Cours 4

Question 2

Unité de base de la chromatine

Answer 2

Le nucléosome

Question 3

Histones

Answer 3

5 protéines (H1, H2A, H2B, H3, H4) basiques (riches en lysines et arginines chargées +): interaction avec l’ADN chargé négativement

Question 4

Complexe ADN

Answer 4

octamère d’histone H2A, H2B, H3, H4: un “nucléosome”

Question 5

Quelles régions sont transcriptionnellement inactives?

Answer 5

Régions condensées des chromosomes

Question 6

Dans quelle chromatine l’ADN est-elle moins accessibles pour les protéines?

Answer 6

Dans la chromatine condensé: hétérochromatine

Question 7

Vrai ou faux,
Toute la chromatine décondensée est transcrite

Answer 7

Faux,
toute la chromatine décondensée n’est pas transcrite.
Cet état favorise, mais n’est pas suffisant pour l’expression des gènes.

Question 8

L’hétérochromatine constitutive

Answer 8

existe dans tous les types de cellules et présente peu ou pas d’expression génique en tout temps. Densité des gènes faible

Question 9

L’hétérochromatine facultative

Answer 9

Présente seulement dans certains types cellulaires ou à certains stades du développement. Permet d’inactiver la transcription de blocs de chromosomes, mais ces régions peuvent redevenir permissives à la transcription

Question 10

Sous quelle forme est l’ADN des régions actives en transcription

Answer 10

Sous forme de chromatine décondensée

Question 11

Que permet la forme de chromatine décondensée

Answer 11

Permet aux protéines de transcription d’avoir accès aux gènes

Question 12

Quelle chromatine est plus facile à digérée par la DNAase I?

Answer 12

Décondensée

Question 13

Qu’est-ce qui confirme l’ADN est plus accessible aux protéines dans les régions décondensées

Answer 13

Chromatine plus facilement digérée par la DNAse I, une nucléase, dans les régions chromosomiques où un gène est transcrit
Régions révélées par Southern Blot

Question 14

Sites hypersensibles

Answer 14

• Région ponctuelle de chromatine ayant une absence de nucléosomes ou déstabilisée
• machinerie transcriptionnelle et facteurs de transcriptions ont ainsi accès au promoteur d’un gène qui contient ces sites.

Question 15

Que permet la présence de un ou plusieurs sites hypersensibles dans la région du promoteur?

Answer 15

Permet la liaison de facteurs de transcription

Question 16

Lien entre site hypersensible à la DNAseI et liaison de facteurs de transcription

Answer 16

Facteurs de transcription protègent l’ADN dans une région qui est flanquée de sites coupés par la DNAse (empreinte ou « footprint »)

Question 17

identifier les régions d’ADN associées à une protéine donnée par Chromatin- Immunoprecipitation (ChIP)

Answer 17

• Après pontage au formaldéhyde, les protéines liées à leur région d’ADN sont purifiées par immuno-précipitation
• Pour ce faire, une résine couplée à un anticorps d’intérêt est incubée avec la chromatine pontée
• On isole ensuite les protéines, et on purifie l’ADN associé
• L’ADN est analysé par PCR quantitatif (informations sur un
  gène en particulier) ou par micropuce/séquençage à haut débit (ChIP on Chip ou ChIP-seq; identification de tous les sites de liaison à travers le génome)