Eksamensspørgsmål - ordinær eksamen 2019/20 Flashcards
Giv et eksempel på en cellulær kemisk reaktion med et positivt ∆Go
. (b) Hvordan kan
energikrævende reaktioner foregå i en celle?
Syntesereaktioner som glutamin-syntese en syntese af peptid eller DNA har et positivt ∆Go
(b)
En enegikrævende reaktion kan foregå ved at den kobles til en energigivende reaktion. Koblede
reaktioner er sammenhængende par af kemiske reaktioner i hvilken den frie energi frigjort fra den
ene reaktion bringes til at drive den anden reaktion (alternativ: To reaktioner, der har et fælles
mellemprodukt og hvor summen af ∆Go er negativ
Beskriv, gerne ved hjælp af en skitse, hvad der forstås ved fosforylering af et protein.
Ved fosforylering forstås at der kovalent bindes en fosfatgruppe til en eller flere
aminosyresidekæder med en OH-gruppe på et protein
Forklar hvordan fosforylering kan regulere et enzyms aktivitet.
De 2 negative ladninger på fosfatgruppen
medfører en større konformationsændring, f.eks. ved at tiltrække positivt ladede aminosyrers
sidekæder. Derved ændres affiniteten mellem ligand og enzymets aktive site, hvorved enzymets
aktivitet ændres
Forklar hvilken funktion Taq polymerasen har i PCR (Polymerase Chain Reaction)
Taq DNA polymerasen katalyserer kovalent binding af nucleosid trifosfat til DNAprimerens 3´-ende under anvendelse af den streng, som primeren har annealet til, som template
Hvorved adskiller Taq polymerasens egenskaber sig fra den polymerase der udfører
replikationsprocessen in vivo?
Taq polymerasen er mere thermostabil end den polymerase, der udfører replikationsprocessen, idet
den kan opvarmes til 92-95 oC uden at denatureres og mister sin katalytiske aktivitet. temperaturoptimum 72 oC mod cellens egen DNA-polymerases temperaturoptimum på 37 oC (andre forskelle
også godkendt)
Forklar, gerne ved hjælp af en skitse, hvad vil det sige at DNA replikationen er
bidirektionel i forhold til replikations-origo.
Replikationsprocessen er bi-direktionen idet den går i begge retninger ud fra dette origo, idet
der dannes 2 replikationsgafler, der går i hver sin retning.
Forklar hvordan beskadigelser på den ene af
DNA strengene kan repareres.
Den generelle
reparationsmekanisme for reparation af beskadigelser som f.eks. depurinisering af enkelte baser
består af 3 trin: 1. Genkendelse af skade ved specifikke proteiner/nucleaser; excision af skade; 2.
Polymerase danner nyt DNA med modsatte streng som skabelon; 3. Reparation af hul i
fosfatrygraden med ligase
Beskriv kort 3 af de processer, der sammenfattes under betegnelsen post-transkriptionelle
modifikationer.
Capping – påsætning af 3-methylguanosin i en 5´-5´-binding i transkriptets 5´ende.
Polyadenylering – enzymatisk fjernelse af en specifik del i transkriptets 3´-ende og påsætning af en
lang kæde af adenosin i stedet. Splejsning – enzymatisk bortskæring af specifikke sekvenser i
transkriptet (introns) og ligering af de 2 dobbeltstrengsbrud.
Forklar hvad der forstås ved begrebet alternativ splejsning.
Ved alternativ splejsning dannes
der forskellige mRNA (og proteiner) ud fra samme primære transkript. Det skyldes at nogen exons
splejses ud sammen med introns.
Hvad er forskellen på genetisk og epigenetisk nedarvning?
Den genetiske nedarvning baserer sig på den DNA-sekvens, som cellens kromosomer
rummer, mens den epigenetiske nedarvning baserer sig på modifikationer af enten DNA eller
histon-proteiner. De epigenetiske mønstre overføres til begge datterceller, hvor specielle
enzymatiske mekanismer sørger for at mønstrene opretholdes ved at (gen-)etablere dem på det
nydannede DNA og nye histoner. Dette er basis for ”cell memory”
Beskriv ved hjælp af et
eksempel, hvordan en epigenetisk modifikation kan have en effekt på transskriptionen af et
gen
Et eksempel kunne være
acetylering af histoners lysin-sidekæde. Denne epigenetiske modifikation øger transkriptionen ved
at tiltrække generelle transkriptionsfaktorer og enhancere samt løsne bindingen mellem histonernes
positivt ladede aminosyresidekæder og DNA’s negativt ladede fosfatrygrad.
Opskriv fem reaktionstyper i organisk kemi
Addition, substitution, elimination, syre-base, redox-reaktioner
Forklar begreberne nukleofil og elektrofil. Giv et eksempel på hver
En nukleofil er en elektronrig forbindelse der gerne vil donere et elektronpar til et positivt
polariseret elektron-fattigt atom. En nukleofil kan være negativt ladet eller neutral.
Eksempler på nukleofiler: OH-
, H2O, ROH, NH3, RNH2 etc. En elektrofil er en elektronfattig
forbindelse der kan acceptere et elektronpar fra en nukleofil. Eksempler på elektrofiler: H+
, Alkylhalider, carbonylforbindelser.
Opskriv to forbindelser der er diastereomere. Stereokemien skal klart fremgå.
Se eksempel i 2019/20 eksamensæt
Det er 2 figure som er ens, men har forskellig cis-trans nomenklatur
Natrium novobiocin er et veterinært lægemiddel mod bl.a. vejrtræknings problemer i hunde.
Hvordan er Natrium novobiocins vandopløselighed sammenlignet med Novobiocin? Svaret
skal begrundes.
Natrium novobiocin er et salt der består af en kation og anion. Salte er meget mere opløselige i
H2O end den neutrale forbindelse.
