Du Gène à la Protéine (I) Flashcards
Qu’est-ce que un gène ?
Séquence de ADN qui code une protéine.
Qu’est-ce que la transcription
Transcrire ADN -> en ARN
Qu’est-ce que la traduction ?
Traduire l’ARN en protéine.
Ou est-ce que la transcription démarre ?
à un promoteur (seq ATG).
Quelle enzyme catalyse la transcription ?
RNA polymerase
Quelle est la vitesse de transcription ?
20/40 nucleotides/sec
Ou est-ce que la transcription s’arrête ?
Terminator.
Quel est le but final de la transcription ?
Faire une copie d’ADN en ARN
Citer les 3 différences principales entre ARN et ADN
ARN : 1 brin.
ARN Uracile au lieu de Thymine
ARN Ribose au lieu de desoxyribose
Quelles sont les 3 étapes de la transcription ?
Initiation
Elongation
termination
Si la transcription est 5’-3’. Quel brin est template (non-codant), lequel et template (codant) ?
Le 5’-3’ est non-template.
Le 3’-5’ est template.
Est-ce que la transcription se fait de la même manière chez les bactéries et les eukaryotes ?
Non. La bactérie traduit direct après transcription, tandis que l’eurkaryote traite l’ARN, l’exporte en dehors de l’enveloppe puis le traduit.
Définir facteur sigma
Le facteur σ est une sous-unité de l’ARN polymérase bactérienne qui se lie aux autres unités au moment de la transcription pour lui permettre de reconnaître le promoteur.
Dès le début de la transcription, le facteur se détache. Il existe plusieurs facteurs sigma qui sont spécifiques d’un promoteur donné.
Qu’est-ce que l’ARN polymerase holoenzyme ?
il s’agit du complexe formé par facteur sigma + RNA pol
Qu’est-ce qu’un promoter
Un promoteur, ou séquence promotrice, est une région de l’ADN située à proximité d’un gène et indispensable à la transcription de l’ADN en ARN. Le promoteur est la zone de l’ADN sur laquelle se fixe initialement l’ARN polymérase, avant de démarrer la synthèse de l’ARN. Les séquences promotrices sont en général situées en amont du site de démarrage de la transcription1.
Définir séquence consensus
Une séquence nucléotidique va correspondre à un enchainement de bases azotées au sein d’une séquence d’ADN. Il existe de nombreuses séquences auxquelles une fonctionnalité a été attribuée. Par exemple, les séquences CAAT et TATA (boîte TATA) sont connus pour être des séquences promotrices d’une partie des gènes des eucaryotes.
Les facteurs de transcription vont réguler l’expression de leurs gènes cibles en venant se fixer à une séquence nucléotidique spécifique, appelée site de fixation. Or, la spécificité entre un facteur de transcription et son site de fixation n’est pas toujours parfaite. L’alignement de séquences correspondant au même facteur de transcription va donc permettre de déterminer la séquence conservée, appelée séquence consensus.
Ou se situent généralement ces séquences consensus ?
-35 et -10 bp du site de départ de transcription
Qu’est-ce qui est crucial dans la fixation du facteur sigma ?
L’espacement des séquences - 17 pb le plus frquent.
Décrire l’étape 1 de la transcription : l’initiation.
RNA pol se fixe sur l’ADN au promoter.
Sigma se fixe sur RNA pol forme holoenzyme.
Décrire l’étape 2 de la transcription : ouverture de l’adn
Relaxation 3d de l’adn qui permet l’attachement de ribonucléotides libres.
Décrire l’étape 3 de la transcription : RNA synthesis
l’ARN polymerase se connecte à des ribonucléotides pour démarrer la synthèse.
Décrire l’étape 4 de la transcription : déplacement de RNA pol.
RNA pol n’est plus attachée au promoter ou au factor sigma (qui se détache). Elle se déplace 5’-3’ en continuant la synthèse.
Décrire l’étape 5 de la transcription : terminaison.
RNA pol atteint une séquence terminatrice caractéristique : non mirrored symetric sequence + terminator sequence
Décrire l’étape 6 de la transcription : dissociation
RNA pol se détache. Le cycle peut se répéter.
Essayer de comprendre le sens de “several genes can be descreibed at the same time”.
essai échoué
Qu’est-ce que la gene regulation ?
Le niveau d’expression genique peut être différentes dans des conditions différentes.
Qu’est-ce que le but de la gene regulation ?
Certaines protéines seront produites seulement quand nécessaire : économie d’énergie !
Comment appelle-ton un gene qui n’est pas régulé ?
Constitutive. Nécessaire pour des trucs indispensables genre hémoglobine.
Ou est-ce que la régulation génique peut s’exercer dans le processus gene —-> protein ?
N’importe ou !
Citer trois processus de régulation génique au niveau de la transcription.
Facteurs sigma spécifiques.
Protéines régulatoires.
Boucles d’ADN.
Quelle est la fonction des sigma factors et en quoi est-elle utile pour la régulation génique ?
Les sigma factor permettent de guider l’ARN polymerase au set de gènes correct.
Qu’est-ce que un répresseur ? activateur ?
inhibite transcription en se liant a l’adn
ou active transcription en se liant a l’adn
Qu’est-ce que le controle négatif ? positif ?
négatif : régulation par répresseurs, positif par activateurs.
Qu’est-ce que un inducer ?
Une molecule effectrice qui permet la transcription en se fixant et inactivant un répresseur.
Qu fait un corepresseur ? un inhibiteur ?
Corepresseur s’attache au répresseur et fait qu’il s’attache a l’adn inbhitant la transcription.
Inhibiteur s’attache à un activateur et l’empêche de se fixer sur l’adn.
Comment s’appelle un gene qui utilise des mécanismes de respression etc ?
Un gêne répressible.
Comment activer un répresseur seul et non actif ?
avec un corepresseur.
Définir operon.
unité transcriptrice formée d’un promoteur, de gènes fonctionellement reliés (ex enzymes pour faire tryptophanes) ainsi que d’un operator ou peut se fixer un répresseur.
Définir enhancer
Il s’agit d’une séquence d’ADN capable de stimuler la transcription en agissant sur le promoteur situé en amont ou en aval.
Pourquoi le LacZ operator est il spécial ?
Il est dépendant ET du CAP et du repressor issu de LacI selon les niveaux de glucoses et lactose. Il s’agit d’un controle négatif ET positif en même temps.
Définir ADN polycistronique.
ADN contenant la séquence codante des gènes functionally-related de l’operon.
