Cours 2.2 Structure secondaire Flashcards
Quelle est la définition d’une structure secondaire ?
Repliement local de plusieurs acides aminés pour former des motifs.
Comment les motifs sont ils maintenu ensemble?
Les motifs sont maintenus ensemble par des interactions non convalentes entre A.A.
Quelles types de motifs existent?
Hélices alpha et feuillets plissés bêta
De quelle coté l’hélice alpha tourne? et pourquoi?
Elle tourne du coté droit pour éviter l’encombrement stérique.
Combien d’A.A sont engagés et c combien de tour d’hélice?
36 A.A et 10 tours d’hélice
Qu’est ce qui retient l’hélice ?
L’hélice entre elle par des ponts H
Quelle A.A favorisent la formation d’hélice Alpha?
Ala, Glu, Leu, Met
Quelle A.A ne favorisent pas la formation d’hélice Alpha? et Pourquoi?
Pro et Gly
Gly: faibles contrainte xi et téta dues à l’absence de chaine latérale, très flexibles du à l’atome H étant petit.
Pro: forte contrainte xi et téta causent une distorsion de l’hélice, chaines latéral trop grosse. Pas de H sur N du lien peptidique, donc pas de pont H possible avec l’AA n-4.
Quelles sont les dispositions possibles d’un composé de chaines polypeptidiques d’une structure feuillet plissé béta?
Parallèle et anti parallèle
Quelles disposition d’un composé de chaines polypeptides d’une structure feuillet plissé béta est la plus stables?
Antiparallèle
A quelles groupes d’atomes les polypeptides se lient elle entre elles dans une structure Feuillet plissé Béta?
Les groupes NH et C=O de chaque A.A sont liés aux groupes NH et C=O des A.A d’un polypeptides aligné
Quelle est l’orientation des chaines latérales d’un polypeptides adoptant une structure feuillet plissé béta?
Les chaines latérales sont projetées alternativement au-dessus et en dessous du plan du feuillet
