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BIO1157 Final > Cours 9 - Les compartiments cellulaires (RE, peroxysome et vésicules)) > Flashcards

Cours 9 - Les compartiments cellulaires (RE, peroxysome et vésicules)) Flashcards

1
Q

Comment on peut séparer les 2 types de RE?

A

Par centrifugation dans un gradient de densité (REL en haut, RER en bas)

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Q

Quel est le rôle du REL et du RER?

A
  • REL: synthèse des lipides
  • RER: prot principalement destinées à la sécrétion
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Q

Quelle enzyme construit les phospholipides et avec quoi?

A

L’acyl-transférase située dans la membrane du REL construit les nouveaux phodpholipides à partir de 2 acides gras et de un glycérol phosphaté. Les nouveaux phospholipides peuvent s’ajouter au feuillet externe de la membrane du REL.

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4
Q

Après l’ajout des nouveaux phospholipides, comment la distribution des 2 couches membranes est égalisée?

A

La scramblase agit au moment de la synthès des lipides et bouche les trous du côté du feuillet interne de la membrane du REL en ajoutant des phospholipides.

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Q

Certains phospholipides sont destinés à la couche externe et d’autres à la couche interne de la membrane du REL. Comment les phospholipides sont-ils réarrangés entre les 2 membranes?

A

Les flippases agissent une fois la synthèse terminée pour distribuer les phospholipides. L’ATP est hydrolysé pour distribuer les phospholipides entre les 2 couches.

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6
Q

Comment sont appelées les prot membranaires produites par le RER?

A

Les peroxines

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7
Q

Vers où migrent les peroxysomes?

A

Vers le REL qui va former une vésicule précurseur

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8
Q

OÙ sont synthétisées les autres prot du peroxysome et comment sont-elles incorporées?

A

Dans le cytoplasme et elles sont incorporées dans l’organite par les peroxines de façon post-traductionnelle.

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9
Q

Quelles sont les fonctions du peroxysome?

A
  • Oxydation des molécules organiques
  • Neutralisation du H2O2
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10
Q

Quelles sont les 2 façons de former et de faire croître un peroxysome?

A
  • Synthèse de novo (à partir de rien) = lent
  • Croissance (fission des peroxysomes existants) = rapide
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11
Q

Décris la synthèse de novo

A

Fusion hétérotypique de 2 vésicules du RE (V1 et V2) suivie par l’incorporation post-traductionnelle des prot

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12
Q

Décris la croissance (fission des peroxysomes existants)

A

Réception des vésicules V3 et incorporation post-traductionnelle des prot. Pex 11 permet l’allongement de la vésicule lorsqu’elle est volumineuse. DRP fait la constriction membranaire.

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13
Q

Qu’est-ce que Pex3?

A

Étiquette d’une vésicule destinée aux peroxysomes et permet l’incorporation des prot membranaires

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14
Q

Qu’est-ce que le Pex5?

A

C’est un transporteur soluble qui amènela cargaison au translocateur et se colle dessus. Le Pex5 devient membranaire. Il est détahché rapidement en hydrolisant l’ATP, donc bcp Pex5 soluble et peu sous forme membranaire (grand gradient = énergie)

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15
Q

De quoi la fct des peroxysomes dépend-t-elle?

A

Elle dépend des prot qui y sont importées et les peroxysomes peuvent changer en fonction du type cellulaire et de l’environnement cellulaire.

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16
Q

Quelles sont 2 voies possibles pour un peroxysome?

A
  • Dégradation de H2O2 par catalase
  • Oxydation de a. gras
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17
Q

Quelle est la particularité du métabolisme des peroxysomes?

A

Normalement, le taux de multiplication des peroxysomes est similaire au cycle cellulaire. Cependant, le même peroxysome peut se subdiviser en 2 peroxysomes ayant des activités métaboliques différentes. Éventuellement, un des 2 parties formera un nouveau peroxysome qui aura une activité spécifique.

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18
Q

Qu’est-ce qui permet la bioluminescence des lucioles?

A

La rx chimique qui produit de la lumière se fait dans le peroxysomes (prouve que les peroxysomes ont diff fcts pour diff espèces)

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19
Q

Qu’est-ce qui permet le lien entre le RE et les mitochondries ou les chloroplastes?

A

Les prot d’échange des phospholipides (PEPs)

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20
Q

Comment se fait l’entrée des prots destinées à des organites ou à une membrane dans le RER?

A

Elle se fait de façon co-traductionnelle

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21
Q

Que se passe-t-il lorsque PSIT est traduit?

A

Le PSIT lie une poche hydrophobe située dans la SRP (GTPase soluble)

22
Q

Que se passe-t-il lorsque la SRP se lie à un PSIT (peptide signal)?

A

La SRP bloque la traduction en cours en bloquant le site A du ribosome (seulement durant un cout moment).

23
Q

Comment les translocateurs permettent au PSIT d’entrer à l’Intérieur du RER?

A

La SRP liée au PSIT est reconnue par son récepteur situé dans la membrane du RER. Une fois liée à son récepteur, SRP hydrolyse son GTP, ce qui provoque le relâchement du signal (PSIT). Les translocateurs sont situés à côté des récepteurs dans la membrane.

24
Q

Quels sont les 2 éléments que le translocateur contient?

A
  • poche hydrophobe dans sa “couture”
  • bouchon dans le fond
25
Q

Comment le PSIT et le restede la prot entrent dans le RER?

A

Le PSIT, libéré de la SRP, tasse le bouchon pour ensuite s’installer au niveau de la couture pour l’ouvrir et la garder ouverte.

26
Q

Qu’arrive-t-il au PSIT des prots solubles quand elles entrent dans la lumière du RER?

A

Leur PSIT sera coupé par paptidase membranaire. Certaines prots membranaires garderont leur PSIT qui servira d’ancrage à la membrane.

27
Q

Quel autre signal peut produire une prot membranaire?

A

La séquence d’arrête de transfert ou SAT (séquence d’a.a. hydrophobes, car le centre du translocateur est hydrophobe)

28
Q

Où vont les prot après avoir entrées dans le RER?

A

Toutes les prots passent vers le Golgi via les vésicules.

29
Q

Quels sont les signaux que possèdent les prots qui retournent au Golgi en C-terminal en plus du PSIT en N-terminal?

A

2 signaux de rétention en C-terminal:
* séquence KDEL pour les prots solubles
* séquence KKXX pour les prots membranaires

30
Q

Où sont sécrétées la pluspart des prots synthétisées dans le RER?

A

À l’extérieur de la cellule

31
Q

Nommes 2 modifications effectuées sur les prots synthétisées dans le RER avant de sortir de la cellule afin qu’elle soit capable de résister à l’envrionnement extérieur.

A

Afin d’être capable de résister à l’environnement extérieur:
* Une disulfide isomérase catalyse la formation ou la rupture de ponts disulfures. Elles s’assure que les liens S-S soient bien faits
* Une ancrre lipidique de GPI peut être ajoutée sur les prots par le complexe enzymatique transmidase. Les prots GPI se trouvent dans les radeaux lipidiques

32
Q

Quel est le rôle du RER dans la modification des prots? Et comment cela se produit?

A

L’ajout de sucres “contrôle-qualité” et non fonctionnels.
Une oligosaccharide transférase membranaire ajoute une unité préformée de sucre (tjrs un oligosaccharide de 14 sucres) sur le résidu asparagine.

33
Q

Que se passe-t-il durant la maturation de la prot (dans RER et Golgi)?

A

L’unité ajoutée sera modifiée et taillée pour finir avec un modèle de base à 5 sucres.

34
Q

Conment les chaperones font le contrôle qualité dans le RER?

A

Les 2 glucoses terminaux sont enlevés à la fin de la traduction et les diff chaperonnes vérifient la forme de la prot:
* Si prot est OK: le dernier glucose est clivé et elle sort du RE via une vésicule vers le Golgi.
* SI prot est mal-repliée: une glycosyl transférase lui ajoute un glucose et la prot doit repasser par les chaperonnes qui essayeront de la replier correctement.

35
Q

Comment voyagent les vésicules d’un endroit à un autre? (2)

A

À l’aide des moteurs protéiques et des éléments du cytosquelette polaires (microtubules et actine F).

36
Q

Les vésicules se forment par (1) (à partir du compartiment donneur) et, une fois rendues à leur destination, elles (2) avec la membrane du compartiment (3).

A
  1. bourgeonnement
  2. fusionnent
  3. cible
37
Q

Quels sont les 3 types de vésicules?

A
  • clathrine
  • COP-I
  • COP-II
38
Q

Comment se forment les vésicules COP-II et où vont-elles?

A

Elles sont formées à partir du RER et sont acheminées vers le Golgi.

39
Q

Comment se forme la vésicule COP-II?

A
  1. Sar1 (GTPase monomérique) est activée par une GEFde la membrane.
  2. Insertion de Sar1 dans la membrane.
  3. Les prots Sec23/24 lient Sar1-GTP et un récepteur de cargaison (cela forme l’int. du manteau protéique des COP-II).
  4. Les prots Sec 13/31 se lient par dessus Sec23/24 et forment l’ext. du manteau protéique de COP-II (forme courbée et leur nb détermine le diamètre de la vésicule).
40
Q

Quels sont les 2 types de prots utilisées pour le ciblage d’une vésicule à une membrane?

A
  • Rabs (GTPase de type Ras)
  • SNAREs (prots de fusion)
    Les 2 travaillent ensemble pour sélectionner la bonne membrane cible.
41
Q

Qu’est-ce que Rab-GTP fait de similaire à Sar1?

A

Rab-GTP s’insère dans la membrane de COP-II lorsqu’elle est activée par un GEF membranaire sur la membrane donneuse de vésicule. Le récepteur de Rab-GTP se trouve sur la membrane cible (acceptrice de la vésicule).

42
Q

Vrai ou faux?
Les Rabs et SNAREs ne participent pas au ciblage des autres vésicules (COP-I et clathrine)?

A

Faux.
Oui elles y participent.

43
Q

Quels sont les 2 types de SNAREs?

A
  • v-SNARE sur la membrane de la vésicule
  • t-SNARE inséré dans la membrane cible
44
Q

Les SNAREs sont des prots (1) qui se trouvent sous forme de (2).

A
  1. membranaires
  2. paires complémentaires
45
Q

Expliques la liaison v/t-SNAREs.

A

la liason v/t-SNAREs est tellement forte que l’eau entre les membranes est expulsée (cela chasse tout ce qui se trouve entre les 2). Sans eau, les 2 couches externes de chaque membrane fusionnent.

46
Q

Une fois la vésicule fusionnée avec la membrane cible, comment faut-il dissocier la paire de SNAREs?

A

Il faut l’énergie de l’hydrolyse d’ATP pour les dissocier (ATPase).

47
Q

Quelles sont les 3 régions du Golgi?

A
  • cis-Golgi
  • médiane-Golgi
  • trans-Golgi
48
Q

Que se passe-t-il dans le cis-Golgi au niveau des vésicules?

A
  • Les vésicules COP-II fusionnent avec le cis-Golgi.
  • Une partie des prots retourneront au RER via les vésicules COP-I.
  • D’autres poursuivront vers le médiane-Golgi et le trans-Golgi.
49
Q

Que se passe-t-il dans le médiane-Golgi au niveau des vésicules?

A

Les prots subissent une maturation de leurs sucres (en plus de celle dans le RER).

50
Q

Que se passe-t-il dans le trans-Golgi au niveau des vésicules?

A

Les prots sont triées et emballées pour leur destination finale:
- endosome/lysosome (clathrine)
- membrane plasmique (COP-I)

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