DNA - Skador Flashcards
1
Q
Förklara vad Base Excision Repair (BER) är och hur det ser ut schematiskt.
A
- Reparationsmekanism på icke-strukturella skador på DNA
- Skadad/saknad bas hittas av Enzymer
- DNA-glykosylas klipper bort
- DNA-polymeras fyller i rätt bas
2
Q
Förklara vad Nucleotide Excision Repair är och hur den ser ut schematiskt.
A
- Skada upptäcks av protein A/B (UvrA/UvrB)
- Protein binder till skadan, protein A lämnar
- Protein C (UvrC) rekryteras till skadan —> klipper på båda sidor om skada
- Protein D lyfter bort skadade biten
- DNA polymeras I fyller i med nya nukleotider
- DNA-Ligas binder samman fosfodiesterbindningen
3
Q
Vad är Depurinering? Hur lagas skadan?
A
- Spontan reaktion där en Purin (A eller G) lossnar genom HYDROLYS
- Anledning: värme, lågt pH eller annat
- Repareras: BER
4
Q
Vad är Tymin-dimer skada? Hur repareras skadan?
A
- Orsakas av UV-strålning
- UV-ljus exciterar elektroner i Tymin —> leder till att de binder kovalent till varandra
- Kovalent bindning orsakar böjning på sträng
- Reparation: NER
- Följder: stör basparning, stoppar DNA-polymeras vid replikation och transkription —-> CANCER
5
Q
Vad är Deaminering för skada? Hur repareras den?
A
- Kvävebas tappar aminogrupp
- Cytosin omvandlas då till Uracil
- Adenin omvandlas till Hypoxantin etc
- Orsak: hög temperatur, lågt ph, kemikalier
- Reparation: BER
6
Q
Förklara enkelsträngsbrott (SSB), hur det lagas.
A
- En sträng bryts i ryggrad (deoxyribos + fosfat)
- Orsak: oxidativ stress, joniserande strålning etc
- Reparation: BER
7
Q
Förklara dubbelsträngsbrott (SSB), hur det lagas.
A
- Båda strängar brutna
- Orsak: kollapsad replikationsgaffel, joniserande strålning, kraftig oxidation
- Följder: Kromosombrott, translokationer, cancer/celldöd
- Reparation: Homolog rekombination (använder systerkromatid som mall),
8
Q
Vad är Bulky adducter? Hur repareras skadan?
A
- Stora kemiska grupper binder till DNA-baser —> strängen buktar
- Orsak: kemikalier
- Reparation: NER
