Cours 3 - Structure Du Génome Flashcards
Mégacaryocyte
Cellule polyploïde spécialisée (~28 copies de chaque chromosome)
Moelle hématopoïétique
Production plaquettes sanguines
Haut niveau d’activité métabolique
Est-ce que la taille du génome corrèle avec la complexité de l’organisme?
Non
Est-ce que les organismes les plus complexes ont une densité génique plus faible?
Oui
Densité génique = nombre de gène par mégabase d’ADN
Quels facteurs expliquent la faible densité génique chez les eucaryotes
- Augmentation de la taille des gènes ( gènes fragmentés par introns + séquences répétitives)
- Augmentation séquences d’ADN entre les gènes (régions intergéniques)
Quel est le rôle des séquences intergéniques
Avant: inutile
Maintenant: confère un avantage sélectif, car conserver
Quelles sont les séquences intergéniques ormis les introns
Séquences répétées et séquences uniques (régulatrices)
~60%
Quelles sont les séquences associées aux gènes
Introns, fragments de gènes et pseudogènes
Quel est le rôle de la transcriptase inverse (Ti)
Enzyme virale
Mécanisme d’origine des pseudogènes (pas exprimés)
Copie ARNm cellulaires en ADNc
Type de séquences d’ADN répétées
ADN répétées dispersées: Grande taille, simple copies ou regroupées, provient d’éléments transposable, 45%
ADN microsatellite: très petites tailles, répétées en tandem (CACACACACA), difficulté de pol de dupliquer 3-5%
ADN minisatellite: Taille intermédiaire, en tandem, taux mutation élevé, pas nombreux
C’est quoi un transposons
Séquence qui peut sauter d’une place à l’autre sur le génome (laisse copie original à sa place) 45% génome de l’évolution
Au début: inutile
Maintenant: création nouveaux gènes, source d’amortissement des mutations
VRAI ou FAUX
Pendant le mitose la duplication et la ségrégation se passent en 2 phases temporellement distinctes.
VRAI
Duplication dans la phase S
Ségrégation dans la phase M
C’est quoi un kinétochore
Protéine située sur le centromère
Sur chaque chromatine sœur
Sert à la séparation
Protéine moteur génère force de déplacement
Autres prot. contôlent attachement +tension
Comment les chromatides sœurs sont-elles associées entre-elles jusqu’à la ségrégation
Cohésines (anneaux de protéines)
Rôle des microtubules
Attaché à une des deux centrosomes
Microtubules s’attachent aux kinétochores et tire vers extrémités durant le ségrégation
Déroulement mitose
- Microtubules se lient aux kinétochores
- Protéolyse des cohésines (non-SMC) (pu de résistance)
- Chromatides sœurs rapidement déplacées vers pôles opp.
Sous quelles formes sont les chromosomes durant interphase et phase M
Interphase: moins compact (plat de spaghettis)
Phase M: état condensé, facilite leur ségrégation
(Condensation du chromosome)
C’est quoi les protéines SMC
Cohésine (maintient les chromatides ensemble) et condensine (créer des boucles à l’int des chromatides sœurs)
Protéines de cohésine
2 prot SMC: Smc1 et Smc3 (ATPases) -> forme anneau
2 prot. Non-SMC: Scc1 et Scc3 -> stabilise anneau
Protéines condensine
2 prot SMC: Smc2 et Smc4 -> forme anneau
2 prot non-SMC: Bm1 et Ycs4 -> stabilise anneau
À quoi servent les phases G1 Et G2 de l’interphase
- Cellule se prépare à l’étape suivante
- Vérification que étape précèdante correcte
Si problèmes -> reste figé en G1 ou G2 et prévient anomalies chromosomiques
Méiose I
Méiose réductionnelle
Paires de chromosomes homologues se séparent
Attachement monovalent: 2 kinétochore sur ch paire chromatides sœurs attaché au même pôle
Protéolyse cohésine sauf ceux au centromère donc chromatides soeur restent ensemble
Méiose II
Division équationnelle
Séparation des chromatides sœurs
Protéolyse des cohésines des centromères
C’est quoi un nucléosome et sa fonction
Octamère de 8 histones + ADN qui l’entoure
Compacter l’ADN (facteur de 6x)
ADN internuclosomique = ADN entre nucléosomes
Nature des segments non compactée en nucléosome
Régions d’ADN pour:
Expression des gènes
Réplication
Recombinaison
(Doivent être accessible)
VRAI ou FAUX
Les histones sont des protéines chargées négativement
FAUX
Les histones sont chargées positivement et se lient à l’ADN qui est négatif
Bcp résidus lysines ou arginines
Assemblage du nucléosome
- H3 et H4 forme un tétramère et H2A et H2B forme 2 dimères
- Tétramère H3-H4 se lie à ADN (cause courbure et tension qui facilite accès pour H2A-H2B
- 2 dimères H2A-H2B s’associent au complexe
Quelles sont les intéractions histone-ADN
- H3-H4 intéragissent avec 60 pb centrales
-N-terminal de H3 intéragit avec 13 dernières pb de chaque extrémité
-H2A-H2B intéragissent avec 30 pb de part et d’autre des 60 pb centrale
Modification covalences des queues N
- longue -> - d’événement de modif post-traductionnelle
Points de contact
14 points de contact chaque fois que petit sillon touche octamère
Bcp liaison H permet courbure
Queues N-terminal émergent à des positions spécifiques
4 queues H2B et H3 émergent entre les 2 sillons
4 queues H2A et H4 émergent au dessous ou au dessus des hélices
Différence entre hétérochromatine et eurochromatine
Hétérochromatine: marquage dense, condensée, faible expression gènes
Eurochromatine: faible marquage, structure ouverte, expression élevée
Fonctionnement histone 1
Protéine chargée + , protège 20 pb supp.
Intéragit avec ADN internucléosomique et ADN associé au nucléosome
Rapproche les 2 sections, donne angle mieux défini
Quels sont le modèle pour la fibre 30 nm
- Solénoïde -> nucléosome forment superhélice, surfaces planes adjacentes, ADN internucléosomique enfoui au centre et passe pas à travers axe
- Zigzag -> passage ADN nucléosomique au travers de l’axe, forme préférée
Fonction queues N-terminales
Essentiel pour stabiliser la fibre de 30 nm
H2A, H3 et H4 intéragit avec nucléosomes adjacents
H4 intéragit avec résidu H2A
Boucles
Fibre 30 nm fait grandes boucles
Retenue par protéines de la matrice nucléaire (topoisomérase II et protéines SMC)
Exemple de H2AX
Variant de H2A
Quand cassure, H2AX se phosphoryle, puis recrute enzymes de réparation
Exemple CENP-A
Variant de H3
Queue N-terminales + longue
Permet d’attacher chromatides soeur avec protéines du kinétochore
