Cours 6 - Le noyau Flashcards

1
Q

Quels sont les rôles du noyau?

A
  • Protection de l’ADN
  • Protection de le transcription
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Q

Pourquoi le noyau protège et séquestre l’ADN?

A

Car l’information génétique est le plus important et cela évite les collisions avec les protéines moteurs qui bougent dans le cytoplasme

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Q

Quelle est la différence entre la transcription et la traduction?

A

Transcription: gène, ARN pré-messager, ARN messager
Traduction: ARN messager, protéine

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4
Q

Pourquoi le noyau protège la transcription?

A

Le noyau empêche la traduction précoce des ARNm en contrôlant leur sortie vers le cytoplasme

une fois qu’il sort; il est traduit

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5
Q

Pourquoi les procaryotes n’ont pas besoin de noyaux? (2)

A
  • Le cytoplasme des bactéries ne possède pas de moteurs protéiques
  • L’ADN des bactéries est majoritairement sans introns: la trasncription et la traduction ont lieu simultanément dans le cytoplasme (co-transcritption et co-traduction = pas bcp étapes de maturation d’ARNm)
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6
Q

Que sont les chromosomes mitotiques?

A
  • Forme la plus condensée
  • Gros complexes d’ADN et de protéines (chromatine)
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7
Q

Comment se nomme le classement des chromosomes? Et que permet-il d’observer?

A

C’est un karyotype et il permet d’observer les mutations (ex: trisomie 21)

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8
Q

Quelle est la différence entre un intron et un exon?

A
  • Exons : Codent pour la protéine.
  • Introns : Ne codent pas pour la protéine et sont éliminés après transcription
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9
Q

Qu’est-ce qu’une séquence conservée?

A

C’est une séquence d’ADN, d’ARN ou de protéine qui reste inchangée au fil de l’évolution au sein de plusieurs ou d’une même espèce en raison de son rôle crucial dans le fonctionnement biologique des organismes.

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10
Q

Qu’est-ce qu’une séquence codante?

A

Ensemble des codons qui vont déterminer la structure de la protéine résultante

Les mutations ne proviennent pas toujours des séquences codantes

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11
Q

Qu’est-ce qu’une séquence consensus?

A

C’est la séquence conservée. Elle est composée des acides aminés ou nucléotides qui occupent une position donnée le plus fréquemment.
(Séquence où l’on va trouver leplus grand pourcentage des mêmes nucléotides ou acides aminés)

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11
Q

Qu’est-ce qu’une séquence régulatrice?

A

Séquence qui régule le métabolisme de la cellule et qui donne l’ordre pour l’expression des gènes (quand & quantité)

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12
Q

Qu’est-ce que faire le BLAST?

A

C’est d’aligner les séquences d’ADN (en nucléotides) connues chez plusieurs espèces afin d’extrapoler et de comprendre les liens d’évolution entre les espèces.

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13
Q

Quel est le pourcentage de gènes codant pour des protéines dans le génome humain?

A

1.5%

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14
Q

Que représente 50% du génome humain?

A

Des séquences répétées dont la majorité sont mobiles (transposons)

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15
Q

Qu’est-ce que l’ADN répétitif comporte?

A
  • Transposons
  • Des duplications de segments chromosomiques (“crossing-over” inégal durant la méiose)
  • Des séquences simples de satellites (souvent dans les centromères et les télomères)
  • Dans les deux cas, il s’agit des séquences non mobiles
16
Q

Qu’elle est la différence entre les organismes complexes et moins complexes quant à la densité génique?

A

Plus l’organisme est complexe, plus la densité génique est faible (57 gènes pour l’E coli. vs 2 gènes pour l’Homme)

17
Q

Qu’est-ce qui sert à identifier la fonction de chacune des bases du génome?

A

ENCODE (Encyclopedia of DNA Elements)

18
Q

Quelle est la particularité de la composition du génome d’une bactérie?

A

Chez les bactéries, on a principalement des séquences codant pour des protéines

19
Q

Quel est le premier niveau de compaction de l’ADN chez les eucaryotes?

A

Le nucléosome

20
Q

Quelle est la différence entre les fibres condensées et les fibres étendues (2 niveaux de compaction)?

A
  • Fibres condensées: environ 30 nm de largeur et c’est la région non transcrite
  • Fibres étendues: environ 10 nm de largeur, perles sur un fil et c’est la région active pour la transcription
21
Q

De quoi est constitué le nucléosome?

A

les nucléosomes sont les bobines autour desquelles s’enroulent 146 paires de bases. Chacun est composé de 8 histones (2 de chaque type).

22
Q

Quels sont les 5 types d’histones?

A
  • H2A
  • H2B
  • H3
  • H4
  • H1 (fait pas partie du nucléosome mais stabilise l’ADN sortant des nucléosomes)
23
Q

Quelles sont les 2 régions distinctes des histones?

A
  • Queue N-terminale variable qui permet la régulation
  • Queue c-terminale conservée qui permet l’assemblage du nucléosome
24
Q

Quelles sont les 4 modifications possibles pour les histones?

A
  • Acétylation: cache la charge + sur les lysines des histones, donc perte d’interaction avec l’ADN chargé -, donc perte des liens ioniques, donc décondensation de l’ADN et dispo pour autres prots
  • Phosphorylation: P est ajouté sur les sérines et il va neutraliser une charge + voisine de le lysine ou d’arginine, P peut aussi augmenter l’effet de répulsion de l’ADN
  • Méthylation et ubiquination: l’ajout des groupements rend l’histone compatible à d’autres prots permettant des changements de configuration de la queue N ou d’autres possibilités avec interaction prot-prot.
25
Q

Comment se nomment l’ADN en fibres de 11 nm pouvant être transcrit en ARN et l’ADN en fibres de 30 nm ne pouvant pas être transcrit?

A
  • Euchromatine
  • Hétérochromatine
26
Q

Comment se nomment les prot qui donnent la possibilité de faire des boucles avec l’hétérochromatine?

A

Ce sont les protéines Sir (silent information regulator=condensation de plus)
-Les queues N des histones doivent porter les modifs compatibles avec les prots Sir
- plus condensé=moins accessible aux prots lors de la transcription , réplication, recombinaison (pas de transcritption dès qu’il y a de l’hétérochromatine)

27
Q

Le nucléole

  • Qu’est-ce que la zone de transcription des ARN ribosomaux?
  • Qu’est-ce que le site d’assemblage des sous unités riobosomales?
A
  • La zone fibrillaire (centre du nucléole)
  • La zone granuleuse (périphérie du nucléole)
28
Q

Le ribosome

De quoi sont composées les sous-unités du ribosome et où s’effectue leur formation?

A

Elles sont composées d’ARN(ARNr) et de prot. Leur formation s’effectue dans le noyau (près du nucléole).

29
Q

Quels sont les 3 sites du ribosome et à quoi servent-ils?

A
  • Site A qui fixe la molécule d’ARNt entrante portant un acide aminé
  • Site P qui fixe la molécule d’ARNt liée à l’extrémité en croissance de la chaîne peptidique
  • Site E qui est la sortie (exit) de l’amino-acyl-ARNt
30
Q

Quelles sont les 4 étapes du fonctionnement du ribosome?

A
  1. Le ribosome trouve l’ARNt correspondant à la séquence ARNm
  2. L’ARNt dans le site E abandonne le ribosome
  3. Le peptide porté par le ARNt du site P existant se lie à l’acide aminé sur le nouveau site A ARNt
  4. Le ribosome se déplace à condition que le codon suivant soit vide
  5. Le ribosome peut donc accepter un autre ARNt et répéter l’élongation jusqu’à la fin de la chaîne d’ARNm
31
Q

Quelles sont les 6 étapes de la biogenèse des ribosomes?

A
  1. Transcription des composants (ARNr dans le nucléole et ARNm à l’ext du nucléole)
  2. Traitement, épissage des prés-ARNr (enlever les introns)
  3. Modif des prés-ARN, RP et AF (prot ribosomales et facteurs d’assemblage reviennent dans le noyau)
  4. Assemblage des sous-unités en périphérie du nucléole (importation nucléaire de RP et d’AF)
  5. Transport: exportation de pré-ribosomes vers le cytoplasme)
  6. Contrôle-qualité et surveillance
32
Q

Comment se nomment les complexes ARN-prot qui épissent les ARNm durant leur maturation?
Et où sont-ils assemblés/recyclés?

A

Ce sont les snRNPs: ils lient les séquences spécifiques aux extrémités des introns (ce qui permet de les enlever).
Ils sont assemblés/recyclés dans les corps de Cajal.

33
Q

Qu’est-ce qui modifie et coupe les ARNr précurseurs durant leur maturation?

A

Les snoRNPs