Cours 3 Flashcards
Qu’est-ce qu’un organite?
Compartiments subcellulaires spécialisés (juste chez cellule eucaryote)
Généralement délimités par une ou plusieurs membranes
Fonctions (3) des organites
CRM
- Maintien de l’homéostasie cellulaire.
- Régulation du métabolisme.
- Compartimentation des différents processus biologiques essentiels à la vie. (Rends possible la coexistence de réactions biochimiques souvent incompatibles
au sein d’une même cellule)
Vrai/faux: Est-ce que la proportion des organites est la même dans toutes les cellules?
Faux, varie en fonction du type de cellule
Compartiments et strucutres cellulaires (7)
Membrane plasmique :
* Sépare et protège le contenu cellulaire de l’environnement externe.
Noyau :
* Centre de contrôle de la cellule, régule et stocke l’information génétique.
Ribosomes :
* Non membranaire, synthèse des protéines,
Réticulum endoplasmique et Appareil de Golgi :
* Production, la modification et le
transport de protéines et de lipides.
Lysosomes et Peroxysomes :
* Centres de dégradation et de recyclage de la cellule.
Mitochondries :
* Centrales énergétiques de la cellule (Production ATP importante).
Cytosquelette, Centrosomes, Cils et Flagelles :
* Structures fournissent le soutien mécanique et sont impliquées dans le
mouvement, à la fois à l’intérieur et à l’extérieur de la cellule
Définition: Cytoplasme
Tout ce qu’on retrouve entre la membrane et le noyau
Composition (4) du cytoplasme
- Organites membranaires
- Cytosquelette
- Cytosol : Fraction liquide du cytoplasme composé de :
* Solvant et solutés : Principalement de l’eau, mais également
de nombreux ions et petites molécules organiques.
* Métabolite : Substrats ou produits de diverses voies
métaboliques.
* Facteurs de signalisation : Messagers secondaires comme le
calcium et des molécules de signalisation intracellulaire. - Inclusions cytoplasmiques : Il peut également y avoir des
inclusions comme des gouttelettes lipidiques, des grains de
glycogène et des pigments
Fonctions (4) dy cytoplasme
MSVT
- Métabolisme :
* Le cytosol est le site de nombreuses voies métaboliques
(glycolyse, gluconéogenèse et une partie de la respiration
cellulaire en absence d’oxygène (fermentation)). - Synthèse protéique :
* Pour les protéines qui ont une activité cytosolique
(récepteurs ou enzymes cytosoliques…) et les protéines
nucléaires. - Voies de signalisation :
* Lieu ou se déroule les cascades de signalisation (contient
différent type d’enzymes comme les kinases et les
phosphatases et les substances second messager). - Trafic intracellulaire :
* Milieu où les vésicules et autres structures (organites) se
déplacent guidées par le cytosquelette
Structure (4) du noyau
CENN
Chromatine :
* L’ADN condensée ou relâchée par des protéines nommés histones pour réguler
l’expression des gènes.
Enveloppe Nucléaire :
* Composée deux membranes de bicouches lipidiques. Cette enveloppe est
perforée par des structures appelées pores nucléaires, qui régulent le transport
des molécules entre le noyau et le cytoplasme.
Nucléoplasme :
* Contenu visqueux du noyau, similaire au cytoplasme.
Nucléole :
* Structure non membranaire présente dans le noyau où la synthèse et
l’assemblage des sous-unités ribosomales ont lieu (Généralement il s’agit de la
région plus sombre quand on observe un noyau)
Qu’est-ce qui compose l’enveloppe nucléaire? (3)
1.La membrane externe :
* Composé de phospholipides.
* En contact avec le cytoplasme.
* Est en continuité avec le système endomembranaire,
plus particulièrement avec le réticulum endoplasmique
rugueux.
2.La membrane interne :
* Composé de phospholipides et de la couche laminaire
* Est en contact avec le nucléoplasme (similaire au
cytosol, mais à l’intérieur du noyau).
3.Ces deux membranes sont rejointes et traversées par les
pores nucléaires :
Canaux protéiques qui permettent les échanges entre le cytoplasme et l’intérieur du noyau cellulaire.
Définir la couche laminaire
Structure dense de filaments protéiques située à la face
interne de l’enveloppe nucléaire des cellules eucaryotes. Principalement composée de lamines
Nommez les 3 rôles de la couche laminaire
SOS
Support structural :
* Contribue à maintenir la forme et la taille du noyau contre les
contraintes mécaniques (Protection du matériel génétique).
Organisation de la chromatine :
* Ancre certaines régions de la chromatine à l’enveloppe
nucléaire (Régulation de l’expression).
Signalisation nucléocytoplasmique :
* Échafaudage pour des protéines impliquées dans des voies de
signalisation (Expression génique, réparation de l’ADN,
régulation du cycle cellulaire…)
Définir les pores nucléaires
Vastes assemblages multiprotéiques
situés à travers l’enveloppe nucléaire, formant des canaux qui
permettent le transport de molécules entre le noyau et le
cytoplasme
Structure des pores nucléaires
Chaque pores contient plus d’une trentaine de protéines qu’on appelle nucléoporines.
Ces nucléoporines sont organisées en sous-complexes qui
forment la structure annulaire du pore, les filaments
cytoplasmique et le “panier” nucléaire
Focntions (2) des pores nucléaires
Transport sélectif et bidirectionnel :
* Les CPN permettent le passage libre de petites molécules
(< 50 kDa), tandis que les molécules plus grandes,
comme les protéines et l’ARN, nécessitent des signaux
de localisation nucléaire ou cytoplasmique pour être
transportées à travers le pore.
Régulation de la signalisation et de l’expression génique :
* Au-delà de leur rôle dans le transport, les pores
nucléaires sont également impliqués dans des processus
tels que la régulation de la signalisation cellulaire et de
l’expression génique, car certains facteurs de
transcription et régulateurs peuvent interagir
directement avec les nucléoporines
Qu’est-ce qu’un signal d’adressage cyto-nucléoplasmique?
Il s’agit de séquences peptidiques qui permettent de diriger des
protéines pour l’importer vers le noyau ou de l’exporter hors du
noyau à travers les CPN
Les deux types de signaux d’adressage cyto-nucléoplasmique
Signal de Localisation Nucléaire (NLS) :
* Séquence peptidique (a.a. basique) qui signale que la
molécule avec laquelle elle est associée doit être transportée
dans le noyau.
* Cette séquence est reconnue par un transporteur protéique
soluble, l’importine.
Signal d’Exportation Nucléaire (NES) :
* Séquence peptidique (a.a. hydrophobes) qui signale à la
molécule sur laquelle elle est présente d’être transportée hors
du noyau.
* Cette séquence est reconnue par un transporteur protéique
soluble, l’exportine
Caractéristiques (3) de la chromatine
- Complexe d’ADN, de protéines et d’ARN qui constitue la
structure des chromosomes à l’intérieur du noyau. - Permet de condenser l’ADN afin qu’il puisse tenir dans le
noyau. - Permet également de donner l’accès aux enzymes
nécessaires pour la transcription, la réparation de l’ADN, et
la réplication
Nommez les deux types de chromatine et leur caract
- Chromatine Euchromatique : Elle est moins compacte et est
généralement active transcriptionnellement. - Chromatine Hétérochromatique : Plus dense et généralement
moins active transcriptionnellement
Définition : Histone
Octamère de protéines chargées positivement, qui facilitent
la compaction de l’ADN (chargé négativement) en formant un
complexe ADN-histone
Nommez les types principaux d’histones
Il existe cinq types principaux d’histones :
* Histones du cœur (H2A, H2B, H3, H4) : autour desquels l’ADN
est enroulé (2 de chaque).
- Histone de liaison (H1) : Cette protéine est externe au noyau
d’histones et aide à sceller l’ADN autour de cet octamère,
stabilisant la structure.
**Ces 9 protéines et l’ADN (environ 147 paires de bases) enroulé
forme le nucléosome (plus petites unités structurales de la
chromatine)
Vrai ou faux: Le matériel génétique est disponible pour la transcription à tout moment
Faux, même si le code génétique complet est présent dans chaque cellule
Qu’est-ce qui permet la transcription spécifique?
Diverses modifications post-traductionelles
Modifications associées à l’activation transcriptionnelle
Décompacter la chromatine, la rendant plus accessible à la
machinerie transcriptionnelle.
- Acétylation: Neutralise les charges positives des histones,
diminuant ainsi leur affinité pour l’ADN chargé négativement. - Méthylation: Recrute des protéines effectrices. Selon l’endroit,
cette modification peu réguler positivement et négativement la
transcription.
Modifications associées à la répression
transcriptionnelle
Compaction accrue de la chromatine qui empêche
l’accès à la machinerie transcriptionnelle.
* Méthylation.
* SUMOylation.
Modifications associées à la réponse aux dommages de
l’ADN et à la réparation
Indique les sites de dommages à l’ADN et régule la
réponse spécifique.
* Phosphorylation : Indique les bris dans l’ADN.
* Ubiquitination: Facilite le recrutement de la machinerie
de réparation de l’ADN
Caractéristiques (3) du nucléole
- Région spécialisée du noyau cellulaire des eucaryotes, non
délimitée par une membrane. - Souvent visible au microscope en tant que structure dense.
- Région riche en ARNr, en précurseur des ribosomes, ainsi
que d’enzyme essentiel à l’assemblage ribosomique
3 régions principales du nucléole
- Centre fibrillaire : où la transcription de l’ADN en ARNr
précurseur a lieu. - Partie fibrillaire dense : impliquée dans la maturation et la
modification de l’ARNr. - Partie granuleuse : où les sous-unités ribosomiques sont
finalement assemblées.
Fonctions (2) du nucléole
- Biogenèse des ribosomes :
Le nucléole joue un rôle essentiel dans la production et
l’assemblage des sous-unités ribosomiques.
* La transcription de l’ADN en ARN ribosomique (ARNr)
précurseur.
* La modification et la maturation de cet ARNr précurseur en
molécules de ARNr matures.
* L’assemblage des molécules de ARNr avec des protéines
ribosomiques pour former les sous-unités pré-ribosomiques
avant d’être exporter dans le cytosol. - Rôle dans la réponse au stress cellulaire :
Outre son rôle principal dans la biogenèse des ribosomes, des
études récentes suggèrent que le nucléole pourrait également
être impliqué dans diverses réponses au stress cellulaire.
Rôle des ribosomes
Responsables de la synthèse des protéines (traduction).
* L’information génétique portée par ARNm est traduite en une
séquence d’acides aminés pour former une protéine.
Machinerie essentielle à la traduction de l’ARNm en protéines.
Intermédiaire entre l’ARNm (Codon) avec ses ARNt (anticodon) correspondants et lie les a.a. pour produire une
protéine spécifique.
Composition des ribosomes
Composés de deux sous-unités, la grande (60S) et la petite (40S).
Formées de :
1. ARN ribosomique (ARNr) :
* Rôle structurale.
* Interaction avec des facteurs de traduction et les ARNt.
* Catalyseur (Ribozymes) dans la formation des liaisons
peptidiques des a.a.
- Protéines ribosomiques :
Rôle dans la stabilité structurale.
Interaction avec l’ARNm.
Sites (3) des ribosomes et ce qui se passe à chacun
Site A (aminoacyl) :
Point d’entrée pour un nouvel ARNt chargé d’un acide aminé
déterminer par l’anticodon correspondant au codon de l’ARNm.
Site P (peptidyl) :
Les a.a. sont ajoutés à la chaîne polypeptidique en croissance. La
formation du lien peptidique est catalysée par le centre peptidyl
transférase du ribosome, régi par l’ARNr.
Site E (exit) :
l’ARNt déchargé se déplace vers le site E, d’où il sort du ribosome pour être recyclé et à nouveau chargé d’un acide aminé.
Donnez les deux types de ribosomes
Ribosomes libres :
* Dispersés dans le cytoplasme et produisent
principalement des protéines qui fonctionnent à
l’intérieur de la cellule.
Ribosomes liés :
* Attachés au réticulum endoplasmique rugueux
(RER) et sont impliqués dans la synthèse de
protéines destinées à être sécrétées hors de la
cellule, incorporées dans la membrane cellulaire
ou envoyées vers les lysosomes
Définition: Système endomembranaire
Ensemble interconnecté de compartiments membranaires qui coordonnent la synthèse, la modification, le transport et le
catabolisme de protéines, de lipides et d’autres molécules
bioactives
