Cours 3 Cohen

Question 1

Caractéristique génomique et morphologique des rétrovirus

Answer 1

ARN simple brin
polarité positive
enveloppé

Question 2

Rétrovirus sont associé à (3)

Answer 2

cancer
atteinte au SI
syndrome neurologique

Question 3

Grandes découvertes (4) et application relié au rétrovirus

Answer 3

1) Découverte de la transcriptase inverse (TI)
2) Découverte des oncogènes cellulaires

3)Découverte des mécanismes contrôlant la prolifération
et la survie cellulaire

4)Découverte de mécanismes fondamentaux contrôlant
l’expression des gènes

• Utilisation des Rétrovirus comme vecteurs pour
effectuer du transfert de gènes

Question 4

Les 2 type de classification de rétrovirus et leur constituants principals

Answer 4

1) Rétrovirus simples:
- Gag-Pol-Env

2) Rétrovirus complexes:
- contiennent en plus de Gag-Pol- Env des gènes de régulation qui contrôlent leur réplication et persistance

Question 5

précurseur Gag

Answer 5

Ma
Ca
NC

Question 6

Précurseur Gag-Pro-Pol:

Answer 6

MA, CA, NC, PRO, RT, IN
• Généré par supression de codon stop ou par un
changement de cadre de lecture (-1) entre
Gag et Pol
• Clivé par la protéase virale

Question 7

precurseur ENV

Answer 7

Glycoprotéine clivés par une protéase cellulaire ( Furine)

SU et TM

Question 8

Cycle d’infection des Rétrovirus

Answer 8

1) Phase d’établissement de l’infection:
- Entrée virale
- Décapsidation
- Transcription inverse (via la TI)
- Transport nucléaire de l’ADN proviral
- Intégration (via l’intégrase)
Dépendance de la division cellulaire pour les Rétrovirus simples

2) Phase de production virale:
- Transcription du provirus (RNA Pol II cellulaire)
- Maturation des ARNm viraux
- Traduction des précurseurs Gag, Gag-Pol et Env
- Traffic des protéines et ARN génomique
- Assemblage des particules virales
- Bourgeonnement et relâche
- Maturation des virions

Question 9

4 points de la transcriptase inverse

Answer 9

1) 2 domaines fonctionnels
- N-terminal: polymérase ARN et ADN-dépendante
- C-terminal: RNase H (activité qui dégrade l’ARN dans des hybrides ARN-ADN)

2) Pas d’activité de correction d’erreurs
3) Fréquence d’erreur = 10-4: une erreur par cycle de réplication
4) Cible anti-rétrovirale de choix , car essentielle à la réplication virale. Les inhibiteurs anti-TI ciblent l’activité polymérase et/ou l’activité RNAse H

Question 10

Composante de structure génétique des rétrovirus

Answer 10

1) PBS: primer binding site
2) Séquence d’encapsidation de l’ARN viral
3) PPT: polypurine tract (région riche en AG)
4) LTR: Long Terminal Repeat

Question 11

Intégration simple vs complexe

Answer 11

Simple = tendance à intégration proche promoteur

Complexe: insertion plus aléatoire (à des sites d’intron ou niveau épissage) généralement plus éloigné du promoteur

Question 12

Qu’est ce que CTE et à quoi sert-il?

Answer 12

CTE : Constitutive Transport Element ou protéine virale qui exporte les ARNs non-épissés ou partiellement épissés du noyau au cytoplasme

Question 13

Décrire les étapes d’assemblage, bourgeonnement et maturation rétroviraux

Answer 13

Assemblage niveau de micro-domaines membrane plasmique riches en cholestérol appelés radeaux lipidiques

Durant assemblage et bourgeonnement, particules virales subissent une étape de maturation ( CLIVAGE des précurseurs Gag et Gag-Pol) par la protéase virale qui confère au virus son potentiel infectieux

Question 14

Rôle des rétrovirus endogène dans l’évolution

Answer 14

protéine syncytine du gène ENV du virus HERV-W permet développement du placenta

Même virus et même principe pour l’amylase des glandes salivaires

Problème: parfois certaines protéines et mimétisme provoque auto-immunité et immuno-suppression

Question 15

Nommez trois groupes de rétrovirus oncogène et la manière dont sont baéss ces classes

Answer 15

transducteur, cis-activateur et transactivateur

r: Basé su
1) La rapidité avec laquelle ces Rétrovirus causent des tumeurs
2) Leur mécanisme de transformation

Question 16

Nommez un exemple de transducteur et décrire son fonctionnement

Answer 16

Rous Sarcoma Virus (RSV)

Acquisition protéines oncogènes par recombinaison avec proto-oncogènes (transduction et capture de gènes)
Ex: RSV: vSrc vs cSrc

Protéines oncogènes n’ont pas de rôle dans le cycle d’infection

Rétrovirus souvent défectifs et requièrent des virus auxiliaires pour être propagés

Transforment, induisent des tumeurs très rapidement (semaines) dans des modèles animaux

Question 17

Par quel processus a-t-on une conversion de proto-oncogène en oncogène?

Answer 17

1) Mutations ponctuelles:
Récepteur Her-2 (Human Epidermal Growth Factor Receptor 2) =mutation ponctuelle Val -Glu pour oncogéne Neu

2) Délétion: v-Erb vs EGF; v-Src vs c-Src
3) Amplification de gènes

Question 18

5 points sur les rétrovirus cis-activateur

Answer 18

1) Longue période d’incubation avant l’apparition de tumeurs (mois ou années).
2) Ne transforment pas les cellules en culture.
3) Ne codent pas pour des protéines oncogènes.
4) Sont compétents pour la réplication.
5) Le mécanisme d’oncogénèse implique l’activation d’un proto-oncogène.

Question 19

Mécanisme d’activation par insertion de promoteur et activateur.

Answer 19

5’ - Activation par insertion de promoteur ou d’ activateur (avant ou après le promoteur)

3’ – Activation par insertion d’activateur (loin après)

Question 20

4 points d’un transactivateur

Answer 20

1) Prototype : HTLV (Human T-cell leukemia virus)
2) HTLV cause leucémie des lymphocytes T chez l’adulte (ATL= Adult T cell leukemia; Leucémie T aïgue) et des désordres neurologiques (HAM = HTLV-associated myelopathy)
3) Virus transmis via allaitement, contacts sexuels et sang (transfusion, seringues contaminées)
4) HTLV-1 est prévalent au sud du Japon (1M d’individus infectés) et dans les Caraïbes - relativement rare dans d’autres régions du monde.

Question 21

HTLV infecte quelle cellule préférentiellement? Quelles sont les symptomes possibles reliés à l’infection?

Answer 21

T CD4

Généralement asymptomatique
1-5% progresse vers leucémie

*ATL caractérisé T CD4+ transformés qui infiltrent la peau et les viscères causant la mort en un ~1 an

Question 22

Qu’est-ce qui est détecté chez les lymphocyte infectés par ATL

Answer 22

L’expression de ARNm viraux ( en particulier des ARNs codant pour Tax (40%) et des ARNs antisense exprimant la protéine viral HBZ (100%)

Question 23

Que sait-on de la molécule TAX

Answer 23

1) protéine de régulation, Tax,
2) Agit comme transactivateur transcriptionnel du LTR
3) Protéine nécessaire à la réplication virale
4) Joue un rôle essentiel dans l’immortalisation et la transformation
5) Altére l’expression de gènes cellulaires contrôlant la physiologie des lymphocytes T
6) Active l’expression du facteur de transcription NFkB qui est requis pour la transcription de ces gènes
7) Interférant avec l’activité des protéines p53 et Rb

Question 24

Nommé un exemple de transactivateur

Answer 24

HTLV

Question 25

Quel mécasnisme de croissance est altéré dans les cellules T immortalisée/transformée

Answer 25

Croissance IL-2 INDÉPENDANT