Cours 2: réponse innée TLR et PRR

Question 1

Quels sont les intérêts de l’étude des PRRs?

Answer 1

• Contrôle étroit dans l’inflammation
• Rôles dans maladies inflammatoires, etc
  -Cibles thérapeutiques potentielles

Question 2

PRR pour?

Answer 2

Pattern recognition receptor

Question 3

PAMPs pour

Answer 3

Pathogen-associated molecular patterns

Question 4

Quelles sont les «3 caractéristiques» des PAMPs

Answer 4

-Structures répétées reconnues/PRR
-Sur les pathogènes et pas le soi
-Essentielles à la survie du pathogène

Question 5

Nommer des exemples de PAMPs

Answer 5

Olligosaccarides, peptidoglycanes, lipopolysaccharides, etc.

Question 6

Qui possèdent des PRRs?

Answer 6

À peu près toutes les cellules genre😯, immunitaires, épithéliales, etc.

Question 7

Nommer des propriétés des PRRs!

Answer 7

-Reconnaissent les PAMPs
-Exprimer de manière constitutive
-Encodés dans le génome
-Exprimés sur toutes les cellules d’un même type!
Pas de mémoire immunologique

Question 8

Le fait que les PRRs reconnaissent les PAMPs est…

Answer 8

Important, car ils sont essentiels à la survie des pathogènes, tels que les pathogènes ne peuvent pas être mutés

Question 9

Les PRRs sont exprimés de manière constitutive, car…

Answer 9

On veut pouvoir détecter les pathogènes peut importe leur cycle de vie!

Question 10

Le fait que les PRRs soient encodés dans le génome fait que…

Answer 10

Il n’y a pas de diversité additionnelle!

Question 11

Les PRRs ne forment pas de mémoires immunologiques, car…

Answer 11

Les cellules du système inné ne développent pas de mémoire immunologique! (Activation par TLR)

Question 12

Le niveau d’expression des TLRs est modulé par quoi?

Answer 12

L’INFLAMMATION

Question 13

Il existe 4 types de PRRs selon 2 critères soit…

Answer 13

Localisation cellulaire et fonction

Question 14

Les 4 types de PRRs sont?

Answer 14

1) Récepteur dans le sérum
2) Récepteur exprimé à la surface pour phagocyter
3) Récepteurs exprimés à la membrane induisant des signaux intracellulaires
4) Récepteurs intracellulaires.

Question 15

LeS TLRS (Toll-like) font partie de quel type de PRR?

Answer 15

Récepteurs exprimés à la membrane induisant des signaux intracellulaires

Question 16

Les RIG-I-like (RLR) font partie de quel type de PRR?

Answer 16

Récepteurs intracellulaires

Question 17

Les NOD-like (NLR) font partie de quel type de PRR?

Answer 17

Récepteurs intracellulaire

Question 18

Voie de signalisation des NLR???

Answer 18

Inflammasome

Question 19

ON COMMENCE AVEC LES TLR:
En vrai, c’est quoi un TLR?

Answer 19

-Type de PRR qui reconnait des PAMPs (motifs pathogènes)
-il y a un grand nombre de protéine dans les génome des vertébrés
-reconnaît plusieurs PAMPs ayant une structure non reliée
-reconnaît stuct. mol. de bactéries, levures, virus et trucs multicellulaires
-structure (récepteur?) et cascade de signalisation sont conservées de la drosophile à l’humain!

Question 20

Est-ce l’expression des TLRs est restreinte aux cellules innés?

Answer 20

NON (l’expression des PRR et donc TLR qui en sont un type est pour toutes les cellules)

Question 21

Pourquoi on parle souvent de TLR4, TLR7 et TLR9?

Answer 21

Plusieurs drogues les inhibent et donc ils sont faciles à étudier + bon pour traitement peau, verrue.

Question 22

Pourquoi existe-t-il une si grande variété de TLR? Pourquoi il n’y en a pas que un type vu qu’on a un TCR?

Answer 22

Parce qu’il y a une co-évolution de notre système immunitaire en plus d’une grande diversité antigénique

Question 23

Qu’est-ce qui permet aux TLR de lier plusieurs ligands? I guess d’être plus polyspécifiques?

Answer 23

L’assemblage hétérodimérique

Question 24

À quel endroit sont exprimés les TLR?

Answer 24

Surface cellulaire ou endosome! = on peut reconnaitre des pathogènes extracellulaires et phagocytés!

Question 25

Décrire vite fait la cascade chez la drosophile concernant le récepteur Toll.

Answer 25

en extérieur: un PAMP lie une protéase pro-spaetzel et donc pro est libéré et spaetzel lie Toll
à l’intérieur: Pelle active Cactus et Dorsal/DIF (FT JE CROIS) est transloqué dans noyau= active transcription gènes! En gros réponse immunitaire

Question 26

Expliquer la cascade chez les plantes et les mammifères concernant le récepteur Toll. En quoi est-elle différente de celle de la drosophile?

Answer 26

Le PAMP lie directement le récepteur Toll et il y a une réponse immunitaire contrairement à la drosophiles où on doit passer par protées/spaetzel:)

Question 27

Pourquoi on peut dire qu’il y a une homologie entre la structure d’un TLR et l’IL-1R?

Answer 27

TLR

LRR:(extérieur) séquence répétées de leucines qui permettent de lier/reco un ligand
TIR(intracellulaires): induit la signalisation

IL-1R

Ig-like domain (équivalent de LRR) et boites 1,2 et 3 (équivalent du TIR)

Question 28

Quel est le rôle de MyD88, en expliquant la cascade MyD88 DÉPENDANTE?

Answer 28

En gros PAMP lie TLR et ça active TLR. Du coup MyD88 pourrait lier le TIR du TLR et MyD88 induit une cascade qui permet la dégradation de IKKB et donc la production de cytokines inflammatoires

Question 29

Décrire un death domain (structure de MyD88).

Answer 29

MyD88 possède un TIR et aussi un death domain qui permet de lier et de faire de la signalisation.

Question 30

Que se passe-t-il en absence de MyD88?

Answer 30

Pas de reconnaissance des pathogènes et donc on y est plus susceptible.

Question 31

Quel est le rôle de MyD88, en expliquant la cascade MyD88 INDÉPENDANTE en absence de MyD88?

Answer 31

On passe par l’intermédiaire TRIF au lieu de MyD88. Mais la fin reste la même (selon prof on produit INF, soit des cytokines inflammatoires)

Question 32

Résumer vite fait cascade des signaux TLR!

Answer 32

On dégrade IKKB= active NFKB!
Ça se fait selon voies MyD88 dépendante ou indépendante.

Question 33

L’activation des TLRs cause…

Answer 33

Production cytokines inflammatoires et augmentation des molécules de co-stimulation et de l’expression du CMH.

Question 34

On a vu les TLR, maintenant les RLR

Answer 34

YES:)

Question 35

Nommer une caractéristique des RLR et les QUATRE types de RLR.

Answer 35

• Cytosolique
• RIG-I ET MDA5
• RLR-3(LGP2)
• IPS1

Question 36

Quelle est la composition des RLR RIG-I ET MDA5?

Answer 36

• Un ou deux domaines CARD
• Un DEAD box
• Un domaine hélicase
• Un domaine régulateur

Question 37

Qu’est ce qui confère la spécificité de RIG-I ET MDA5 (indice: un truc dans leur composition)?

Answer 37

Le domaine régulateur!

Question 38

Que reconnait RIG-I?
Que reconnait MDA5?
Pourquoi?

Answer 38

RIG-I reconnait ARN viral double brin des mammifères (à savoir?: par l’absence du gr triP en 5’ chez les virus) IMP RECO ARN DOUBLE BRIN COURT: PLUS PETIT QUE 2000 nt

MDA5 reconnait les ARN double brins long supérieur à 2000nt

LE FAIT D’AVOIR LES DEUX PERMET DE RECO TOUS LES ARN DOUBLE BRINS

Question 39

Nommer des caractéristiques de RLR-3 (LGP2) ET IPS-1!

Answer 39

RLR-3(LGP2): N’a pas de domaine CARD et donc agit via son activité ATPase.

IPS-1: Contient un domaine CARD homologue à cette famille qui sert d’adaptateur dans la signalisation + SURTOUT IL N’A PAS DE DOMAINE RÉGULATEUR DONC PAS UN PRR

Question 40

Décrire la cascade impliquant la reconnaissance d’ARN double brin virale avec (RLR-3) LGP2, RIG-I ET MDA5.

Answer 40

JE CROIS:
-MDA5 ET (RLR-3) LGP2 reco ARN double brin
-RIG-I reco ARN double brin (OU SIMPLE?) par son dom régulateur
-Il s’ouvre en deux (RIG-I)
- RIG-I lie IPS1 qui lui lie la mb de la mitochondrie (en fait le CARD de IPS1 permet d’attirer RIG-I par son CARD à lui je crois)
-CASCADE ACTIVÉE: Plusieurs caspases sont activées, dégradation de IKKB du coup NFKB transloqué dans noyau= PRODUCTION DE CYTOKINES

Question 41

Est-ce qu’il existe une autre voie que celle de reconnaissance d’ARN double brin viral? Si oui laquelle?

Answer 41

OUI, la voie de l’ADN (i guess double brin)

Question 42

Selon tout ce que tu sais des TLR ET RLR compare les deux. Quelles sont les spécificités des RLR?

Answer 42

-Cytosoliques (intracellulaire tu vois alors que les TLR induisent des signaux intracellulaires)
-Ont besoin d’ATP
-Intermédiaire de signalisation lie le domaine CARD et on n’a pas de TIR
-LE DOM RÉGU PERMET DE RECO LE PATHO
TLR: patho dans endosmose alors que RLR il est en flottement dans le cytosol tranquille lol

Question 43

MAINTENANT: LES NLR
(NOD LIKE RECEPTORS)

Answer 43

LET’S GO SLAY:)

Question 44

Donner les informations suivantes sur les NLR:
Localisation? Domaines (3)? Quels organismes les ont vs qui ne les ont pas?

Answer 44

➡️Cytoplasmique

➡️DOMAINES:
- LRR (Leucine-rich repeats) -reco ligand genre le pathogène, entre autres, petits peptides bactériens

-NOD(nucleotide binding oligomerization): permet la dimérisation ATP-dépendante

-CARD qui est le dom de signalisation ou encore purin(comme LRR) ou Bir

➡️Plantes et mammifères et non chez la drosophile et C.elegans!

-

Question 45

Décrire en une phrase la cascade impliquant les NLR.

Answer 45

Le pathogènes est reconnu par LRR et du coup NFKB va dans noyau et ça active la production de cytokines inflammatoires UN CLASSIQUE!

Question 46

NOMMER UNE CARACTÉRISTIQUES PROPRES AU NLR DANS LE CADRE DU COURS!

Answer 46

IL RECONNAISSENT LES DAMPs! LES SEULS

Question 47

MAINTENANT L’INFLAMMASOME

Answer 47

LE DERNIER GO!

Question 48

Caractéristiques générales de ce gros complexe?
- Maturation de?
-Quelles sont les 3 protéines qui le compose?
-Types?

Answer 48

-Permet la maturation d’IL
-Senseurs, adapateurs et effecteurs
-Plusieurs types NLRP3 ENTRE AUTRES

Question 49

Expliquer la voie de signalisation de l’inflammasome, pourquoi est-elle spéciale?

Answer 49

Le complexe NLRP3 (inflammasome) reconnait les PAMP OU DAMP et directement on active une caspase qui clive la cytokines DIRECT et hop rx inflammatoire

ON NE PASSE PAS PAR UN FT!!

Question 50

Expliquer la voie de signalisation de l’inflammasome en détaillant un peu plus!

Answer 50

-Sgt1 et Hsp90 gardent Nlrp3 inactif jusqu’à l’apparition de PAMP ou DAMP!

-Nlrp3 s’oligomérise du coup libère domaine purin pour interactions homonymiques avec ASC

• Le dom CARD DE ASC permet de recruter la procaspase-1 qui s’autoclave et ensuite clive des IL (cytokines inflammatoires je crois) en forme mature

Question 51

Quels moyens les pathogènes utilisent pour échapper au PRRs?

Answer 51

Les PRR ciblent des structures conservées et essentielles à la survie des pathogènes (PAMPs)

exemple: virus de la vaccine prod des prot avec domaine TIR ce qui inhibe la voie des TLR