Cours 2 - Spectrométrie de masse 1 Flashcards
Quels sont quatre rôles principaux de la spectrométrie de masse ?
- Détection de stéroïdes anabolisants.
- Détection de toxines biologiques et contaminants.
- Détection d’explosifs et narcotiques.
- Études pharmacocinétiques et métaboliques.
Quels types de composés sont caractérisés structurellement par spectrométrie de masse en biotechnologie ?
Les oligonucléotides et les protéines.
Quelles sont les quatre composantes d’un spectromètre de masse ?
Introduction de l’échantillon, ionisation, séparation, détection.
Pourquoi un spectromètre de masse fonctionne-t-il sous vide ?
Pour focaliser le faisceau ionisant.
Que représente l’espèce ionisée en spectrométrie de masse ?
Une molécule avec un proton supplémentaire ou en moins.
Quelles sont les trois façons d’exprimer la masse moléculaire dans la littérature ?
- Masse moyenne
- Masse nominale
- Masse précise.
Qu’est-ce que la masse moyenne (ou chimique) ?
La masse calculée en tenant compte de l’abondance relative des isotopes naturels.
Qu’est-ce que la masse nominale ?
La masse entière de l’isotope principal de chaque élément.
Qu’est-ce que la masse mono-isotopique ?
La masse exacte de l’isotope principal tenant compte des défauts de masse.
Que signifie m/z en spectrométrie de masse ?
Le rapport masse/charge, exprimé en Thomson (Th).
Qu’est-ce qu’un isotope ?
Un élément avec le même nombre de protons mais un nombre différent de neutrons.
Donnez deux exemples d’éléments monoisotopiques.
Le fluor et le sodium.
Quels sont des exemples d’éléments multi-isotopiques ?
Le carbone, le chlore et l’hydrogène.
Quelle est la masse définie de l’isotope léger du carbone ?
12.00000 u.
Comment les isotopes affectent-ils la masse des éléments ?
Certains ont une masse légèrement supérieure (exemple : hydrogène) ou inférieure (exemple : oxygène) à la masse nominale.
Que représente l’enveloppe isotopique en spectrométrie de masse ?
- L’espacement des pics indique la différence de masse entre isotopes.
- L’abondance relative X+1/X détermine le nombre d’éléments.
Quel est l’isotope X’ le plus abondant ?
L’isotope 13C.
Quelle est la formule de résolution en spectrométrie de masse ?
R= M / ΔM
Quels analyseurs de masse offrent une haute résolution ?
- Temps de vol (TOF).
- Résonance cyclotronique ionique.
Qu’est-ce que la méthode MALDI permet ?
La désorption et ionisation avec peu de fragmentation, produisant des ions simplement chargés.
Quelle est la fonction principale de la matrice en MALDI ?
Absorber la radiation laser et transférer des protons à l’analyte.
Donnez deux exemples de matrices pour MALDI.
DHB (2,5-dihydroxybenzoic acid) et CHCA (α-cyano-4-hydroxycinnaminic acid).
Pourquoi DHB est-il considéré comme une matrice versatile ?
Il fonctionne pour de nombreux types d’analytes.
Quelles sont deux propriétés importantes d’une matrice en MALDI ?
- Absorption du laser.
- Formation de cristaux homogènes avec l’analyte.
Comment les ions sont-ils séparés dans un analyseur TOF ?
Par dispersion temporelle en fonction de leur temps d’envol.
Quelle est la différence entre un TOF linéaire et un réflectron ?
- Linéaire : faible résolution.
- Réflectron : haute résolution.
Quels sont les avantages d’un réflectron ?
Des pics étroits et une meilleure résolution.
Que se passe-t-il lors de l’identification de protéines par MS ?
- Réduction/alkylation.
- Digestion trypsique.
- MALDI-TOF.
- Empreinte de masse et recherche dans des bases de données.¸
- Séquençage par MS
Pourquoi la trypsine est-elle utilisée pour digérer les protéines ?
Elle produit des peptides avec un acide aminé basique au C-terminal facilitant la fragmentation.
Que permet une cellule à collision en MS-MS ?
Favoriser la fragmentation des ions précurseurs.
Quelles énergies de collision sont utilisées pour la fragmentation ?
- Basse énergie (𝐸𝐿𝑎𝑏 < 200 𝑒𝑉) : quadripolaire, trappe ionique, ICR.
- Haute énergie (𝐸𝐿𝑎𝑏 > 𝑘 𝑒𝑉) : secteurs, TOF.
Que sont les fragments typiques observés en MS-MS ?
- Ions b (frag N-term).
- Ions y (frag C-term).
- Ions a (frag N-term).
Quelles sont les étapes pour interpréter un spectre MS-MS ?
- Identifier les ions adjacents.
- Assigner les acides aminés correspondants.
- Déterminer la séquence partielle.
Que signifie MALDI-TOF en termes de temps d’analyse ?
Un spectre MALDI-TOF est obtenu en moins d’une seconde.
Qu’est-ce que m/z représente dans MS-MS ?
Le rapport entre la masse de l’ion et sa charge.
Comment une barrière de voltage agit-elle dans un réflectron ?
Elle synchronise la transmission d’ions précurseurs.
Quelle est la résolution atteinte dans certains cas en MS-MS ?
Jusqu’à 1000.
Quelle est la taille approximative d’une zone irradiée en MALDI ?
300 mm x 600 mm avec une profondeur de 25 Å.
Comment l’abondance relative X+1/X est-elle utilisée ?
Pour déterminer le nombre de chaque élément dans un échantillon.
Quelle est la fonction du réflectron dans un analyseur TOF ?
Corriger les différences d’énergie initiale des ions pour améliorer la résolution.
Quelle étape précède une analyse MS-MS ?
La sélection des ions précurseurs.
Quelle information la spectrométrie de masse peut-elle fournir sur les protéines ?
Leur séquence primaire et des informations sur leur structure.
Comment l’énergie interne est-elle augmentée dans une cellule à collision ?
Par collision avec un gaz neutre.
Quels sont les deux types d’ions dans les spectres MS-MS de peptides ?
Les ions b et y.
Quel est le rôle des ions gate dans un réflectron ?
Permettre la synchronisation des ions précurseurs.
Pourquoi les isotopes naturels influencent-ils les spectres MS ?
Parce qu’ils contribuent à l’enveloppe isotopique et à l’espacement des pics.
