Cours 7 Flashcards
Définition de communauté
L’ensemble des micro-organismes qui habitent dans une niche écologique particulière
Définition de population
Groupe d’individus de la même espèce défini dans le temps et dans l’espace
Pourquoi n’importe qui peut interagir avec n’importe qui? Comment est ce possible?
Les acides aminés sont identiques
Les bases azotées sont identiques
Nommez les 4 interactions conflictuelles
La compétition
L’amensalisme
La prédation
Le parasitisme
La quelle des interactions conflictuelles est la plus répandue?
La compétition
Expliquez la compétition
Interaction dans laquelle les partenaires utilisent la même ressource
Expliquez en bref l’amensalisme
C’est une interaction de type négative-neutre ( 1 des 2 bactérie va être en compétition et l’autre va être neutre)
Expliquez la prédation
Élimination instantanée d’un organisme par un autre (relation négative (proie) bénéfique (prédatrice))
Expliquez le parasitisme
Interaction durable négative pour l’hôte parasité elle peut être définitive ou temporaire (cycle de reproduction)
Nommez les 3 interactions bénéfiques
Le commensalisme
La pro-coopération
Le mutualisme
Expliquez le commensalisme
C’est la seule interaction bénéfique pour laquelle les effets positifs ne s’exercent que sur l’un des 2 partenaires. Aucun effet négatif pour les 2 partenaires.
Expliquez la pro-coopération
Relation facultative à bénéfice réciproque. Les 2 partenaires collaborent pour survivre dans certains milieux ou certaines conditions seulement.
Quel autre nom peut on donner au mutualisme
La symbiose
Expliquez le mutualisme
Relation obligatoire à bénéfice réciproque
Définition de adaptation
Ensemble de caractéristiques morphologiques et physiologiques qui permet aux organismes de se multiplier dans un biotype donné
Définition d’adaptabilités
Capacité à l’adaptation
Définition de fitness
Capacité d’un organisme à se reproduire et à transmettre ses gènes
Qu’est ce que le quorum sensing?
Un système de communication bactéries relié à la densité cellulaire
Quelles sont les utilités du quorum sensing?
Important pour la virulence, colonisation de l’hôte,formation de biofilms,défense contre les concurrents et adaptation à des environnements changeants
Permet la communication intra-espèce et inter-espèce
Fait intervenir des molécules appelées «auto-inducteurs»
Par quoi sont produit les AHL?
Par les lactones
Nommez 3 familles d’AHL synthase
LuxI
LuxM
HdtS
Les AHL sont elles spécifiques ou non-spécifique à une espèce bactérienne?
Non spécifique
Dans quelles conditions on va avoir de l’interférence ou «quorum-quenching»?
Par pH basique et température élevée
Par dégradation enzymatique
Par production de composés mimant les AHL
Nommez 3 caractéristiques important sur les PAI
Forte diversité structurelle
Les PAI sont très spécifiques et reconnu par 1 seul récepteur
Communication intra-espèces spécifique
(Les récepteurs peuvent être présent chez différentes espèces donc possibilité de communication inter-espèce )
Quels sont les 2 stress pouvant influencer les communautés?
Le stres biotique
Le stress abiotique
Donnez des exemples de facteurs de stress abiotique
Environnementaux (pH, salinité, température, disponibilité des nutriments)
Humains (pollution, exploitation,antibiothérapie)
Donnez des exemples de facteurs de stress biotique
Animaux (disparition de l’espèce, labourage etc)
Bactériens (transfert de gènes, mutation, nouvelle espèce etc)
Quelles sont les protéines exprimées en cas de choc thermique?
Hsp classé selon leur masse moléculaire
Hsp70 (DnaK)
Hsp60 (GroEL)
Hsp40 (DnaJ)
Les Hsp sont sous la régulation de quoi?
Sigma32
Les canaux ioniques bactériens ont une homologie avec quels canaux ioniques?
Les canaux ioniques des eukaryotes
De quoi sont responsables les canaux ioniques bactériens?
De signaux électriques longues distances dans les biofilms bactériens
Comment se propagent les signaux envoyés par les canaux ioniques?
Ils sont envoyés par des ondes qui se propagent du centre aux extrémités des biofilms
À quoi est due la diversité existante de la population bactérienne?
À l’apparition de variants via un mécanisme appelé variation de phase ou conversion phénotypique
Nommez les deux façons dont la variation de phase peut se faire
Par modification du génome
Par régulation épigénétique
Définir conversion génique
Événement de recombinaison entre une copie silencieuse et une copie exprimée d’un gène, conduisant à la formation d’un gène chimère
Quels sont les 5 sous types de variation de phase par modification du génome?
Conversion génique
Inversion site spécifique
Insersion-excision
Duplication
Délétion
Définir inversion site spécifique
Événement de recombinaison qui implique la présence de séquences répétées et d’une recombinase
Définir Insersion-excision
Nécessite la présence d’un élément génétique mobile comme une séquence d’insertion conduisant à l’inactivation d’un gène
Définir duplication (notion de variation de phase)
Implique la duplication d’une partie d’un gène entraînant la perte de la fonction du gène. Cette duplication est ensuite excisée de manière précise au moment de la réversion
Définir délétion
Phénomène non réversible qui consiste en l’excision et la suppression d’un gène
Quelle est la différence entre la variation par modification du génome et la variation par régulation épigénétique
La régulation épigénétique ne modifie pas la séquence génomique
Expliquer le principe de la variation de phase par régulation épigénétique
Régulation par méthylation des séquences dans les zones régulatrices, ce qui affecte donc la fixation du facteur de transcription
En quoi consiste les bactéries tricheuses?
Ce sont des bactéries qui utilisent les ressources produites par la population sans participer à sa production
Qu’est ce qu’il va se passer lorsque les biofilms vont manquer de nutriments? (Notions canaux ioniques)
Ils vont envoyer une vague d’ions potassium, ce qui va dire aux cellules qui sont à l’extérieur (au niveau du contour du biofilm) que l’intérieur du biofilm manque de nutriments. Donc les bactéries autour vont arrêter de prendre les nutriments ce qui va permettre aux nutriments de diffuser vers l’intérieur
Qu’est ce qu’une bactérie tricheuse?
Bactérie qui utilise les ressources produites par la population sans participer à sa production
Les bactéries tricheuses sont favorisés en présence d’antibiotiques, expliquez ce qui ce passe
1- leur proportion augmente
2- les coopérateurs sont plus sensibles aux antibiotiques à cause du coût énergétique de la coopération
3-les tricheuses ne participant pas à la coopération ont plus d’énergie disponible pour leur croissance
