cours 6 - noyau et organisation du génome Flashcards
1
Q
Quelle est une des principales différences entre les eucaryotes et les procaryotes?
A
La présence d’un noyau chez les eucaryotes
2
Q
Quelle est la fonction du noyau?
A
Lieu de stockage de presque toute l’information génétique
3
Q
Quelles sont les six structures du noyau?
A
- Enveloppe nucléaire
- Pores nucléaires
- Nucléole
- Chromatine
- Nucléoplasme
- Matrice nucléaire
4
Q
De quoi est composée la structure de l’enveloppe nucléaire?
A
Composée de deux bicouches lipides
5
Q
De quoi est composée l’enveloppe nucléaire?
A
Composée de filaments intermédiaires de lamine qui tapissent l’intérieur (lame nucléaire)
6
Q
L’enveloppe nucléaire est en continuité avec quoi?
A
Le RER
7
Q
De quoi est formé la lame nucléaire composant l’enveloppe nucléaire?
A
De filaments intermédiaires (A, B et C) formant un treillis rigide
8
Q
Quelle est la fonction de l’enveloppe nucléaire/lame nucléaire?
A
Donne la forme au noyau
9
Q
Que sont les pores nucléaires?
A
Complexes protéiques traversant l’enveloppe nucléaire
10
Q
Quelle est la fonction des pores nucléaires?
A
Transport: Permettent les échanges entre le noyau et le cytoplasme
11
Q
Qu’est-ce qui est transporté dans les pores nucléaires lors de l’import?
A
Protéines résidentes du noyau
12
Q
Qu’est-ce qui est transporté dans les pores nucléaires lors de l’export?
A
ARNs
13
Q
Qu’est-ce que le nucléole?
A
Site de fabrication des ribosomes (80% de l’ARN dans la cellule)
14
Q
Le nucléole est composé de quoi?
A
Assemblage d’ADN, de protéines et d’ARN
15
Q
Le nucléole est le site d’assemblage de quoi?
A
Des loci d’ADN
16
Q
Quels sont les noms des deux états de la chromatine?
A
- Hétérochromatine: région dense
- Euchromatine: région claire
17
Q
Qu’est-ce que le nucléoplasme?
A
Partie soluble du noyau
18
Q
Qu’est-ce que la matrice nucléaire?
A
Réseau fibrillaire qui structure la chromatine
19
Q
La matrice nucléaire est connectée à quoi par quoi?
A
À l’enveloppe nucléaire par des laminines
20
Q
Qu’est-ce qu’un acide désoxyribonucléique?
A
Polymère composé de bases azotées, d’un sucre (désoxyribose) et de groupements phosphates
21
Q
Quelles sont les bases azotées de l’ADN?
A
Adénine
Guanine
Cytosine
Thymine
22
Q
De quoi est composé un nucléotide?
A
Base azotée
sucre
Acide phosphorique
23
Q
Comment sont liés le sucre et l’acide phosphorique dans une nucléotide?
A
Par un lien phosphodiester
24
Q
Quelles sont les deux purines?
A
Adénine
Guanine
25
Quelles sont les deux pyrimidines?
Cytosine
Thymine
26
L'extrémité 5' d'un brin d'ADN se termine par quoi?
Par un phosphate
27
L'extrémité 3' d'un brin d'ADN se termine par quoi?
Par une fonction hydroxyde (-OH)
28
Les séquences des bases d'un brin d'ADN se lit de quelle direction?
5' vers 3'
29
Quelle est l'orientation d'un brin d'ADN?
5' vers 3'
30
Comment s'apparie deux brins d'ADN?
Par complémentarité des bases (A+T et C+G)
31
Les deux brins sont liés par quoi?
Par des ponts H non-covalents (faciles à briser)
32
A+T forment combien de ponts?
2 ponts H
33
G+C forment combien de ponts?
3 ponts H
34
Que veut-on dire par le fait que les deux brins d'ADN sont antiparallèles?
La séquence d'un brin correspond à la séquence complémentaire de l'autre brin
35
À quoi sert l'antiparallélisme des deux brins?
Cela aide la cellule à répliquer l'ADN
36
Que cause l'enroulement particulier d'un brin d'ADN en double-hélice?
La double-hélice forme des sillons majeurs et mineurs
37
Où se trouvent les instructions qui déterminent les caractères héréditaires des espèces?
Dans l'ADN
38
Quelle est la définition du gène classique? (MENDEL)
Unité héréditaire encodant un trait (information dans l'ADN)
39
Pour quoi le gène est encodé?
1. Donner l'ordre des résidus d'a.a. des protéines
2. Déterminer le moment ou l'endroit où les proétines sont exprimées
40
Qu'est-ce que le dogme central de la biologie moléculaire?
ADN - transcription - ARNm - traduction - protéine
41
Quels sont les autres noms du brin matrice-modèle?
Brin non-codant
Brin non-sens
42
Comment les bases du code génétique sont-elles lues?
En triplets (3 nucléotides = 1 a.a.)
43
Un codon équivaut à quoi?
1 codon = 3 nucléotides
1 codon = un résidu d'a.a.
44
Combien il y a-t-il de codons différents?
64
45
Combien il y a-t-il d'a.a. possibles dans les protéines?
20
46
V/F: les codons ne se chevauchent pas
Vrai
47
Combien il y a-t-il de possibilité de cadre de lecture?
3
48
V/F: une séquence codante a un début et une fin
Vrai, un codon start et un codon stop
49
Le code génétique est traduit par quoi?
Par le ribosome à partir de l'ARNm en utilisant des ARNt
50
Quel est le codon start?
ATG-méthionine
51
Quels sont les trois codons stop?
TAA
TGA
TAG
52
Qu'est-ce qu'une séquence codante?
Partie de séquence qui encode la protéine
53
Quelle est la "structure" d'une séquence codante?
Codon start
Cinquantaine de codons d'a.a.
Codon stop
Le tout dans le même cadre de lecture
54
Quel est le brin codant?
5' vers 3'
Codant/sens/non-matrice
55
Le brin codant est la même séquence que quoi?
Même séquence que l'ARNm, mais T va être remplacé par U
56
Qu'est-ce qu'un cadre de lecture?
Division de la séquence d'ADN en groupes de trois nucléotides qui constituent les codons
57
Qu'est-ce qu'un cadre de lecture ouvert?
Cadre de lecture identifiable dans une séquence d'ADN par son codon start et qui est susceptible d'être transcrit en ARNm pour être traduit en protéines par un ribosome
58
Quelle est la définition d'un gène?
Endroit dans l'ADN où se trouve l'information codante pour l'expression d'une protéine
59
Un gène englobe quoi?
1. Les séquences codantes
2. Les séquences transcrites non-codantes
3. Les régions régulatrices
60
Quelle est la définition d'un génome?
Ensemble des gènes que contient un organisme vivant
61
Quelle est la structure des gènes procaryotes?
Structure simple: promoteur, séquence codante, terminateur
62
Chez les procaryotes, comment sont assemblés les gènes ayant des fonctions similaires?
En opérons
63
Comment est l'ADN génomique des bactéries?
Circulaire (une seule molécule double-brin sans extrémité)
64
Quelle est la structure des gènes eucaryotes?
Divisé en plusieurs sections: exons, eux-mêmes séparés par des morceaux d'ADN non-codantes: introns
65
Quels sont les trois éléments d'ADN régulateurs dans les gènes chez les eucaryotes?
Promoteur
Éléments proximaux
Éléments distaux
66
Comment peuvent se positionner les éléments régulateurs distaux dans les gènes eucaryotes?
Peuvent être très éloignés et se trouver autant en amont (5') qu'en aval (3')
67
Qu'est-ce que l'épissage?
Après la transcription de l'ADN en ARN, l'ARN doit maturer (subir une série de modifications): les introns sont retirés et les exons sont collés ensemble
68
À quoi servent les introns?
Permettent de produire plusieurs transcrits différents à partir d'un même gène (plusieurs variantes de ARNm = plusieurs protéines)
69
Que contient l'ARNm?
La séquence codante de la protéine
70
Que déterminent les éléments régulateurs dans les gènes eucaryotes?
1. À quel moment le gène devient actif (transcrit en ARN)
2. L'intensité de l'activation
71
Les éléments régulateurs se font reconnaître par quoi?
Les facteurs de transcription
72
Quelle est la structure du génome eucaryote?
- ADN double-brin linéaire
- 46 molécules, 23 paires
73
Chez les eucaryotes, comment sont assemblés les gènes ayant des fonctions similaires?
Pas en opérons
- Il y a un promoteur pour chaque gène
- Ils sont répartis dans l'ADN
74
Quel est le pourcentage de l'ADN qui encode pour des protéines? (exons)
1,5%
75
Seulement 1,5% de l'ADN encode pour des protéines. Le reste encode pour quoi?
1. Introns
2. Éléments régulateurs
3. Séquences répétées (tandem ou dispersées)
76
Quels sont les deux types de séquences répétées?
1. En tandem
2. Dispersées
77
Que sont les transposons?
Segments d'ADN (séquences répétées non-codantes dispersées) capables de se déplacer dans le génome
78
Les éléments transposables, qu'on appelle "parasites génomiques", ont la capacité à faire quoi?
À se répliquer dans le génome
79
Les éléments transposables sont responsable de quoi?
Ils augmentent l'aspect dynamique du génome
80
Quels sont les deux mécanismes de transposition?
1. Transposon
2. Rétrotransposon
81
Qu'est-ce que le mécanisme de transposition par transposon?
Couper-coller
82
Qu'arrive-t-il a la copie initiale du transposon lors du mécanisme de couper-coller?
La copie initiale du transposon ne fait que se déplacer dans le génome
83
Qu'est-ce que le mécanisme de transposition par rétrotransposon?
Copier-coller
84
Qu'arrive-t-il au rétrotransposon initial lors du mécanisme de copier-coller?
Le rétrotransposon initial reste dans le génome, et un nouveau transposon s'est introduit ailleurs dans le génome
85
Quel est l'effet de la capacité du rétrotransposon à refaire le processus de copier-coller plusieurs fois?
Permet la dissémination d'un grand nombre de nouveaux transposons (40% des séquences répétées dans le génome humain)
86
Qu'est-ce que la chromatine?
Matière complexe des chromosomes eucaryotes fait d'un assemblage d'ADN et de protéines (histones)
87
La chromatine embobine quoi?
L'ADN
88
Qu'est-ce qui donne les chromosomes lors de la mitose?
La compaction successive de chromatine
89
Quelles sont les caractéristiques de l'état hétérochromatine de la chromatine?
- Plus dense
- Contient moins de gènes
- Se trouve en périphérie du noyau
90
Quelles sont les caractéristiques de l'état euchromatine de la chromatine?
- Moins dense
- Contient de l'ADN avec beaucoup de gènes actifs
91
Qu'est-ce qu'un nucléosome?
Unité de base de la chromatine
92
À quoi servent les nucléosomes?
Un nucléosome est une sphère permettant d'enrouler l'ADN
93
Quelle est la structure d'un nucléosome et de quoi est-il composé?
4 histones de bases essentielles à la structure:
(H2A H2B H3 H4) x 2
Ce qui forme un octamère d'histones
94
Quels sont les 4 histones de bases essentielles à la structure du nucléosome?
H2A
H2B
H3
H4
95
Quel est l'histone accessoire?
H1
96
À quoi sert l'histone accessoire H1?
1. Sert à la compaction
2. Stabilise les brins d'ADN
97
Où s'associent les histones accessoires H1?
Au point d'entrée/sortie de l'ADN
98
Comment pouvons-nous décrire les extrémités des histones?
1. Non-structurées
2. Débordent de la structure
99
Qu'est-ce qu'un chromosome?
Brin filamenteux composé d'ADN des cellules eucaryotes et qui sont le support de l'information génétique
(État de compaction ultime)
100
Combien y-a-t-il de chromosome?
46 chromosomes, 23 paires
44 autosomes, 2 chromosomes sexuels
1. XY mâle
2. XX femelle
101
Le chromosome facilite quoi?
C'est un état de compaction ultime qui facilitent la ségrégation lors de la division cellulaire (mitose ou méiose)
102
Qu'est-ce qu'un chromosome métaphasique?
Métaphasique: après la réplication de l'ADN et l'entrée en mitose
103
Quelle est la structure du chromosome métaphasique?
Deux chromatides soeurs (identiques, deux copies post-réplication), donc deux molécules d'ADN
104
Comment les deux chromatines soeurs du chromosome sont-elles attachées ensemble?
Par le centromère (association au fuseau lors de la mitose)
105
Les extrémités du chromosome sont protégées pas quoi?
Le télomère
106
Qu'est-ce que le centromère?
Rétrécissement visible dans un chromosome mitotique qui sert de site de formation du kinétochore
107
Les centromères sont entourés de quoi?
D'hétérochromatine
108
V/F: un seul centromère doit exister par chromosome
Vrai, sinon ça risque de se déchirer lors de la division
109
De quoi sont composés les centromères?
De séquences d'ADN répétées d'alpha-satellites en tandem
110
À quoi sert le centromère?
Point de fixation des chromatines soeurs du chromosome
111
Qu'est-ce que le kinétochore?
Machinerie qui tire sur les chromosomes lors de la division cellulaire
112
Qu'est-ce qu'un télomère?
Segment inhabituel de séquences répétées formant une coiffe aux deux extrémités du chromosome, ce qui les protège
113
De quoi sont composés les télomères?
De séquences d'ADN répétées et conservées d'alpha-satellites TTAGGG
114
Comment se forme les télomères?
L'extrémité du chromosome se referme en boucle par l'interaction du brin d'ADN simple-brin 3' libre répété, ce qui crée une liaison d'une multitude de facteur
115
Quelles sont les deux fonctions des télomères?
1. Protègent les chromosomes en empêchant la cellule de considérer les extrémités comme des brins double-lien d'ADN
2. Holorge moléculaire pour les cellules
116
Expliquez la fonction de protection du télomère
Les télomères empêchent la cellule de considérer les extrémités comme des brins double-lien d'ADN
- Les cellules ont tendances à recoller des bouts d'ADN libre, ce qui fait que tous les chromosomes seraient collés bout-à-bout
117
Expliquez la fonction d'horloge du télomère
Les télomères se raccourcissent lors de réplication de l'ADN, donc leur longueur est signe de vieillissement cellulaire: lorsqu'ils deviennent trop courts la cellule cesse de se diviser (devient sénescente)
118
Qu'est-ce qu'une cellule germinale?
Cellule qui sert à la reproduction, donnant des ovules et des spermatozoïdes
119
Que doivent faire les cellules germinales avec leurs télomères?
Doivent renouveler la longueur de leurs télomères (sinon enfants vieilliraient plus vite que nous)
120
Quelle est l'enzyme des cellules germinales qui est responsable de rallonger les télomères?
La télomérase
