Cours 6 Flashcards
Qu’est ce que le Sab? Nommez la formule et expliquez la
Le coefficient de similarité. Sab=2Nab/(Na+Nb)
Na:nombre d’oligo dans le catalogue de l’espèce a
Nb:nombre d’oligo dans le catalogue de l’espèce b
Nab: nombre d’oligo commun aux catalogues des espèces a et b
Si Sab =1 qu’est ce que ça veut dire?
Si Sab=1 les 2 espèces sont identiques
Si Sab<0,1 qu’est ce que ça veut dire?
Les espèces sont très éloignées
Si 1>Sab<0,1 qu,est ce que ça veut dire?
Les 2 espèces sont plus ou moins proches
Vrai ou faux les Archaea sont des procaryotesunicellulaires?
Vrai
Est ce qu’il y a des Archaea pathogènes identifiés?
Non
Quels sont les caractéristiques similaires entre les Archaea et les Eukaryote?
La DNA replication
La transcription
La translation
Quels caractéristiques sont commune entre les Archaea et les bactéries?
Le métabolisme
Les 2 n’ont pas d’organelles, de spliceosomal introns et de telomeres
Les deux ont un chromosome circulaire
Quelle est les 2 différences des Archaea comparé aux bactéries et aux eukaryotes
Le lien carbone des lipides Archaea: ether, bactéries et eukaryotes: esther
Jsp quoi lien phosphate
Morphologie des Archaea (taille,forme,reproduction,flagelle)
Petite taille 05 à 5 micromètre
Forme de batônnets, rondes,spirales certaines sont filamenteuses
Reproduction asexuelle par fission (comme bactéries)
Certaines possèdent des flagelles
Quelles sont les caractéristiques des flagelles des Archaea? (6)
Elles sont plus fines que celles des bactéries (10-14nm contre 20nm)
Elles sont très solides, elle ne sont pas creuses, structure pleine
Rotation du sens horaire, moins rapide
Énergie nécessaire: ATP
Plusieurs types de flagellines
Élongation à lieu par la base et non pas par la pointe
Nommez les 2 homologies au niveau des protéines des flagelles des Archaea et des bactéries
Homologie de séquence entre le N-ter des fagellines des Archaea et les pilines de type IV des bactéries
Parcelles hydrophiles et un N-ter hydrophobe
Nommez les 2 homologies au niveau de la synthèse entre les flagelles des Archaea et des bactéries
Les pilines de types IV sont fabriqués initialement sous la forme de prépiline
Les flagellines des Archaea possèdent également un peptide signal court qui est clivé par une enzyme située dans la membrane
Quelles sont les différences dans la paroi cellulaire des Archaea comparé aux bactéries et aux eucaryotes?
Liaisons ether et non esther
Chaines phytanyl
Les Archaea ont elles ont une monocouche ou une bicouche lipidique?
Une monocouche, c’est plus résistant qu’une bicouche lipidique
Vrai ou faux la paroi des Archae contient du peptidoglycane
Faux
La paroi des Archaea est elle résistante au lyzsozyme?
Oui
Quelle est l’exception pour l’Archaea qui possède une membrane externe?
Ignicoccus
Donnez la taille du génome ainsi que sa structure
Taille entre 2 à 4 Mbp
Génome circulaire, sous forme de particules nucleosome-like
À quoi sert la gyrase inverse chez les Archaea hyperthermophiles?
Elle est capable de super-enrouler positivement l’ADN
Combien y a t’il d’origines de réplication chez les Archaea?
1 seule
La machine de réplication des Archaea est semblable à qui?
Aux eukaryotes
Vrai ou Faux la réplication et la ségrégation du chromosome sont 2 procédés distincts
Vrai
Quels sont les 4 phyla des Archaea?
Crenarcheota
Euryachaeaota
Nonarchaeaota
Korarchaeaota
Dans le phylum Crenarchaeota,nommez les 4 ordres
Desulfurococcales
Caldisphaerales
Thermoproteales
Sulfolobales
Chez les Crenarchaeaota, nommez la morphologie des Thermoprotales, Desulfurococcales et les sulfolobales
Thermoprotales: bâtonnets ou des filaments
Desulfurococcales: forme ovale aplatie
Sulfolobales et les Caldisphaerales sont ronds
Nommez les 8 ordres dans le phylum Euryarchaeaota
Halobacteria
Methanomicrobia (methanosarcinales, methanomicrobiales)
Thermoplasmata
Archaeaoglobi
Methanococci
Thermococci
Methanopyri
Vrai ou faux le phylum euryarchaeaota est plus diversifié phylogénétiquement et phénotypiquement que les Crenarchaeaota
Vrai
Les Archaea cultivables des ordres Methanomicrobia, Methanobacterua et Methanococci sont impliqués dans quel cycle?
Le cycle du méthane
Expliquez le protocole de la méthode ayant permis la découverte des Archaea
Digestion et électrophorèse bidimensionnelle des petites sous unités radioactives de l’ARN (16S ou 18S)
Vrai ou faux, les Archaea sont plus primitives que les eucaryotes mais partagent un ancêtre commun plus proche qu’avec les bactéries
Vrai
Vrai ou faux les flagelles des Archae fonctionnent comme les flagelles bactériens (mouvement rotatif) mais ressemblent plus aux pilis (assemblage et structure)
Vrai
Quel est l’habitat des crenarchaeaota?
Elles sont communes dans les environnements hydrothermiques (cultivables)
Une grande proportion (non cultivable) est retrouvée dans des environnements non thermophiles
Quel ordre du phylum Euryarchaeaota est halophile extrême?
L’ordre des Halobacteria
Nommez 2 caractéristiques des méthanogènes (euryarchaeaota)
Anaerobes extrêmes, très sensibles à l’oxygène
Thermophiles ou mésophiles
Quel est le métabolisme des méthanogènes?
Réduction du CO2 ou du CO en méthane ou formation de méthane à partir d’acétate, de méthanol ou d’hydrogène
Donnez la morphologie des méthanogènes
Methanococci: ronds
Methanobacteria: forment des bâtonnets
Methanomicrobia: morphologie diverse
Carl Woese s’est basé sur l’hypothèse selon laquelle la présence de régions ______ au niveau de la séquence codant pour l’ARN 16S devrait permettre de déterminer l’________ de la vie. Il utilise un protocole qui consiste en une _______ suivie d’une _______ des petites sous unités radioactives de l’ARN (16S ou 18S). Lorsqu’ils sont exposés aux rayons X, les fragments séparés génèrent une empreinte unique pour chaque organismes testé. C’est ce qu’on appelle la __________
Distinctes/variables
Évolution
Digestion enzymatique
Électrophorèse bidirectionnelle
Signature ribosomale
Sur quels arguments repose la validité de la théorie de l’endosymbiose? (2)
1- les Archaea possèdent un eucaryome
2- les Archaea ancéstrales étaient plus complexes que les Archaea modernes
