Cours 3 cinétique enzymatique Flashcards

1
Q

Que font les enzymes sur le fonctionnement des cellules?

A
  • accélèrent réactions chimique ( baisse EA)
  • contrôlent stéréospécificité des S et P
  • site de régulations
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Q

Quels sont les principes de la catalyse enzymatique? rappel

A
  • accélèrent rx chmique
  • contrôlent spécificité des réactions
  • aident à spécifier voies réactionnells du substrat
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3
Q

Quelle est la vitesse de réaction chimique simple de : A -> P?

A

V = d [P] / dt = k [A]
donc k = v/ [A]

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4
Q

Dans quelle condition Vmax = kcat [E0] ?

A

Lorsqu’on augmente la valeur de [S] à des niveaux de plus en plus haut, on fait en sorte que
toutes les molécules d’enzyme seront saturées par des molécules de substrat. À ce moment:
[ES] = [E0]

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5
Q

équation de MM :

A

V = Vmax * [S] / Km + [S]

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6
Q

À quoi correspond Km dans le graphique de MM?

A

Correspond à la concentration de substrat à laquelle la
vitesse V est à la moitié de la vitesse maximal

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7
Q

qu’est-ce que Km?

A

valeur approximative de l’affinité du substrat pour l’enzyme.

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8
Q

Dans ces conditions la vitesse de la réaction aura atteint son maximum et on pourra écrire ?

A

Vmax = Kcat [E0]

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9
Q

à quoi correspond la valeur de Kcat/Km?

A

à une mesure de l’efficacité catalytique d’une enzyme

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10
Q

Quels sont les avantages du graphique Lineweaver-Burke?

A
  • Donne une ligne droite dont la pente correspond à Km/Vmax
  • intersection de la droite avec l’ace des Y = 1/vax
  • intersection axe X = -1/Km
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11
Q

Quelles réponses nous donne le graphique LB?

A

Permet d’obtenir des valeurs de Km et Vmax + précise que MM

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12
Q

Comment est exprimmé l’efficacité d’un inhibiteur?

A

Par sa constante d’inhibition Ki

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13
Q

Que fait un inhibiteur compétitif.

A

Se lie à l’enzyme (EI),
augmente le Km et Vmax ne change pas.
Dans LB, les droites se croisent à l’axe des Y

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14
Q

que fait inhibiteur incompétitif?

A

Se lie au complexe ES
Vmax et Km sont diminués
les droites ne se croisent pas dans LB

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15
Q

Que fait inhibiteur non-compétitif?

A

Se lie à E libre et complexe Es
Vmax est diminué et Km reste pareil si Inhib à même affinité que E que pour ES
Les droites se croisent à l’axe des X dans le négatif

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16
Q

résumés des inhibiteurs

A
17
Q

En règle général, quelle concentration de substrat doit être utilisé, si l’enzyme obéit la cinétique MM?

A

dépassant 10 X le Km

18
Q

Comment éviter une retro-inhibition ? (5) pour que la vitesse soit linéaire pendant la période d’incubation -> détecter la formation du produit.

A
  • mesurer la rx enzymatique pour une courte durée pour diminuer produit
  • haute concentration de substrat
  • pH non-physiologique pour enlever proton
  • méthode sensible pour détecter produit
  • inhibition par le substrat à des hautes []
19
Q

Par quoi le Vmax et Km sont influencés ? (3)

A
  • ph
  • température
  • force ionique
20
Q

Est-ce que certain tampon peut agir comme inhibiteurs?

A

Oui, en compétionnant avec des substrats possédant des charges négatives

21
Q

La vitesse de rx augmente d’un facteur _ pour chaque 10 degré?

A

Facteur 2

22
Q

Plus la pédiore d’incubation est courte, plus la température apparente de l’activité maximale peut être….

A

élevé, car a moins de temps pour que l’enzyme se
dénature

23
Q

qu’est-ce que la méthode discontinue?

A

enzyme est incubé avec ses substrats pendant une certaine période de temps et la réaction est ensuite arrêtée.
Vérifier l’évolution linéaire
faire +sieurs incubations

24
Q

Comment est arrêtées l’incubation ?

A

par une méthode qui provoque la dénaturation de l’enzyme

25
Q

Quelles méthodes sont utilisé pour dénaturer l’incubation?

A

La précipitation par acide ou dénaturation thermique

26
Q

Qu’est-ce que la mesure de l’activité d’une enzyme?

A

une méthode qui détermine la
quantité de produit généré durant la réaction
- continue (pas arrêté) ou discontinue (dénaturation)

27
Q

Comment mesurer le produits de réactions enzymatique? (3)

A
  • convertir produit en un autre
  • spectrophotométrie
  • fluorométrie
28
Q

Comment fonctionne la détection directe ? (mesure produit)

A

un des produits de la réaction enzymatique absorbe la
lumière

29
Q

Comment fonctionne la détection indirecte (mesure produit)

A

ajoute une enzyme qui utilise le produit de la réaction pour former du NADH par couplage avec une autre réaction