cours 3 (diagnostic moléculaire) Flashcards
Quelle est la première cause identifiable de mort subite chez le jeune ?
Une maladie génétique cardiovasculaire
Quelles méthodes permettent un dépistage familial efficace des maladies génétiques cardiovasculaires ?
Le dépistage clinique et moléculaire.
Quelles sont les approches de prévention efficaces contre la mort subite chez le jeune ?
Défibrillateur implantable, médication, chirurgie de l’aorte.
Quel est l’objectif principal de la prévention de la mort subite chez le jeune ?
Identifier et traiter les maladies génétiques cardiovasculaires à temps.
Qu’est-ce que la médecine de précision ?
Une médecine personnalisée visant à améliorer la stratification et la prise en charge des patients à l’aide d’informations biologiques et de biomarqueurs.
Qu’est-ce que la pharmacogénétique ?
L’étude de l’influence du profil génétique d’un patient sur sa réponse aux médicaments.
Comment le profil génétique influence-t-il la pharmacogénétique ?
Il permet d’adapter le choix et la dose des médicaments au profil génétique du patient.
Qu’est-ce que l’oncogénétique ?
Une discipline qui adapte les thérapies en fonction des caractéristiques génétiques de la tumeur et du profil génétique du patient
Quel est le but de l’oncogénétique ?
Rechercher des marqueurs génétiques particuliers pour personnaliser les traitements.
Qu’est-ce que la cardiogénétique ?
L’utilisation des caractéristiques génétiques pour guider le traitement et dépister les membres de la famille à risque.
Quand l’ADN a-t-il été isolé pour la première fois ?
En 1869.
En quelle année l’ADN a-t-il été lié à la transmission héréditaire ?
En 1952.
Qui a fourni les données expérimentales ayant contribué à la structure de l’ADN ?
Franklin et Wilkins.
Qui a défini la double hélice de l’ADN et en quelle année ?
Watson et Crick en 1953.
Quels types de chromosomes composent le génome humain ?
Les chromosomes nucléaires et les chromosomes mitochondriaux.
Combien de paires de chromosomes nucléaires possède l’humain ?
23 paires : 22 paires d’autosomes et 1 paire de gonosomes (chromosomes sexuels).
Quelle est la forme des chromosomes mitochondriaux ?
Ils sont sous forme circulaire.
Combien de gènes sont codés par les chromosomes mitochondriaux ?
37 gènes.
Comment les chromosomes mitochondriaux sont-ils transmis ?
Exclusivement transmis par la mère.
À quoi sont associées les variantes dans les gènes mitochondriaux ?
À des maladies à transmission maternelle.
Qu’est-ce que l’expression du génotype dans le phénotype ?
Le transfert d’information génétique permet de passer du génotype au phénotype.
Qu’a permis l’étude des petits pois par Mendel ?
L’élaboration des lois de Mendel sur l’hérédité.
Quelle est la différence entre une maladie mendélienne homogène et hétérogène ?
Homogène : même gène affecté chez tous les patients ; Hétérogène : gènes différents affectés selon les patients.
Quels sont les quatre modes de transmission mendélienne ?
Autosomal dominant, autosomal récessif, lié à l’X dominant, lié à l’X récessif.
Qu’est-ce qu’une transmission autosomique dominante ?
C’est une transmission où la présence d’un seul allèle muté suffit à provoquer la maladie.
: Que signifie être hétérozygote pour une maladie autosomique dominante ?
L’individu est malade.
Que signifie être homozygote pour une maladie autosomique dominante ?
A: L’individu est atteint plus sévèrement.
Qu’est-ce que la pénétrance ?
Le pourcentage d’individus ayant un génotype donné qui expriment le phénotype associé.
Que signifie une pénétrance incomplète ?
L’individu a le génotype associé à la maladie mais ne développe pas la maladie.
Qu’est-ce que l’expressivité ?
Le niveau d’expression d’un génotype au niveau phénotypique.
Qu’est-ce qu’une mutation de novo ?
Une mutation apparue chez un individu alors que ses parents ne sont pas porteurs.
La pénétrance peut-elle être influencée par l’âge ?
Oui, la maladie peut apparaître à l’âge adulte, influençant l’expression phénotypique.
Quelles sont les conditions pour qu’une maladie autosomique récessive se manifeste ?
La présence des deux allèles mutés.
Que signifie être hétérozygote (Aa) dans une maladie autosomique récessive ?
L’individu est porteur sain.
Qu’est-ce qu’une maladie dominante liée à l’X ?
Une maladie transmise par un gène dominant situé sur le chromosome X
Que se passe-t-il quand la mère est porteuse d’un gène dominant lié à l’X ?
Les fils et filles peuvent être atteints ou sains selon l’allèle hérité.
Que se passe-t-il quand le père est porteur d’un gène dominant lié à l’X ?
Toutes les filles héritent du gène muté et peuvent être malades, les fils ne reçoivent pas le X du père donc restent sains.
Qu’est-ce qu’une maladie récessive liée à l’X ?
C’est une maladie transmise par un gène récessif situé sur le chromosome X.
Qu’est-ce que l’effet fondateur ?
C’est la perte de variation génétique lorsqu’un petit groupe fonde une nouvelle population.
Pourquoi l’effet fondateur peut-il augmenter la fréquence de certaines maladies ?
Parce que des variations génétiques rares peuvent devenir courantes dans la nouvelle population.
Quel type de transmission concerne l’hérédité mitochondriale ?
Transmission maternelle, non-mendélienne.
Quelle est la fréquence des variants dans les gènes mitochondriaux par rapport aux gènes nucléaires ?
10 à 20 fois plus fréquents.
Qu’est-ce que l’hérédité multifactorielle ?
Une hérédité non-mendélienne dépendant à la fois des gènes et de l’environnement.
Combien de variants génétiques un individu peut-il présenter ?
Environ 5 millions.
À quoi peuvent être associés les variants rares ?
Au développement de maladies.
Que peuvent provoquer les variants sur les protéines encodées ?
Un gain ou une perte de fonction.
Citez quelques types de SNPs. (68%)
Variants synonymes, faux-sens, non-sens, affectant les sites d’épissage, non-codants.
Qu’est-ce qu’une monosomie ?
Une aneuploïdie par défaut, c’est-à-dire l’absence d’un chromosome.
Qu’est-ce qu’une trisomie ?
Une aneuploïdie par excès, soit un gain d’un chromosome.
Que signifie une délétion chromosomique ?
Une portion du chromosome est manquante ou supprimée.
Qu’est-ce qu’une duplication chromosomique ?
Une portion du chromosome est dupliquée, générant un excès de matériel génétique
Que se passe-t-il lors d’une inversion chromosomique ?
Une portion du chromosome est brisée, inversée (tête-bêche) et réattachée.
Quelle est la différence entre une insertion et une translocation ?
Une insertion implique l’ajout d’un segment d’un chromosome dans un autre, tandis qu’une translocation est un échange de segments entre deux chromosomes non homologues.
Qu’est-ce qu’une insertion ou délétion courte (InDel) ?
A: Une petite insertion ou délétion de moins de 50 nucléotides.
Que se passe-t-il si une InDel est un multiple de 3 nucléotides ?
Il n’y a pas de changement du cadre de lecture.
Qu’est-ce qu’une mutation faux-sens (missense) ?
Une mutation qui change un codon spécifique d’un acide aminé à un autre.
Qu’est-ce qu’une mutation non-sens (nonsense) ?
Une mutation qui introduit un codon stop prématuré, arrêtant la traduction.
Qu’est-ce qu’une mutation synonyme ?
Une mutation qui modifie un codon sans changer l’acide aminé correspondant.
Que provoque une mutation au niveau des sites d’épissage ?
Elle affecte les sites donneur ou accepteur, perturbant l’épissage de l’ARN.
Quels sont les types de variants fonctionnels en génétique?
A: Faux-sens, non-sens, frameshift, site d’épissage, large délétion, gain ou perte de fonction
Qu’est-ce que l’épigénétique?
Facteurs modifiant l’expression des gènes sans modifier le génotype.
Qu’est-ce qu’un cas-index en génétique médicale?
Premier membre d’une famille à être diagnostiqué cliniquement avec une maladie génétique.
Quelles sont les étapes de l’analyse moléculaire?
A: Prélèvement, extraction de l’ADN, séquençage, analyse, classification des variants.
Quelle est la méthode gold standard pour le séquençage?
Séquençage Sanger.
Q: Qu’est-ce que le séquençage parallèle à haut débit? (Nanopore)
Méthode rapide permettant de séquencer de grandes quantités d’ADN en parallèle.
Quelle est la différence entre WGS, WES et séquençage de gènes ciblés?
WGS séquence tout le génome, WES l’exome, et le profil ciblé seulement les gènes pertinents.
Comment classifie-t-on les variants selon l’ACMG?
Pathogénique, probablement pathogénique, de signification incertaine, probablement bénin, bénin.
Quelles sont les grandes familles de maladies cardiovasculaires héréditaires?
A: Cardiomyopathies, arythmies, aortopathies, dyslipidémies familiales.
Quelle est la cause principale de la cardiomyopathie hypertrophique (CMH)?
Variants dans les gènes du sarcomère cardiaque, qui cause l’épaississement du muscle
Variants dans les gènes du sarcomère cardiaque comme MYBPC3, MYH7, etc.
Quelle est la première cause de la mort subite chez les moins de 40 ans
CMH
Quelle est la prévalence et le mode de transmission du CMH
- 1/500 à 1/200
-Autosomique dominant
Quels sont les symptômes typiques de la CMH?
Fatigue, essoufflement, palpitations, syncope, œdème, parfois mort subite.
Quelle est la base génétique du syndrome du QT long (SQTL)?
A: Variants dans les gènes qui affectant les canaux ioniques dans le but d’augmenter ou diminuer les fonctions
Qu’est-ce qu’est le syndrome du QT long (SQTL)
C’est une anomalie électrique qui rallonge le segment QT, puis, cela peut causer des risque d’arythmie ventriculaire
C’est quoi la prévalence et le mode de transmission du SQTL
- 1/3000 à 1/2000
- Autosomique dominant
Quels autres facteurs externes peuvent déclenchée une SQTL
Certaines situations (activités physiques, stimuli auditif, émotions intense, … ) ou encore par la prise de certains médicaments
Quelle est la mutation la plus fréquente dans le syndrome de Marfan?
Mutation dans le gène FBN1 codant pour la fibrilline-1
Qu’est-ce que le syndrome de Marfan (SM) et son mode de transmission
Désordre génétique multisystémique qui affecte le tissus conjonctif.
-Autosomique dominant
Nommer des symptômes du SM
Luette bifide;
• Subluxation du cristallin;
• Très grande taille disproportionnée
(anomalies du squelette);
• Pectus excavatum ou carinatum;
• Hyperlaxité ligamentaire;
• Anévrisme de l’aorte initiale (à son
émergence du cœur) et dissection aortique;
• Prolapsus de la valve mitrale;
• Pneumothorax spontanés.
C’Est quoi l’étalon d’or pour la génétique
Le séquençage du gène FBN1
Nommer 3 caractéristiques de la mort subite cardiaque
- Varie selon l’âge
-Anomalies cardiaques non-structurelles correspondent aux arythmies héréditaires
-Anomalies cardiaque de structures correspondent aux maladies de la structure de la cellule musculaire cardiaque
C’est quoi une dyslipidémie
Désordres fréquents du métabolisme du cholestérol provient des niveaux anormaux de lipides et lipoprotéines
Quelles sont les bases moléculaires de l’hypercholestérolémie familiale (HF)?
Mutations dans LDLR, APOB, PCSK9 (semi-dominant) et LDLRAP1 (récessif).
Qu’est-ce que l’hypercholestérolémie familiale (HF)
Un trouble génétique du métabolisme des lipides provoquant une élévation du LDL-C.
Que provoquent des niveaux élevés de LDL-C chez les patients non traités ?
Le développement précoce de maladies cardiovasculaires athérosclérotiques (MCVAS).
Quelle est la prévalence de l’HF au Québec ?
Entre 1/81 et 1/250 selon les régions, en raison d’un effet fondateur.
Quelles sont deux grandes classes de variants retrouvés dans le gène LDLR ?
Déletions (ex. : exons 2 et 3, région promotrice) et variants faux-sens/non-sens.
Pourquoi un diagnostic précoce est-il essentiel en HF ?
Pour initier un traitement hypocholestérolémiant et prévenir les MCVAS.
Quel traitement permet de retarder les complications chez les homozygotes ?
Aphérèse plasmatique (retrait des lipides du plasma).
À quoi peut servir la confirmation génétique pour certains traitements émergents ?
Critère d’inclusion pour les thérapies ciblées (comme les CMF).
Quel est le signe biologique clé en laboratoire pour la CMF ?
Accumulation visible de chylomicrons dans le sérum.
Quels organes peuvent être élargis dans la CMF ?
Foie (hépatomégalie) et rate (splénomégalie).
Quel gène est responsable de la grande majorité des cas de CMF ?
Le gène LPL (environ 95 % des cas homozygotes).
Quelle est la prévalence de la CMF dans la population canadienne française ?
1 sur 10 000, soit 100 fois plus élevée à l’est de la province.
Quel est le taux de porteurs dans certaines régions ?
1 sur 100 à 1 sur 50.
-Taux porteur très élevé
Quel est le principal risque si la CMF n’est pas bien traitée ?
Une pancréatite aiguë potentiellement fatale.
Pourquoi le régime alimentaire dans la CMF est-il difficile à suivre ?
Il est très contraignant et doit être suivi strictement pour éviter les complications.
Quel est le type de mutation causale principal dans la CMF ?
Variant bi-allélique dans le gène LPL.
Qu’est-ce que la dystrophie musculaire de Duchenne (DMD) ?
Une maladie neuromusculaire caractérisée par une atrophie et une faiblesse musculaire progressive.
Quels muscles sont touchés dans la DMD ?
Muscles squelettiques, lisses et cardiaques.
Quelle est la protéine impliquée dans la DMD ?
La dystrophine, exprimée dans les muscles et certains neurones.
: Quel est le mode de transmission de la DMD ?
Récessif lié à l’X
Quelle est la maladie autosomique récessive la plus fréquente chez les Caucasiens ?
La fibrose kystique (FK).
Quel est le gène impliqué dans la fibrose kystique ?
Dysfonctionnement du canal chlore CFTR (cystic fibrosis transmembrane conductance receptor).
Quel est le gène impliqué dans la fibrose kystique ?
A: Le gène CFTR (cystic fibrosis transmembrane conductance receptor).
4. Q: Que provoque le dysfonctionnement du canal CFTR ?
Une augmentation de la viscosité du mucus et son accumulation dans les voies respiratoires et digestives.
Quels sont les symptômes respiratoires de la FK ?
Toux persistante, bronchiolites, dyspnée, colonisation bactérienne des voies respiratoires.
Quelle conséquence digestive est liée à un défaut d’enzymes pancréatiques dans la FK ?
Maldigestion des graisses et des protéines, provoquant stéatorrhée.
Quel gène est muté dans la fibrose kystique ?
Le gène CFTR (CF transmembrane conductance regulator).
Combien de mutations du gène CFTR ont été identifiées ?
Plus de 1600 mutations, classées en 6 classes selon leur effet sur la protéine CFTR.
Qu’est-ce que le variant deltaF508 ?
Une délétion de trois nucléotides causant la perte d’une phénylalanine à la position 508.
Quel est le but d’un test de confirmation en FK ?
Établir le diagnostic chez un patient présentant des signes cliniques de FK.
Quelle est l’importance du diagnostic moléculaire dans la FK ?
Il a un impact profond sur le traitement et améliore la qualité de vie et l’espérance de vie.
Qu’est-ce que la pharmacogénétique ?
A: C’est l’étude de la réponse d’un patient à certains médicaments en fonction de son profil génétique.
Quel est l’objectif de la médecine personnalisée en pharmacogénétique ?
Ajuster la dose de médicament selon les données génétiques du patient pour éviter les effets secondaires ou améliorer la réponse au traitement.
Qu’est-ce que le dépistage populationnel utilisant le risque pangénomique ?
C’est la prédiction du risque de développer une maladie en analysant le génotype de milliers ou millions de variants de l’ADN.
Quel est l’avantage d’un système informatique spécialisé en génétique ?
Il permet de retracer facilement un échantillon en cas d’erreur ou de doute.
Qu’est-ce qu’un flux unidirectionnel en laboratoire ?
C’est un processus où les étapes du travail se font dans un seul sens, sans retour en arrière, pour éviter la contamination croisée.
Est-ce qu’un système fermé a besoin d’un circuit unidirectionnel
Non, juste le système ouvert
À
Quelles sont les grandes étapes de l’implantation d’un test génétique ?
Développement du test, validation du test, et gestion de la qualité.
Quel est le but de la validation d’un test génétique selon l’INESSS ?
S’assurer que le test est pertinent et fiable pour être implanté dans le réseau de la santé.
Qu’est-ce que les ADN Corriel ?
ADN provenant de lignées cellulaires hautement caractérisées par le NIST et largement utilisées pour la validation.
