Cours 5 Flashcards

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1
Q

Quels sont les 3 types d’animal transgénique?

A

1- Transgénique
2- Knock-out (invalidation de gène)
3- Knock-in

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Q

Qu’est-ce qu’un animal transgénique?

A

addition d’un gène inséré au hasard

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3
Q

Qu’est-ce qu’un animal knock-out?

A

Perte de fonction pour étudier la fonction d’un gène

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4
Q

Qu’est-ce qu’un animal knock-in?

A

Insertion d’un ADN dans un locus spécifique
a. Gain de fonction
b. Modification de fonction
c. Humanisation (gène souris en gène humain)

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5
Q

Pourquoi utiliser des souris comme modèles transgéniques?

A

Essentiel pour la recherche scientifique médicale
1- Modéliser le développement de maladies humaines dans un environnement contrôlé
2- Étudier spécifiquement la fonction de certains gènes et l’effet de certaines mutations
3- Tester d’éventuels nouveaux traitements thérapeutiques : valider le mécanisme d’action, l’efficacité et l’innocuité
4- Reproduire les caractéristiques spécifiques, les symptômes ou pathologie d’une maladie
5- Essais sur les hommes sont un problème éthique

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6
Q

Qu’est-ce qu’un transgène?

A
  • Un transgène est un ADN qui est pris dans un organisme et incorporé dans le génome d’un autre organisme. Cet ADN peut coder pour une protéine ou un ARN.
  • Dans le cas d’une séquence codante, on parle de cDNA.
  • Cette modification génétique peut entraîner une modification du phénotype de l’organisme génétiquement modifié.
  • L’incorporation du transgène dans les cellules germinales permet la transmission du transgène aux futures génération.
  • Ex : entrée d’un virus dans une cellule dans des souris transgéniques
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7
Q

Quelles sont les modèles d’études du cancer chez la souris?

A

1- Modèle de transplantation
2- Modèles de souris génétiquement modifiés

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8
Q

Qu’est-ce que le modèle de transplantation?

A
  • Modèle de xénogreffes de tumeurs dérivées de patients (humain à la souris)
  • Transplantation d’une lignée cancéreuse humaine dans une souris immunodéficience à partir de lignée cellulaire, évite de rejeter la tumeur
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9
Q

Qu’est-ce que la tumorigénèse de novo?

A

1- Expression d’un oncogène
La tumorigenèse de novo est induite par l’expression transgénique d’un oncogène (ONC) à partir d’un promoteur spécifique à un tissu.
2- KO gène suppresseur de tumeur
La tumorigènese de novo est induite par l’invalidation du gène suppresseur.
3- Expression ou KO conditionnel
La formation de novo de tumeurs est induite par l’inactivation d’allèles tumeurs suppresseurs de gènes conditionnels (C) et/ou l’activation d’oncogènes conditionnels (D) médiée par la Cre-loxP et spécifique au tissu. L’expression tissulaire spécifique de la Crerecombinase est obtenue par croisement avec des souris transgéniques Cre ou des souris transgéniques Cre-ERT inductibles au tamoxifène

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10
Q

Quels sont les inconvénients à utiliser des modèles de souris?

A

1- Malgré la grande homologie entre les gènes de la souris et ceux de l’homme, certains gènes ne sont pas interchangeables ou uniques à chaque espèce.
2- Si la majorité des paramètres du modèle de la maladie sont corrects et qu’un traitement est efficace chez la souris, il ne l’est pas forcément chez l’humain.
3- Certaines maladies humaines ne peuvent pas être entièrement modélisées chez la souris, ou se développent différemment chez la souris. Ceci peut constituer un inconvénient important pour la compréhension de la maladie et l’évaluation des traitements potentiels

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11
Q

Pourquoi créer des animaux d’élevage génétiquement modifiés?

A

1- D’améliorer la valeur nutritionnelle de la viande, du lait et des œufs
2- De rendre les animaux résistants aux maladies vétérinaires telles que la mammite et la maladie de la vache folle (chaque année, 20 % des vaches et autres animaux du secteur de l’élevage sont perdus à cause d’une maladie)
3- De produire des médicaments pour l’homme à partir du lait de vaches, de chèvres ou de lapins transgéniques: biopharming

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12
Q

Qu’est-ce que la Pharmaculture animale ou biopharming?

A

Technologie basée sur la modification de l’ADN d’un animal pour y introduire un nouvel ADN, appelé transgène, provenant d’une autre espèce. Ces animaux transgéniques sont utilisés pour fabriquer des protéines humaines ayant une valeur médicale. En général, la protéine codée par le transgène est sécrétée dans le lait, les œufs ou le sang de l’animal, puis recueillie et purifiée. Des animaux tels que les bovins, les moutons, les chèvres, les poulets, les lapins et les porcs ont déjà été modifiés de cette manière pour produire plusieurs protéines et médicaments utiles

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13
Q

Quels sont les enjeux de la pharmaculture?

A

Enjeux de la pharmaculture : “Coûts en vies animales”
- En règle générale, seul 1 % des œufs injectés donneront lieu à une naissance et tous les animaux n’exprimeront pas le transgène d’une manière optimale.
- Pour certains, le coût élevé, en vies animales et en argent, de la fabrication d’un animal transgénique ne vaut pas les avantages éventuels.
- D’autres estiment que le coût est justifié par les vies humaines qui pourraient être sauvées grâce aux médicaments produits.
Enjeux de la pharmaculture : Les besoins sont importants
Certaines des protéines actuellement développées en pharmaculture peuvent être collectées à partir de dons de sang humain. Cependant, les besoins sont bien plus importants que l’offre, et il existe également un risque de contamination indésirable dans les produits dérivés du sang humain
Enjeux de la pharmaculture : Avantages pour le développement durable
Chaque cas doit être évalué séparément pour comparer les avantages et les risques. Par exemple, dans le cas de Spidergoat, la soie d’araignée remplacerait de nombreux produits courants à base de pétrole dont la fabrication nécessite des produits chimiques toxiques.

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14
Q

Qu’est-ce que la transgénèse classique?

A

Addition de gène : Injection dans le zygote, intégration aléatoire, réimplantation, faible efficacité
1. Intégration aléatoire peut produire des phénotypes différents
2. Nécessité d’analyser plusieurs lignées transgéniques indépendantes pour confirmer la spécificité du phénotype obtenu

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15
Q

Quelles sont les avantages/enjeux de l’approche avec vecteur rétroviral pour la transgénèse?

A

1- Les rétrovirus insèrent leur matériel génétique dans le génome de la cellule de manière prévisible, en ciblant des séquences spécifiques qui n’interrompent généralement pas les fonctions normales d’une cellule.
2- Cette approche quand même soulève des inquiétudes quant à la possibilité de création et de propagation de nouveaux virus lorsque les composants viraux du transgène se combinent avec des virus naturellement présents dans un organisme.

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16
Q

Quelles sont les étapes d’une modification génétique avec des cellules souches embryonnaires?

A

1- Lignée cellulaire ES + Construction de ciblage
2- Transfection ou électroporation
3- Sélection
4- Microinjection
5- Implantation dans souris pseudogestante

17
Q

Qu’est-ce que l’intégration ciblé par recombinaison homologue?

A

Capacité de transformé en molécule toxique
Intégration par recombinance homologue : Cellules résistantes
Intégration aléatoire : Cellules sensibles
Cette double sélection permet donc de sélectionner majoritairement des cellules ES avec intégration ciblée

18
Q

Vrai ou Faux
Dans la très grande majorité des cas, la recombinaison homologue ne modifie qu’un seul des 2 allèles?

A

Vrai

19
Q

Comment vérifier l’intégration lors de la croissance des cellules?

A

par PCR

20
Q

Quelles sont les cellules ES sensibles au gancylovir?

A

Les cellules sans intégration ou avec intégration aléatoire

21
Q

Quelles sont les cellules ES résistantes au G418?

A

Cellules avec intégration ciblée

22
Q

À quoi sert une souris KO?

A

1- Une souris knock-out (KO) est une souris de laboratoire chez laquelle un locus (gène) a été inactivé en le délétant ou en le perturbant par un morceau d’ADN recombinant.
2- C’est une approche de référence largement utilisée pour étudier la fonction d’une protéine dans un organisme entier.
3- L’observation du phénotype des souris KO fournit des informations pour mieux comprendre comment un gène similaire peut causer ou contribuer à une maladie chez l’homme.

23
Q

Lorsqu’il y a une insertion de cassette d’expression ayant pour but d’inactiver le gène cible, est-ce un KI ou KO?

A

KO car malgré l’insertion, c’est une inactivation

24
Q

Quels sont les désavantages possibles d’un knock-out conventionnel/constitutif?

A

1- Environ 1/3 des gènes sont essentiels: leur délétion sur les 2 allèles peut donc induire: – Une létalité embryonnaire ou post-natale, ce qui empêche l’obtention du modèle animal pour l’étude de la fonction d’une protéine par exemple; – L’activation de mécanismes compensatoires via l’activation d’autres gènes, ce qui peut interférer avec le modèle animal
2- Toutes les cellules de l’organisme sont KO: – On ne peut pas déterminer le rôle spécifique d’un gène dans un type cellulaire ou dans un tissu en particulier

25
Q

À quoi sert une souris KI?

A
  1. Une souris knock-in (KI) est une souris de laboratoire chez laquelle:
    a. un locus (gène) a été inséré dans un autre locus particulier
    b. un allèle normal a été remplacé par un allèle mutant
  2. Une souris KI sert à modéliser des variations génétiques humaines en créant une mutation ponctuelle dans le gène, à effectuer les humanisations génétiques où le gène endogène est remplacé par le gène humain, et à insérer des rapporteurs fluorescents où l’expression d’une protéine fluorescente est contrôlée par des éléments régulateurs endogènes.
26
Q

À quoi sert les modifications génétiques conditonnelles?

A

spécifique à un tissu ou à un type cellulaire et pour enlever une cassette de sélection

27
Q

Qu’est-ce que le système Cre-loxP?

A

Une recombinaison entre 2 sites loxP dans la même orientation entraine la délétion de la séquence située entre les 2 sites loxP.
Si la recombinase Cre est exprimée dans un type cellulaire ou un tissu spécifique, l’excision se fera spécifique, l’excision se fera spécifiquement dans ce type cellulaire ou ce tissu.

28
Q

Quelle est la différence entre le système Flp-FRT et Cre-loxP?

A

La recombinase : soit Flp ou Cre.
Le principe est le même.

29
Q

Quelles sont les étapes de la stratégie KO avec le système Cre-loxP?

A

1- Construction de ciblage
2- Recombinaison homologue dans les cellules ES
3- Injection dans blastocystes receveurs
4- Souris chimères
5- Croisements pour obtenir des hétérozygotes puis des homozygotes

30
Q

Vrai ou Faux
Dans le KO conditionnel, le type cellulaire est non spécifique?

A

Faux, type cellulaire spécifique pour le KO conditionnel. L’expression dans un type cellulaire non spécifique est lors de KO constitutif.

31
Q

Quelles sont les étapes du KO conditionnel?

A

1- Locus génomique + construction de ciblage
2- Allèle modifié après recombinaison homologue
3- Allèle KO conditionnel après Flp
4- Après Cre, allèle KO dans un tissu ou type cellulaire spécifique ou bien constitutif

32
Q

Quelles sont les étapes pour passer le KO conditionnel de cellules ES à la souris?

A

1- Transfection/électroporation
2- Double sélection
3- Recombinaison Flp
4- Microinjection
5- Implantation dans des souris pseudogestante

33
Q

Quels sont les objectifs du KI cDNA pour remplacer l’expression du gène cible?

A

1- Expression d’un cDNA sous le contrôle du promoteur endogène
2- KO du gène cible

Conçue pour permettre l’expression de la protéine humaine sous le contrôle des éléments régulateurs endogènes de la souris tout en éliminant l’expression de la protéine de la souris, c’est un remplacement de gène.

34
Q

Qu’est-ce qu’un KI humanisation?

A

Inséré la construction ciblage à partir d’exon codant humain pour remplacer les exons codants de souris. Une cassette de résistance à chaque extrémité est utilisé pour sélection les évènements de recombinaison homologue permettant l’intégration complète.

35
Q

À quoi sert le système Tet-on ou Tet-off?

A

Modèle de souris génétiquement modifiées régulées par la tétracycline

36
Q

Dans quel modèle de Tet, la doxycycline inhibe l’expression?

A

Tet-off

37
Q

Vrai ou faux
Dans le système Tet-on, la doxycycline active l’expression?

A

Vrai