DAÑO Y REPARACIÓN DEL DNA: Flashcards
Inestabilidad de DNA:
-tendencia a presentar mutaciones en DNA durante la replicación
-error en DNA d y e se van a detener
La mutación es indispensable para la evolución pero no controlada puede causar….
Cáncer
Enfermedades
Envejecimiento
Son factores:
Endógenos y exógenos
VÍAS DE TOLERANCIA, participan en la reparación del DNA mutado.
Polimerasas de síntesis a través de la lesión (agrega nucleótidos)
Realizan la síntesis de DNA en la región dañada:
Polimerasas de tolerancia a la lesión
Tipos de TLS:
Poln, Poli, Polk, REV1, Polv, Pol 0 y tienen cierto grado de especificidad entre tipo de lesión y polimerasa de TLS encargada de replicarlo.
Si el daño persiste…,
Apoptosis o muerte celular programada
Tipo de daño de DNA: ENDÓGENOS
DNA polimerasas incorporan nucleótido erróneo
*mutaciones espontáneas
Error replicativo
Topoisomerasas: mal alineamiento de las hebras
*tirosil DNA fosfodiesterasa y endonucleasas reparan.
Error replicativo
Pérdida de amino exocíclico:
Desaminación espontánea de base, quita grupos amino
Citosina a
Uracilo
Adenina a
Hipoxantina
Guanina a
Xantina
5´metil citosina
Timina
Hidrolización a DNA glucosilasa, rompe enlace N-glucosídico
Pérdida de bases
-especies reactivas de oxígeno y ejemplos:
O2- (superóxido)
H202- peróxido de hidrógeno
OH (radical hidroxilo)
-especies reactivas de hidrógeno generan dobles enlaces, fragmentar a purinas y pirimidinas
-rotura de una sola hebra de DNA o en ocasiones las 2
-Forman 8-oxoguanina
Daño oxidativo
METILACIÓN DEL DNA:
-Grupos metilo (CH3) en una base nitrogenada.
-Metilación de citosina en el DNA es un fenómeno habitual.
Metilguanina:
Pone adenina si no hay metilación de citosina
Metiltimina, metiladenina
MUTACIONES:
G:C—-A:T
*Inhibir la síntesis de DNA
DAÑOS DE DNA. EXÓGENOS:
-Penetra a la célula, Alfa, Beta, Gamma, Neutrones y Rayos x
-rotura de 2 cadenas de DNA
Radiación ionizante
REPARACION DE RADIACION IONIZANTE:
-Endonucleasas
-tirosil DNA fosfodiesterasa 1
-reparación homóloga
RADIACIÓN ULTRAVIOLETA:
UV-C 190-290nm
UV-B 290-320 nm
UV-A 320-400nm
Genera dímeros de nucleótidos y rompe bases nitrogenadas, se usó en pandemia:
UV-C
Cuánto absorbe de longitud de onda el DNA?
260nm- formaban radicales libres
Enlaces covalentes entre
Pirimidinas y fotoproductos de las pirimidinas
-Adquiere grupos alquilo al DNA
*metil, etil
-Tabaco, agentes mostaza (1era guerra)
-Cisplatino
-Forman puentes cruzados y se fragmenta el DNA
Agentes alquilantes
Agentes aromáticos:
-Sustituyen bases por otros agentes
-Tabaco, carbon, pesticidas
-necesitan activación metabólica
-Altera geometría del DNA
Los agentes aromáticos necesitan activación metabólica por el…
Citocromo P450
REPARACIÓN DEL DNA:
-Elimina nucleótidos alterados que se generan por reactivos químicos presente en dieta o metabolismo
Reparación por escisión bases
REPARACIÓN POR ESCISIÓN DE BASES EN:
Desaminaciones
Alquilaciones
Especies reactivas de oxígeno
Quiénes actúan y que hacen en la escisión de bases?
-DNA glucosilasa:
-ENDONUCLEASA AP
DNA pol B
Ligasa
DNA GLUCOSILASA:
-8 tipos diferentes
-elimina base dañada, hidrolizar el enlace glucosídico entre base nitrogenada y azúcar.
-GENERA SITIOS AP
ENDONUCLEASA AP (sin purina o pirimidina):
Rompe enlace fosfodiéster
DNA pol B
Poner nucleótido que se quitó, el correcto
Ligasa:
poner enlaces fosfodiéster
-dímeros- causados por UVC
-uniones interhebras
-distorsión de hebra
-vía genómica global que corrige las cadenas de DNA en el resto del genoma.
REPARACION POR ESCISIÓN DE NULEÓTIDOS
Pasos para la reparación de escisión de nucleótidos:
1.- Reconoce el daño en secuencia de DNA.
2.- Helicasa
3.- Endonucleasa
4.- DNA polimerasa d y e
5.- Ligasa
Helicasa:
Rompe puentes de hidrógeno, correspondientes al fragmento escindido y se elimina fragmento de DNA.
Endonucleasa:
Hidroliza enlaces fosfodiéster a cada lado y varios pares de base de distancia de la lesión
24 a 32 Nt
DNA POLIMERASA D Y E
elongan las hebras de cadena continua (e) y discontinua (d)
Ligasa:
Une por medio de enlaces fosfodiéster.
-Durante replicación, se utiliza cuando se oxida guanina
GUANINA– 8-oxoguanina
-en lugar de que se una a citosina, se une a adenina
Se emplea la reparación por Mismatch (MMR)
-Reconoce a adenina unida con GO
**-Metil directed mismatch repair (mutM y mutY)- reconoce, corta y repara
-Elimina a adenina y sustituye por citosina.
DNA 0GG1- glucosilasa de oxoguanina
Se busca reparar bases mal apareadas, quién las reconoce?
MSH
Permite formación de complejo de reparación
MLH
Exonucleasas:
Exo7 (5´) y Exo 1 y 10 (3´)
DNA DELTA Y LIGASA
para elongar la hebra y añadir enlaces fosfodiéster
REPARACIÓN POR RECOMBINACIÓN HOMOLOGA: - daño o ruptura en dos hebras
-fase S o G2
-se activa gen ATM, que identifica ruptura
-recluta complejo MRE11 y entra exonucleasa 5´-3´
Complejo MRN:
-agarra 2 extremos rotos
-MRE 11, RAD 50 Y NBS1
RPA. se une a cadena sencilla
RAD 51, 52 54 y BRCA2- permiten movilizar hebras para recombinación
RAD 51 Y 52:
Traslocan y ponen nucleótidos, llegue a cromosoma homólogo.
Si se muta es un factor de riesgo para cáncer, es un gen supresor de tumor
BRCA2
Reparación no homóloga
*DNA-Pkcs
-reconoce cortes de DNA
-mantiene extremos cerca de procesamiento
*MRE11, NBS1, RAD50
-Actividad de exonucleasas
*XRCC4/ligasa (une dos extremos aunque se pierdan genes)
KU80 LLAMA A:
DNA-PKcs, SÓLO MARCAN.
Sin cromosoma homólogo..
No se puede copiar
Exonucleasa llega y
Quita nucleótidos de forma “pareja”