Cours 6

Question 1

Qu’est ce que le Sab? Nommez la formule et expliquez la

Answer 1

Le coefficient de similarité. Sab=2Nab/(Na+Nb)
Na:nombre d’oligo dans le catalogue de l’espèce a
Nb:nombre d’oligo dans le catalogue de l’espèce b
Nab: nombre d’oligo commun aux catalogues des espèces a et b

Question 2

Si Sab =1 qu’est ce que ça veut dire?

Answer 2

Si Sab=1 les 2 espèces sont identiques

Question 3

Si Sab<0,1 qu’est ce que ça veut dire?

Answer 3

Les espèces sont très éloignées

Question 4

Si 1>Sab<0,1 qu,est ce que ça veut dire?

Answer 4

Les 2 espèces sont plus ou moins proches

Question 5

Vrai ou faux les Archaea sont des procaryotesunicellulaires?

Answer 5

Vrai

Question 6

Est ce qu’il y a des Archaea pathogènes identifiés?

Answer 6

Non

Question 7

Quels sont les caractéristiques similaires entre les Archaea et les Eukaryote?

Answer 7

La DNA replication
La transcription
La translation

Question 8

Quels caractéristiques sont commune entre les Archaea et les bactéries?

Answer 8

Le métabolisme
Les 2 n’ont pas d’organelles, de spliceosomal introns et de telomeres
Les deux ont un chromosome circulaire

Question 9

Quelle est les 2 différences des Archaea comparé aux bactéries et aux eukaryotes

Answer 9

Le lien carbone des lipides Archaea: ether, bactéries et eukaryotes: esther
Jsp quoi lien phosphate

Question 10

Morphologie des Archaea (taille,forme,reproduction,flagelle)

Answer 10

Petite taille 05 à 5 micromètre
Forme de batônnets, rondes,spirales certaines sont filamenteuses
Reproduction asexuelle par fission (comme bactéries)
Certaines possèdent des flagelles

Question 11

Quelles sont les caractéristiques des flagelles des Archaea? (6)

Answer 11

Elles sont plus fines que celles des bactéries (10-14nm contre 20nm)
Elles sont très solides, elle ne sont pas creuses, structure pleine
Rotation du sens horaire, moins rapide
Énergie nécessaire: ATP
Plusieurs types de flagellines
Élongation à lieu par la base et non pas par la pointe

Question 12

Nommez les 2 homologies au niveau des protéines des flagelles des Archaea et des bactéries

Answer 12

Homologie de séquence entre le N-ter des fagellines des Archaea et les pilines de type IV des bactéries
Parcelles hydrophiles et un N-ter hydrophobe

Question 13

Nommez les 2 homologies au niveau de la synthèse entre les flagelles des Archaea et des bactéries

Answer 13

Les pilines de types IV sont fabriqués initialement sous la forme de prépiline
Les flagellines des Archaea possèdent également un peptide signal court qui est clivé par une enzyme située dans la membrane

Question 14

Quelles sont les différences dans la paroi cellulaire des Archaea comparé aux bactéries et aux eucaryotes?

Answer 14

Liaisons ether et non esther
Chaines phytanyl

Question 15

Les Archaea ont elles ont une monocouche ou une bicouche lipidique?

Answer 15

Une monocouche, c’est plus résistant qu’une bicouche lipidique

Question 16

Vrai ou faux la paroi des Archae contient du peptidoglycane

Answer 16

Faux

Question 17

La paroi des Archaea est elle résistante au lyzsozyme?

Answer 17

Oui

Question 18

Quelle est l’exception pour l’Archaea qui possède une membrane externe?

Answer 18

Ignicoccus

Question 19

Donnez la taille du génome ainsi que sa structure

Answer 19

Taille entre 2 à 4 Mbp
Génome circulaire, sous forme de particules nucleosome-like

Question 20

À quoi sert la gyrase inverse chez les Archaea hyperthermophiles?

Answer 20

Elle est capable de super-enrouler positivement l’ADN

Question 21

Combien y a t’il d’origines de réplication chez les Archaea?

Answer 21

1 seule

Question 22

La machine de réplication des Archaea est semblable à qui?

Answer 22

Aux eukaryotes

Question 23

Vrai ou Faux la réplication et la ségrégation du chromosome sont 2 procédés distincts

Answer 23

Vrai

Question 24

Quels sont les 4 phyla des Archaea?

Answer 24

Crenarcheota
Euryachaeaota
Nonarchaeaota
Korarchaeaota

Question 25

Dans le phylum Crenarchaeota,nommez les 4 ordres

Answer 25

Desulfurococcales
Caldisphaerales
Thermoproteales
Sulfolobales

Question 26

Chez les Crenarchaeaota, nommez la morphologie des Thermoprotales, Desulfurococcales et les sulfolobales

Answer 26

Thermoprotales: bâtonnets ou des filaments
Desulfurococcales: forme ovale aplatie
Sulfolobales et les Caldisphaerales sont ronds

Question 27

Nommez les 8 ordres dans le phylum Euryarchaeaota

Answer 27

Halobacteria
Methanomicrobia (methanosarcinales, methanomicrobiales)
Thermoplasmata
Archaeaoglobi
Methanococci
Thermococci
Methanopyri

Question 28

Vrai ou faux le phylum euryarchaeaota est plus diversifié phylogénétiquement et phénotypiquement que les Crenarchaeaota

Answer 28

Vrai

Question 29

Les Archaea cultivables des ordres Methanomicrobia, Methanobacterua et Methanococci sont impliqués dans quel cycle?

Answer 29

Le cycle du méthane

Question 30

Expliquez le protocole de la méthode ayant permis la découverte des Archaea

Answer 30

Digestion et électrophorèse bidimensionnelle des petites sous unités radioactives de l’ARN (16S ou 18S)

Question 31

Vrai ou faux, les Archaea sont plus primitives que les eucaryotes mais partagent un ancêtre commun plus proche qu’avec les bactéries

Answer 31

Vrai

Question 32

Vrai ou faux les flagelles des Archae fonctionnent comme les flagelles bactériens (mouvement rotatif) mais ressemblent plus aux pilis (assemblage et structure)

Answer 32

Vrai

Question 33

Quel est l’habitat des crenarchaeaota?

Answer 33

Elles sont communes dans les environnements hydrothermiques (cultivables)
Une grande proportion (non cultivable) est retrouvée dans des environnements non thermophiles

Question 34

Quel ordre du phylum Euryarchaeaota est halophile extrême?

Answer 34

L’ordre des Halobacteria

Question 35

Nommez 2 caractéristiques des méthanogènes (euryarchaeaota)

Answer 35

Anaerobes extrêmes, très sensibles à l’oxygène
Thermophiles ou mésophiles

Question 36

Quel est le métabolisme des méthanogènes?

Answer 36

Réduction du CO2 ou du CO en méthane ou formation de méthane à partir d’acétate, de méthanol ou d’hydrogène

Question 37

Donnez la morphologie des méthanogènes

Answer 37

Methanococci: ronds
Methanobacteria: forment des bâtonnets
Methanomicrobia: morphologie diverse

Question 38

Carl Woese s’est basé sur l’hypothèse selon laquelle la présence de régions ______ au niveau de la séquence codant pour l’ARN 16S devrait permettre de déterminer l’________ de la vie. Il utilise un protocole qui consiste en une _______ suivie d’une _______ des petites sous unités radioactives de l’ARN (16S ou 18S). Lorsqu’ils sont exposés aux rayons X, les fragments séparés génèrent une empreinte unique pour chaque organismes testé. C’est ce qu’on appelle la __________

Answer 38

Distinctes/variables
Évolution
Digestion enzymatique
Électrophorèse bidirectionnelle
Signature ribosomale

Question 39

Sur quels arguments repose la validité de la théorie de l’endosymbiose? (2)

Answer 39

1- les Archaea possèdent un eucaryome
2- les Archaea ancéstrales étaient plus complexes que les Archaea modernes