COURS 3 Flashcards

1
Q

où est transcrit l’adn humain ?

A

dans le noyau

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2
Q

qui transcrit l’adn?

A

l’arn polymérase à partir du brin matrice

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3
Q

quel est l’autre nom du brin matrice

A

brin antisens

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4
Q

dans quel sens se fait la transcription?

A

5’–>3’

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5
Q

en quoi est maturé l’arn primaire

A

en arn messager

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6
Q

quelles différences entre Arn primaire et messager ?

A

ajout d’un coiffe, d’une queue polyA, épiage des introns

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7
Q

que se passe t il après la maturation en arn messager

A

exportation dans le cytoplasme pour être traduits en protéines

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8
Q

quelles sont les caractéristiques du code génétique ?

A

universel et non chevauchant

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9
Q

quel est le codon d’initiation de la traduction

A

AUG

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10
Q

quels sont les 3 codons stop?

A

UAA, UGA, UAG

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11
Q

comment appelle t on une sq susceptible d’être traduite en p°

A

en ORF (open reading frame)

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12
Q

caractéristiques de l’épigénétique

A

réversible,transmissible, adaptative (expression des gènes), ne modifie pas !! la sq nucléotidique

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13
Q

qu’est ce que l’empreinte parentale?

A

mécanisme par lequel un seul des gènes présents dans la cellule s’exprime en fonction de son origine parentale

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14
Q

les règles de nomenclature des variations ponctuelles de l’adn sont revues et modifiées régulièrement par la ?

A

Human genome variation society (HGVS)

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15
Q

la nomenclature des gènes suit la recommandation de ?

A

HUGO Gene nomenclature Comitee (HGNC)

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16
Q

Quelles sont les règles pr nommer un gène ?

A

lettres latines et chiffres arabes sans espace

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17
Q

Quelles sont les règles pr nommer un gène humain ?

A

en majuscule et en italique pr le différencier de la protéine

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18
Q

quel est le terme le plus approprié pr parler d’un chgmt d’une ou plusieurs nucléotides dans la sq de ref ?

A

variation allélique

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19
Q

d’où proviennent les sq de référence de l’adn c?

A

de la base de données RefSeqGene (référence séquences gène) du National Center for biotechnology information (NCBI)

20
Q

les variants décrits à partir d’une sq. de réf. protéique sont associés au préfixe …

A

“p”

21
Q

les variants doivent tjrs être décrits au niveau de ..

A

l’adn car une même variation° sur la p° peut aboutir à différents variants nucléotidiques

22
Q

que signifie p.Val600Glu

A

que la valine du codon 600 est substituée par une glutamine

23
Q

que signifie c.800A>C

A

que le A en position 800 de la sq de référence est substitué par un C

24
Q

Que signifie c.800insA?

A

l’insertion d’un A en position 800

25
Q

que signifie c.34delinsTTC?

A

la délétion d’un nucléotide en position 34 et son remplacement par TTC

26
Q

nomenclature des variations ponctuelles de protéines : comment désigne t on un codon stop ?

A

par “*”

27
Q

nomenclature des variations ponctuelles de protéines :

comment désigne t on un codon stop prématuré ?

A

“fs*”

28
Q

Que signifie p.Arg28Serfs*23 ?

A

L’AA Arginine en position 28 est remplacé par une sérine avec un décalage de lecture sur 23 AA et l’apparition d’un codon stop prématuré à la 23ème position

29
Q

mutation perte de fonction def

A

la protéine mutée est soit absente soit présente mais ayant perdue son activité

30
Q

mutation gain de fonction def

A

la protéine mutée est présente mais en qté augmentée ou en qté normale mais avec une fonction amplifiée ou déréglée ou toxique ou complètement nouvelle pr la cellule

31
Q

quand parle t on de variant bénin?

A

lorsqu’il n’a pas de csq phénotypique, qu’il est sans csq sur la fonction de la p°

32
Q

lorsque la fréquence d’un variant allélique mineur est >à 1% dans la pop° on parle de …

A

polymorphisme

33
Q

lorsqu’on ne sait pas classer un variant on parle de ..

A

variant à signification inconnue

34
Q

quelles techniques sont utilisées lorsqu’on cherche à mettre en évidence une variation de sq connue de l’adn?

A

1)PCR`2) méthode de Sanger

35
Q

quelles techniques sont utilisées lorsqu’on cherche à mettre en évidence une variation de sq mais qu’on ne sait pas a priori quelle variation de sq

A

1)PCR 2) séquençage à haut débit de l’exode ou du génome

36
Q

combien de copies d’ADN peut on obtenir après quelques heures de PCR ?

A

environ 1 million de copies

37
Q

principe de la PCR

A

succession de réplication d’une matrice double brin d’ADN

38
Q

comment peut on qualifier l’amplification PCR

A

D’EXPONENTIELLE

39
Q

n cycle de PCR permettent d’obtenir … copies de la sq cible

A

2^n

40
Q

comment visualiser l’adn amplifié après PCR ?

A

En le faisant migrer sur gel d’agarose

41
Q

comment s’appellent les nucléotides modifiées utilisées dans la méthode de Sanger ?

A

les didésoxynucléotides

42
Q

quelle différence entre nucléotides & didésoxynucléotides?

A

les didésoxynucléotides ont été privées de leur groupement OH en position 3’
l’incorporation d’un didésoxynucléotides à une chaine d’ADN interrompu définitivement la polymérisation

43
Q

quelle étape supplémentaire nécessite l’étude de l’ARN?

A

une étape en amont de rétrotranscription en adn complémentaire cDNA

44
Q

quelle méthode permet d’analyser de façon qualitative et quantitative les protéines ?

A

le western blot

45
Q

variant non sens

A

aboutit à la formation d’un codon stop prématuré

46
Q

variation faux sens

A

variant génétique qui conduit au remplacement d’un AA par un autre au niveau génétique

47
Q

variant isosemantique

A

également appelé silencieux, la variation génétique d’apparait pas