Dichroisme circulaire

Question 1

Qu’est-ce que la lumière?

Answer 1

C’est une onde électromagnétique combinant un : champ électrique et un champ magnétique

Question 2

Le champ électrique induit un déplacement linéaire ou une circulation?

Answer 2

Le champ électrique induit un déplacement linéaire des charges tandis que le champ magnétique induit une circulation des charges

Question 3

Vrai ou Faux
La polarisation diminue l’éblouissement?

Answer 3

Vrai
Utile en conduisant, en ski, sur un lac

Question 4

Vrai ou Faux
Les atomes ne sont pas affectés par la lumière?

Answer 4

Faux,
Les atomes sont faits de particules chargées
Les charges sont affectées par les champs électriques
La lumière a un champ électrique
Donc les atomes sont affectés par la lumière

Question 5

La lumière polarisé est circulaire ou linéaire?

Answer 5

Circulaire

Question 6

Vrai ou Faux
La chiralité n’a pas d’impact sur le vivant?

Answer 6

Faux, la chiralité a un impact sur les médicaments et qui pourraient influencer la génétique des enfants par exemple

Question 7

Quelles sont les macromolécules chirales?

Answer 7

• Protéine
• Hélices alpha
• Feuillet beta
• Coudes (turn)
• ADN
• Double hélice d’ADN

Question 8

À quoi sert la chiralité dans la lumière?

Answer 8

Empêche la lumière circulaire gauche et droite de s’annuler

Question 9

Est-ce que le dichroisme circulaire est lent ou rapide?

Answer 9

Rapide

Question 10

À quoi sert le dichroisme circulaire?

Answer 10

• Répondre rapidement à des questions structurales
• Suivre la dénaturation d’une protéine
• Thermodynamique
• Optimisation
• Validation

Question 11

Quels sont les avantages du dichroisme circulaire?

Answer 11

• Rapide et facile
• Sensible
• Renseigne sur les proportions des structures secondaires
• Suivi dans le temps de la structure
• Ex. variation de pH, température, solvent, dénaturant …
• Peut fournir des paramètres thermodynamiques
   ΔG et ΔH de dénaturation
• Vérifier si une protéine est en conformation native

Question 12

Quelles sont les limitations du dichroisme circulaire?

Answer 12

• Mesures extrêmes sensibles et sujette au bruit de fond
• Calibration avec des hélice-α, feuillet-β, « random coil » pur
• Faible range dynamique, protéines entre 0,03 et 0,3 mg/ml
• L’oxygène absorbe les UV lointain et crée de l’ozone
• Mauvais pour la lecture
• Mauvais pour l’expérimentateur

Besoin de rigueur et spécifique

Question 13

Comment fonctionne un CD?

Answer 13

Lumière polarisée circulairement en alternance
Différence d’absorption entre la lumière polarisée gauche et droite

Question 14

Quelles sont les utilités du CD?

Answer 14

• Valider la structure d’une protéine (vs référence)
• Impact de mutations ponctuelles
• Stabilité
• Température
• pH
• Force ionique
• Dénaturant
• Rôle de cofacteurs

Question 15

Que peut-on mesurer avec un graphique de DC?

Answer 15

Ellepticité et repliement

Question 16

Une molécule avec plus d’hélice alpha aura une ou deux bosse dans son graphique?

Answer 16

2 bosses dans le bas