Cours 1 - ADN et ARN Flashcards

1
Q

Qu’est ce que la pangénèse ?

A

Théorie sur l’hérédité: Transmission, au cours des rapports sexuels, de fragments corporels miniaturisés: cheveux, ongles, veines, artères, tendons et os. Particules invisibles

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2
Q

Qui a inventé le modèle expérimental du pois?

A

Mendel

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3
Q

Qui a inventé le mouvement de l’eugénisme?

A

Galton

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4
Q

Qui a écrit “le déclin de la grande race”

A

Grant

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5
Q

Qu’est ce que Watson a découvert?

A

ADN est une longue molécule composée de 4 bases différentes

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6
Q

Qu’est ce que Rosalind Franklin a découvert?

A

le contenu en eau de l’ADN cristallisé rend impossible un modèle avec armature centrale. Favorise plutôt armature externe.

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7
Q

De quoi est constitué l’ADN?

A

Chaines polynucléotidiques

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8
Q

Dans la structure en hélice de l’ADN, vers où se projettent les bases azotées?

A

vers l’intérieur

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9
Q

Comment se forme un nucléotide par condensation?

A

Le phosphate et le désoxyribose forment un lien phophoester. La base et le désoxyribose forment un lien glycosyle (voir p25)

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10
Q

Quelles sont les bases PURINES

A

AG

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11
Q

Quelles sont les bases pyrimidine

A

CT

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12
Q

L’adénine et la cytosine peuvent prendre deux états tautomériques, lequel est préférentiel

A

AMINO et imino

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13
Q

La guanine et la thymine peuvent être dans deux états tautomériques, lequel est préférentiel

A

CÉTO et énol

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14
Q

Pourquoi les bases doivent être dans leur état tautomérique préférentiel ?

A

pour que l’appariement soit possible

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15
Q

C’est quoi des états tautomériques?

A

États stables - en équilibre

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16
Q

Par quels liens chimiques 2 bases azotées se lient?

A

liens H p29

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17
Q

Qu’assurent les liens H entre les bases?

A

Stabilité thermodynamique de l’hélice
Spécificité d’appariement des paires de bases

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18
Q

Vrai ou faux? les bases azotées sont hydrophobes

A

vrai

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19
Q

L’armature sucre-phosphate est hydrophile ou hydrophobe?

A

Hydrophile

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20
Q

Qu’est ce qui stabilise la double hélice ? 3

A
  1. L’entropie: Les liasons H des H2O sont très mobiles en solutions. Chaque lien H entre deux bases vient de la disparition d’un lien H avec de l’eau. Quand les deux brins se séparent, l’eau s’aligne le long des bases de la chaine. Quand ils se réapparient, les mol d’eau sont chassées. Ça crée de l’entropie.
  2. L’empilement des bases: Les pb s’attirent avec les forces de Van der waals. Ça stabilise
  3. Influences hydrophiles/phobes: armature sucre-phosphate= hydrophile, reste proche de l’eau. pb: non polaire. Cette dualité stabilise. Ça crée une pression qui “colle” les deux brins
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21
Q

Quelles sont les bases qui s’apparie ensemble?

A

AT CG

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22
Q

Pourquoi le pivotement des bases a lieu?

A

La base retournée devient le ligand pour certaines enzymes, qui permettent:
- Méthylation des bases
- Recombinaison homologue
- Réparation de l’ADN

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23
Q

Le pas de la double hélice est à droite ou à gauche?

A

À droite

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24
Q

Quelles sont les différences entre les conformations A, B et Z de l’ADN

A

B: 10 pb/tour, grand et petit sillon
A: 11 pb/tour, grand sillon étroit et petit sillon large et - profond
Z: 12 pb/tour, grand sillon applatit, petit sillon très étroit et + profond

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25
Quand retrouve-t-on la forme A de l'ADN?
Dans une solution pauvre en eau
26
Avec ADN à hélice droite, le lien glycosyle est en configuration syn ou anti?
anti
27
Avec ADN à hélice gauche, le lien glycosyle est en configuration syn ou anti?
Anti pour les résidus pyrimidiques TC Syn pour les puriques AG
28
Où est souvent retrouvée l'ADN Z
en aval des promoteurs
29
Quel est le sens de l'enroulement pour L'ADN a b et z ?
A: droite B: droite Z: gauche
30
Quelle est la configuration de la liaison glycosyle pour l'ADN a b et z?
A: anti B: anti Z: anti pour les C, syn pour les G
31
Quelles sont les deux configurations que peut prendre la liaison glycosule?
Syn ou anti
32
Avec ADN à hélice à droite : lien glycosyle toujours en configuration _. Pour une hélice à gauche, _ pour TC et _ pour AG
anti anti pour TC syn pour AG
33
De quoi dépend la temp de fusion de l'ADN?
Contenu en GC Force ionique de la solution (concentration saline)
34
Plus l'ADN contient des GC, plus la temp de fusion est _
haute
35
Plus la solution d'ADN a une force ionique élevée, plus la temp de fusion est _
haute
36
Comment la force ionique de la solution influence la temp de fusion de l'ADN?
les sels vont neutraliser les charges négatives des groupements phosphates, donc besoin d'une plus grande temp pour séparer les doubles brins
37
Quelle est la différence entre l'ADN bactérien/plasmidique et humain? (la forme)
bactérien: circulaire Humain: chromosomes linéaires mais surenroulés
38
Les 2 brins d’un ADNccc ne peuvent être séparés sans que _
qu’une liaison covalente ne soit rompue
39
Qu'est ce que le nombre d'enlacement? (Lk)
C'est le nombre de fois qu'un brin d'ADNccc (circulaire lié covalent) doit passer à travers l'autre pour que les deux brins soient séparés. Toujours un nombre entier!!
40
Le nombre d'enlacement est la somme de quelles composantes?
Nombre de torsions et de supertours Torsions: nb de tours d’hélice d’un brin autour de l’autre Supertours: torsions visibles dans la molécule
41
Un superenroulement négatif (Wr < 0) _ l’ADN et _ la transcription.
détend, facilite
42
Un superenroulement positif (Wr > 0) _ l’ADN et _ la transcription
compacte, rend plus difficile
43
Quelles sont les deux formes de supertours dans un ADN surenroulé&
Plectonémique Toroïdaux
44
Que fait l'enzyme Dnasel sur l'ADNccc?
Élimine le surenroulement et relâche l’ADN: les 2 brins peuvent tourner l’un autour de l’autre
45
Qu'est ce que le surenroulement négatif?
forme d’emmagasinage d’énergie libre disponible pour faciliter les processus biologiques que nécessite la séparation des 2 brins de la double hélice (réplication, transcription).
46
la séparation des 2 brins de l’ADN est plus _ dans des régions à surenroulement négatif que dans les régions relâchées.
facile
47
Dans quelles structures on retrouve l'ADN des cellules eucaryotes
Nucléosomes
48
Comment s'appelle le coeur protéique de l'ADN
histones
49
Que sont les topoisomérases?
enzymes qui modifient la topologie de l’ADN en coupant et reliant les brins pour soulager les contraintes de torsion causées par le surenroulement. Utilisées pour la réplication, transcription, sépération des chromosomes)
50
Que fait la topoisomérase I?
Coupe un seul brin d’ADN. Il passe le brin non coupé à travers la brèche et referme derrière la coupure. Donc, modifie le nb d'enlacements de +1 N'UTILISE PAS D'ATP ! p59
51
Que fait la topoisomérase II?
Coupe transitoirement les 2 brins de l’ADN, passe la partie intacte de l’ADN à travers la brèche et referme la coupure derrière en reformant 2 liens phosphodiesters. Modifie le nb d'enlacement de 2. UTILISE ATP p61
52
Les topoisomérases forment un _ pour passer les segments d’ADN un à travers l’autre
pont enzymatique
53
Lequel est plus rapide sur un gel d'électrophorèse, ADn circulaire ou surenroulé?
surenroulé
54
Comment l'ion éthidium impact l'ADN?
glisse entre les bases de la double hélice grâce à sa structure plate. ça déroule l'ADN. l'enlacement du ADNccc ne change pas
55
Quelle sont les 3 différences de l'ARN p/r à l'ADN
1. Contient du ribose au lieu de désoxyribose 2. Contient Uracile au lieu de thymine 3. Généralement monocaténaire
56
À quoi sert des ARNm
transporte l’information génétique depuis le noyau (chez les eucaryotes) jusqu’aux ribosomes où elle est traduite en protéine.
57
À quoi sert des ARNt
adaptateurs entre les codons des ARNm et les acides aminés correspondant
58
À quoi sert les ARNr?
composent les ribosomes
59
À quoi servent les micro-ARN (miARN)
rôle de régulation
60
Vrai ou faux? Certains ARN sont des enzymes
Vrai
61
Quelles sont les structures secondaires que peuvent former les ARN?
Épingle à cheveux, hernies, simples boucles p71
62
72-73
63
Que sont les pseudo-noeuds?
se forme à partir d'une structure en tige et boucle, lorsque des nucléotides de la boucle s'apparient avec une autre région de l'ARN situé à l'extérieur de la tige.
64
L’ ARN peut se replier et former des structures tertiaires complexes Triplet de bases _
U:A:U
65
Que sont les ribozymes?
ARN enzymes.
66
Quelle partie d'un ribozyme peut catalyser une réaction?
la partie ARN
67
Quel est le rôle de la Rnase P
Ribonucléase impliquée dans la production des ARNt à partir d’un ARN précurseur
68
À quoi sert la partie protéique de la Rnase P?
facilite l’association du substrat à la partie ARN en neutralisant les charges négatives du squelette sucre-phosphate
69
À quoi sert les ribozyme à tête de marteau?
segment d'ARN qui catalyse le clivage et la jonction réversibles d'un site spécifique sur une molécule d'ARN. Il fonctionne en se repliant sur lui-même pour cliver (couper) un autre ARN en un point précis, sans avoir besoin de protéines.
70
Que sont les viroïdes?
Agents subviraux qui existent à l'intérieur des cellules en tant que particules d'ARN uniquement, sans capside ni enveloppe. COntient un seul ARN circulaire qui contient êu de nucléotides
71
Vrai ou faux? Dans un viroïde, l'ARN ne code aucune protéine
vrai
72
Qu'arrive-t-il quand l'ARN de viroïde est répliqué dans la cellule?
produit plusieurs copies de lui-même sous forme d'un long ARN unique
73
Les copies isolées de viroïdes sont produites par clivages répétés de cette longue molécule sous l’action d’un _
ribozyme
74
p80 chat
75
Quelle est la structure du ribozyme à tête de marteau?
p81 Trois tiges en double hélice (I, II et III) entourent ribonucléotides non hélicoïdaux = coeur catalytique du ribozyme.