taq polimeráz

A

hőstabil
PCR-hez használják
nincs 3’5’ exonuk
nem nagy hűségű polimeráz

28
Q

Pfu polimeráz

A

hőstabil
nagyobb hőstabilitás mint a Taq
an proofreading

29
Q

Phusion polimeráz

A

proofreading polimerz és DNS kötő domén fúziója
nagy másolási hűség (fidelity)
gyors

30
Q

Reverz transzkriptáz

A

RNS függő DNS polimeráz

labor: mRNS->DNS másolat (cDNS)

31
Q

Terminális transzferáz

A

homopolimer ragadós véget alakít ki dGTP-vel

templát független polimeráz

32
Q

Alkalikus foszfatáz

A

Hidroláz, 5’ végről távolít el foszfát csoportot

33
Q

T4 polinukleotid-kináz

A

ATP y-foszfát csoportjának a DNS szabad 5’-OH végére történő átvitelt katalizálja