Chapitre 21 : Evolution des génomes Flashcards
Décrire les 4 étapes du séquencage d’un génotype
étape 1 : coupage de l’ADN en overlapping fragments, assez courts
étape 2 : clonage des fragments en utilisant des plasmies ou phage vectors (organisme ne provocant pas lui même la maladie mais qui aide à l’infection en transportant les agents pathogènes d’un phage à l’autre.)
étape 3: Séquençage de chaque fragment obtenu.
étape 4 : arrangement des fragments pour reformer la séquence totale, par ordinateur.
Donner les proportions générales de la composition de notre ADN.
44% : ADN répétitif, dont éléments transposables
1,5% : Exons (ARNs !)
15% : ADN non répétitif, non codant.
15% :ADN répétitif, pas liés aux éléments transposables.
Définir un transposon.
C’est une portion d’ADN, capable de se déplacer et de se multiplier de manière autonome dans un génome, par un mécanisme appelé transposition.
Définir la transposition copy and paste des rétrotransposons (classe I).
Le transposon est copié par transcription (via ARN transcriptase), puis est inséré à un autre endroit du génome. Cela crée des nombreuses copies de l’élément transposable, dispersées dans le génome : ADN répétitif. (42% des 44% de l’ADN répétitif est constitué de rétrotransposons.)
Définir le mécanisme cut and paste des transposons
Le transposon est juste retiré de la séquence, pour s’insérer ailleurs. Pas d’intermédiaire de transcripton impliqué comme pour les rétrotransposons.
Quelles sont les différentes étapes de formation d’une famille ?
Duplication d’un gène ancestral, unique.
Mutation des copies de ce gène ancestral.
Transposition de ces copies dans différents chromosomes.
Le cycle se répète.
Donner un exemple familles de gènes.
Hémoglobines.
Comment a-t-on découvert que les chromosomes se recombinaient ?
On a observé sur le chromosome 16 humain des séquences d’ADN similaires
qui se retrouvaient sur 4 différents chromosomes de souris.
Comment de telles recombinaisons peuvent se produire ?
Par exemple par cross-over entre non-homologues pendant la méiose, induisant un changement de chromosome pour le gène, ou encore un exon-shuffling.
Définir un exon.
Un exon est un fragment d’ARN primaire qui a été sauvegardé par l’épissage et retrouvé dans l’ARN cytoplasmique. Un gène est constitué d’exons et d’introns alternés. L’exon est souvent codant.
Définir l’épissage.
Les ARN transcrits subissent l’épissage : étapes de coupure et ligatures, coupant certaines séquences qu’on appellera introns et ligaturant d’autres appelées exons.
Définir exon-shuffling
Mécanisme évolutif consistant à mélanger les exons de différents gènes par transposons ou cross over non homologue : cela implique l’apparition de nouveaux gènes avec des nouvelles séquences alternées d’exons/introns. Certains exons peuvent aussi être dupliqués, créant des nouvelles structures d’alternance entre introns et exons.
