Cours 3 Cohen Flashcards
Caractéristique génomique et morphologique des rétrovirus
ARN simple brin
polarité positive
enveloppé
Rétrovirus sont associé à (3)
cancer
atteinte au SI
syndrome neurologique
Grandes découvertes (4) et application relié au rétrovirus
1) Découverte de la transcriptase inverse (TI)
2) Découverte des oncogènes cellulaires
3)Découverte des mécanismes contrôlant la prolifération
et la survie cellulaire
4)Découverte de mécanismes fondamentaux contrôlant
l’expression des gènes
• Utilisation des Rétrovirus comme vecteurs pour
effectuer du transfert de gènes
Les 2 type de classification de rétrovirus et leur constituants principals
1) Rétrovirus simples:
- Gag-Pol-Env
2) Rétrovirus complexes:
- contiennent en plus de Gag-Pol- Env des gènes de régulation qui contrôlent leur réplication et persistance
précurseur Gag
Ma
Ca
NC
Précurseur Gag-Pro-Pol:
MA, CA, NC, PRO, RT, IN
• Généré par supression de codon stop ou par un
changement de cadre de lecture (-1) entre
Gag et Pol
• Clivé par la protéase virale
precurseur ENV
Glycoprotéine clivés par une protéase cellulaire ( Furine)
SU et TM
Cycle d’infection des Rétrovirus
1) Phase d’établissement de l’infection:
- Entrée virale
- Décapsidation
- Transcription inverse (via la TI)
- Transport nucléaire de l’ADN proviral
- Intégration (via l’intégrase)
Dépendance de la division cellulaire pour les Rétrovirus simples
2) Phase de production virale:
- Transcription du provirus (RNA Pol II cellulaire)
- Maturation des ARNm viraux
- Traduction des précurseurs Gag, Gag-Pol et Env
- Traffic des protéines et ARN génomique
- Assemblage des particules virales
- Bourgeonnement et relâche
- Maturation des virions
4 points de la transcriptase inverse
1) 2 domaines fonctionnels
- N-terminal: polymérase ARN et ADN-dépendante
- C-terminal: RNase H (activité qui dégrade l’ARN dans des hybrides ARN-ADN)
2) Pas d’activité de correction d’erreurs
3) Fréquence d’erreur = 10-4: une erreur par cycle de réplication
4) Cible anti-rétrovirale de choix , car essentielle à la réplication virale. Les inhibiteurs anti-TI ciblent l’activité polymérase et/ou l’activité RNAse H
Composante de structure génétique des rétrovirus
1) PBS: primer binding site
2) Séquence d’encapsidation de l’ARN viral
3) PPT: polypurine tract (région riche en AG)
4) LTR: Long Terminal Repeat
Intégration simple vs complexe
Simple = tendance à intégration proche promoteur
Complexe: insertion plus aléatoire (à des sites d’intron ou niveau épissage) généralement plus éloigné du promoteur
Qu’est ce que CTE et à quoi sert-il?
CTE : Constitutive Transport Element ou protéine virale qui exporte les ARNs non-épissés ou partiellement épissés du noyau au cytoplasme
Décrire les étapes d’assemblage, bourgeonnement et maturation rétroviraux
Assemblage niveau de micro-domaines membrane plasmique riches en cholestérol appelés radeaux lipidiques
Durant assemblage et bourgeonnement, particules virales subissent une étape de maturation ( CLIVAGE des précurseurs Gag et Gag-Pol) par la protéase virale qui confère au virus son potentiel infectieux
Rôle des rétrovirus endogène dans l’évolution
protéine syncytine du gène ENV du virus HERV-W permet développement du placenta
Même virus et même principe pour l’amylase des glandes salivaires
Problème: parfois certaines protéines et mimétisme provoque auto-immunité et immuno-suppression
Nommez trois groupes de rétrovirus oncogène et la manière dont sont baéss ces classes
transducteur, cis-activateur et transactivateur
r: Basé su
1) La rapidité avec laquelle ces Rétrovirus causent des tumeurs
2) Leur mécanisme de transformation
Nommez un exemple de transducteur et décrire son fonctionnement
Rous Sarcoma Virus (RSV)
Acquisition protéines oncogènes par recombinaison avec proto-oncogènes (transduction et capture de gènes)
Ex: RSV: vSrc vs cSrc
Protéines oncogènes n’ont pas de rôle dans le cycle d’infection
Rétrovirus souvent défectifs et requièrent des virus auxiliaires pour être propagés
Transforment, induisent des tumeurs très rapidement (semaines) dans des modèles animaux
Par quel processus a-t-on une conversion de proto-oncogène en oncogène?
1) Mutations ponctuelles:
Récepteur Her-2 (Human Epidermal Growth Factor Receptor 2) =mutation ponctuelle Val -Glu pour oncogéne Neu
2) Délétion: v-Erb vs EGF; v-Src vs c-Src
3) Amplification de gènes
5 points sur les rétrovirus cis-activateur
1) Longue période d’incubation avant l’apparition de tumeurs (mois ou années).
2) Ne transforment pas les cellules en culture.
3) Ne codent pas pour des protéines oncogènes.
4) Sont compétents pour la réplication.
5) Le mécanisme d’oncogénèse implique l’activation d’un proto-oncogène.
Mécanisme d’activation par insertion de promoteur et activateur.
5’ - Activation par insertion de promoteur ou d’ activateur (avant ou après le promoteur)
3’ – Activation par insertion d’activateur (loin après)
4 points d’un transactivateur
1) Prototype : HTLV (Human T-cell leukemia virus)
2) HTLV cause leucémie des lymphocytes T chez l’adulte (ATL= Adult T cell leukemia; Leucémie T aïgue) et des désordres neurologiques (HAM = HTLV-associated myelopathy)
3) Virus transmis via allaitement, contacts sexuels et sang (transfusion, seringues contaminées)
4) HTLV-1 est prévalent au sud du Japon (1M d’individus infectés) et dans les Caraïbes - relativement rare dans d’autres régions du monde.
HTLV infecte quelle cellule préférentiellement? Quelles sont les symptomes possibles reliés à l’infection?
T CD4
Généralement asymptomatique
1-5% progresse vers leucémie
*ATL caractérisé T CD4+ transformés qui infiltrent la peau et les viscères causant la mort en un ~1 an
Qu’est-ce qui est détecté chez les lymphocyte infectés par ATL
L’expression de ARNm viraux ( en particulier des ARNs codant pour Tax (40%) et des ARNs antisense exprimant la protéine viral HBZ (100%)
Que sait-on de la molécule TAX
1) protéine de régulation, Tax,
2) Agit comme transactivateur transcriptionnel du LTR
3) Protéine nécessaire à la réplication virale
4) Joue un rôle essentiel dans l’immortalisation et la transformation
5) Altére l’expression de gènes cellulaires contrôlant la physiologie des lymphocytes T
6) Active l’expression du facteur de transcription NFkB qui est requis pour la transcription de ces gènes
7) Interférant avec l’activité des protéines p53 et Rb
Nommé un exemple de transactivateur
HTLV
Quel mécasnisme de croissance est altéré dans les cellules T immortalisée/transformée
Croissance IL-2 INDÉPENDANT
