Cours 5

Question 1

Extremophiles vs extremotolérants?

Answer 1

Extremophiles ont besoin de vivre dans des milieux extremes tandis que les extremotolérants ne sont pas obligés mais les tolèrent.

Question 2

Caractéristiques acidophiles? (1) + exemple endroit

Answer 2

Croissance seulement lorsque pH plus bas que 4
Ex: source volcanique ou effluents miniers

Question 3

Mécanismes pH faible? (5)

Answer 3

1. Éventail de molécules tampons + acides aminés basiques (lysine, arginine et histidine) capable de séquestrer les protons
2. Des pompes à efflux et influx
3. Membrane imperméable
4. Dégradation des acides
5. Réparation ADN (++ chaperonnes et répétition de séquences dans le génome de système de réparation)

*Les acidophiles ne possèdent pas un pouvoir tampon plus puissant que les neutrophiles

Question 4

Résistance au milieux acides est il transmissible?

Answer 4

Oui, par: plasmide, élément mobile, CRISPR.

Question 5

caractéristiques Alacalophiles? (5)

Answer 5

1. Pousse dans un pH plus grand que 9
2. Est capable de régénérer l’ATP (ATP synthase réutilise les protons perdu)
3. Transporteurs membranaires importe protons
4. Utilisent des protéases actives en milieu basiques
5. Utilisent pompes a sodium pour l’énergie motile

Question 6

Caractéristiques des bactéries Thermophiles? (2)

Answer 6

1. Températures moyenne de plus de 45 degrés Celsius.
2. Adaptatives ou primitives (ont peu évoluées)

Question 7

Phylum Aquificae (métabolisme et morphologie)

Answer 7

Métabolisme:
- Source d’énergie : oxydation de l’hydrogène
- Aérobie et microaérophile en raison d’une solubilité de l’O2 faible
- autotrophe

Morphologie: Bacille filamenteux, Gram négatif. Granules de sulfure

Question 8

Phylum Thermotogae (métabolisme et morphologie)

Answer 8

Métabolisme:
Hétérotrophe
Anaérobies fermentatifs (utilise soufre comme accepteur final d’électron)

Morpho:
Bacille, Gram négatif et présence de sacs riches en porines

Question 9

Mécanismes d’adaptation aux températures élevées (4)

Answer 9

1. Membrane est plus rigide, acides gras sont plus saturés
2. Gyrase inverse qui enroule l’ADN de façon plus stable. Plus d’histones.
3. Heat shock proteines
4. Enzymes performants a haute température

Question 10

Température maximale pour les thermophiles?

Answer 10

120 C. Protéines se dénaturent (a.a racémiques)

Question 11

Caractéristique (1) et mécanismes (3) des psychrophiles?

Answer 11

1. 20C et moins.
2. 85% de la biosphère est à 5C et moins.
3. Combinaison de Tréhalose (effet drainant) + EPS (séquestration nutriments, protection enzymes contre le froid) = cryoprotection
4. Membrane moins fluide
5. Synthèse de proteines de résistance (anti-gel, acclimatation au froid, protéine de liaison à l’ADN) Elles sont ultra sensibles à la chaleur

Question 12

caractéristiques des barophiles? (4) + exemple

Answer 12

• Croissance optimale à plus de 100 kpa (fond marin)
• membranes riche en a.g
• moins d’a.a glycine et proline en raison de leur flexibilité dans les protéines.
• expression chaperonnes ++

*Record = pyrococcus yayanosii avec 150 megapascal)

Question 13

caractéristiques des Halophiles? (4)

Answer 13

1. Majorité sont Archeea
2. Minimum de 10-15% de NaCl
3. Aquaporines actives, pompes à ions qui augmentent la pression osmotique intérieur.
4. utilisation du Na+ pour processus essentiels.

Question 14

Exemples de halophiles Gram -?

Exemples de halophiles Gram +?

Answer 14

Halomonas et Chromobacter

Halobacillus, marinacoccus

Question 15

Bactéries Vs archées halophiles?

Answer 15

Archées ont besoin de beaucoup plus de sel que les bactéries.

Ex: on baisse la salinité —> bactéries augmentes. On augmente la salinité —> archées augmentes

Question 16

Bactéries qui exploitent les métaux?

Utilisation des métaux?

Les bactéries blindées?
Utilités? (2)

Answer 16

Bactéries acidophiles et thermophiles. Oxydation et réduction.

• Plusieurs bactéries vont utiliser le Fe2+ pour faire de l’oxydation et de la respiration aérobie
• Certaines bactéries vont utiliser le Fe3+ qu’elles vont précipiter autour d’elles
  Utilités: Précipiter l’or et la bioremédiation.

Question 17

NOTE 1
Les bactéries sulfato-réductrice sont retrouvés dans quasiment toutes les branches procaryotiques de l’arbre de la vie.

Question 18

Caractéristiques bactéries sulfureuses? (3) + exemple

Answer 18

1. Bactéries photosynthétiques anaérobies
2. Ont besoin de sulfide (S2-) pour pousser (oxydation du sulfide)
3. Accumulatrices de soufre dans les vacuoles.

Ex: chromatium okenii

Question 19

2 types de bactéries sulfureuses? (Couleur)

Bactérie capable d’associer le cycle du soufre et celui de l’azote?

Answer 19

Vertes et pourpres

Thiomargarita. Vacuoles de nitrate et de soufre.

Question 20

Applications des extremophiles? (5)

Answer 20

Lixiviation: acidophile + thermophile pour extraire les métaux .

Polymérase PCR par thermus aquaticus

Xylanase pour papier et boulangerie

Nucléase H pour l’alimentation.

Halophiles pour produire l’ectoïne dans les crèmes, pancréas et Alzheimer.

Question 21

Problèmes sanitaires? (2)

Answer 21

Listeria qui résiste aux basses température

Staphylococcus aureus qui résiste aux grandes concentrations de sel.