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biocell > cours 6 - noyau et organisation du génome > Flashcards

cours 6 - noyau et organisation du génome Flashcards

1
Q

Quelle est une des principales différences entre les eucaryotes et les procaryotes?

A

La présence d’un noyau chez les eucaryotes

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Q

Quelle est la fonction du noyau?

A

Lieu de stockage de presque toute l’information génétique

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Q

Quelles sont les six structures du noyau?

A
  1. Enveloppe nucléaire
  2. Pores nucléaires
  3. Nucléole
  4. Chromatine
  5. Nucléoplasme
  6. Matrice nucléaire
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Q

Quelle est la structure de l’enveloppe nucléaire?

A

Composée de deux bicouches lipides

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5
Q

De quoi est composée l’enveloppe nucléaire?

A

Composée de filaments intermédiaires de lamine qui tapissent l’intérieur (lame nucléaire)

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6
Q

L’enveloppe nucléaire est en continuité avec quoi?

A

Le RER

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7
Q

De quoi est formé la lame nucléaire composant l’enveloppe nucléaire?

A

De filaments intermédiaires (A, B et C) formant un treillis rigide

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8
Q

Quelle est la fonction de l’enveloppe nucléaire/lame nucléaire?

A

Donne la forme au noyau

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9
Q

Que sont les pore nucléaires?

A

Complexes protéiques traversant l’enveloppe nucléaire

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10
Q

Quelle est la fonction des pores nucléaires?

A

Transport: Permettent les échanges entre le noyau et le cytoplasme

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11
Q

Qu’est-ce que le nucléole?

A

Site de fabrication des ribosomes (80% de l’ARN dans la cellule)

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12
Q

Le nucléole est composé de quoi?

A

Assemblage d’ADN, de protéines et d’ARN

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13
Q

Le nucléole est le site d’assemblage de quoi?

A

Des loci d’ADN

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14
Q

Quels sont les noms des deux états de la chromatine?

A
  1. Hétérochromatine: région dense
  2. Euchromatine: région claire
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15
Q

Qu’est-ce que le nucloplasme?

A

Partie soluble du noyau

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16
Q

La matrice nucléaire est connectée à quoi par quoi?

A

À l’enveloppe nucléaire par des laminines

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17
Q

Qu’est-ce qu’un acide désoxyribonucléique?

A

Polymère composé de bases azotées, d’un sucre (désoxyribose) et de groupements phosphates

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18
Q

Quelles sont les bases azotées de l’ADN?

A

Adénine
Guanine
Cytosine
Thymine

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19
Q

De quoi est composé un nucléotide?

A

Base azotée
sucre
Acide phosphorique

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20
Q

Comment sont liés le sucre et l’acide phosphorique dans une nucléotide?

A

Par un lien phosphodiester

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21
Q

Quelles sont les deux purines?

A

Adénine
Guanine

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22
Q

Quelles sont les deux pyrimidines?

A

Cytosine
Thymine

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23
Q

L’extrémité 5’ d’un brin d’ADN se termine par quoi?

A

Par une phosphate

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24
Q

L’extrémité 3’ d’un brin d’ADN se termine par quoi?

A

Par une fonction hydroxyde (-OH)

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25
Q

Les séquences des bases d’un brin d’ADN se lit de quelle direction?

A

De 5’ vers 3’

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26
Q

Quelle est l’orientation d’un brin d’ADN?

A

5’ vers 3’

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27
Q

Comment s’apparie deux brins d’ADN?

A

Par complémentarité des bases (A+T et C+G)

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28
Q

Les deux brins sont liés par quoi?

A

Par des ponts H non-covalents (faciles à briser)

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29
Q

A+T forment combien de ponts?

A

2 ponts H

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30
Q

G+C forment combien de ponts?

A

3 ponts H

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31
Q

Que veut-on dire par le fait que les deux brins d,ADN sont antiparallèles?

A

La séquence d’un brin correspond à la séquence complémentaire de l’autre brin

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32
Q

À quoi sert l’antiparallélisme des deux brins?

A

Cela aide la cellule à répliquer l’ADN

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33
Q

Que cause l’enroulement particulier d’un brin d’ADN en double-hélice?

A

La double-hélice forme des sillons majeurs et mineurs

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34
Q

À quoi servent les sillons majeurs?

A

Aident aux interactions entre l’ADN et les protéines

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35
Q

Où se trouvent les instructions qui déterminent les caractères héréditaires des espèces?

A

Dans l’ADN

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36
Q

Quelle est la définition du gène classique? (MENDEL)

A

Unité héréditaire encodant un trait (information dans l’ADN)

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37
Q

Pour quoi le gène est encodé?

A
  1. Donner l’ordre des résidus d’a.a. des proétines
  2. Déterminer le moment ou l’endroit où les proétines sont exprimées
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38
Q

Comment les bases du code génétique sont-elles lues?

A

En triplets (3 nucléotides = 1 a.a.)

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39
Q

Un codon équivaut à quoi?

A

1 codon = 3 nucléotides
1 codon = un résidu d’a.a.

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40
Q

Combien il y a-t-il de codons différents?

A

64

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41
Q

combien il y a-t-il d’a.a. possibles dans les protéines?

A

20

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42
Q

V/F: les codons ne se chevauchent pas

A

Vrai

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43
Q

combien il y a-t-il de possibilité de cadre de lecture?

A

3

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44
Q

V/F: une séquence codante a un débutt et une fin

A

Vrai, un codon start et un codon stop

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45
Q

Le code génétique est traduit par quoi?

A

Par le ribosome à partir de l’ARNm en utilisant des ARNt

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46
Q

Quel est le codon start?

A

ATG-méthionine

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47
Q

Quels sont les trois codons stop?

A

TAA
TGA
TAG

48
Q

Qu’est-ce qu’une séquence codante?

A

Partie de séquence qui encode la proétine

49
Q

Quelle est la “structure” d’une séquence codante?

A

Codon start
Cinquantaine de codons d’a.a.
Codon stop

Le tout dans le même cadre de lecture

50
Q

Quel est le brin codant?

A

Le brin d’en haut (5’ vers 3’)

51
Q

Le brin codant est la même séquence que quoi?

A

Même séquence que l’ARNm, mais T va être remplacé par U

52
Q

Qu’est-ce qu’un cadre de lecture?

A

Division de la séquence d’ARN en groupes de trois nucléotides qui constituent les codons

53
Q

Qu’est-ce qu’un cadre de lecture ouvert?

A

Cadre de lecture identifiable dans une séquence d’ADN par son codon start et qui est susceptible d’être transcrit en ARNm pour être traduit en protéines par un ribosome

54
Q

Quelle est la définition d’un gène?

A

Endroit dans l’ADN où se trouve l’information codant pour l’expression d’une protéine

55
Q

Un gène englobe quoi?

A

Les séquences transcrites non-codantes et les régions régulatrices

56
Q

Quelle est la définition d’un génome?

A

Ensemble des gènes que contient un organisme vivant

57
Q

Quelle est la structure des gènes procaryotes?

A

Structure simple: promoteur, séquence codante, terminateur

58
Q

Chez les procaryotes, comment sont assemblés les gènes ayant des fonctions similaires?

A

En opérons

59
Q

Comment est l’ADN génomique des bactéries?

A

Circulaire (une seule molécule double-brin sans extrémité)

60
Q

Quelle est la structure des gènes eucaryotes?

A

divisé en plusieurs sections: exons, eux-mêmes séparés par des morceaux d’ADN non-codantes: introns

61
Q

Quels sont les trois éléments d’ADN régulateurs dans les gènes chez les eucaryotes?

A

Promoteur
Éléments proximaux
Éléments distaux

62
Q

Comment peuvent se positionner les éléments régulateurs distaux dans les gènes eucaryotes?

A

Peuvent être très éloignés et se trouver autant en amont (5’) qu’en aval (3’)

63
Q

Qu’est-ce que l’épissage?

A

Après la transcription de l’ADN en ARN, l’ARN doit maturer (subir une série de modifications): les introns sont retirés et les exons sont collés ensemble

64
Q

Que contient l’ARNm?

A

La séquence codante de la protéine

65
Q

Que déterminent les éléments régulateurs dans les gènes eucaryotes?

A
  1. À quel moment le gène devient actif (transcrit en ARN)
  2. L’intensité de l’activation
66
Q

Les éléments régulateurs se font reconnaître par quoi?

A

Les facteurs de transcription

67
Q

Quelle est la structure du génome eucaryote?

A
  • ADN double-brin linéaire
  • 46 molécules, 23 paires
68
Q

Chez les eucaryotes, comment sont assemblés les gènes ayant des fonctions similaires?

A

Pas en opérons
- Il y a un promoteur pour chaque gène
- Ils sont répartis dans l’ADN

69
Q

Quel est le pourcentage de l’ADN qui encode pour des protéines? (exons)

A

1,5%

70
Q

Seulement 1,5% de l’ADN qui encode pour des protéines. Le reste encode pour quoi?

A
  1. Introns
  2. Éléments régulateurs
  3. Séquences répétées (tandem ou disperées)
71
Q

Quels sont les deux types de séquences répétées?

A
  1. En tandem
  2. Dispersées
72
Q

Que sont les transposons?

A

Segments d’ADN (séquences répétées non-codantes dispersées) capables de se déplacer dans le génome

73
Q

Les éléments transposables, qu’on appelle “parasites génomiques”, ont la capacité à faire quoi?

A

À se répliquer dans le génome

74
Q

Les éléments transposables sont responsable de quoi?

A

Ils augmentent l’aspect dynamique du génome

75
Q

Quels sont les deux mécanismes de transposition?

A
  1. Transposon
  2. Rétrotransposon
76
Q

Qu’est-ce que le mécanisme de transposition par transposon? (+étapes)

A

Couper-coller
1. La transposase va chercher la séquence de son transposon dans le génome
2. Enzyme coupe l’ADN avant et après le transposon
3. Réintroduit séquence ailleurs dans le génome

77
Q

Qu’arrive-t-il a la copie initiale du transposon lors du mécanisme de couper-coller?

A

La copie initiale du transposon ne fait que se déplacer dans le génome

78
Q

Qu’est-ce que le mécanisme de transposition par rétrotransposon?

A

Copier-coller
1. Le rétrotransposon est transcrit au complet pour produire ARNm qui encode la rétrotransposase et le reste de la séquence non-codante du transposon
2. La rétrotransposase reconnait ARNm et l’utilise pour produire ADN simple-brin
3. ADN simple-brin est répliqué en ADN double-brin
4. La rétrotransposase prend cet ADN (qui représente la séquence complète d’un nouveau transposon) et l’introduit ailleurs dans le génome

79
Q

Qu’arrive-t-il au rétrotransposon initial lors du mécanisme de copier-coller?

A

Le rétrotransposon initial reste dans le génome, et un nouveau transposon s’est introduit ailleurs dans le génome

80
Q

Quel est l’effet de la capacité du rétrotransposon à refaire le processus de copier-coller plusieurs fois?

A

Permet la dissémination d’un grand nombre de nouveaux transposons (40% des séquences répétées dans le génome humain)

81
Q

Qu’est-ce que la chromatine?

A

Matière complexe des chromosomes eucaryotes fait d’un assemblage d’ADN er de protéines (histones)

82
Q

La chromatine embobine quoi?

A

L’ADN

83
Q

Qu’est-ce qui donne les chromosomes lors de la mitose?

A

La compaction successive de chromatine

84
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’état hétérochromatine de la chromatine?

A
  • Plus dense
  • Contient moins de gènes
  • Se trouve en périphérie du noyau
85
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’état euchromatine de la chromatine?

A
  • Moins dense
  • Contient de l’ADN avec beaucoup de gènes actifs
86
Q

Qu’est-ce qu’un nucléosome?

A

Unité de base de la chromatine

87
Q

À quoi servent les nucléosomes?

A

Un nucléosome est une sphère permettant d’enrouler l’ADN

88
Q

Quelle est la structure d’un nucléosome et de quoi est-il conmposé?

A

4 histones de bases essentielles à la structure:
(H2A H2B H3 H4) x 2

Ce qui forme un octamère d’histones

89
Q

Quels sont les 4 histones de bases essentielles à la structure du nucléosome?

A

H2A
H2B
H3
H4

90
Q

Quel est l’histone accessoire?

A

H1

91
Q

À quoi sert l’histone accessoire H1?

A
  1. Sert à la compaction
  2. Stabilise les brins d’ADN
92
Q

Où s’associent les histones accessoires H1?

A

Au point d’entrée/sortie de l’ADN

93
Q

Comment pouvons-nous décrire les extrémités des histones?

A
  1. Non-strcturées
  2. Débordent de la structure
94
Q

Qu’est-ce qu’un chromosome?

A

Brin filamenteux composé d’ADN nucléaire des cellules eucaryotes et qui sont le support de l’information génétique
(État de compaction ultime)

95
Q

Combien y-a-t-il de chromosome?

A

46 chromosomes, 23 paires

44 autosomes, 2 chromosomes sexuels
1. XY mâle
2. XX femelle

96
Q

Le chromosome facilite quoi?

A

C’est un état de compaction ultime qui facilitent la ségrégation lors de la division cellulaire (mitose ou méiose)

97
Q

Qu’est-ce qu’un chromosome métaphasique?

A

Métaphasique: après la réplication de l’ADN et l’entrée en mitose

98
Q

Quelle est la structure du chromosome métaphasique?

A

Deux chromatines soeurs (identiques, deux copies post-réplication), donc deux molécules d’ADN

99
Q

Comment les deux chromatines soeurs du chromosome sont-elles attachées ensemble?

A

Par le centromère (association au fuseau lors de la mitose)

100
Q

Les extrémités du chromosome sont protégées pas quoi?

A

Le télomère

101
Q

Qu’est-ce que le centromère?

A

Rétrécissement visible dans un chromosome mitotique qui sert de site de formation du kinétochore

102
Q

Le centrosome contient un variant de l’histone H3. Lequel est-il?

A

CenH3

103
Q

Les centromères sont entourés de quoi?

A

D’hétérochromatine

104
Q

V/F: un seul centromère doit exister par chromosome

A

Vrai, sinon ça risque de se déchirer lors de la division

105
Q

De quoi sont composés les centromères?

A

De séquences d’ADN répétées d’alpha-satellites en tandem

106
Q

À quoi sert le centromère?

A

Point de fixation des chromatines soeurs du chromosome

107
Q

Qu’est-ce que le kinétochore?

A

Machinerie qui tire sur les chromosomes lors de la division cellulaire

108
Q

Qu’est-ce qu’un télomère?

A

Segment inhabituel de séquences répétées formant une coiffe aux deux extrémités du chromosome, ce qui les protège

109
Q

De quoi sont composés les télomères?

A

De séquences d’ADN répétées et conservées d’alpha-satellites TTAGGG

110
Q

Comment se forme les télomères?

A

L’extrémité du chromosome se referme en boucle par l’interaction du brin dADN simple-brin 3’ libre répété, ce qui crée une liaison d’une multitude de facteur

111
Q

Quelles sont les deux fonctions des télomères?

A
  1. Protègent les chromosomes en empêchant la cellule de considérer les les extrémités comme des brins double-lien d’ADN
  2. Holorge moléculaire pour les cellules
112
Q

Expliquez la fonction de protection du télomère

A

Les télomères empêchent la cellule de considérer les les extrémités comme des brins double-lien d’ADN
- Les cellules ont tendances à recoller des bouts d’ADN libre, ce qui fait que tous les chromosomes seraient collés bout-à-bout

113
Q

Expliquez la fonction d’horloge du télomère

A

Les télomères se raccourcissent lors de réplication de l’ADN, donc leur longueur est signe de vieillissement cellulaire: lorsqu’ils deviennent trop courts la cellule cesse de se diviser (devient sénescente)

114
Q

Qu’est-ce qu’une cellule germinale?

A

Cellule qui sert à la reproduction, donnant des ovules et des spermatozoïdes

115
Q

Que doivent faire les cellules germinales avec leurs télomères?

A

Doivent renouveler la longueur de leurs télomères (sinon enfants vieilliraient plus vite que nous)

116
Q

Quelle est l’enzyme des cellules germinales qui est responsable de rallonger les télomères?

A

La télomérase

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