COURS 4 et 5 Flashcards
Associer les phylums suivant aux bons règnes:
a. Eumycota
b. Oomycota
c. Plasmodiophoromycota
i. Chromaveolata
ii. Fungi
iii. Stramnipila
a. ii
b. iii
c. i
Qu’est-ce qui différencie les champignons de leur analogues?
Oomycota et Plasmodiophoromycota n’ont pas de chitine dans leur paroi.
Évolution convergente: hétérotrophe par absorption
Est-ce que les 3 phylums (Eumycota, Oomycota et Plamodiophoromycota) sont dans les Unikonta/Opimoda?
Non Oomycota et Plamodiophoromycota =Bikonta/Diphoda
2 flagelles
Nommer un problème majeur de l'ancienne classification se basant sur la reproduction sexuée et la phylogénie: Chytridiomycota (primitifs) Glomeromycota (symbioytiques) Lignées des zygomycètes Ascomycota (ascospores) Basidiomycota (basidiospores)
Les zygomycètes sont un groupe polyphylétique
Comment est-ce que les Oomycota se reproduisent?
Oogamie
Lorsqu’on parle de lime molds/ moisissures visqueuses, on parle de quel phylum?
Plasmodiophoromycota
Expliquer à quoi ressemble l’appareil végétatif/la thalle des Plasmodiphoromycota.
le thalle= un plasmode
SANS paroi externe ni de cloisons internes
Donc, pas de forme déterminée= masse cytoplasmique multinucléée
Expliquer à quoi ressemble l’appareil végétatif/la thalle d’Eumycota et Oomycota.
le thalle est unicellulaire (levures)
ou filamenteux, formé de filaments tubulaires cylindriques ramifiés ou non
Le mycélium peut s’agréger en strome (filaments forment un tissu)
Quel champignon est responsable pour les ronds de sorcière?
Marasmius oreades
Nommer 2 synonymes pour décrire des hyphes non cloisonnées.
coenocytiques ou siphon
Les hyphes peuvent former des structures spécialisées comme des appressoria et les haustoria (=suçoirs).
Quelle de ces structures se trouvent chez les biotrophes?
Laquelle se trouve chez les nécrotrophes?
Apressoria= rôle de pénétration -> nécrotrophe Haustoria= se développent à l'intérieur des cellules. rôle: absorber les nutriments qui s'y trouvent -> biotrophe
Les rhizomorphes et les sclérotes sont des exemples de strome. Quelle raison justifie la spécialisation de ces tissus?
ORGANES DE CONSERVATION
Rhizomorphes= cordons mycéliens subcorticaux/ plusieurs filaments
peuvent devenir très rigide
Sclérotes= forme de reproduction favorisant la conservation= très rigide
Expliquer ce qui distingue la paroi des Ascomycota, Basidiomycota, Chytridiomycota et Glomeromycota des Zygomycètes et Oomycètes.
À noter, le stérol présent dans la membrane cytoplasmique de la plupart des champignons est l’ergostérol
paroi constitué de chitine (N-acétylglucosamine)
Zygomycètes= paroi en chitosane (glocosamine)
Oomycètes= cellulose (glucose) critère qui a confirmer que ce phylum n’appartenait pas aux Eumycota
Expliquer la croissance de l’hyphe.
La croissance de l’hyphe est strictement apicale et de très nombreuses vésicules cytoplasmiques se concentrent dans la zone d’expansion.
On y trouve également le Spitzenkörper (plusieurs vacuoles “l’oeil du champignon” réagit à la lumière, centre métabolique avec bcp de mitochondries pour favoriser la croissance apicale)
Associer les modes de reproduction aux termes anamorphe et téléomorphe. Dire quelle forme favorise la dispersion et laquelle promeut la conservation.
AS= anamorphe, dispersion S= téléomorphe, conservation
Les spores suivants sont issus de quel mode de reproduction? conidies, chlamydospores, zoospores
AS Chlamydospores (forme de résistance apparaissant sous forme d’articles terminaux ou intercalaires)
zoospores= motiles 1 ou 2 flagelles
Nommer les principaux appareils permettant la fructification des conidies (AS) chez les Ascomycota.
Pycnide (conceptacles ouverts par un ostiole)
Acervule (déchirement du tissu hôte)
Corémie/stilbum
Sporodochium
Associer chacun des taxons avec le nom de leurs spores sexués: Oomycota Zygomycètes Ascomycota Basidiomycota
oospore
zygospore
ascospore
basidiospore
Décrire le cycle de reproduction sexuée des champignons.
Le cycle de reproduction sexuée des champignons comporte une étape de plasmogamie (fusion/rencontre de 2 hyphes), suivie d’une caryogamie (fusion des 2 noyaux, phase dicaryotique avec mitose conjugué) et d’une méiose.
Expliquer la formation de l’oospore.
L’oospore résulte de l’union de deux gamétanges (contenant les gamètes) morphologiquement distincts (hétérogamétangie), l’anthéridie et l’oogone
Pythium sp.
Expliquer la formation du zygospore.
La zygospore résulte de l’union de deux gamétanges morphologiquement identiques (isogamétangie)
2 hyphes
gamétangiogamie
croissance
formation d’une zygospore
Rhyzopus sp.
Il faut causer un stress pour favoriser ce mode de reproduction.
Expliquer la formation de l’ascospore.
L’ascospore est une endospore haploïde caractéristique du phylum des Ascomycota .
Dans l’asque il y a 8 ascospores.
Le zygote subit une méiose -> 4 noyaux suivit d’une mitose -> 8 noyaux au total
on peut observer l’enjambement génétique.
Nommer les principaux appareils permettant la fructification donnant naissance aux asques (S).
Cléistothèce (ascospores désordonnées)
Périthèce (parfois asques très filiformes, comme pycnide, mais ne donne pas des conidies, donnent des ascospores!)
Apothécie (plus évolué même si les organes reproducteurs sont moins protégés… projectiles-> armée) Sclerotinia sclerotiorum : production d’apothécie à partir des sclérotes
Pseudothèce (dans les tissus de l’hôte)
Expliquer la formation du basidiospore.
La basidiospore est une spore exogène qui naît sur une baside.
Décrire classifications fondées sur les critères morphologiques.
Critères utilisés pour la classification des champignons
-Morphologie du thalle
thalle non filamenteux
thalle filamenteux cloisonné ou non
-Type et morphologie de l’organe de reproduction sexuée
oospore
ascospore
basidiospore
-Type et morphologie de l’organe de reproduction asexuée (conidie)
Chez les champignons comment est-ce qu’on nomme le terme de spécialisation à un hôte (ex. chez les bactéries c’est un pathovare)?
forma specialis
race= variété (R)
biotype=propriétés particulières de l’isolat (ex.: résistance à tel ou tel fongicide)
Pourquoi est-ce que le Fusarium a longtemps été considéré un deutéromycètes/ un champignon imparfait?
Se reproduit majoritairement via la reproduction AS. Les conidiophores sont en forme de fuseau.
Conidies pluricellulaires en forme de fuseau.
Expliquer pourquoi on utilise les ITS 1 et ITS 2 comme code barre pour identifier les champignons.
Internal transcribed spacer (ITS) refers to the spacer DNA situated between the small-subunit ribosomal RNA (rRNA) and large-subunit rRNA genes in the chromosome. Ne code pas pour l’ARN donc ne sont pas soumis à la pression de sélection.
=> amorces conservées pour 18s et 28s
Donner des caractéristiques générales des Plasmodiophoromycota et nommer les 3 genres.
Champignons dont le thalle est constitué d’un plasmode
Parasites obligatoires d’organes souterrains et de tiges
Plasmodiophora
Polymyxa
Spongospora (agent de la gale poudreuse de la pomme de terre) rappel gale commune = PdT
Décrire Plasmodiophora brassicae
l’agent de la hernie des crucifères.
Dégâts d’une importance économique majeure.
Jusqu’à 10% de dégâts dans le monde entier
L’hernie constitue aujourd’hui la maladie la plus importante des crucifères
Les cellules augmentent de volume (hypertrophie). Ce n’est pas une tumeur!!!
kyste pénètre via poil absorbant! Perce la cellule tôt et y injecte son cytoplasme très visqueux qui va être en mesure de créer sa propre membrane plasmique.
Nommer deux espèces de Polymyxa qui sont des vecteurs importants pour des virus.
Polymyxa betae : vecteur du virus de la rhizomanie de la betterave
Polymyxa gramini : vecteur du virus de la mosaïque de l’orge
Vrai ou faux.
Les zygomycètes peuvent former des zoospores.
Faux
ils ont de zygospores! et nymphes coenocytique (siphon)
Quelle taxon cause:
les fontes de semis et les pourritures radiculaires
Les mildious (nécroses)
Les rouilles blanches
Oomycota
Quel agent est responsable d’un grand nombre de mildious?
Les Peronosporaceae
Quel pathogène est responsable du mildiou de la pomme de terre.
À noter: les sporangiphores sortent des stomates et se ramifient de façon dichotomique.
Sporocystes sont identiques entre la reproduction S et AS.
Forme diploïde plus importante alors que les autres champignons ont une phase haploïde dominante.
Phytophtora infestans
Le zoospore des Oomycètes possède combien de flagelle(s)?
2
Quelle température est idéale pour entamer le cycle de vie de Phytophtora infestans?
12-15°C
Chez Oomycota, la méiose à lieu avant ou après la fertilization.
Avant, une méiose a lieu dans l’oogone et une autre dans l’anthéridie.
Nomme la maladie causée par Plasmopara viticola .
Mildiou de la vigne
introduit accidentellement en Europe en 1870 (porte-grêfe résistant à un insecte ravageur en France), après quoi il a détruit la quasi-totalité du vignoble français.
LUTTE: mélange de la chaux et de sulfate de cuivre (bouillit bordelaise) est actif sur cet oomycète!
Nommer le genre qui cause la rouille blanche.
Albugo
la fructification est AS
Hausteria
sporocysts s’adapte à l’env (AS vs S)
hyphes=siphons
Pourquoi est-ce que le taxon Chytridiomycota est considéré primitif chez les vrais champignons.
Nommer 2 genres importants (peuvent être des vecteurs pour certains virus)
le zoospore n’a qu’un flagelle
Olpidium
Synchytrium
Est-ce que les ascospores et basidiospores ont une origines sexuée ou asexuée?
sexuée
Nommer un genre primitif des Ascomycètes.
Indice: les ascospores sont nus sur le tissu de l’hôte et désordonnés.
Taphrinales
Taphrina deformans-> responsable du cloque du pêcher
Comment sont placés les ascospores chez l’ordre Erysiphales?
Cléistothèces avec appendices (fulcres)
ressemble à un soleil
Qu’est qu’il ne faut pas confondre entre les oïdium VS mildiou?
oïdium =face supérieure
mildiou= face inférieure
Comment nommons-nous le taxon qui a des asques agrégés, contenus dans un périthèce.
(= ascocarpes globuleux, pourvu d’un ostiole)
Pyrénomycètes
Chez les Ascomycota chez les Pyrénomycètes. Nommer des ordres et genre associé aux périthèces de couleur vive et celles de couleurs foncées.
vive=Ordre des Hypocréales (Claviceps)
foncée=Ordre des Diaporthales (Magnaporthe
et Cryphonectria)
Ordre des Ophiostomales
(ophiostoma)
Ordre des Phyllachorales
(Glomerella)
Nommer les caractéristiques générales du pathogène Ophiostoma ulmi.
Ascomycota-> Pyrénomycètes->Ophiostomales (périthèces couleur foncée)
l’agent de la graphiose de l’orme./ maladie hollandaise de l’orme
le périthèce se prolonge par un col par où s’échappent les ascospores
Nommer les caractéristiques générales du pathogène Claviceps purpurea.
Agent de l’ergot du seigle
Ascomycota-> Pyrénomycètes->Hypocréales (périthèce à couleur vive)
LSD, Albert Hofman 1943
Nommer les caractéristiques générales du pathogène Fusarium.
Ascomycota-> Pyrénomycètes->Hypocréales
Plusieurs espèces produisent des mycotoxines
Maladies vasculaires
Nécroses
Conidies pluricellulaires en forme de fuseau.
Quelle est la forme téléomorphe de Fusarium graminearum?
Gibberella zeae
reprod S
Donc fusarium= reproductive AS
Nommer 2 ordres des Loculoascomycètes
et les genres qui y sont associés.
(ASCOMYCOTA)
Ordre des Dothidéales (Mycosphaerella)
Ordre des Pléosporales (Venturia)
Nommer 1 ordre des Discomycètes et 2 genre qui y sont associés.
(ASCOMYCOTA)
Hélotiales (Sclerotinia & Monilinia)
Nommer le plus grand genre de champignons phytopathogènes (appartenant dans les Ascomycètes).
Genre Mycosphaerella
(dans les Loculoascomycètes)
Mycosphaerella graminicola (téléomorphe: Septoria tritici) agent de la septoriose du blé d’hiver-> US 275M et Europe 400M pour fongicide
Mycosphaerella fijiensis agent de la cercosporiose noire du bananier (mycotoxine qui perturbe le fonctionnement des chloroplastes) nécrose au niveau du feuillage
Qui suis-je?
L’agent de la tavelure du pommier. Mes périthèces se forment dans les feuilles mortes ; mes ascospores sont éjectées lors de pluies au printemps.
Je me conserve dans les feuilles et les fruits.
Mes ascospores sont bicellulaires et inégales.
Venturia inaequalis
Ascomycota-> Loculoascomycètes->Pléosporales
Tavelure: Au printemps= nécrose au niveau du feuillage et gale sur le tégument
Décrire les taxons d’appartenance du pathogène Sclerotinia sclerotiorum: l’agent de la pourriture blanche
Ascomycota-> Discomycètes-> ordre Hélotiales -> Sclerotinia
enzyme pectinolytiques
Nommer une pourriture AS qui affecte les fruits (on voit que le point de départ de l’infection est un point noir et la moisissure pousse de manière circulaire autour de ce point.
(Ascomycota, Discomycètes)
Monilinia fruticola
Pourriture des fruits (très commune)
Nommer les 3 classes importantes qu’on distingue dans le taxon Basidiomycota.
les Urédinomycètes-> rouilles
les Ustilaginomycètes-> charbons et caries
les Hyménomycètes -> champignons au sens populaire= chapeau et pied
Vrai ou Faux
Les Basidiomycota sont caractérisés par la production de spores monocaryotiques haploïdes appelées basidiospores, à l’extérieur de sporocystes appelés basides
Vrai
Est-ce que les champignons parasites chez les Urédinomycètes sont nécrotrophes?
Énumérer d’autres caractéristiques.
Non, ces champignons ne tuent pas les cellules.
(rouilles, Basidiomycota)
Majorité des espèces sont hétérothalliques
Biotrophe obligatoire ont une phase parasitique
Hyphes intercellulaires avec haustoria pour s’alimenter
Majorité des espèces forment des infections locales
Cycle de vie complexe avec plus de 5 types de spores différentes
autoïque ou dioïque => cycle de vie avec un hôte ou 2…
Nommer 2 espèces de la famille des Pucciniaecae qui appartiennent aux Urédinomycètes (Basidiomycota).
Puccinia graminis (rouille noire du blé) histoire de l'épinvinette ehe
Uromyces -> différent de Puccinia puisque téliospores à cellule individuelles
infectent légumineuse, herbes et lis
Décrire le groupe Ustilaginomycètes.
Les Ustilaginales regroupent un ensemble de champignons provoquant des maladies connues sous le nom de charbons (smuts) ou caries (bunts), avec production de masses caractéristiques de téliospores noires dans les organes floraux (Tilletia sp., Ustilago sp.) ou les feuilles
Basidiomycota
Expliquer la différence entre les charbons nus, les charbons couverts et les caries.
charbons nus: téliospores remplacent glumes et glumelles. Dispersion lors de la floraison-> pluie ou vent
charbons couverts: glumes préservées, téliospores dispersés lors de la récolte.
caries: chez lesquelles les parois de la graine sont préservées et les téliospores dispersées à la récolte.
Peuvent être dans d’autres tissus que le tégument de la graine.
Décrire les téliospores.
Formées séparément ou dans des boules de spores (=sores)
La plupart du temps globeux, pigmentées, avec paroi très épaisse et ornementée
3.5 à 60 microns de diamètre
Masse de téliospores = couleur foncée
Structures résistantes, peuvent survivre jusqu 10 ans dans le sol, et 25 ans ou plus dans des conditions optimales
Nommer 2 espèces pathogènes appartenant aux Ustilagomycètes,
Ustilago maydis
charbon du maïs
Tilletia sp.
carie des céréales
Quelle est la forme infectieuse d’Ustilago maydis?
haploïde
diploïde
dicaryotique
dicaryotique et filamenteuse
Décrire les hyménomycètes & les 2 ordres qui y appartiennent.
Ce sont les Basidiomycota typiques caractérisés par des basides
non cloisonnées disposées en hyménium dans un appareil
fructifère appelé basidiocarpe
ordre des Aphyllophorales
ordre des Agaricales
Décrire la forme de conservation d’Armillaria mellea.
hyménomycètes, agaricales
Rhizomorphe = forme de conservation, un arbre contaminé à ce point= ces jours sont comptés!!!
Nommer le groupe appartenant aux hyménomycètes qui possèdes des formes anamorphes avec des hyphes dépourvues de cloisons!
Agonomycètes caractérisés par l’absence de sporulation (Rhizoctonia solani), un groupe important autre fois appelé: Groupe des Rhizoctones
RARE chez les basidiomycota
régression évolutive
Donner un exemple d’un parasite opportuniste.
Botrytis cinerea (agent nécrotrophe)
Les formes les plus primitives de parasitisme sont représentées par des agents opportunistes (essentiellement saprotrophes) et n’attaquant les tissus végétaux qu’en conditions défavorables
Nommer un parasite nécrotrophe qui tue les cellules via des toxines.
Helminthosporium maydis
Nommer deux espèces de parasites biographes qui possèdent des haustoria.
Les rouilles Urédinomycètes
Les oïdium Erysiphaceae
Phytophtora infestans
Nommer plusieurs formes de conservation de l’inoculum
Sclérotes
Chlamydospores
Rhizomorphes
Organes de reproduction sexuée (exemple : oospores, zygospores, urédiospores, téliospores, etc.)
SOUVENT ISSUS DE LA REPRODUCTION SEXUÉE
Qu’est-ce qu’un Chlamydospore?
Portions d’hyphes qui se sont entourées d’une
paroi épaisse. Ces structures peuvent survivre pendant
de nombreuses années dans le sol.
la maladie du Bayoud sur palmier dattier
Fusarium
Donner un exemple d’espèce pour chaque:
Oospore
Téliospore
Zygospore
Oospore: Phytophthora cactorum
Téliospore: ustilaginomycètes
Zygospore: Rhizopus oryzae
Nommer les facteurs qui peuvent influencer la maturation des spores.
Des éléments nutritifs
La lumière : important puisque les champi ont des photorécepteurs qui permettent la régulation de leur cycle circadien ainsi de prendre connaissance des saisons
Obscurité
Lumière (U.V…)
Alternance (Périodes de lumière et d’obscurité = photopériode)
L’humidité relative élevée ou l’humectation
Énumérer les différentes façons de disséminer les spores.
Libération passive (vent, eau, animaux)
Libération active (Ascomycota)
Éjection des ascospores sous l’effet de l’humectation
LORSQUE les conditions sont favorables
Nommer les différentes possibilités d’infection.
-Parties aériennes
Végétaux ligneux (lenticelle, craquelure…) svt patho opportunistes
-Plantes herbacées
Cuticule (fixation= parties hydrophobes se collent: protéines ou des glycoprotéines, hydrophobines)
Ouvertures naturelles
Ouvertures accidentelles (blessures)
Parties souterraines
Expliquer la formation de l’appressorium.
Lors de la pénétration dans la feuille, que ce soit par percement de la cuticule ou par passage entre les cellules de garde d’un stomate, le tube germinatif forme généralement une structure plus ou moins différenciée, l’appressorium.
Ascochyta pisi
Comment se fait-il que l’appressorium se forme entre les cellules?
Figure à droite: appressorium ne sont pas formés au hasard ils vont directement entre les cellules-> puisqu’ils sont capable de détecter la topographie = detecte les jointements et par pression mécanique va etre capable d’écarter les cellules!
Expliquer les étapes d’une infection par les voies aériennes.
ouvertures naturelles
(Le tube germinatif de plusieurs pathogènes (rouille, cercosporiose,…) pénètre par les stomates)
Cuticule
constituée de polyesters d’acides gras associés à des cires, formant la première barrière susceptible d’arrêter la progression d’une hyphe pénétrante
- pénétration mécanique= faisceau rigide par mélanine
Magnaporthe grisea
= par un stachel Plasmodiophora brassicae -> cristaux rigides qui peuvent briser la paroi du poil absorbant - pénétration par voie enzymatique: la cutinase: peut dégrader le cuticule
3. pénétration par blessures La taille et autres plaies (arbres fruitiers) Coupes d'arbre (foresterie) Insectes (Ophiostoma ulmi) Cicatrices foliaires
- Transmission de la graphiose de l’orme par des espèces de scolytes (insectes)
- blessures souterraines
Blessures au niveau des sites d’émergence des racines secondaires
Piqûres de nématodes
Blessures occasionnée lors des opérations de plantation des arbres
Greffe de racines
