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Cours 8 - Épissage de l'ARN Flashcards

1
Q

Vrai ou faux? On retrouve des exons et introns chez les procaryotes

A

Faux, juste chez les eucaryotes

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Q

À quel moment l’ADN est épissé?

A

Lorsqu’il est transcrit en ARN

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3
Q

Plus l’organisme est complexe, plus/moins il a d’introns

A

Plus

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4
Q

Vrai ou faux? Les introns sont exclus dans le pré-ARN

A

Faux

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Q

Vrai ou faux? La transcription reconnait les introns

A

Faux, donc ils sont inclus dans le pré-ARNm

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6
Q

Vrai ou faux? La traduction discrimine les introns et les exons

A

Faux, donc il faut enlever les introns avant la traduction

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7
Q

Que retrouve-t-on à la jonction intron/exon ?

A

Séquences spécifiques conservées

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8
Q

Quelles sont les trois séquences nécessaires pour l’épissage ?

A

Site d’épissage 5’ donneur
Site d’épissage 3’ receveur
Site de branchement

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9
Q

De quoi est suivi le site de branchement?

A

Séquence riche en pyrimidine

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10
Q

Quelle est la séquence du site d’épissage 5’ pour le spliceosome majeur?

A

GU

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11
Q

Quelle est la séquence du site d’épissage 3’?

A

AG

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12
Q

Quelle est la séquence du site de branchement ?

A

A dans une séquence précise
YNYURAY

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13
Q

Quelles sont les premières réactions qui ont lieu lors de l’épissage?

A

2 réactions de trans-estérification successives
Les liens phosphodiesters dans le pré-ARNm sont brisés puis reformés

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14
Q

De quoi est fait le spliceosome?

A

150 protéines et 5 ARN: snARN U1 U2 U4 U5 U6

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15
Q

La majorité des fonctions du spliceosome est réalisée par les protéines ou l’ARN?

A

L’ARN

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16
Q

Quel est le rôle de l’ARN dans le spliceosome?

A

Réperer les séquences conservées aux jonctions intron/exon
Catalyser la réaction d’épissage

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17
Q

Quels sont les ARN qui composent le spliceosome?

A

U1 U2 U4 U5 U6

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18
Q

Que sont les snRNP?

A

Complexes ARN-protéines qui forment le spliceosome

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19
Q

Quel est le rôle des snRNP?

A

Basically la même réponse que pour l’ARN: reconnaitre les site d’épissage 5’ et site de branchement
Rapprocher ces 2 sites
Catalyser les réactions de clivage et ligation de l’ARN

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20
Q

Quelles protéines peuvent se lier au site d’épissage 5’?

A

U1 et U6

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21
Q

Quelles protéines peuvent se lier au site de branchement?

A

U2 et BBP

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22
Q

Explique le processus d’épissage

A

word

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23
Q

Quelle est la première protéine à se lier lors de l’épissage?

A

U1 sur le site 5’

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24
Q

Quelle protéine se lie au site de branchement, qui déplace BBP? Elle est aidée de qui?

A

U2, aidée par U2AF

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25
Qu'est ce que l'auto-épissage? Explique son mécanisme
Introns qui s'éliminent eux-mêmes sans ARN externe ou protéines L'intron se replis en une configuration précise au sein du pré-ARN et auto catalyse la réaction d'épissage Ça imite le repliement créé par l'interaction de U2 et U6
26
Comment l'ARNpol aide à prevenir des erreurs lors de l'épissage?
L'ARNpol transporte des protéines qui jouent un rôle dans l'épissage de l'ARN. Ces protéines sont transférées de l'ARNpol vers le pré-ARNm quand il y a rencontre d'un site d'épissage 5'. Il y aura un recrutement des protéines au site d'épissage 3'
27
À quoi servent les protéines SR ?
Elles se lient au séquences "amplificateurs d'épissage exoniques" (ESE), des séquences dans les exons. Les SR qui sont liées à ces séquences interagissent avec des composantes du spliceosome, donc qui les recrute proche. Ainsi, les composantes se lient plus efficacement aux bons sites d'épissage, et non ailleurs trop loin des exons. SR recrute U2AF au site 3' et U1 au site 5'
27
Comment fonctionne le processus d'épissage avec le spliceosome mineur?
Au lieu de U1, on a U11 Au lieu de U2, on a U12 Mêmes étapes, mais les séquences de reconnaissance aux extrémités des introns sont différentes.
28
Quels sont les séquences des sites 5' et 3' pour le spliceosome mineur?
5' : AU 3' : AC
29
Quelle proportion des gènes humains subit un épissage alternatif?
75%
30
La plupart des ARN qui subissent un épissage alternatif donne combien d'ARNm?
2 (mais peut être beaucoup plus)
31
Que veut dire "protéines isoformes" ?
Qui viennent du même pré-ARN
32
Quels sont les différents types d'épissages alternatifs ?
Exon éliminé (sauté) Exon allongé: tous les exons sont là, mais il reste un peu d'intron Intron retenu: l'intron au complet est encore là Épissage trans alternatif : 2 exons qui viennent de deux ARNm différents
33
Qu'est ce que l'exclusion par encombrement stérique?
Si des protéines se lient trop proches sur un exon, le spliceosome ne peut pas se lier. donc cet exon sera sauté
34
Qu'est ce que l'exclusion par combinaison de sites d'épissage majeur et mineur?
Aucun spliceosome peut enlever un intron contenant une combinaison de sites mineur/majeur Aucun des deux spliceosomes ne peut fonctionner efficacement, car ils ne reconnaissent pas simultanément ces signaux mixtes. Par exemple: GU AC Le 5' est majeur, le 3' est mineur.
35
Sur quels sites se lient les protéines qui régulent l'épissage?
Exonic ou intronic splicing enhancer (ESE ou ISE)
36
Qu'est ce qu'un amplificateur exonique ou intronique d'épissage?
ESE: amplifie l'épissage, dans l'exon ISE: dans l'intron Possèdent un domaine de liaison à l'ARN et aux protéines de la machinerie d'épissage
37
Les protéines SR sont des amplificateurs ou répresseurs?
Amplificateurs
38
Les protéines de la famille hnRNP sont des réprésseurs ou amplificateurs?
Répresseurs
39
Quel est le rôle des protéines hnRNP?
Répresseurs d'épissage. Ils possèdent un domaine de liaison à l'ARN Encombrent le site de liaison des protéines de la machinerie d'épissage, donc empêche qu'ils se lient.
40
Comment fonctionne le répresseur hnRNP1 ?
Deux façons: 1. Deux hnRNP1 se lient à l'extrémité des deux exons et masquent l'intron. Le spliceosome ne peut donc pas se lier. 2. Un hnRNP1 se lie au site poly Y, qui va en lier d'autres par système coopératif. Le spliceosome ne peut donc pas lier l'intron car il est encombré
41
Quand a lieu l'édition de l'ARN?
Après la transcription et avant la traduction
42
Quels sont les deux mécanismes utilisés lors de l'édition de l'ARN?
Désamination d'adénines ou cytosines Insertion/délétion d'uridine par un ARN guide
43
Sur quelles bases la désamination a lieu?
Cytosines ou adénosines
44
Lors de la désamination, la cytosine devient quoi?
Uridine
45
La désamination de l'adenosine est catalysée par quelle enzyme?
ADAR
46
L'ADAR est une enzyme qui sert à quoi?
Désaminer l'adénosine
47
La désamination de l'adénosine donne quoi?
Inosine
48
Quelle enzyme catalyse la désamination des cytosines?
Cytidine désaminase
49
Que reconnaissent les désaminases sur l'ARN?
Séquence spécifique ou structure secondaire
50
Lors de la traduction, l'inosine est reconnu comme quelle base?
Guanine
51
Quelle base est reconnue comme la guanine lors de la traduction?
Isonine
52
Où a lieu d'édition de l'ARN par désamination?
Dans certains tissus, de façon régulée
53
Où a lieu l'édition de l'ARN par insertion de U?
Dans les mitochondries de trypanosomes
54
Quelle structure servent à l'insertion de U dans l'édition de l'ARN?
ARN guides
55
Quelles régions comportent les ARNg, et à quoi ils servent?
Extrémité 5': ancrage, dirige l'ARNg vers la région de l'ARNm à édier Région d'édition: région qui détermine la position d'insertion des U Extrémité 3': région poly-U (on connait pas le rôle)
56
Quel est le rôle de l'extrémité 5' de l'ARNg?
Ancrage, dirige l'ARNg vers la région de l'ARNm à éditer
57
Quel est le rôle de la région d'édition de l'ARNg?
région déterminant la position d’insertion des U
58
De quoi est formé l'extrémité 3' de l'ARNg?
région poly U
59
Les ARNm matures représentent _% des ARN dans le noyau
1-5%
60
Qu'est ce qui régule quels ARN sont bons à transportés hors noyau ou non?
Protéines qui favorisent/inhibent le transport
61
Les protéines SR favorisent ou inhibent le transport des ARNm hors noyau?
Favorisent
62
Les snRNP favorisent ou inhibent le transport des ARNm hors noyau?
Inhibent
63
L'exportation des ARNm hors noyau se fait via quelle structure?
Pores de la membrane nucléaire
64
Les pores de la membrane nucléaire permet le passage de molécules < _ kDa
< 50 kDa
65
Pourquoi les snRNP inhibent le transport des ARNm hors noyau?
Les snRNP font partie du spliceosome.Tant que le spliceosome est encore attaché, cela signale que l’ARN n’est pas encore prêt à être exporté.Cela évite que des ARN non matures (avec introns ou erreurs) sortent trop tôt.
66
Rappel: on retrouve des introns seulement chez les eucaryotes !
67
Quelle séquence retrouve-t-on au site d'épissage 5' ?
GU
68
Quelle séquence retrouve-t-on au site d'épissage 3'?
AG
69
p14 !!! jonction triple
70
Qu'est ce que l'épissage trans?
Un exon est formé de deux exons venant de deux ARNm différents
71
Vrai ou faux? L'épissage nécessite beaucoup d'ATP
Vrai
72
Que sont les snRNA?
ARN du spliceosome
73
Qu'est ce que le site de branchement ?
A dans la séquence YNYURAY (Dans l'intron)
74
Lequel est plus long, l'intron ou l'exon?
Intron (3000 nucléotides) Exon (150 nucléotides)
75
Quelles sont les erreurs qui peuvent arriver lors de l'épissage?
1. Saut d'un exon 2. Sélection d'un pseudo-site (qui ressemble à une séquence d'intron)
76
Les protéines SR se lient à quoi?
Elles reconnaissent des sites d'épissage proches des exons: les ESE ESE: séquences amplificateurs d'épissage exonique.
77
Les protéines SR recrutent quels snRNA sur l'ARN?
U2AF au site 3' U1 au site 5'
78
Quel est le but de l'épissage alternatif?
produire plusieurs protéines différentes à partir d’un d'un seul pré-ARNm
79
Qu'est ce que l'édition de l'ARN?
Modification de la séquence. On insère, enlève ou modifie des bases de l'ARN
80
Quelle est la conséquence de l'édition de l'ARN par insertion de U?
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