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Diversité Microbienne > Cours 7 > Flashcards

Cours 7 Flashcards

1
Q

Définition de communauté

A

L’ensemble des micro-organismes qui habitent dans une niche écologique particulière

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Q

Définition de population

A

Groupe d’individus de la même espèce défini dans le temps et dans l’espace

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3
Q

Pourquoi n’importe qui peut interagir avec n’importe qui? Comment est ce possible?

A

Les acides aminés sont identiques
Les bases azotées sont identiques

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4
Q

Nommez les 4 interactions conflictuelles

A

La compétition
L’amensalisme
La prédation
Le parasitisme

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Q

La quelle des interactions conflictuelles est la plus répandue?

A

La compétition

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6
Q

Expliquez la compétition

A

Interaction dans laquelle les partenaires utilisent la même ressource

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7
Q

Expliquez en bref l’amensalisme

A

C’est une interaction de type négative-neutre ( 1 des 2 bactérie va être en compétition et l’autre va être neutre)

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8
Q

Expliquez la prédation

A

Élimination instantanée d’un organisme par un autre (relation négative (proie) bénéfique (prédatrice))

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9
Q

Expliquez le parasitisme

A

Interaction durable négative pour l’hôte parasité elle peut être définitive ou temporaire (cycle de reproduction)

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10
Q

Nommez les 3 interactions bénéfiques

A

Le commensalisme
La pro-coopération
Le mutualisme

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11
Q

Expliquez le commensalisme

A

C’est la seule interaction bénéfique pour laquelle les effets positifs ne s’exercent que sur l’un des 2 partenaires. Aucun effet négatif pour les 2 partenaires.

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12
Q

Expliquez la pro-coopération

A

Relation facultative à bénéfice réciproque. Les 2 partenaires collaborent pour survivre dans certains milieux ou certaines conditions seulement.

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13
Q

Quel autre nom peut on donner au mutualisme

A

La symbiose

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14
Q

Expliquez le mutualisme

A

Relation obligatoire à bénéfice réciproque

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15
Q

Définition de adaptation

A

Ensemble de caractéristiques morphologiques et physiologiques qui permet aux organismes de se multiplier dans un biotype donné

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16
Q

Définition d’adaptabilités

A

Capacité à l’adaptation

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17
Q

Définition de fitness

A

Capacité d’un organisme à se reproduire et à transmettre ses gènes

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18
Q

Qu’est ce que le quorum sensing?

A

Un système de communication bactéries relié à la densité cellulaire

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19
Q

Quelles sont les utilités du quorum sensing?

A

Important pour la virulence, colonisation de l’hôte,formation de biofilms,défense contre les concurrents et adaptation à des environnements changeants
Permet la communication intra-espèce et inter-espèce
Fait intervenir des molécules appelées «auto-inducteurs»

20
Q

Par quoi sont produit les AHL?

A

Par les lactones

21
Q

Nommez 3 familles d’AHL synthase

A

LuxI
LuxM
HdtS

22
Q

Les AHL sont elles spécifiques ou non-spécifique à une espèce bactérienne?

A

Non spécifique

23
Q

Dans quelles conditions on va avoir de l’interférence ou «quorum-quenching»?

A

Par pH basique et température élevée
Par dégradation enzymatique
Par production de composés mimant les AHL

24
Q

Nommez 3 caractéristiques important sur les PAI

A

Forte diversité structurelle
Les PAI sont très spécifiques et reconnu par 1 seul récepteur
Communication intra-espèces spécifique
(Les récepteurs peuvent être présent chez différentes espèces donc possibilité de communication inter-espèce )

25
Q

Quels sont les 2 stress pouvant influencer les communautés?

A

Le stres biotique
Le stress abiotique

26
Q

Donnez des exemples de facteurs de stress abiotique

A

Environnementaux (pH, salinité, température, disponibilité des nutriments)
Humains (pollution, exploitation,antibiothérapie)

27
Q

Donnez des exemples de facteurs de stress biotique

A

Animaux (disparition de l’espèce, labourage etc)
Bactériens (transfert de gènes, mutation, nouvelle espèce etc)

28
Q

Quelles sont les protéines exprimées en cas de choc thermique?

A

Hsp classé selon leur masse moléculaire
Hsp70 (DnaK)
Hsp60 (GroEL)
Hsp40 (DnaJ)

29
Q

Les Hsp sont sous la régulation de quoi?

A

Sigma32

30
Q

Les canaux ioniques bactériens ont une homologie avec quels canaux ioniques?

A

Les canaux ioniques des eukaryotes

31
Q

De quoi sont responsables les canaux ioniques bactériens?

A

De signaux électriques longues distances dans les biofilms bactériens

32
Q

Comment se propagent les signaux envoyés par les canaux ioniques?

A

Ils sont envoyés par des ondes qui se propagent du centre aux extrémités des biofilms

33
Q

À quoi est due la diversité existante de la population bactérienne?

A

À l’apparition de variants via un mécanisme appelé variation de phase ou conversion phénotypique

34
Q

Nommez les deux façons dont la variation de phase peut se faire

A

Par modification du génome
Par régulation épigénétique

35
Q

Définir conversion génique

A

Événement de recombinaison entre une copie silencieuse et une copie exprimée d’un gène, conduisant à la formation d’un gène chimère

36
Q

Quels sont les 5 sous types de variation de phase par modification du génome?

A

Conversion génique
Inversion site spécifique
Insersion-excision
Duplication
Délétion

37
Q

Définir inversion site spécifique

A

Événement de recombinaison qui implique la présence de séquences répétées et d’une recombinase

38
Q

Définir Insersion-excision

A

Nécessite la présence d’un élément génétique mobile comme une séquence d’insertion conduisant à l’inactivation d’un gène

39
Q

Définir duplication (notion de variation de phase)

A

Implique la duplication d’une partie d’un gène entraînant la perte de la fonction du gène. Cette duplication est ensuite excisée de manière précise au moment de la réversion

40
Q

Définir délétion

A

Phénomène non réversible qui consiste en l’excision et la suppression d’un gène

41
Q

Quelle est la différence entre la variation par modification du génome et la variation par régulation épigénétique

A

La régulation épigénétique ne modifie pas la séquence génomique

42
Q

Expliquer le principe de la variation de phase par régulation épigénétique

A

Régulation par méthylation des séquences dans les zones régulatrices, ce qui affecte donc la fixation du facteur de transcription

43
Q

En quoi consiste les bactéries tricheuses?

A

Ce sont des bactéries qui utilisent les ressources produites par la population sans participer à sa production

44
Q

Qu’est ce qu’il va se passer lorsque les biofilms vont manquer de nutriments? (Notions canaux ioniques)

A

Ils vont envoyer une vague d’ions potassium, ce qui va dire aux cellules qui sont à l’extérieur (au niveau du contour du biofilm) que l’intérieur du biofilm manque de nutriments. Donc les bactéries autour vont arrêter de prendre les nutriments ce qui va permettre aux nutriments de diffuser vers l’intérieur

45
Q

Qu’est ce qu’une bactérie tricheuse?

A

Bactérie qui utilise les ressources produites par la population sans participer à sa production

46
Q

Les bactéries tricheuses sont favorisés en présence d’antibiotiques, expliquez ce qui ce passe

A

1- leur proportion augmente
2- les coopérateurs sont plus sensibles aux antibiotiques à cause du coût énergétique de la coopération
3-les tricheuses ne participant pas à la coopération ont plus d’énergie disponible pour leur croissance

Diversité Microbienne (10 decks)

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