Du Gène à la Protéine (II) Flashcards
Donner les deux types de facteurs de transcription etc.
General transcription factor type : nécessaire pour lier l’ARN polymérase au promoter.
Regulatory : utilisé pour réguler la transcription des gènes voisins. influence la capacité de l’arn pol à démarrer la transcription de certains gènes. Reconnaissent des éléments situés près du promoter (=séquences régulatrices)
Donner les trois étapes pendant l’élongation transcriptionelle.
Coiffe 5’.
Epissage
3’ polydenylation
Qu’est-ce que la coiffe 5’ ?
5’-cap est un nucléotide modifié que l’on trouve à l’extrémité 5’ des ARN messagers dans les cellules eucaryotes. La coiffe joue plusieurs rôles, elle protège en particulier les ARN contre la dégradation par des ribonucléases et, après son export dans le cytoplasme, elle permet le recrutement du ribosome qui va traduire l’ARN messager.
Qu’est.ce que l’épissage ?
Introns coupés (restent dans le noyau, non codants), exons liés (exportés dans le cytoplasme, codants.).
Donner les 3 étapes de l’épissage.
Assembly of the spliceosome (snRNA + autres proteines = snRNP)
Physical proximity of the exons
Cutting and ligation (5’ cutting, 3’ cutting, Disassembly of spliceosome, degradation of intron)
Quelle est l’ARN pol responsable du capping, splicing et termination
l’ARN pol II.
Comment l’arn pol ii coupe lors de l’épissage ?
transesterification
Comment l’ARN pol II relie les trucs lors de l’epissage ?
Avec diff enzymes qui forment l’EJC Exon jonction complex
Qu’est-ce que la Poly A tail ?
c’est une séquence d’aa ajoutée lors de la phase de terminaison qui permet d’éviter la dégradation de l’ARN et qui aide à différencier les diff types (arnm en a une). Régule l’export nucléaire.
Chez une cellule eukaryote ou se fait la transcription et la traduction ?
transcription : noyau
traduction : cytoplasme
Quelles sont les conditions pour que un ARN soit exporté ?
présence de cap, présence de la queue polyA, absence de snRNP et de CPSF. Si pas ces critères dégradé par nuclear exosome.
Par quoi est exporté l’ARN ?
Par un pore du noyau.
Que se passe-t-il avant que l’ARN passe par le NPC ?
Il est débarassé de toutes protéines pro-nucleaires encore attachées et est attaché à un nuclear export receptor. Après y être passé, la coiffe et le recepteur s’enlèvent.
Généralement comment et ou se fixent les protéines régulatoires ?
Major groove de l’ADN ( a l’extérieur de la structure donc) via des liaisons hydrogène.
Ou vont se fixer les activateurs ( responsables d’une augmentation de la vitesse de transcription ) ?
Sur les séquences enhancer.
ou vont se fixer les represseurs ?
Sur les séquences silencer
Qu’est-ce que la tata box ?
La boîte TATA est une séquence d’ADN présente au niveau de la séquence promotrice d’une partie des gènes des eucaryotes. Cette séquence d’ADN codée TATA se situe à environ 25 nucléotides en amont du premier nucléotide transcrit. Cette séquence sert de lieu de reconnaissance à l’ARN polymérase chez les eucaryotes.
Qu’est-ce que un médiateur ?
Un complexe multriproteique qui joue le role d’un activator transcriptionnel chez les eukaryotes.
Activateurs et répresseurs peuvent être en compétition de trois manières. lesquelles sont-elle ?
Competitive binding
Masking activation surface
Direct interaction with the general TF.
Donner les 4 étapes du controle combinatorial.
Combinaison de protéine régulatries
hétérodimérisation des TF (leucine zipper)
Gradients de concentration des proteines régulatoires
Barrières et insulator elements
Qu’est-ce que un insulator ?
Il s’agit d’une frontière génétique qui bloque les interactions entre enhancers et promoters. Nécessaire quand on a deux gènes qui codent des trucs très différents et qui sont très proches pour éviter que les mécanismes de répression influent sans le vouloir sur le gène voisin. L’insulator doit être situé entre le promoter et l’autre gène.
Qu’est.ce qu’une barrière au sens biologique ?
Sépare hétéro (gènes silenced) de euchromatine (gènes activement transcrits). Se fixe à la chromatine entre hétéro et euchro d’un coté et à un NPC de l’autre pour éviter la dispersion de l’hétérochromatine.
