Cours 5 - Mimi la bactérie Flashcards
Distinguer le génome et le plasmide chez les procaryotes
Le génome est l’ensemble du matériel génétique de la bactérie.
Le plasmide c’est le matériel génétique accessoire de la bactérie qui peut être interchangé avec d’autres bactéries
Quelle partie du génome bactérien peut encoder de l’information procurant un avantage unique à la bactérie hôte
Le plasmide
Définis pangénome
Ensemble des gènes qui peuvent se retrouver dans au moins une souche d’une espèce bactérienne
____ + ____ = Pangénome
Génome de base + accessoire
Comment les bactéries se divisent-elles?
Par fission binaire
Qu’est-ce qu’un promoteur
C’est une séquence d’ADN en amont d’un gène qui permet la transcription de ce gène en ARNm.
Qu’est-ce qu’un opérateur
Séquence d’ADN adjacente à un gène. Reconnue par une protéine régulatrice, elle contrôle la transcription de ce gène.
Qu’est-ce qu’un répresseur
Protéine inhibant la transcription d’un gène en se liant à une séquence spécifique de nucléotides de l’ADN.
Qu’est-ce qu’un activateur
Protéine stimulant la transcription d’un gène ou d’un ensemble de gènes. Ces protéines reconnaissent généralement une séquence spécifique sur l’ADN située à proximité d’un promoteur.
Durant quelle phase de la croissance bactérienne trouve-t-on la régulation rapide
Expoentielle
Qu’est-ce que la régulation simple
Un promoteur pour contrôler un gène
Qu’est-ce que la régulation dans un opéron
Un seul promoteur pour contrôler plusieurs gènes
Qu’est-ce que la régulation par un régulon
Une seule protéine régulatrice pour contrôler plusieurs gènes situés à différents endroits dans le génome
Qu’est-ce que la régulation par un stimulon
Le contrôle de plusieurs gènes non contigus par un même stimulus.
Définis mutation
Modification de la séquence des nucléotides de l’ADN.
Différencie une mutation spontanée de induite
Spontanée: erreurs lors de la réplication. Aléatoires
Induites: plus commune, fréquence plus élevées. Agents mutagènes et physicochimiques en cause
Nomme cinq groupes distincts de systèmes de réparation de l’ADN chez les bactéries
- Réparation directe de l’ADN
- Réparation par excision
- Réparation par recombinaison
- Réponse SOS (stimule le transfert horizontal de gènes)
- Réparation sujette à erreur (entraîne mutation parfois)
Nomme les trois mécanismes distincts d’échange de gènes chez les bactéries
- Transformation
- Conjugaison
- Transduction
Comment se fait la transformation
Absorption d’ADN libre à partir de cellules lysées dans l’environnement
Comment se déroule la transduction
Le matériel génétique est introduit à partir d’un phage dans les génomes bactériens
Comment se déroule la conjugaison
Implique le transfert d’ADN à travers des pili conjugatifs et constitue le mécanisme prédominant
Comment appelle-t-on la capacité qu’ont certaines cellules d’être modifiées génétiquement par de l’ADN externe libre
la compétence
Nomme certaines espèces de bactéries chez qui la compétence est naturelle
-Acinetobacter sp.
- Bacillus sp.
- Haemophilus influenzae
- Neisseria sp.
Qu’est-ce qui permet la compétence chez une bactérie
La capacité de faire entrer l’ADN externe dans sa cellule et de l’intégrer dans son génome par recombinaison homologue.
Comment les antibio favorisent-ils la transformation
En imposant une pression sélective aux bactéries transformées par des gènes de resistance
En agissant comme stimulus externe induisant ou augmentant la compétence
En favorisant la lyse de cellules, libérant ainsi l’ADN servant à la transformation.
Décris brièvement le phénomène de conjugaison
Une cellule donatrice étend un pili conjugatif vers une cellule réceptrice. Appelé également pili sexuel, c’est un moyen de transférer le matériel génétique entre deux bactéries.
Qu’est-ce qu’un bactériophage
C’est une virus qui parasite uniquement les bactéries
Définis le phénomène de transduction
C’est un transfert de gènes médié par les bactériophages
Qu’est-ce qu’un capside
C’est l’enveloppe protéique des bactériophages qui renferme leur matériel génétique (ADN ou ARN du phage)
Différencie un cycle lysogénique d’un cycle lytique chez le bactériophage
Lors de la lysogénisation, le bagage génétique transmis par le bactériophage est introduit dans le génome bactérien et se trouve répliqué. Il n’y a pas d’atteinte à la bactérie hôte dans le cadre de la lysogénisation
Lors du cycle lytique, l’ADN du phage s’excise du génome bactérien, puis crée de nouvelles particules de phages qui sont libérées et qui entraîne la lyse cellulaire
Décris les deux types de transduction de phage
La transduction peut être dit spécialisée, si le phage précédant la mort cellulaire possède un génome à la fois phage et à la fois bactérie. Cela n’impacte pas la propagation de ce phage
La transduction généralisée est l’empaquetage accidentel d’ADN bactérien et non-phagique. Cela empêche le bactériophage de se propager.
Décris brièvement le mécanisme de transposition
Un gène se trouve flanqué de deux séquences appelés IS. Une fois clivé, ce brin est transposé à un autre endroit à proximité (Phage, Plasmide, Chromosome etc.)
Différencie transposon simple de complexe
Un transposon complexe est un composite fait d’IS comme un transposon simple, mais qui contient plusieurs gènes.
Qu’est-ce qu’un intégron
C’est un élément génétique qui recrute des gènes de résistance et les intègrent les uns à la suite des autres devant des promoteurs forts assurant l’expression de multiples gènes simultanément.
Différencie le microbiote du microbiome
Le microbiote est l’ensemble des microbes, bactéries, archées, fungi, protistes et virus vivant dans un environnement spécifique.
Le microbiome est l’ensemble des génomes microbiens colonisant un environnement
Nomme certaines conséquences possibles des perturbations répétées du microbiotes par les antibiotiques chez l’enfant
Asthme, obésité, diabète T1, Sclérose multiple, cancer et autisme.
Récapitule brièvement le développement de la résistance
-Notre corps contient d’innombrables microbes
- Les antibio. tuent les bactéries
- Seules celles dite résistantes ont possibilité de devenir prédominantes et de proliférer
-Via conjugaison ou transformation, cette résistane peut être transférée à d’autres microbes
Nomme certaines barrières à l’échange des gènes de résistance
Dans le sol:
-Moins de mobilité
-Moins de sélection
Chez l’humain
- Plus de mobilité
- Plus de sélection
Décris la réaction d’amplification d’ADN par la polymérase et son usage dans le diagnostic rapide
Un ADN double brin est dénaturé pour former 2 brins. Il y a apposage des amorces et élongation. Les deux doubles brins sont à nouveau dénaturés, et le même processus s’ensuit. La croissance donc est exponentielle, et il y a environ 10000000000 copies au bout du 30e cycle.
