Cours 3: Flore humaine et interaction hôte-microorganisme Flashcards
La flore humaine normale comprend la flore endogène et la flore exogène. Expliquer la différence entre les 2 ?
- flore endogène = retrouvé de façon normale (permanente) chez l’humain
- flore exogène = ne colonise habituellement pas l’humain (bactérie non adaptée pour habiter sur nous, non permanente)
La flore endogène comprend la flore résidente et la flore transitoire. Expliquer la différence entre les 2 ?
- Flore résidente = retrouvée à un site anatomique donné (ex: staph sur la peau et E coli dans intestin)
- flore transitoire = non présente à un site anatomique donné (mais peut colonier de façon transitoire)
Quels sont les différents rôles de la flore normale ?
1- Contribution nutritionnelle et métabolique : rôle dans la digestion, synthèse vitamine K, synthèse vitamine groupe B)
2- résistance à la colonisation par les microorganismes pathogènes (facteurs protecteurs) : compétition pour les éléments nutritifs, production de métabolites toxiques, sécrétions bactériocines, modification pH
Vrai ou Faux: la prise d’AB peut avoir un impact sur l’INR ?
VRAI
si on prend des AB => enlève la vitamine K apporté par les bactéries (vitamine K importante pour la coagulation) => augmentation de l’INR chez patient sous coumadin (risque de caillots)
Quels sont les facteurs influençant la flore endogène ?
- régime alimentaire
- facteurs physiologiques (âge, cycle menstruel, présence ou absence de dents)
- Facteurs pathologiques ( diabète, plaie / maladie cutanée, alcoolisme, fibrose kystique, maladie pulmonaire chronique)
- antibiothérapie ( le plus grand facteur)
Pour quelles raisons la peau est-elle peu favorable à la croissance bactérienne / possède densité bactérienne faible ?
- sec
- pH entre 5 et 6
- Sueur (production IgA et haut contenu en sodium qui inhibe prolifération bactérienne)
- desquamation (élimine bactérie)
Quelles sont les bactéries résidentes de la peau ?
Certaines bactéries Gram + capables de se multiplier sur la peau:
- staphylocoques **
- Corynébactérie
- Propionibacterium acnes
**endroit plus humide comme les aisselles ont plus de bactéries
Quelles sont les bactéries de la flore de la bouche ?
Flore bactérienne très dense (se nourrit des nutriments amenés par alimentation) :
- streptocoque du groupe viridans ** (cause la carie dentaire car se nourrit de sucre)
- Neisseria
- fusobacterium
- capnocytophaga
Quelles sont les bactéries dans la flore du nez, nasopharynx et gorge ?
même flore que la bouche (strep viridans)
Quelles sont les bactéries pathogènes du nez, nasopharynx et gorge ?
- streptococcus pyogenes (groupe A)
- staphylococcus aureus
- streptococcus pneumoniae
- haemophilus influenzae
- moraxella catarrhalis (pneumonie)
- Neisseria meningitidis
Comment peut - on qualifier le contenu en microorganisme au niveau de la trachée - bronches- poumons (voies respiratoires) ?
essentiellement stérile (plus on avance dans le poumon, moins il y a de bactérie =alvéole stérile)
*microorganisme éliminé par les cellules ciliées des bronches (phagocyté par des macrophages)
Vrai ou Faux: L’estomac est un milieu favorable à la croissance bacrérienne ?
FAUX
- très peu favorable car milieu trop acide (pH 2)
- acidité gastrique = barrière à la pénétration des bactéries apportés par les aliments
(donc si prise d’anti-acide ou IPP = facteurs de risque pour infection)
Quelle bactérie est adapté à l’environnement de l’estomac et peut y vivre ?
Helicobacter pylori
(produit une uréase qui augmente le pH localement et lui permet de proliférer)
Qualifiez la flore bactérienne au niveau de l’intestin grèle (duodénum, jéjunum, iléon ) ?
duodénum = pH acide donc même flore que estomac (H pylori)
Jéjunum / iléon = pH devient graduellement alcalin et densité bactérienne augmente
Qualifiez la flore bactérienne au niveau du colon et quelles sont les espèces bactériennes principales qu’on y retrouve ?
- flore la plus dense de tout l’organisme
- bactéries anaérobies car il n’y a pas d’O2
*Principales espèces:
- bacteroides fragilis (l’O2 leur est toxique ; peut créer abcès abdominal)
- entérobactérie (E coli)
- Entérocoque
Qualifiez la flore bactérienne au niveau des reins / vessie ?
- normalement stérile
- bactérie présente en faible quantité dans urine
Vrai ou Faux: les bactéries contenues dans l’urètre peuvent contaminer les cultures d’urine ?
VRAI
on doit faire une culture du mi-jet (on enlève le 1e jet d’urine et le restant va dans le pot)
L’urètre est colonisé par quelles bactéries ?
- staphylocoque
- corynébactérie
- entérobactérie
- entérocoque
Pour quelles raisons y a t’il du glycogène au niveau du vagin ?
glycogène utilisé par les bactéries
- sécrété par épithélium vaginal (pendant période reproductive donc de puberté à ménopause)
- fermentation par lactobacilles produit acide lactique => acidifie pH (diminue vaginite, vaginose) et inhibe bactéries
*facteur protecteur
Quels sont les microorganismes retrouvés au niveau du vagin ?
- lactobacilles ** (batonnet gram +)
- candida albicans (si quantité importante => vaginite)
*diabète peut augmenter quantité de candida albicans - streptocoque B-hémolytique du groupe B (innofensif chez la femme , mais si femme enceinte peut donner infection grave chez nouveau né comme scepticémie/méningite
Vrai ou Faux: si on détecte du strep B-hémolytique de groupe B chez une femme enceinte on donne un AB en prophylaxie lors de l’accouchement pour éviter transmission d’infection ?
VRAI
Quelles sont les différentes causes possibles d’une infection causée par la flore normale ?
1- causes anatomiques (perte intégrité d’une barrière ex: utilisateur de drogue IV; occlusion d’un conduit)
2- Causes physiologiques (neutropénie souvent secondaire à chimio= baisse neutrophile donc perte du système de défense = septicémie ; diabète)
3- modification de la composition de la flore (ex: C diff suite à AB)
4- iatrogénique (procédure médicale ou on met unc orps étrangerex: cathéter)
Vrai ou Faux: les bactéries au niveau de la bouche peuvent se retrouver au niveau du coeur et infecter une valve, ce qui provoque une endocardite ?
VRAI
Quelles sont les implications de la flore normale dans le diagnostic microbiologique ?
1- distinction entre colonisation asymptomatique et infection symptomatique
2- contamination des prélèvements par la flore normale
3- complexifie les cultures (ex: si beaucoup de pathogène lors d’une culture de selle on doit trouver la bactérie problématique à travers tellement d’autres)
Quelle est la différence entre les microorganismes commensaux et pathogènes ?
- microorganisme commensaux = colonisent généralement l’humain de façon asymptomatique
- microorganismes pathogènes = peuvent engendrer une maladie lorsqu’il infecte l’humain
Quelle est la définition du pouvoir pathogène ?
capacité d’un microorganisme de causer une maladie particulière ou de toucher certains organes (qualitatif)
= permet de savoir quel pathogène cause quelle infection
Quelle est la définition de virulence ?
degré de pathogénicité d’un micro-organisme (quantitatif, on peut le mesurer)
Quelles sont les 2 types de mesures possibles à prendre lorsqu’on veut mesurer la virulence ?
1- mesure de la dose infectante (nb de microorganismes qu’il faut introduire chez l’hote pour causer maladie ; dose minimale de bactérie)
2- mesure de la létalité ( % de mortalité suite à l’infection ; quel portion des gens infectés vont en mourir)
Quels sont les facteurs de risque de développer une maladie infectieuse ?
- maladie pulmonaire chronique
- fibrose kystique
- diabète
- VIH
- grossesse
- déficit en anticorps
- prise d’immunosupresseurs
etc
Quelles sont les 4 grandes étapes d’une maladies infectieuses ?
1- existence d’un réservoir
2- transmission à l’hôte réceptif
3- invasion chez l’hôte
4- induction de dommages à l’hôte
Quels sont les 3 types de réservoirs de pathogènes ?
- être humain (pour la plupart des microorganismes)
- animaux
-environnement (sol, eau)
La transmission d’un microorganisme à partir d’un réservoir humain peut se faire à quels étapes de l’infection ?
Transmission durant:
- infection symptomatique
- phase asymptomatique
- colonisation asymptomatique
La transmission d’un microorganisme à partir d’un réservoir animal se fait de quelles manières ?
transmission par :
- contact direct (ex: morsure)
- contact indirect (ex: contact avec selle d’un animal)
- ingestion (salmonelle, maladie du hamburger)
- air (peroquet infecté dans animalerie)
- insecte vecteur
Qu’est-ce qu’une zoonose ?
maladie nécessitant un contact avec un animal (aucune transmission humain à humain)
Comment peut se transmettre une infection à partir d’un réservoir environnemental ?
maladie nécessitant contact avec l’environnement (aucune transmission humain à humain)
- bactérie dans le sol (ex: tétanos)
- champignons respirés => infection pulmonaire
- bactérie dans eau
Quels sont les 3 modes de transmission d’un pathogène ?
- par contact
- par véhicule
- par vecteur
Quels sont les 3 modes de transmission d’une maladie par contact ?
1- transmission par contact direct (contact physique entre hôte et réservoir)
2- transmission par contact indirect (intermédiaire d’un objet inanimé)
3- transmission par gouttelettes (gouttelettes de mucus ; contact à < 2m du pt infecté car particules plus grosses que aérosols)
Quels sont les 3 véhicules possibles dans la transmission par véhicule (transmission sur une longue distance sans contact avec personne infecté) ?
1- air (aérosols = particules très petites qui restent en suspension dans air et se déplace bcq plus loin que gouttelettte) ex: tuberculose
2- eau (ex: choléra)
3- nourriture (ex: travailleur qui cueille des framboises et qui est infecté par hépatite A)
Donner un exemple d’une maladie transmise par vecteur ?
maladie de lyme (vecteur = moustique)
Quelles sont les 3 étapes de l’invasion du pathogène ?
1- pénétration de l’hôte par une porte d’entrée (peau, muqueuse = la plupart, voie parentérale)
2- adhésion aux tissus et cellules de l’hôte (adhésine)
3- Résistance aux mécansimes de défense de l’hôte
Comment un pathogène peut -il résister aux mécanismes de défense de l’hôte ?
1- compétition pour le fer (on séquestre notre fer pour le rendre inaccessibles aux bactéries)
2- résistance à la phagocytose (se cache des neutrophiles ; capsule bactérienne ; destruction des neutrophiles ; survie à l’intérieur du neutrophile)
Quelle est l’utilité d’une bactérie à avoir une capsule ?
la capsule empêche le phagocyte de l’hôte de manger la bactérie => peut causer une septicémie
Par quels mécansimes (3) la plupart des Sx de la maladie sont causé / qu’est-ce qui induit les dommages ?
1- réponse immunitaire et inflammation locale (notre système immunitaire réagit à la présence d’une bactérie => ex: peau chaude, rouge, dlr, pus)
2- destruction par les enzymes extracellulaires (il y a des enzymes qui tuent les cellules humaines ex: les globules rouges et d’autres qui tuent les tissus humain ex: bactérie mangeuse de chair)
3- toxines
Quelles sont les 3 sortes d’enzyme extracellulaires pouvant causer des dommages ?
1- cytolysine (ex: hémolysine = tuent globule rouge ; leucocidine = tuent globules blancs)
2- enzyme dégradant la matière intercellulaire
3- coagulase (fait coaguler le sang pour empêcher globules blancs d”atteindre le site d’infection)
Quels sont les 2 types de toxines bactériennes possibles et leurs caractéristiques respectives ?
Exotoxine:
- bactérie Gram +
- Protéine
- libérées dans milieu durant prolifération bactérienne
Endotoxine:
- bactérie Gram -
- LPS de la membrane externe
- libérée lorsque bactérie meurent (déclenche grosse réponse immunitaire)
Quelles sont les 4 exotoxines bactériennes possibles ?
1- cytotoxine (tue les cellules hôtes)
2- neurotoxine (perturbe transmission influx nerveux)
3- entérotoxine (affecter tractus gastro-intestinal)
4- superantigènes (induit réponse immunitaire démesurée = dysfonction d’organe =choc toxique)
Vrai ou Faux: les endotoxines bactériennes ont une action spécifique ?
FAUX
action non spécifique => provoque libération massive de cytokine => fièvre/hypotension/choc septique
Quels sont les types d’infection bactérienne disséminée ?
- bactériémie (bactérie dans sang)
- sepsis (baisse TA)
- choc septique (soins intensif, on doit donner vasopresseur comme adrénaline car trop grande baisse de TA)
- coagulation intra-vasculaire disséminée
- dysfonction d’organes multiples (IR, IH, syndrome de détresse respiratoire aigu)
