Cours 8 - Les compartiments cellulaires (mitochondries + chloroplastes) Flashcards

1
Q

Lorsque les protéines doivent trouver leur chemin vers leur “lieu de travail”, elles doivent franchir: (4)

A
  • un pore (formé d’un gros complexe protéique)
  • une membrane (RER, peroxysome)
  • deux membranes (mitochondries et chloroplastes)
  • sortir de la cellule (voie de sécrétion)
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2
Q

Pour organiser les protéines dans la cellule il faut: (3)

A
  • l’énergie (transport actif)
  • l’étiquette (plupart du temps=peptide signal, parfois=sucre)
  • destination (récepteur)
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3
Q

Qu’est-ce que les pores nucléaires permettent aux protéines?

A

Les protéines autorisées peuvent passer de part et d’autre (sous certaines conditions), car il y a une continuité entre le nucléoplasme et le cytoplasme.

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4
Q

Quelle est l’hypothèse sur la formation du noyau et du RE?

A

L’invagination de la membrane plasmique aurait formé le noyau et aurait donné naissance au RE.

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5
Q

Quel élément fait varier la taille de l’ouverture des pores nucléaires?

A

Un centre protéique

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6
Q

Quelle est la différence entre les petites et les grosses molécules pour le passage dans les pores nucléaires?

A
  • petites prot. = diamètre de 9 nm et moins
    peuvent passer (diffuser) à travers le pore par diffusion simple (transport passif).
  • grosses molécules = diamètre de 9-40 nm
    peuvent passer par le pore, mais nécessitent de l’énergie (transport actif) pour agrandir l’ouverture du pore.
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7
Q

Quels sont les 2 signaux que portent les protéines? + abréviations

A
  • Signal d’importation (SLN)
  • Signal d’exportation (SEN)
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8
Q

Quel est le type de récepteur pour chaque signal nucléaire? Et que font-ils?

A
  • les karyophérines importines lient le SLN
  • les karyophérines exportines lient le SEN

elles transportent les prot. à travers le pore nucléaire

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9
Q

Quels sont les 2 sites de liaison des karyophérines?

A
  • site pour le signal (SLN ou SEN) situé sur la prot. à importer ou exporter
  • site pour la Ran-GTP (car besoin d’énergie)
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10
Q

Comment se nomme le centre protéique qui fait varier l’ouverture du pore nucléaire?

A

Le complexe du pore nucléaire (CPN) est un structure modulaire construite à partir des nucléoporines (Nups)

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11
Q

Quelles sont les 4 types de nucléoporines (Nups)? Et que font-ils?

A
  1. Poms: ancrent le CNP dans l’enveloppe cellulaire
  2. Nups de liaison: relient les deux anneaux
  3. Nups asymétriques: attachées aux deux anneaux (les filaments et le panier)
  4. FG Nups: forment le canal central et interagissent avec les karyophérines
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12
Q

Quelles sont les 2 conformations possibles d’une prot. RAS? Et comment fonctionnent-elles?

A
  • RAS-GTP: interagit avec d’autres prot. et a une activité de GTPase en présence de la prot. GEF.
  • RAS-GDP: forme inactive dû à la présence de GAP
  • le GDP est libéré à l’aide de la prot. GEF qui change le GDP en GTP.
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13
Q

Décris en étapes l’importation d’une prot. du cytoplasme vers le noyau.

A
  1. La prot s’attache à l’importine via le SLN dans le cytoplasme
  2. L’importine lie le Ran-GTP unefois rendu dans le noyau grâce à GEF
  3. La prot se détache dans le nucléoplasme grâce à GEF
  4. L’importine libère le Ran-GDP grâce à GAP dans le cytoplasme
  5. L’importine devient dispo pour lier une nouvelle prot. via son SLN
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14
Q

Décris en étapes l’exportation d’une prot. du noyau vers le cytoplasme.

A
  1. L’exportine fixe le Ran-GTP et une prot ayant un SEN
  2. L’exportine relâche la prot et le Ran-GDP dans le cytoplasme
  3. L’exportine repasse dans le pore et revient seule au noyau
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15
Q

Quelle est la majeure différence entre le système d’importation et d’exportation d’une prot (importine vs exportine)?

A
  • Les importines peuvent lier Ran-GTP et SLN seulement 1 à la fois (liaisons mutuellement exclusives).
  • Les exportines peuvent lier Ran-GTP et SEN en même temps.
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16
Q

Quelles sont les 4 voies alternatives de transport?

A
  1. Modèle de diffusion-rétention
  2. Modèle du facteur de transport
  3. Modèle de séquence signal
  4. Modèle médié par la vésicule
17
Q

Qu’est-ce que TOM et TIM?

A

TOM: Transport Outer Membrane
TIM: Transport Inner Membrane

18
Q

Vrai ou faux?
Le récepteur fait partie de TOM.

A

Vrai

19
Q

Comment les chaperonnes Hsp70 cytosoliques aident à faire entrer la protéine?

A

Les prots entrent lorsque les chaperonnes, qui conservaient les prots dépliées, hydrolysent l’ATP et se dissocient,

20
Q

Qu’arrive-t-il avec le signal une fois que la prot est entrée dans la matrice mitochondriale?

A

Le singal est coupé (il ne fait pas partie de la prot finale).

21
Q

Qu’arrive-t-il aux chaperonnes cytosoliques au fur et à mesure que la prot entre dans la mito?

A

Elles sont enlevées petit à petit lorsque le prot entre et de nouvelles chaperonnes (mitochondriales) prennent en charge la prot.

22
Q

Quels sont les étapes de l’importation des prots mitochondriales…

… destinées à la matrice mito?

A
  1. Import via TOM
  2. Passage dans TIM23
  3. Passage dans PAM (hsp70 mito)
  4. Clivage (couper) du peptide signal par MPP
23
Q

Quels sont les étapes de l’importation des prots mitochondriales…

… destinées à la membrane interne?

(provenant du cytosol)

A
  1. Import via TOM
  2. Insertion par TIM22 ou TIM23
    (Transport via chaperonnes Tim9/Tim10 pour arriver à TIM22)
24
Q

Quels sont les étapes de l’importation des prots mitochondriales…

… destinées à l’espace intermembranaire?

A
  1. Import via TOM
  2. Pliage via MIA
25
Q

Quels sont les étapes de l’importation des prots mitochondriales…

… hydrophobes destinées à la membrane externe?

A
  1. Import via TOM
  2. Transport dans l’espace intermembranaire via chaperonnes Tim9/Tim10
  3. Pliage et insertion dans la memb via SAM
26
Q

Quels sont les étapes de l’importation des prots mitochondriales…

… avec hélices-alpha hydrophobes destinées à la membrane externe?

A
  1. Insertion dans memb ext via Mimi (translocateur)
27
Q

Quels sont les étapes de l’importation des prots mitochondriales…

… destinées à la membrane interne?

(produites par la mito)

A
  1. Intégration directe dans la memb int via OXA
28
Q

Qu’arrive-t-il au peptide signal après l’incorporation de la prot à l’endroit désiré? Et aux signaux internes?

A

Le peptide signal (hélice alpha en N-terminal) est coupé par des peptidases. S’il existe des signaux internes, ces derniers ne sont pas coupés.

29
Q

Qu’est-ce que TOC et TIC?

A

TOC: Transport Outer Chloroplaste
TIC: Transport Inner Chloroplaste

30
Q

Quelle est la membrane suplémentaire dans les chloroplastes? Et qu’est-ce que cela demande à une prot?

A

La membrane des thylakoïdes.
Il faut donc un signal supplémentaire pour entrer dans ce 3e compartiment