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Microorganismes phytopathogènes > COURS 4 et 5 > Flashcards

COURS 4 et 5 Flashcards

1
Q

Associer les phylums suivant aux bons règnes:

a. Eumycota
b. Oomycota
c. Plasmodiophoromycota
i. Chromaveolata
ii. Fungi
iii. Stramnipila

A

a. ii
b. iii
c. i

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2
Q

Qu’est-ce qui différencie les champignons de leur analogues?

A

Oomycota et Plasmodiophoromycota n’ont pas de chitine dans leur paroi.

Évolution convergente: hétérotrophe par absorption

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3
Q

Est-ce que les 3 phylums (Eumycota, Oomycota et Plamodiophoromycota) sont dans les Unikonta/Opimoda?

A

Non Oomycota et Plamodiophoromycota =Bikonta/Diphoda

2 flagelles

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4
Q 
Nommer un problème majeur de l'ancienne classification se basant sur la reproduction sexuée et la phylogénie:
Chytridiomycota (primitifs)
Glomeromycota (symbioytiques) 
Lignées des zygomycètes
Ascomycota (ascospores)
Basidiomycota (basidiospores)
A

Les zygomycètes sont un groupe polyphylétique

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5
Q

Comment est-ce que les Oomycota se reproduisent?

A

Oogamie

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6
Q

Lorsqu’on parle de lime molds/ moisissures visqueuses, on parle de quel phylum?

A

Plasmodiophoromycota

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7
Q

Expliquer à quoi ressemble l’appareil végétatif/la thalle des Plasmodiphoromycota.

A

le thalle= un plasmode
SANS paroi externe ni de cloisons internes
Donc, pas de forme déterminée= masse cytoplasmique multinucléée

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8
Q

Expliquer à quoi ressemble l’appareil végétatif/la thalle d’Eumycota et Oomycota.

A

le thalle est unicellulaire (levures)
ou filamenteux, formé de filaments tubulaires cylindriques ramifiés ou non
Le mycélium peut s’agréger en strome (filaments forment un tissu)

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9
Q

Quel champignon est responsable pour les ronds de sorcière?

A

Marasmius oreades

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10
Q

Nommer 2 synonymes pour décrire des hyphes non cloisonnées.

A

coenocytiques ou siphon

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11
Q

Les hyphes peuvent former des structures spécialisées comme des appressoria et les haustoria (=suçoirs).
Quelle de ces structures se trouvent chez les biotrophes?
Laquelle se trouve chez les nécrotrophes?

A 
Apressoria= rôle de pénétration -> nécrotrophe
Haustoria= se développent à l'intérieur des cellules. rôle: absorber les nutriments qui s'y trouvent -> biotrophe
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12
Q

Les rhizomorphes et les sclérotes sont des exemples de strome. Quelle raison justifie la spécialisation de ces tissus?

A

ORGANES DE CONSERVATION
Rhizomorphes= cordons mycéliens subcorticaux/ plusieurs filaments
peuvent devenir très rigide

Sclérotes= forme de reproduction favorisant la conservation= très rigide

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13
Q

Expliquer ce qui distingue la paroi des Ascomycota, Basidiomycota, Chytridiomycota et Glomeromycota des Zygomycètes et Oomycètes.

À noter, le stérol présent dans la membrane cytoplasmique de la plupart des champignons est l’ergostérol

A

paroi constitué de chitine (N-acétylglucosamine)

Zygomycètes= paroi en chitosane (glocosamine)

Oomycètes= cellulose (glucose) critère qui a confirmer que ce phylum n’appartenait pas aux Eumycota

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14
Q

Expliquer la croissance de l’hyphe.

A

La croissance de l’hyphe est strictement apicale et de très nombreuses vésicules cytoplasmiques se concentrent dans la zone d’expansion.
On y trouve également le Spitzenkörper (plusieurs vacuoles “l’oeil du champignon” réagit à la lumière, centre métabolique avec bcp de mitochondries pour favoriser la croissance apicale)

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15
Q

Associer les modes de reproduction aux termes anamorphe et téléomorphe. Dire quelle forme favorise la dispersion et laquelle promeut la conservation.

A 
AS= anamorphe, dispersion
S= téléomorphe, conservation
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16
Q

Les spores suivants sont issus de quel mode de reproduction? conidies, chlamydospores, zoospores

A 
AS
Chlamydospores  (forme de résistance apparaissant sous forme d’articles terminaux ou intercalaires)

zoospores= motiles 1 ou 2 flagelles

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17
Q

Nommer les principaux appareils permettant la fructification des conidies (AS) chez les Ascomycota.

A

Pycnide (conceptacles ouverts par un ostiole)
Acervule (déchirement du tissu hôte)
Corémie/stilbum
Sporodochium

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18
Q 
Associer chacun des taxons avec le nom de leurs spores sexués:
Oomycota
Zygomycètes
Ascomycota
Basidiomycota
A

oospore
zygospore
ascospore
basidiospore

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19
Q

Décrire le cycle de reproduction sexuée des champignons.

A

Le cycle de reproduction sexuée des champignons comporte une étape de plasmogamie (fusion/rencontre de 2 hyphes), suivie d’une caryogamie (fusion des 2 noyaux, phase dicaryotique avec mitose conjugué) et d’une méiose.

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20
Q

Expliquer la formation de l’oospore.

A

L’oospore résulte de l’union de deux gamétanges (contenant les gamètes) morphologiquement distincts (hétérogamétangie), l’anthéridie et l’oogone

Pythium sp.

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21
Q

Expliquer la formation du zygospore.

A

La zygospore résulte de l’union de deux gamétanges morphologiquement identiques (isogamétangie)

2 hyphes
gamétangiogamie
croissance
formation d’une zygospore

Rhyzopus sp.

Il faut causer un stress pour favoriser ce mode de reproduction.

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22
Q

Expliquer la formation de l’ascospore.

A

L’ascospore est une endospore haploïde caractéristique du phylum des Ascomycota .
Dans l’asque il y a 8 ascospores.

Le zygote subit une méiose -> 4 noyaux suivit d’une mitose -> 8 noyaux au total
on peut observer l’enjambement génétique.

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23
Q

Nommer les principaux appareils permettant la fructification donnant naissance aux asques (S).

A

Cléistothèce (ascospores désordonnées)

Périthèce (parfois asques très filiformes, comme pycnide, mais ne donne pas des conidies, donnent des ascospores!)

Apothécie (plus évolué même si les organes reproducteurs sont moins protégés… projectiles-> armée) Sclerotinia sclerotiorum : production d’apothécie à partir des sclérotes

Pseudothèce (dans les tissus de l’hôte)

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24
Q

Expliquer la formation du basidiospore.

A

La basidiospore est une spore exogène qui naît sur une baside.

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25
Décrire classifications fondées sur les critères morphologiques.
Critères utilisés pour la classification des champignons -Morphologie du thalle thalle non filamenteux thalle filamenteux cloisonné ou non -Type et morphologie de l’organe de reproduction sexuée oospore ascospore basidiospore -Type et morphologie de l’organe de reproduction asexuée (conidie)
26
Chez les champignons comment est-ce qu'on nomme le terme de spécialisation à un hôte (ex. chez les bactéries c'est un pathovare)?
forma specialis race= variété (R) biotype=propriétés particulières de l’isolat (ex.: résistance à tel ou tel fongicide)
27
Pourquoi est-ce que le Fusarium a longtemps été considéré un deutéromycètes/ un champignon imparfait?
Se reproduit majoritairement via la reproduction AS. Les conidiophores sont en forme de fuseau. Conidies pluricellulaires en forme de fuseau.
28
Expliquer pourquoi on utilise les ITS 1 et ITS 2 comme code barre pour identifier les champignons.
Internal transcribed spacer (ITS) refers to the spacer DNA situated between the small-subunit ribosomal RNA (rRNA) and large-subunit rRNA genes in the chromosome. Ne code pas pour l'ARN donc ne sont pas soumis à la pression de sélection. => amorces conservées pour 18s et 28s
29
Donner des caractéristiques générales des Plasmodiophoromycota et nommer les 3 genres.
Champignons dont le thalle est constitué d’un plasmode Parasites obligatoires d’organes souterrains et de tiges Plasmodiophora Polymyxa Spongospora (agent de la gale poudreuse de la pomme de terre) rappel gale commune = PdT
30
Décrire Plasmodiophora brassicae | l’agent de la hernie des crucifères.
Dégâts d’une importance économique majeure. Jusqu’à 10% de dégâts dans le monde entier L’hernie constitue aujourd'hui la maladie la plus importante des crucifères Les cellules augmentent de volume (hypertrophie). Ce n'est pas une tumeur!!! kyste pénètre via poil absorbant! Perce la cellule tôt et y injecte son cytoplasme très visqueux qui va être en mesure de créer sa propre membrane plasmique.
31
Nommer deux espèces de Polymyxa qui sont des vecteurs importants pour des virus.
Polymyxa betae : vecteur du virus de la rhizomanie de la betterave Polymyxa gramini : vecteur du virus de la mosaïque de l’orge
32
Vrai ou faux. | Les zygomycètes peuvent former des zoospores.
Faux | ils ont de zygospores! et nymphes coenocytique (siphon)
33
Quelle taxon cause: les fontes de semis et les pourritures radiculaires Les mildious (nécroses) Les rouilles blanches
Oomycota
34
Quel agent est responsable d'un grand nombre de mildious?
Les Peronosporaceae
35
Quel pathogène est responsable du mildiou de la pomme de terre. À noter: les sporangiphores sortent des stomates et se ramifient de façon dichotomique. Sporocystes sont identiques entre la reproduction S et AS. Forme diploïde plus importante alors que les autres champignons ont une phase haploïde dominante.
Phytophtora infestans
36
Le zoospore des Oomycètes possède combien de flagelle(s)?
2
37
Quelle température est idéale pour entamer le cycle de vie de Phytophtora infestans?
12-15°C
38
Chez Oomycota, la méiose à lieu avant ou après la fertilization.
Avant, une méiose a lieu dans l'oogone et une autre dans l'anthéridie.
39
Nomme la maladie causée par Plasmopara viticola .
Mildiou de la vigne introduit accidentellement en Europe en 1870 (porte-grêfe résistant à un insecte ravageur en France), après quoi il a détruit la quasi-totalité du vignoble français. LUTTE: mélange de la chaux et de sulfate de cuivre (bouillit bordelaise) est actif sur cet oomycète!
40
Nommer le genre qui cause la rouille blanche.
Albugo la fructification est AS Hausteria sporocysts s'adapte à l'env (AS vs S) hyphes=siphons
41
Pourquoi est-ce que le taxon Chytridiomycota est considéré primitif chez les vrais champignons. Nommer 2 genres importants (peuvent être des vecteurs pour certains virus)
le zoospore n'a qu'un flagelle Olpidium Synchytrium
42
Est-ce que les ascospores et basidiospores ont une origines sexuée ou asexuée?
sexuée
43
Nommer un genre primitif des Ascomycètes. | Indice: les ascospores sont nus sur le tissu de l'hôte et désordonnés.
Taphrinales Taphrina deformans-> responsable du cloque du pêcher
44
Comment sont placés les ascospores chez l'ordre Erysiphales?
Cléistothèces avec appendices (fulcres) | ressemble à un soleil
45
Qu'est qu'il ne faut pas confondre entre les oïdium VS mildiou?
oïdium =face supérieure | mildiou= face inférieure
46
Comment nommons-nous le taxon qui a des asques agrégés, contenus dans un périthèce. (= ascocarpes globuleux, pourvu d’un ostiole)
Pyrénomycètes
47
Chez les Ascomycota chez les Pyrénomycètes. Nommer des ordres et genre associé aux périthèces de couleur vive et celles de couleurs foncées.
vive=Ordre des Hypocréales (Claviceps) foncée=Ordre des Diaporthales (Magnaporthe et Cryphonectria) Ordre des Ophiostomales (ophiostoma) Ordre des Phyllachorales (Glomerella)
48
Nommer les caractéristiques générales du pathogène Ophiostoma ulmi.
Ascomycota-> Pyrénomycètes->Ophiostomales (périthèces couleur foncée) l ’agent de la graphiose de l ’orme./ maladie hollandaise de l'orme le périthèce se prolonge par un col par où s ’échappent les ascospores
49
Nommer les caractéristiques générales du pathogène Claviceps purpurea.
Agent de l'ergot du seigle Ascomycota-> Pyrénomycètes->Hypocréales (périthèce à couleur vive) LSD, Albert Hofman 1943
50
Nommer les caractéristiques générales du pathogène Fusarium.
Ascomycota-> Pyrénomycètes->Hypocréales Plusieurs espèces produisent des mycotoxines Maladies vasculaires Nécroses Conidies pluricellulaires en forme de fuseau.
51
Quelle est la forme téléomorphe de Fusarium graminearum?
Gibberella zeae reprod S Donc fusarium= reproductive AS
52
Nommer 2 ordres des Loculoascomycètes et les genres qui y sont associés. (ASCOMYCOTA)
Ordre des Dothidéales (Mycosphaerella) Ordre des Pléosporales (Venturia)
53
Nommer 1 ordre des Discomycètes et 2 genre qui y sont associés. (ASCOMYCOTA)
Hélotiales (Sclerotinia & Monilinia)
54
Nommer le plus grand genre de champignons phytopathogènes (appartenant dans les Ascomycètes).
Genre Mycosphaerella (dans les Loculoascomycètes) Mycosphaerella graminicola (téléomorphe: Septoria tritici) agent de la septoriose du blé d'hiver-> US 275M et Europe 400M pour fongicide Mycosphaerella fijiensis agent de la cercosporiose noire du bananier (mycotoxine qui perturbe le fonctionnement des chloroplastes) nécrose au niveau du feuillage
55
Qui suis-je? L’agent de la tavelure du pommier. Mes périthèces se forment dans les feuilles mortes ; mes ascospores sont éjectées lors de pluies au printemps. Je me conserve dans les feuilles et les fruits. Mes ascospores sont bicellulaires et inégales.
Venturia inaequalis Ascomycota-> Loculoascomycètes->Pléosporales Tavelure: Au printemps= nécrose au niveau du feuillage et gale sur le tégument
56
Décrire les taxons d'appartenance du pathogène Sclerotinia sclerotiorum: l'agent de la pourriture blanche
Ascomycota-> Discomycètes-> ordre Hélotiales -> Sclerotinia enzyme pectinolytiques
57
Nommer une pourriture AS qui affecte les fruits (on voit que le point de départ de l'infection est un point noir et la moisissure pousse de manière circulaire autour de ce point. (Ascomycota, Discomycètes)
Monilinia fruticola | Pourriture des fruits (très commune)
58
Nommer les 3 classes importantes qu'on distingue dans le taxon Basidiomycota.
les Urédinomycètes-> rouilles les Ustilaginomycètes-> charbons et caries les Hyménomycètes -> champignons au sens populaire= chapeau et pied
59
Vrai ou Faux Les Basidiomycota sont caractérisés par la production de spores monocaryotiques haploïdes appelées basidiospores, à l’extérieur de sporocystes appelés basides
Vrai
60
Est-ce que les champignons parasites chez les Urédinomycètes sont nécrotrophes? Énumérer d'autres caractéristiques.
Non, ces champignons ne tuent pas les cellules. (rouilles, Basidiomycota) Majorité des espèces sont hétérothalliques Biotrophe obligatoire ont une phase parasitique Hyphes intercellulaires avec haustoria pour s’alimenter Majorité des espèces forment des infections locales Cycle de vie complexe avec plus de 5 types de spores différentes autoïque ou dioïque => cycle de vie avec un hôte ou 2...
61
Nommer 2 espèces de la famille des Pucciniaecae qui appartiennent aux Urédinomycètes (Basidiomycota).
``` Puccinia graminis (rouille noire du blé) histoire de l'épinvinette ehe ``` Uromyces -> différent de Puccinia puisque téliospores à cellule individuelles infectent légumineuse, herbes et lis
62
Décrire le groupe Ustilaginomycètes.
Les Ustilaginales regroupent un ensemble de champignons provoquant des maladies connues sous le nom de charbons (smuts) ou caries (bunts), avec production de masses caractéristiques de téliospores noires dans les organes floraux (Tilletia sp., Ustilago sp.) ou les feuilles Basidiomycota
63
Expliquer la différence entre les charbons nus, les charbons couverts et les caries.
charbons nus: téliospores remplacent glumes et glumelles. Dispersion lors de la floraison-> pluie ou vent charbons couverts: glumes préservées, téliospores dispersés lors de la récolte. caries: chez lesquelles les parois de la graine sont préservées et les téliospores dispersées à la récolte. Peuvent être dans d'autres tissus que le tégument de la graine.
64
Décrire les téliospores.
Formées séparément ou dans des boules de spores (=sores) La plupart du temps globeux, pigmentées, avec paroi très épaisse et ornementée 3.5 à 60 microns de diamètre Masse de téliospores = couleur foncée Structures résistantes, peuvent survivre jusqu 10 ans dans le sol, et 25 ans ou plus dans des conditions optimales
65
Nommer 2 espèces pathogènes appartenant aux Ustilagomycètes,
Ustilago maydis charbon du maïs Tilletia sp. carie des céréales
66
Quelle est la forme infectieuse d'Ustilago maydis? haploïde diploïde dicaryotique
dicaryotique et filamenteuse
67
Décrire les hyménomycètes & les 2 ordres qui y appartiennent.
Ce sont les Basidiomycota typiques caractérisés par des basides non cloisonnées disposées en hyménium dans un appareil fructifère appelé basidiocarpe ordre des Aphyllophorales ordre des Agaricales
68
Décrire la forme de conservation d'Armillaria mellea. | hyménomycètes, agaricales
Rhizomorphe = forme de conservation, un arbre contaminé à ce point= ces jours sont comptés!!!
69
Nommer le groupe appartenant aux hyménomycètes qui possèdes des formes anamorphes avec des hyphes dépourvues de cloisons!
Agonomycètes caractérisés par l’absence de sporulation (Rhizoctonia solani), un groupe important autre fois appelé: Groupe des Rhizoctones RARE chez les basidiomycota régression évolutive
70
Donner un exemple d'un parasite opportuniste.
Botrytis cinerea (agent nécrotrophe) Les formes les plus primitives de parasitisme sont représentées par des agents opportunistes (essentiellement saprotrophes) et n’attaquant les tissus végétaux qu’en conditions défavorables
71
Nommer un parasite nécrotrophe qui tue les cellules via des toxines.
Helminthosporium maydis
72
Nommer deux espèces de parasites biographes qui possèdent des haustoria.
Les rouilles Urédinomycètes Les oïdium Erysiphaceae Phytophtora infestans
73
Nommer plusieurs formes de conservation de l'inoculum
Sclérotes Chlamydospores Rhizomorphes Organes de reproduction sexuée (exemple : oospores, zygospores, urédiospores, téliospores, etc.) SOUVENT ISSUS DE LA REPRODUCTION SEXUÉE
74
Qu'est-ce qu'un Chlamydospore?
Portions d’hyphes qui se sont entourées d ’une paroi épaisse. Ces structures peuvent survivre pendant de nombreuses années dans le sol. la maladie du Bayoud sur palmier dattier Fusarium
75
Donner un exemple d'espèce pour chaque: Oospore Téliospore Zygospore
Oospore: Phytophthora cactorum Téliospore: ustilaginomycètes Zygospore: Rhizopus oryzae
76
Nommer les facteurs qui peuvent influencer la maturation des spores.
Des éléments nutritifs La lumière : important puisque les champi ont des photorécepteurs qui permettent la régulation de leur cycle circadien ainsi de prendre connaissance des saisons Obscurité Lumière (U.V...) Alternance (Périodes de lumière et d'obscurité = photopériode) L’humidité relative élevée ou l’humectation
77
Énumérer les différentes façons de disséminer les spores.
Libération passive (vent, eau, animaux) Libération active (Ascomycota) Éjection des ascospores sous l’effet de l’humectation LORSQUE les conditions sont favorables
78
Nommer les différentes possibilités d'infection.
-Parties aériennes Végétaux ligneux (lenticelle, craquelure...) svt patho opportunistes -Plantes herbacées Cuticule (fixation= parties hydrophobes se collent: protéines ou des glycoprotéines, hydrophobines) Ouvertures naturelles Ouvertures accidentelles (blessures) Parties souterraines
79
Expliquer la formation de l'appressorium.
Lors de la pénétration dans la feuille, que ce soit par percement de la cuticule ou par passage entre les cellules de garde d'un stomate, le tube germinatif forme généralement une structure plus ou moins différenciée, l'appressorium. Ascochyta pisi
80
Comment se fait-il que l'appressorium se forme entre les cellules?
Figure à droite: appressorium ne sont pas formés au hasard ils vont directement entre les cellules-> puisqu’ils sont capable de détecter la topographie = detecte les jointements et par pression mécanique va etre capable d’écarter les cellules!
81
Expliquer les étapes d'une infection par les voies aériennes.
ouvertures naturelles (Le tube germinatif de plusieurs pathogènes (rouille, cercosporiose,...) pénètre par les stomates) Cuticule constituée de polyesters d'acides gras associés à des cires, formant la première barrière susceptible d'arrêter la progression d'une hyphe pénétrante 1. pénétration mécanique= faisceau rigide par mélanine Magnaporthe grisea = par un stachel Plasmodiophora brassicae -> cristaux rigides qui peuvent briser la paroi du poil absorbant 2. pénétration par voie enzymatique: la cutinase: peut dégrader le cuticule ``` 3. pénétration par blessures La taille et autres plaies (arbres fruitiers) Coupes d'arbre (foresterie) Insectes (Ophiostoma ulmi) Cicatrices foliaires ``` 4. Transmission de la graphiose de l’orme par des espèces de scolytes (insectes) 5. blessures souterraines Blessures au niveau des sites d’émergence des racines secondaires Piqûres de nématodes Blessures occasionnée lors des opérations de plantation des arbres Greffe de racines

Microorganismes phytopathogènes (5 decks)

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