Enzimek Flashcards
DNS módosító enzimek?
Nukleázok
DNS polimeráz
DNS molekula végződését módosító
Ligáz
Mik a nukleázok?
Nukleinsavak nukleotid egységek közötti foszfodiészter kötéseit hasítják
Mik a DNS polimerázok?
Létező nukleinsav templátról szintetizálnak új, komplementer polinukleotid szálat
dNTP építőköveket használ
Mik a DNS molekula végződését módosító?
Polinukleotid kináz, alkalikus foszfatáz
Mik a ligázok?
Nukleotid egységeket tudnak összekapcsolni foszfodiészter kötés kialakításával
Mi véd az endonukleáz hasítástól?
DNS metilálás
Milyen elemei vannak a restrikciós modifikációs rendszernek?
Restrikciós endonukleáz
annak megfelelő DNS metiláz
Metiláz enzimek típusai?
dam metiláz
dcm metiláz
Nukleázok csoportosítás (hatás,hasítás,szubsztrát,szubsztrát szál, végődés)
Hatás: exo vagy endo Hasítás irány: 5'->3', 3'->5' Szubsztrát típus: DNS vagy RNS Szubsztrát szál: egyszálú vagy kétszálú DNS Végződés: 3'-OH, 5'-OH
Mik a palindrom szekvenciák?
Restrikciós enzimek felismerési helyei, rövidebb vagy hosszabb szekvenciák
Géza kék az ég
Mi keletkezik egy DNS molekulából?
2 kisebb DNS, hasítási helynél foszfát az 5’-n, OH-3’
Restrikciós enzimek típusai?
I-es típus
III-as típus
II-es típus
I-es típus jellemzői
Restrikciós és metiltranszferáz aktivitás
3 alegység
Mg ion kell a működéshez
Hasítóhely távol a felismerésitől
II-es típus jellemzői
Restrikciós funkció
Mg ion
Hasítóhely felismerőben vagy közvetlen közelben
Felismerőhely palindrom szekvencia és 4-8 bázis hosszú
Hasítás eredményezhet ragadós vagy tompa véget
III-as típus jellemzői
Hidrolizáló és metiláló alegység
Mg ion
Hasítóhely felismerés közelében
Nem palindrom
Mi a tompa vég?
Mindkét szál azonos helyen lett hasítva
Mi a ragadós vég?
Szimmetrikusan de nem középen lett hasítva, rövid egyszálú vég az eredmény
Mik az izoschizomerek?
Egyforma a hasító és felismerőhely
Mik a neoschizomerek?
Felismerőhely megegyezik de a hasítóhely nem
S1-nukleáz jellemzői
Egyszálú DNS-t vagy RNS-t bont
Kofaktora Zn ion
pH optimuma sava
DNáz I jellemzői
1 és 2 szálú DNS bontás Ca-Mg-mangán-ion EDTA-val gátolható Felhasználható: Sanger szekvenálás, jelölt DNS létrehozás Része a Klenow fragmentum
Polimerázok típusai
Templát-függő: templát alapján készít másolatot
Templát-független
Polimeráz működése
Kell egy rövid kétszálú szakasz (természetben ez RNS primer)
Képesek láncbontásra is:
- 3’->5’ exonukleáz aktivitás, visszafele haladva eltávolít =proofreadin
- 5’->3’ exonuk ak., előre haladva képes a templáttal komplementer szálat bontani
DNS polimeráz I jellemzői
Minden prokariótában megvan, eltáolítja az RNS primert, Okazakit összeköti 4 enzimaktivitás: - 5'3' DNS függő DNS polimeráz -3'5' exonukleáz -5'3' exonukleáz -5'3' RNS függő DNS polimeráz
