Cours 9 – Transcription et Traduction Flashcards

1
Q

À quels niveaux principaux s’effectue la régulation de l’expression des gènes ?

A

La régulation de l’expression des gènes s’effectue principalement au niveau de la transcription (ADN → ARN) et de la traduction (ARN → protéine).

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2
Q

Pourquoi la régulation de la transcription est-elle particulièrement importante dans l’expression des gènes ?

A

Parce que c’est à ce niveau que la cellule décide quels gènes seront exprimés, en réponse à des signaux internes ou externes. Elle permet ainsi un contrôle précis de la production des ARN messagers.

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3
Q

Quelle est la différence entre le sucre de l’ADN et celui de l’ARN ?

A

L’ADN contient un désoxyribose (sans groupement hydroxyle en 2’), tandis que l’ARN contient un ribose (avec un groupement hydroxyle en 2’).

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4
Q

Quelle est la différence entre les bases azotées de l’ADN et de l’ARN ?

A

L’ADN utilise la thymine (T), alors que l’ARN utilise l’uracile (U) à la place.

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5
Q

Quelle est la principale différence structurale entre l’ADN et l’ARN ?

A

L’ADN est principalement double brin (double hélice), tandis que l’ARN est principalement simple brin.

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6
Q

Pourquoi les ARN simple-brin peuvent-ils adopter des structures complexes ?

A

Parce qu’ils peuvent former des appariements internes entre bases complémentaires, ce qui leur permet de se replier en structures secondaires (tiges-boucles) et tertiaires.

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7
Q

Qu’est-ce qu’une structure secondaire typique de l’ARN ?

A

Une structure tige-boucle (ou “hairpin”) où des régions complémentaires d’un même brin s’apparient pour former une double hélice localisée.

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8
Q

Que sont les ribozymes ?

A

Ce sont des ARN ayant une activité catalytique, capables d’agir comme des enzymes dans certaines réactions biochimiques.

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9
Q

Quel est le rôle des ARN messagers (ARNm) ?

A

Les ARNm transportent l’information génétique de l’ADN vers les ribosomes, où ils servent de matrice pour la synthèse des protéines.

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10
Q

Quel est le rôle des ARN de transfert (ARNt) ?

A

Les ARNt apportent les acides aminés aux ribosomes pendant la traduction et les insèrent dans la chaîne polypeptidique en formation selon le codon de l’ARNm.

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11
Q

Quel est le rôle des ARN ribosomiques (ARNr) ?

A

Les ARNr forment la structure de base des ribosomes et catalysent la formation des liaisons peptidiques entre acides aminés.

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12
Q

Quelle est la fonction de l’ARN polymérase I (Pol I) chez les eucaryotes ?

A

L’ARN pol I transcrit les gros ARNs ribosomiaux : 28S, 18S et 5.8S.

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13
Q

Quelle est la fonction de l’ARN polymérase II (Pol II) chez les eucaryotes ?

A

L’ARN pol II transcrit les ARNs messagers (ARNm), ainsi que certains petits ARN non codants.

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14
Q

Quelle est la fonction de l’ARN polymérase III (Pol III) chez les eucaryotes ?

A

L’ARN pol III transcrit les ARNs de transfert (ARNt) et l’ARN ribosomial 5S.

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15
Q

Dans quel sens l’ARN polymérase synthétise-t-elle l’ARN ?

A

Toujours dans le sens 5’ vers 3’.

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16
Q

Quel est le mécanisme chimique de l’élongation de l’ARN ?

A

Le 5’-phosphate du nucléotide entrant réagit avec le groupement 3’-OH de la chaîne d’ARN en cours d’élongation.

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17
Q

L’ARN polymérase a-t-elle besoin d’une amorce pour commencer la synthèse ?

A

Non, contrairement à l’ADN polymérase, l’ARN polymérase peut initier la synthèse sans amorce.

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18
Q

Quel brin d’ADN sert de matrice lors de la transcription ?

A

Le brin matrice (ou brin antisens, non-codant) sert de modèle pour produire un ARN complémentaire.

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19
Q

Quelles sont les étapes de la transcription ?

A

Initiation: 1. Liaison au promoteur, 2. Fusion de l’ADN (Séparation
des brins), formation d’une bulle de transcription, 3. Ajout des 2
premiers nucléotides du transcrit (souvent abortif à cette étape)
Élongation: 1. Polymérisation de l’ARN à partir du brin matrice
Terminaison: 1. Rencontre de la séquence de terminaison dans
l’ADN et relâchement de l’ARN

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20
Q

Pourquoi les ARN polymérases ont-elles besoin de facteurs de transcription ?

A

Parce qu’elles ne peuvent pas reconnaître et se lier seules aux promoteurs ; les facteurs de transcription les aident à s’y positionner correctement pour initier la transcription.

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21
Q

Quels éléments de l’ADN sont reconnus chez les eucaryotes pour initier la transcription ?

A

Le promoteur est reconnu par les facteurs généraux de transcription (GTFs), qui permettent le recrutement de l’ARN polymérase II.

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22
Q

Quel est le rôle des enhancers (activateurs distaux) dans la transcription eucaryote ?

A

Les enhancers sont des séquences éloignées du promoteur, liées par des facteurs de transcription spécifiques, qui stabilisent et renforcent le complexe de transcription au niveau du promoteur.

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23
Q

Quel est le rôle principal des facteurs généraux de transcription chez les eucaryotes ?

A

Ils permettent le recrutement et le bon positionnement de l’ARN polymérase II sur le promoteur, en reconnaissant des éléments conservés comme la boîte TATA.

24
Q

Comment les facteurs généraux de transcription aident-ils à initier la transcription ?

A

Certains possèdent une activité hélicase, ce qui leur permet d’ouvrir la double hélice d’ADN au niveau du promoteur pour initier la synthèse de l’ARN.

25
Q

Quelle est la fonction du domaine de liaison à l’ADN des activateurs transcriptionnels ?

A

Il permet à l’activateur de se fixer spécifiquement à des séquences cibles dans l’ADN, comme les enhancers.

26
Q

Quelle est la fonction du domaine d’activation des facteurs de transcription activateurs ?

A

Il interagit avec d’autres protéines pour stimuler la transcription, notamment en facilitant l’assemblage du complexe de transcription.

27
Q

Quel rôle jouent les domaines de dimérisation dans les activateurs ?

A

Ils permettent à deux activateurs de s’associer (homodimères ou hétérodimères), ce qui est souvent nécessaire pour leur fonction.

28
Q

Que permet le domaine d’activation des facteurs de transcription ?

A

Il permet le recrutement de divers éléments nécessaires à l’initiation de la transcription, comme l’ARN polymérase II, via le complexe Médiateur.

29
Q

Quels autres éléments peuvent être recrutés par les domaines d’activation des facteurs de transcription ?

A

Des facteurs généraux de transcription, des enzymes de remodelage de la chromatine, et des enzymes de modification des histones.

30
Q

Que sont les coactivateurs dans la régulation transcriptionnelle ?

A

Ce sont des protéines comme les enzymes de remodelage de la chromatine ou de modification des histones, qui facilitent l’activation de la transcription sans se lier directement à l’ADN.

31
Q

Quel est le rôle de la queue C-terminale (CTD) de l’ARN polymérase II ?

A

Elle sert de plateforme d’interaction protéine-protéine, facilitant la coordination entre transcription et maturation des ARNs.

32
Q

Que permet la phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARN pol II ?

A

Elle déclenche la transition de l’initiation à l’élongation de la transcription et permet le recrutement de facteurs de maturation des ARNs (coiffe, épissage, polyadénylation).

33
Q

Quelles sont les étapes de la maturation des ARNs?

A
  1. L’ajout d’une coiffe en 5’ (coiffe 7-méthylguanosine) qui protège l’ARNm de la dégradation et facilite sa reconnaissance par le ribosome.
  2. Clivage au site poly A : L’ARNm est clivé à ce site spécifique, situé en 3’ de la séquence codante.
  3. Polyadénylation :C’est l’ajout d’une queue poly-A (environ 200 adénines) à l’extrémité 3’ de l’ARNm, qui stabilise la molécule et facilite sa traduction.
  4. Épissage: C’est le processus par lequel les introns (séquences non codantes) sont retirés et les exons (séquences codantes) sont reliés pour former un ARNm mature.
34
Q

Quel est le but de l’épissage des ARNs ?

A

Il permet de retirer les introns (séquences non codantes) et de relier les exons entre eux pour former un ARNm fonctionnel.

35
Q

Quel complexe est responsable de l’épissage des ARNs ?

A

Le spliceosome, un complexe ribonucléoprotéique formé d’ARNs et de protéines, qui catalyse le retrait précis des introns.

36
Q

Qu’est-ce que l’épissage alternatif ?

A

C’est un mécanisme qui permet de générer différents ARNm matures à partir d’un même gène en combinant les exons de façon variable.

37
Q

Quel est l’impact de l’épissage alternatif sur les protéines ?

A

Il permet la production de plusieurs isoformes d’une même protéine, augmentant ainsi la diversité fonctionnelle des protéines à partir d’un seul gène.

38
Q

De quoi est composé un ribosome eucaryote ?

A

C’est une ribonucléoprotéine composée de protéines et d’ARN ribosomiques (ARNr), formée de deux sous-unités : 40S (petite) et 60S (grosse).

39
Q

Quelles sont les trois cavités fonctionnelles du ribosome ?

A

Le site A (aminoacyl), le site P (peptidyl) et le site E (exit).

40
Q

Quel est le rôle des sites A, P et E dans la traduction ?

A

Le site A accueille l’ARNt entrant, le site P contient l’ARNt porteur de la chaîne peptidique en croissance, et le site E permet la sortie de l’ARNt vidé.

41
Q

Quelle est la particularité de l’extrémité 3’ des ARNt matures ?

A

Ils possèdent une extrémité CCA-OH en 3’, sur laquelle une aminoacyl-ARNt synthétase spécifique ajoute un acide aminé.

42
Q

Quel est le rôle de la boucle anticodon des ARNt ?

A

Elle contient une séquence de trois bases complémentaires aux codons de l’ARNm, permettant l’appariement codon-anticodon dans le ribosome.

43
Q

Quel est le rôle des ARNt dans la traduction ?

A

Ils assurent le lien entre le code génétique de l’ARNm et la séquence d’acides aminés de la protéine en apportant les bons acides aminés au ribosome.

44
Q

Quelles sont les trois grandes étapes du processus de traduction ?

A

Initiation, élongation et terminaison.

45
Q

Que se passe-t-il lors de l’initiation de la traduction ?

A

L’ARNm, le premier ARNt (portant la méthionine) et les deux sous-unités ribosomiques s’assemblent au niveau du codon start (AUG).

46
Q

Que se passe-t-il durant l’élongation de la traduction ?

A

Le ribosome lit l’ARNm codon par codon, et les ARNt apportent les acides aminés qui sont liés entre eux pour former la chaîne polypeptidique.

47
Q

Que se passe-t-il à l’étape de terminaison de la traduction ?

A

Un codon stop (UAA, UAG, UGA) est reconnu par un facteur de terminaison, ce qui libère la protéine et dissocie le complexe de traduction.

48
Q

Que contient le complexe 43S lors de l’initiation de la traduction ?

A

La sous-unité 40S du ribosome, l’ARNt initiateur lié à la méthionine (Met) et le facteur d’initiation eIF2 lié au GTP.

49
Q

Que se passe-t-il après la formation du complexe 43S ?

A

Le complexe 43S s’associe à l’ARNm, qui est préalablement lié à d’autres facteurs d’initiation, puis le ribosome scanne l’ARNm jusqu’au codon start (AUG).

50
Q

Quel événement déclenche l’assemblage du ribosome complet et le début de la traduction ?

A

L’hydrolyse du GTP par eIF2, une fois l’AUG reconnu, permet le recrutement de la sous-unité 60S, formant le ribosome 80S actif pour l’élongation.

51
Q

Quel complexe entre dans le site A du ribosome pendant l’élongation ?

A

Un aminoacyl-ARNt associé au facteur d’élongation eEF1A lié au GTP.

52
Q

Qu’est-ce qui stabilise l’aminoacyl-ARNt au site A du ribosome ?

A

L’appariement correct avec le codon de l’ARNm et l’hydrolyse du GTP par eEF1A stabilisent l’aminoacyl-ARNt dans le site A.

53
Q

Comment le lien peptidique est-il formé entre les acides aminés ?

A

La fonction amine du nouvel acide aminé (site A) attaque le carboxyle de l’acide aminé précédent (site P) ; la réaction est catalysée par la peptidyl transférase du ribosome.

54
Q

Comment le ribosome se déplace après la formation du lien peptidique ?

A

Grâce à l’activité GTPase de eEF2, le ribosome glisse de 3 nucléotides (5’→3’) sur l’ARNm : l’ARNt vide passe au site E et le peptide-ARNt au site P.

55
Q

Que se passe-t-il lorsqu’un codon STOP est atteint sur l’ARNm ?

A

Il est reconnu par un facteur de relâchement, eRF1, qui entre dans le site A du ribosome.

56
Q

Quel est le rôle du facteur eRF1 lors de la terminaison ?

A

Il stimule l’hydrolyse du lien ester entre la chaîne peptidique et l’ARNt, ce qui permet la libération de la protéine, de l’ARNm, et la dissociation des sous-unités ribosomiques.