Écologie, industrie, recherche

Question 1

Par quoi est déterminée une niche écologique

Answer 1

*Capacité d’assimiler une source de carbone de faible poids moléculaire par fermentation ou respiration
*capacité de transformer des petits composés azotés (nitrate…) en composés azotés plus complexes
*capacité de tolérer les caractéristiques physiques du milieu
*type d’intéractions avec les autres organismes du milieu

Question 2

Facteurs physiques d’une niche écologique pour les levures

Answer 2

• Temp: rarement >42C
• pH: varié, mais souvent + acide (min 2.5)
• salinité: varié, max 10% NaCl
• tolérance aux AB ou autres substances toxiques

Question 3

Exemple mutualisme

Answer 3

sporobolomyces roseus sur mais

Question 4

exemple commensalisme

Answer 4

ascobotryozyma + nématodes

Question 5

exemple de compétition

Answer 5

actinomycètes produisent cycloheximide
levures brettanomyces (acide acétique)
Levures toxines killer

Question 6

Y a-t-il des levures en milieu aquatique

Answer 6

eau douce: allochtones
océans: près des côtes
profondeurs de l’océan: rare

Question 7

Quel est la nourriture, le vecteur et le milieu d’entreposage / croissance des levures terrestres

Answer 7

bouffe: plante
vecteur: insectes
milieu entreposage/croissance: sol

Question 8

Ou trouve-t-on la plupart des levures associées aux plantes

Answer 8

*exsudats à la surface des feuilles / écorce
*fleurs / fruits
*tissus nécrosé

Question 9

Caractéristiques des levures associées aux plantes

Answer 9

souvent spécifique de la plante
rarement pathogènes

Question 10

Système cactus-levure-drosophile

Answer 10

insecte:
fréquente plantes bien spécifique
assure transport des levures
se nourrit des levures

Question 11

Ou se trouvent les levures dans le sol

Answer 11

surtout surface 5-15cm

Question 12

majorité des espèces de levure dans le sol sont allochtones ou autochtone

Answer 12

allochtone
(autochtone: lipomyces…)

Question 13

Présence de levures vs bactéries + autres mycètes dans le sol?

Answer 13

levures peu présentes

Question 14

Principales levure pathogènes des mammifères

Answer 14

candida
cryptococcus
malassezia

Question 15

Proportion des espèces de Candida isolées des candidémies

Answer 15

albicans (48-59%)
glabrata (12-24%)
parapsilosis (7-11%)
tropicalis (6-19%)
krusei (1-5%)
lusitaniae (<1%)
autres (2-7%)

Question 16

ou se trouve C. neoformans

Answer 16

pigeons

Question 17

ou se trouve c. gattii

Answer 17

eucalyptus

Question 18

quel est l’agent étiolique causant le pityriasis versicolor

Answer 18

malassezia furfur

Question 19

Malassezia furfur fait-elle partie de la flore normale des adultes?

Answer 19

oui 90%

Question 20

objectif du biotypage

Answer 20

distinguer 2 organismes taxonomiquement apparentés (souches) provenant de sources différentes

Question 21

4 manière de faire du biotypage

Answer 21

PCR spécifique
PCR non-spécifique (RAPD)
RFLP (restriction fragment length polymorphisms)
Electrophorèse à champs pulsés

Question 22

Comment analyser une PCR non spécifique

Answer 22

tailles des fragments différentes selon ou l’amorce sest collée puisque les amorces sont des séquences arbitraires

Question 23

défis d’étudier l’écologie des microorganismes

Answer 23

• difficile d’observer dans les milieux naturels
• cultures pures vs cultures mixtes

Question 24

Quelles levures utilise-t-on pour la levure alimentaire

Answer 24

candida utilis
kluyveromyces marxianus
Fusarium venenatum

Question 25

Quelles levures utilise-t-on pour production acide citrique

Answer 25

aspergillus niger
yarrowia lipolityca

Question 26

fonction de l’inulinase

Answer 26

inuline -> fructose

Question 27

fonction de la lactase

Answer 27

lactose -> galactose + glucose

Question 28

fonction invertase

Answer 28

saccharose -> glucose + fructose

Question 29

fonction des glucanes

Answer 29

*propriétés imunostimulantes
alimentation: agent épaississant. substitut gras
cosmétique: réparation de la peau
pharmaco: réduction cholestérol, adjuvant vaccins, cicatrisation
nourriture pour animaux (suppléments pour aquaculture + élevage de porcs)

Question 30

Quelle levure produit astaxanthine (+ c’est quoi sa fonction)

Answer 30

Phaffia rhodozyma
(précurseur dans biosynthèse de vitamine A)

Question 31

Applications de production de protéines hétérologues

Answer 31

étude structures des protéines
santé (vaccins, inhibiteurs coagulation, inhibiteurs protéases, hormones, réactifs de diagnostic)
enzymes

Question 32

Quelle levure produit chymosine et c’est quoi la fonction de l’enzyme

Answer 32

Kluyverovymes lactis
fonction: coagulation du lait lors production fromage

Question 33

qui produit céramides et c’est quoi la fonction

Answer 33

pichia ciferrii
fonction: sphingolipides dans la peau, maintient et structuration barrière lipidique de la peau

Question 34

quelle levure produit insuline humaine

Answer 34

s. cerevisiae

Question 35

quelle levure produit vaccin contre Virus Hépatite B

Answer 35

S. cerevisiae

Question 36

que veut dire GRAS

Answer 36

generally regarded as safe

Question 37

saccharomyces est un bon milieu de production pour protéines; pourquoi

Answer 37

non pathogène, cellules stables, milieux culture peu complexes, protéines sont glycosylées, sécrétion des protéines hétérologues

Question 38

2 levures méthylotrophes

Answer 38

pichia pastoris
hansenula polymorpha

Question 39

quel type de toxines certaines souches de s. cerevisiae dégradent

Answer 39

mycotoxines (inocuité des aliments)

Question 40

levures protégeant contre la détérioration des citrons / pommes / poires

Answer 40

candida eleophila
cryptococcus albidus

Question 41

Besoins de base croissance des levures

Answer 41

sucres (hexose)
sels ammonium
minéraux / éléments
vitamines
pH : 5.5

Question 42

pH optimal croissance des levures

Answer 42

4.5 à 6.5

Question 43

minimum de sucres assimilables par les levures

Answer 43

D-glucose, D-fructose, D-mannose

Question 44

sucres fermentescibles les + courants

Answer 44

*glucose, fructose, mannose, galactose (hexose)
*maltose, lactose, sucrose, mélibiose, tréhalose (disaccharides)
*raffinose (trisaccharide)

Question 45

Acides aminés comme sources de carbone?

Answer 45

par la voie oxydative
*milieux peptonés utilisés pour essais fermentations

Question 46

hydrocarbures comme source de carbone?

Answer 46

candida maltosa
Yarrowia lipolytica

Question 47

Méthanol comme source de carbones

Answer 47

Levures méthylotrophes: Pichia, Hensenula

Question 48

Sources d’azote assimilables

Answer 48

-sels d’ammonium (NH4+)
-acides aminés *s. cerevisiae + S. carlsbergensis n’utilisent pas L-lysine
-purines/pyrimidines
-urée, nitrates, nitrites, ammoniaque

Question 49

Quel milieu utilise-t-on pour les essais d’assimilation d’azote

Answer 49

Yeast carbone base

Question 50

Minéraux essentiels? et leur fonctions?

Answer 50

*Potassium: essentiel pour la croissance (co-facteur enzymatique), essentiel pour la fermentation, stimule la sporulation
*Magnésium: essentiel croissance, rôle structuraux/enzymatiques
*Na: qq levures peuvent croître dans environnements salés (aucune évidence suggérant que besoin de Na..)

Question 51

Facteurs de croissance?

Answer 51

différent selon les levures
*biotine
*pantothenic acid

Question 52

Que contient Malt extract

Answer 52

*extrait céréales germées
*glucose/fructose, sucrose/maltose
*peptides/acides aminés
*minéraux/vitamines

Question 53

Que contient le milieu Yeast Extract

Answer 53

• autolysat de cellules de levures
• acides aminés / peptides
• minéraux/vitamins (B), acides nucléiques
• pas de sucres fermentescibles

Question 54

Que contient le milieu peptone

Answer 54

• digestion enzymatiques de viandes / protéines
• riche en acides aminés + peptides
• absence d’hydrates de carbones fermentescible

Question 55

Sur quel milieux on fait pousser les levures si on veut qu’elles sporulent

Answer 55

*ascospores peuvent former sur YMA
*milieux spécialisés:
- gorodkowa
- V8
- Acétate
*on utiliise un milieu de présporulation riche en glucose avant de passer au milieu faible

Question 56

Quels milieux l’industrie utilisent pour la croissance de levures

Answer 56

mélasse, malt wort, wine must, cheese whey