Cours 5 Flashcards
Qu’est-ce que provoquent les moteurs protéiques?
Les moteurs protéiques, en circulant le long des filaments, provoquent du mouvement dans le cytoplasme.
Quel est le rôle du noyau envers l’ADN?
Le noyau protège et séquestre l’ADN, cela évite des collisions avec les protéines moteurs ou les cargos qu’elles traînent.
Qu’est-ce que la transcription?
la transcription est la première étape de l’expression génique basée sur l’ADN, au cours de laquelle un segment particulier d’ADN est « copié » en ARN par une enzyme appelée ARN polymérase.
gene -> ARN pre-messager -> ARN messager
Qu’est-ce que la traduction?
la traduction génétique est l’étape de synthèse des protéines par les ribosomes, à partir de l’information génétique contenue dans les ARN messagers
ARNmessager-> proteine
Qu’est-ce que l’ARNm doit subir avant d’être traduit en protéine? (processus de transcription)
L’ARNm transcrit à partir de l’ADN doit subir plusieurs étapes de maturation avant d’être traduit en protéine (épissage, coiffe en 5’, poly-adenylation en 3’).
Quelle est la conséquence de la contrôle des sorties vers le cytoplasme par le noyau?
Le noyau empêche la traduction précoce des ARNm en
contrôlant leur sortie vers le cytoplasme.
Quelles sont les rôles du noyau (2)?
-protection de l’ADN
-protection de la transcription : empechement de la traduction précoce des ARNm en controlant les sorties vers le cytoplasme
Pourquoi les procaryotes n’ont pas besoin de noyau ?
-L’ADN des bactéries est majoritairement sans introns: la transcription et la traduction ont lieu simultanément dans le cytoplasme (donc pas de collision)
Le cytoplasme des bactéries ne possède pas de moteurs protéiques
Quelle est la conséquence d’un ADN non protégé par un noyau?
Augmentation du risques de mutation
Qu’est-ce que les chromosomes mitotiques?
Les chromosomes mitotiques (forme la plus condensée) sont de gros complexes d’ADN et de protéines (chromatine).
Comment sont distinguées (visibles) les chromosomes mitotiques?
Pour mieux les distinguer, il est possible d’utiliser différents colorants, comme le Giemsa (patron caractéristique de bandes)
ou des sondes fluorescentes complémentaires à des séquences spécifiques
Vrai ou faux: Il y a que des gènes sur les chromosomes.
Faux
Comment se trouves l’information génétique sur les chromosomes?
sous forme de gènes
Que peut-on retrouve sur un gène?
exons
introns
sequence régulatrice
Qu’est-ce que la séquence régulatrice dans le gène?
Contrôle la transcription du gène (quand et combien il faut faire de protéines)
Combien de paire de bases contient le génome humain?
Le génome humain contient 3 milliards de paires de bases
Quelle est la caractéristique commune des séquences codantes et régulatrices?
Les séquences codantes et régulatrices sont très conservées: en comparant l’ADN de plusieurs organismes différents, on isole et analyse les séquences similaires (bons candidats pour être des gènes).
Donne la définition des mots suivants:
1-Une sequence codante?
2-Une sequence conservee?
3-Une sequence régulatrice ?
1- partie d’ADN ou d’ARN (généralement ARN) qui contient les infos nécessaires pour la synthèse d’une protéine (exos est un exemple de séquence qui code pour la protéine)
2-sequence (nucleotides, d’acide amines,…) qui est retrouve dans plusieurs organisme
3-regule l’expression génique
l’expression génique de l’être humain est similaire a quel autre animal?
souris
Qu’est-ce que la séquence consensus?
La séquence consensus est la séquence conservée. Elle est composée des acides aminés ou nucléotides qui occupent une position donnée le plus fréquemment.
Qu’est-ce qu’un BLAST?
Alignement de séquences d’ADN (en nucleotides) de plusieurs espèces différentes, Un BLAST peut même se faire avec une séquence spécifique et toutes celles qui sont connues
Vrai ou Faux: Il est aussi possible d’aligner les séquences des protéines (en acides aminés).
Vrai
Qu’est-ce que des transposons?
Séquences répétées dont la majorité sont mobiles (se déplacent de manière autonome)
Vrai ou Faux: Tous le génome code pour des protéines.
Faux, seulement 1,5% du génome détient des genes codant pour des proteines.
En plus des transposons, qu’est-ce que l’ADN répétitif contient?
-des duplications de segments chromosomiques («crossing over» inégal durant la méiose)
-des séquences simples de 2-6 pb, répétées jusqu’à 100 fois (souvent dans les centromères et les télomères)
Qu’est-ce qu’un crossing over?
fait référence à l’échange d’ADN entre des chromosomes homologues appariés (un de chaque parent)
Ou retrouve-t’on les séquences simple de 2-6pb répétées jusqu’à 100 fois
ADN répétitif dans les centromères et telomeres
De combien de brins est compose le genome d’une batterie?
2:
-Gènes codant des protéines sur le brin +
-Gènes codant des protéines sur le brin0-
Sur quel gène se trouve l’ARNt dans le génome de la bactérie?
Gènes codant des protéines sur le brin +
Sur quel gène se trouve l’ARNr dans le génome de la bactérie?
Gènes codant des protéines sur le brin -
La principale constitution du génome d’une bactérie:
Principalement des séquences codant pour des protéines
Le genome de la bacterie possede-t-il des introns?
Majoritairement non
Quelle est la problématique dans le compactage de l’ADN?
-Le compactage d’ADN est problématique, à cause des groupements P chargés ‘-’ (accumulation de la charge du même type)
Décris l’adn humain (taille)
L’ADN eucaryote est très long et doit être condensé à l’intérieur du noyau. L’ADN humain mesure
2 m de long et doit être compacté à l’intérieur du noyau d’une cellule de 10-50 μm.
Quelles sont les 2 niveau de compactions observe, en telophase?
-Fibres condensées de ≥ 30 nm (région non transcrite)
-Fibres étendues ~ 10 nm (région active pour la transcription), ressemble à des perles sur un fil
Qu’est-ce qu’un nucleosome?
Le nucléosome (perles sur un fil): Structure de base de la chromatine et le premier niveau de compaction.
Les nucléosomes sont les bobines autour desquelles s’enroulent 146
paires de bases. Chaque nucléosome est composé de 8 histones (4
types différents, deux de chaque type). Il s’agit de la fibre de 11 nm
Pourquoi utilise-t’on un 5ieme histone ?
Une cinquième histone, l’histone (H1), stabilise l’ADN sortant des nucléosomes (approche les 2 extrémités)
et permet leur empilement en fibre 30 nm.
Décris les 4 histones du nucleosome
Les 4 histones du nucléosome possèdent deux régions bien distinctes : une queue N-terminale variable, qui permet la régulation de la liaison de l’histone avec l’ADN et une partie C-terminale conservée, qui permet l’assemblage du nucléosome.
Quelles sont les méthodes de stabilisation de l’histone (ce qui permet sa transcription ou pas)?
Acetylation
Phophorylation
Methylation et ubiquitination
Comment acetylation va stabiliser l’histone?
cache la charge + sur les lysines des histones et donc il y a une perte d’interaction avec l’ADN charge -
=perte des liens ioniques
=l’ADN se détache et donc moins condense
Comment phosphorylation va stabiliser l’histone?
Le P ajoute sur les serines va neutraliser une charge + voisine d cela lysine ou arginine. Le p peut augmenter l’effet de répulsion d’adn (en ajoutant des charges -)
Comment methylation et ubiquitination va stabiliser l’histone?
rend l’histone compatible a des proteines
Que se passe-t-il aux queues N qui sortent du nuclesomes?
peuvent être modifiées par des enzyme
Avec quoi peut-on faire des boucles d’heterochromatine?
proteins sir (apporte une condensation de plus)
Qu’est-ce que l’euchromatine et l’heterochromatine?
L’ADN en fibres de 11 nm peut être transcrit en ARN. Il s’agit de euchromatine.
À partir de 30 nm, on parle d’hétérochromatine (ADN non transcrit).
Quelle est la conséquence de la condensation (par protéines.sir)
Plus condensée === Moins accessible aux protéines lors de la transcription, réplication, recombinaison
Qu’est-ce que le nucléole?
espace non défini par une membrane, dans le noyau
Une section du noyau apparaît plus sombre au microscope MET (présence de plusieurs protéines). Le nucléole est fibrillaire au centre et plus granuleux en périphérie.
a quoi sert les 2 zones du nucléole?
- La zone fibrillaire est la zone de transcription des ARN ribosomaux, à partir de 200 gènes arrangés en tandem
-la zone granuleuse est le site d’assemblage des sous-unités ribosomales (ARNr + protéines)
Qu’ets-ce que le ribosome?
Le ribosome sert à la traduction de l’ARNm en protéine, dans le cytoplasme. Il est composé de deux sous- unités (grosse et petite) qui s’assemblent uniquement au moment de la traduction.
Comment fonctionne le ribosome/traduction
-un site pour l’ARNm est présent
-site A : entree du ARNt, charge d’un a . a (amino-acyl-ARNt)
-site p :occupe l’ARNt (peptidyl-ARNt)qui tient en charge l’élongation de la chaine peptique
-site E: sortie de l’ARNt après avoir donne l’a.a (amino-acyl-ARNt)
le mouvement du ribosome provoque le déplacement des sites
Presentes les étapes de la biogenèse des ribosomes
(i) Transcription des composants (ARNr, ARNm codant
pour les protéines ribosomales (RP) et les facteurs
d’assemblage (AF) et snoRNA ) : ARNr et ARNm transcrits
dans le noyau (ARNr dans le nucléole et ARNm à l’extérieur du nucléole)
(ii) Traitement (épissage des pré-ARNr);Retrait des introns
(iii) Modification des pré-ARN, RP et AF: se preparent a la traduction, doivent passer par la queue, la coiffe, epissage
(iv) Assemblage des sous-unités en périphérie du nucléole;
(importation nucléaire de RP et d’AF); vont retrum er vers rehoyal pour retrouver ARNr
(v) Transport : exportation de pré-ribosomes vers le
cytoplasme;
(vi) Contrôle de la qualité et la surveillance.
Qu’est-ce que les snRNPs (snurps)
complexe ARN-proteine qui sert a l’epissage des ARNm et
utilises pour lier les séquences spécifiques aux extrémités des introns (ce qui permet de les enlever) (PAS EN GRAS DANS LE PP)
Qu’est-ce que les snoRNPs?
complexe ARN-proteine qui modifie et coupe les précurseurs de l’ARNr durant la maturation
Qu’est-ce que le corps de Cajal
endroit ou se fait la synthèse des snoRNPS et snRNPs??
Recyclage , assemblage modif
Ou est-ce que s’assemble le complexe 40s 60s
Dans le cytoplasme en présence d’un ARNm pour effectuer la synthèse de ;a protéine
Ou s’effectue la transcription des ARNr et ARNm?
ARNr=a l’intérieur du nucleole
ARNm= a l’extérieur du nucléole
Vrai ou Faux: ARNr et protéines ribosomales passent par les mêmes étapes.
Faux
Pourquoi l’ARNr ne quitte pas le nucléole?
L’ARNr ne quitte pas le nucléole puisqu’il n’a pas besoin de produire de protéine, il ne passe, donc, pas besoin de traduction.
Laquelle est la moins condense entre l’euchromatine et l’heterochromatine, par conséquent la plus active ?
l’euchromatine est compose de 11nm d’adn en fibre, elle est donc moins condensée = ADN plus accessible = accessible aux proteines lors de la transcription, réplication, recombinaison
Qu’est-ce qui s’insère dans les proteines Sir?
Les queues N
Quel est le rôle de la queue N-terminal de la région du histone ? meme question pour C-terminal
queue N-terminale =permet la régulation de la liaison de l’histone avec l’ADN
partie C-terminale =permet l’assemblage du nucléosome.
Quelles sont les 8 histones qui composent le nucleosome?
(2xH2A + 2xH2B + 2xH3 + 2xH4)
