Du Gène à la Protéine (II)

Question 1

Donner les deux types de facteurs de transcription etc.

Answer 1

General transcription factor type : nécessaire pour lier l’ARN polymérase au promoter.
Regulatory : utilisé pour réguler la transcription des gènes voisins. influence la capacité de l’arn pol à démarrer la transcription de certains gènes. Reconnaissent des éléments situés près du promoter (=séquences régulatrices)

Question 2

Donner les trois étapes pendant l’élongation transcriptionelle.

Answer 2

Coiffe 5’.
Epissage
3’ polydenylation

Question 3

Qu’est-ce que la coiffe 5’ ?

Answer 3

5’-cap est un nucléotide modifié que l’on trouve à l’extrémité 5’ des ARN messagers dans les cellules eucaryotes. La coiffe joue plusieurs rôles, elle protège en particulier les ARN contre la dégradation par des ribonucléases et, après son export dans le cytoplasme, elle permet le recrutement du ribosome qui va traduire l’ARN messager.

Question 4

Qu’est.ce que l’épissage ?

Answer 4

Introns coupés (restent dans le noyau, non codants), exons liés (exportés dans le cytoplasme, codants.).

Question 5

Donner les 3 étapes de l’épissage.

Answer 5

Assembly of the spliceosome (snRNA + autres proteines = snRNP)
Physical proximity of the exons
Cutting and ligation (5’ cutting, 3’ cutting, Disassembly of spliceosome, degradation of intron)

Question 6

Quelle est l’ARN pol responsable du capping, splicing et termination

Answer 6

l’ARN pol II.

Question 7

Comment l’arn pol ii coupe lors de l’épissage ?

Answer 7

transesterification

Question 8

Comment l’ARN pol II relie les trucs lors de l’epissage ?

Answer 8

Avec diff enzymes qui forment l’EJC Exon jonction complex

Question 9

Qu’est-ce que la Poly A tail ?

Answer 9

c’est une séquence d’aa ajoutée lors de la phase de terminaison qui permet d’éviter la dégradation de l’ARN et qui aide à différencier les diff types (arnm en a une). Régule l’export nucléaire.

Question 10

Chez une cellule eukaryote ou se fait la transcription et la traduction ?

Answer 10

transcription : noyau

traduction : cytoplasme

Question 11

Quelles sont les conditions pour que un ARN soit exporté ?

Answer 11

présence de cap, présence de la queue polyA, absence de snRNP et de CPSF. Si pas ces critères dégradé par nuclear exosome.

Question 12

Par quoi est exporté l’ARN ?

Answer 12

Par un pore du noyau.

Question 13

Que se passe-t-il avant que l’ARN passe par le NPC ?

Answer 13

Il est débarassé de toutes protéines pro-nucleaires encore attachées et est attaché à un nuclear export receptor. Après y être passé, la coiffe et le recepteur s’enlèvent.

Question 14

Généralement comment et ou se fixent les protéines régulatoires ?

Answer 14

Major groove de l’ADN ( a l’extérieur de la structure donc) via des liaisons hydrogène.

Question 15

Ou vont se fixer les activateurs ( responsables d’une augmentation de la vitesse de transcription ) ?

Answer 15

Sur les séquences enhancer.

Question 16

ou vont se fixer les represseurs ?

Answer 16

Sur les séquences silencer

Question 17

Qu’est-ce que la tata box ?

Answer 17

La boîte TATA est une séquence d’ADN présente au niveau de la séquence promotrice d’une partie des gènes des eucaryotes. Cette séquence d’ADN codée TATA se situe à environ 25 nucléotides en amont du premier nucléotide transcrit. Cette séquence sert de lieu de reconnaissance à l’ARN polymérase chez les eucaryotes.

Question 18

Qu’est-ce que un médiateur ?

Answer 18

Un complexe multriproteique qui joue le role d’un activator transcriptionnel chez les eukaryotes.

Question 19

Activateurs et répresseurs peuvent être en compétition de trois manières. lesquelles sont-elle ?

Answer 19

Competitive binding
Masking activation surface
Direct interaction with the general TF.

Question 20

Donner les 4 étapes du controle combinatorial.

Answer 20

Combinaison de protéine régulatries
hétérodimérisation des TF (leucine zipper)
Gradients de concentration des proteines régulatoires
Barrières et insulator elements

Question 21

Qu’est-ce que un insulator ?

Answer 21

Il s’agit d’une frontière génétique qui bloque les interactions entre enhancers et promoters. Nécessaire quand on a deux gènes qui codent des trucs très différents et qui sont très proches pour éviter que les mécanismes de répression influent sans le vouloir sur le gène voisin. L’insulator doit être situé entre le promoter et l’autre gène.

Question 22

Qu’est.ce qu’une barrière au sens biologique ?

Answer 22

Sépare hétéro (gènes silenced) de euchromatine (gènes activement transcrits). Se fixe à la chromatine entre hétéro et euchro d’un coté et à un NPC de l’autre pour éviter la dispersion de l’hétérochromatine.