Cours 7 - Altérations, réparations et mutations de l'ADN !

Question 1

De quoi dépend la probabilité d’apparition d’une mutation?

Answer 1

La fréquence de dommages
La vitesse de réparation
Du potentiel mutagène des dommages

Question 2

Quelles sont les causes de mutations?

Answer 2

1. Erreurs de réplication (la machinerie n’est pas 100% fidèle)
2. Les lésions chimiques ou physiquess:
   - L’ADN subit des agressions par des agents chimiques, naturels ou artificiels, et par des radiations qui peuvent modifier les bases et casser l’ADN.
   - Ça crée des mutations (définitif) et peut bloquer la réplication/transcription

Question 3

Qu’est ce qu’une mutation?

Answer 3

Tout changement de séquence de l’ADN

Question 4

Qu’est ce qu’une substitution dans une mutation?

Answer 4

Changement d’une base par une autre, transition ou transversion

Question 5

Qu’est ce que MutS?

Answer 5

Protéine qui reconnait les mésappariement chez e coli

Question 6

Comment MutS reconnait les mésappariements?

Answer 6

Par la distortion que ça crée sur le backbone de l’ADN

Question 7

Explique le fonctionnement de MutS

Answer 7

1. Il inspecte et reconnaît le mésappariement
2. Il recrute MutL, puis MutH, qui lui va faire une incision près du mésappariement (sur le brin non-méthylé) au niveau du site GATC
   IMPORTANT: MutL+MutH sont sur le mismatch. MutS va sur GATC (??)
3. MutH est activé
4. MutH clive en 5’ de GATC et en 3’ du mésappariement
5. Une hélicase enlève le bout d’ADN contenant le mésappariement
6. ADN pol III et la ligase remplissent la brèche

Question 8

Quel est le rôle de DAM méthylase?

Answer 8

Elle méthyle le A de la séquence GATC

Question 9

p19

Question 10

Une cytosine désaminée donne:

Answer 10

Uracile

Question 11

Quelle est la base la plus fréquemment désaminée? Elle va donner quoi?

Answer 11

Cytosine, va donner uracile

Question 12

L’uracile s’apparie à quoi?

Answer 12

Adénine

Question 13

Une adénine désaminée donne:

Answer 13

Hypoxanthine

Question 14

Un uracile est une _ désaminée

Answer 14

Cytosine

Question 15

Un hypoxanthine est une _désaminée

Answer 15

Adénine

Question 16

À quoi s’apparie une hypoxanthine?

Answer 16

Cytosine

Question 17

Une guanine désaminée donne _

Answer 17

Xanthine

Question 18

À quoi se lie une xanthine?

Answer 18

Cytosine

Question 19

Qu’est ce que du 5’méthylcytosine?

Answer 19

Cytosine méthylé

Question 20

La désamination d’une 5’méthylcytosine donne quoi?

Answer 20

Thymine

Question 21

C’est quoi une dépurination?

Answer 21

Hydrolyse spontanée de la liaison N-Glycosidique (lien entre base et sucre). Crée le site AP (désoxyribose sans purine)

Question 22

Une oxydation qui dommage l’ADN vient de source exogène ou endogène?

Answer 22

Peut être les deux

Question 22

Une oxydation de l’ADN peut être causée par quoi?

Answer 22

Endogène: radicaux libres créés lors de la chaine respiratoire
Exogène: radiations, UV, agents chimiques

Question 23

L’oxydation de quelle base est la plus fréquente?

Answer 23

Guanine

Question 24

La guanine oxydée s'apparie avec quelle base?

Answer 24

Adénine

Question 25

Une dépurination est de source endogène ou exogène?

Answer 25

Endogène

Question 26

Qu'est ce qu'une alkylation?

Answer 26

Groupements méthyle (CH3) ou éthyle (CH2CH3) sont ajoutés sur les phosphates ou les bases de l’ADN

Question 27

L'alkylation est de source exogène ou endogène?

Answer 27

Exogène

Question 28

Quel est un site sensible à l'alkylation dans les bases?

Answer 28

Oxygène du carbone 6 de la guanine

Question 29

Que génère l'oxygène du carbone 6 de la guanine quand il est alkylé?

Answer 29

O6-méthylguanine

Question 30

O6-méthylguanine peut s'apparier à quelle base?

Answer 30

Thymine

Question 31

L'ADN absorbe les longueurs d'ondes près de _nm

Answer 31

260nm

Question 32

Les UV sont entre _ et _ nm

Answer 32

100-400

Question 33

Quelles sont les conséquences directes lorsque les bases absorbent les UV?

Answer 33

Fusion photochimique de 2 pyrimidines adjacentes. (voir word): 1. Dimères cyclobutaniques de pyrimidines (CPD) 2. Photoproduit pyrimidine (6-4) pyrimidone (6-4PP)

Question 34

Quels sont les dommages indirects des UV?

Answer 34

Excitent d'autres chromophores cellulaires: ex tryptophane, sérotonine, etc. Ces chromophores excités génèrent des ROS. L'ADN se fait oxyder par ces ROS

Question 35

Que causent les rayons gamma et x sur l'ADN?

Answer 35

Cassures bicaténaires (brise la double-hélice). Ils attaquent le désoxyribose du squelette.

Question 36

Que sont les analogues de bases?

Answer 36

Composés qui se substituent aux bases normales

Question 37

Qu'est ce que le 5-BrDU?

Answer 37

Analogue de base le plus mutagène Analogue de la thymine S'apparie à la guanine

Question 38

Que provoquent les agents intercalants dans l'ADN?

Answer 38

Addition ou délétion d'une ou plusieurs paires de bases

Question 39

Pourquoi les addition/délétions causées par les agents intercalants sont problématiques?

Answer 39

Problème pour la traduction: le reading frame est décalé

Question 40

p38

Question 41

Quelles sont les deux conséquences principales des altérations de l'ADN?

Answer 41

- Empêchent la réplication/transcription - Provoquent un changement permanent de l'ADN après réplication

Question 42

Qu'est ce que la photoréactivation?

Answer 42

Réparation des dommages par réversion directe: - La photolyase utilise l'énergie de la lumière pour rompre les liens covalents entre les pyrimidines adjacents (utilise la lumière UV longue pour réparer les dommages fait par les courts.) - Présent chez les procaryotes et eukaryotes inférieurs.

Question 43

Quelle enzyme répare les O6-méthylguanine? Comment elle fonctionne?

Answer 43

Méthyltransférase Enlève le méthyl de la guanine et le transfère sur ses cystéines Enzyme suicide :'(

Question 44

Comment fonctionne l'excision de base (BER)?

Answer 44

Enzyme spécifique qui va enlever seulement la base endommagée. Une glycosylase différente pour chaque type de dommage

Question 45

Explique le mécanisme de BER (glycosylase)

Answer 45

1. Glycosylase reconnaît et enlève la base altérée en hydrolysant le lien glycosidique entre la base et le désoxyribose 2. AP endonucléase enlève le site AP qui a été généré 3. ADN pol et une ligase remplissent la brèche

Question 46

Vrai ou faux? NER et BER sont spécifiques de lésion

Answer 46

Faux, seulement BER (un glycosylase par lésion) NER reconnaît plutôt des déformations

Question 47

NER est responsable de reconnaître quels dommages?

Answer 47

Ceux non-reconnus par les autres mécanismes - Reconnaît une déformation de la double hélice

Question 48

Explique le fonctionnement de NER chez les procaryotes

Answer 48

word lol

Question 49

Explique le fonction de NER chez les eucaryotes

Answer 49

word

Question 50

Comme NER est générale, pourquoi on a besoin de la BER?

Answer 50

1. BER est moins énergivore 2. Ce n'est pas tous les dommages qui créent une distorsion. Donc, NER passerait à côté

Question 51

Qu'est ce que la synthèse translésionnelle?

Answer 51

Permet de synthétiser de l'ADN, lorsqu'un dommage n'a pas été réparé et que l'ADNpol est bloquée

Question 52

Explique la translésion chez les mammifères

Answer 52

1. L'anneau coulissant PCNA est ubiquitiné suite à un blocage de l'ADNpol par un dommage 2. PCNA-ubi recrute ADNpol translésionnelle

Question 53

Vrai ou faux? NER et BER ont un brin matrice comme modèle

Answer 53

Vrai

Question 54

Lors de cassures bicaténaires, qu'est ce qu'on utilise comme modèle?

Answer 54

Chromosome homologue

Question 55

Quelles peuvent être des causes de cassures bicaténaires?

Answer 55

Radiations ionisantes/agents mutagènes qui causent des cassures directement ou via un blocage de la fourche de réplication

Question 56

Explique le processus de la recombinaison homologue

Answer 56

word

Question 57

Explique le processus de recombinaison avec cassure bicaténaire

Answer 57

!!à faire

Question 58

rendu p64