Cours 3 cinétique enzymatique Flashcards
Que font les enzymes sur le fonctionnement des cellules?
- accélèrent réactions chimique ( baisse EA)
- contrôlent stéréospécificité des S et P
- site de régulations
Quels sont les principes de la catalyse enzymatique? rappel
- accélèrent rx chmique
- contrôlent spécificité des réactions
- aident à spécifier voies réactionnells du substrat
Quelle est la vitesse de réaction chimique simple de : A -> P?
V = d [P] / dt = k [A]
donc k = v/ [A]
Dans quelle condition Vmax = kcat [E0] ?
Lorsqu’on augmente la valeur de [S] à des niveaux de plus en plus haut, on fait en sorte que
toutes les molécules d’enzyme seront saturées par des molécules de substrat. À ce moment:
[ES] = [E0]
équation de MM :
V = Vmax * [S] / Km + [S]
À quoi correspond Km dans le graphique de MM?
Correspond à la concentration de substrat à laquelle la
vitesse V est à la moitié de la vitesse maximal
qu’est-ce que Km?
valeur approximative de l’affinité du substrat pour l’enzyme.
Dans ces conditions la vitesse de la réaction aura atteint son maximum et on pourra écrire ?
Vmax = Kcat [E0]
à quoi correspond la valeur de Kcat/Km?
à une mesure de l’efficacité catalytique d’une enzyme
Quels sont les avantages du graphique Lineweaver-Burke?
- Donne une ligne droite dont la pente correspond à Km/Vmax
- intersection de la droite avec l’ace des Y = 1/vax
- intersection axe X = -1/Km
Quelles réponses nous donne le graphique LB?
Permet d’obtenir des valeurs de Km et Vmax + précise que MM
Comment est exprimmé l’efficacité d’un inhibiteur?
Par sa constante d’inhibition Ki
Que fait un inhibiteur compétitif.
Se lie à l’enzyme (EI),
augmente le Km et Vmax ne change pas.
Dans LB, les droites se croisent à l’axe des Y
que fait inhibiteur incompétitif?
Se lie au complexe ES
Vmax et Km sont diminués
les droites ne se croisent pas dans LB
Que fait inhibiteur non-compétitif?
Se lie à E libre et complexe Es
Vmax est diminué et Km reste pareil si Inhib à même affinité que E que pour ES
Les droites se croisent à l’axe des X dans le négatif
résumés des inhibiteurs
En règle général, quelle concentration de substrat doit être utilisé, si l’enzyme obéit la cinétique MM?
dépassant 10 X le Km
Comment éviter une retro-inhibition ? (5) pour que la vitesse soit linéaire pendant la période d’incubation -> détecter la formation du produit.
- mesurer la rx enzymatique pour une courte durée pour diminuer produit
- haute concentration de substrat
- pH non-physiologique pour enlever proton
- méthode sensible pour détecter produit
- inhibition par le substrat à des hautes []
Par quoi le Vmax et Km sont influencés ? (3)
- ph
- température
- force ionique
Est-ce que certain tampon peut agir comme inhibiteurs?
Oui, en compétionnant avec des substrats possédant des charges négatives
La vitesse de rx augmente d’un facteur _ pour chaque 10 degré?
Facteur 2
Plus la pédiore d’incubation est courte, plus la température apparente de l’activité maximale peut être….
élevé, car a moins de temps pour que l’enzyme se
dénature
qu’est-ce que la méthode discontinue?
enzyme est incubé avec ses substrats pendant une certaine période de temps et la réaction est ensuite arrêtée.
Vérifier l’évolution linéaire
faire +sieurs incubations
Comment est arrêtées l’incubation ?
par une méthode qui provoque la dénaturation de l’enzyme