Cours 2 Flashcards

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1
Q

Quelles sont les définitions de “génotype” et “phénotype”?

A

Le génotype est la composition génétique d’un individu, alors que le phénotype est l’ensemble des caractéristiques observables d’un individu.

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2
Q

Les caractères génotypiques et phénotypiques peuvent être étudiés à plusieurs niveaux. Quels sont-ils?

A
  • Moléculaire
  • Cellulaire
  • Morphologique
  • Physiologique
  • Comportemental
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3
Q

La sélection naturelle agit-elle sur les phénotypes ou les génotypes?

A

Les phénotypes

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4
Q

Dans quels cas est-ce que les variations phénotypiques sont habituellement essentielles pour le maintien des populations?

A

Si l’environnement est hétérogène dans l’espace ou le temps.

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5
Q

Comment se nomme les adaptations entre les populations d’une même espèce?

A

Des adaptations locales

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6
Q

Quelles sont les conditions qui mène à des adaptations?

A

La sélection est constante, et les différents phénotypes sont héritables.

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7
Q

Quelles sont les exigences des adaptations.

A
  • Nécessite plusieurs générations
  • Requiert un environnement stable dans le temps
  • requiert de la diversité génétique
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8
Q

Qu’arrive-t-il lorsque l’environnement change trop rapidement (en une seule génération ou moins)?

A

Slide 11 chap.2

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9
Q

Qu’arrive-t-il lorsque les populations n’ont pas ou peu de diversité génétique?

A

Slide 11 chap.2

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10
Q

Quels sont les types de reproduction asexuée?

A
  • Bourgeonnement

- Gyogenèse

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11
Q

Décrivez le processus de la gyogénèse.

A

Un individu diploïde femelle produit des oeufs non réduits, le sperme active la division de l’oeuf sans le pénétrer, et donc la progéniture est un clone de la mère.

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12
Q

Définissez l’effet fondateur.

A

La perte de diversité génétique causé par le faible nombre d’individus au départ.

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13
Q

Définissez la modification épigénétique.

A

Changement de l’expression des gènes, sans changement de la séquence nucléotidique des gènes.

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14
Q

Est-ce que les modification épigénétiques peuvent subvenir de façon aléatoire?

A

Oui

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15
Q

Est-ce que les modification épigénétiques peuvent subvenir en fonction de l’environnement?

A

Oui

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16
Q

Donner un exemple de modifications épigénétiques qui peuvent subvenir en fonction de l’environnement?

A

Les abeilles domestiques selon l’alimentation.

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17
Q

Quels sont les sources de variations phénotypiques?

A
  • Génétique
  • Épigénétique
  • Interaction épigénétique-environnementale
  • Environnementale
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18
Q

Quels sont les stratégies écologiques vue dans le cours?

A
  • Jack of all trades
  • Plasticité phénotypique
  • Bet Hedging
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19
Q

Expliquez la stratégie “Jack of all trades”.

A

Un génotype produit le même phénotype peu importe l’environnement, car il est tolérant aux conditions environnementales (il a une valeur adaptative moyenne élevée dans plusieurs environnement).

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20
Q

Expliquez la stratégie de “plasticité phénotypique”.

A

Provient des interactions entre l’environnement et l’épigénétique. Lors du développement, l’individu reçoit un signal environnemental. Il s’ensuit une modification de l’expression de gènes via des mécanismes épigénétiques, menant à différents phénotypes selon l’environnement.

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21
Q

Donnez un exemple de plasticité phénotypique et expliquez

A

L’escargot marin Nucella lamellosa a une forme différente selon le signal environnemental des prédateurs présents. S’il y a présence d’étoile de mer, l’ouverture sera plus mince et profonde car l’étoile se nourrit en régurgitant son estomac dans la coquille. S’il y a présence de crabe la coquille sera plus épaisse, car le crabe se nourrit en brisant la coquille. Lorsque les deux prédateurs sont présents, les deux aclimatations sont observées.

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22
Q

Dans quel cas est-ce que la stratégie de plasticité phénotypique est favorable?

A

Lorsque l’environnement est prévisible à l’intérieur d’une génération, mais changeant d’une génération à l’autre.

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23
Q

Qu’est-ce que veux dire un environnement “prévisible”?

A

L’environnement au moment de la production du phénotype et lors de la sélection du phénotype sont similaires.

24
Q

Quelle est la différence entre “adaptation” et “acclimatation”?

A

Adaptation est une modification de la composition génétique d’une population, alors que l’acclimatation est une modification phénotypique non-génétique. Dans les deux cas cela permet d’avoir une meilleure valeur adaptative.

25
Q

Qu’est-ce qu’on entend par “coûts associés à la plasticité phénotypique”?

A

-Facteurs reliés à la plasticité d’un trait qui réduisent la valeur adaptative d’un individu, même si le trait correspond au phénotype optimal

26
Q

Qu’est-ce qu’on entend par “limites de la plasticité phénotypique”?

A
  • Facteurs qui empêche à un individu de développer un trait qui correspond au phénotype optimal
  • Même sans coût
27
Q

Quels sont les coûts possibles associés à la plasticité phénotypique?

A
  • Coûts de maintient
  • Coûts de production
  • Coût d’acquisition de l’information
  • Coûts génétiques
  • etc
28
Q

Expliquez les coûts de maintient de la plasticité phénotypiques.

A

Le maintient de la “machinerie” nécessaire pour faire de la plasticité peut être coûteux énergétiquement.

29
Q

Expliquez les coûts de production de la plasticité phénotypiques.

A

La production de certaine structures peut être couteuse, ex: épines pour se protéger des prédateurs.

30
Q

Expliquez les coûts d’acquisition de l’information de la plasticité phénotypiques.

A

Acquérir l’information dans l’environnement peut être risqué, ex: une plante doit être consommée partiellement pour développer des défenses.

31
Q

Expliquez les coûts génétiques de la plasticité phénotypiques.

A

La modification épigénétique d’un gène peut entraîner une modification du phénotype favorable pour un trait mais défavorable pour un autre.

32
Q

Quels sont les limites de la plasticité phénotypique?

A
  • Limite de la fiabilité de l’information
  • Limite du temps de réponse
  • Limite du phénotype produit
  • etc
33
Q

Expliquez la limite de la fiabilité de l’information en relation à la plasticité phénotypique.

A

L’environnement au moment du développement et au moment de la sélection n’est pas le même, et le signal au moment du développement ne peut pas prédire le futur.

34
Q

Expliquez la limite du temps de réponse en relation à la plasticité phénotypique.

A

Il peut y avoir un laps de temps trop grand entre le changement dans l’environnement et la modification du phénotype.

35
Q

Expliquez la limite du phénotype produit en relation à la plasticité phénotypique.

A

Incapacité de produire un phénotype optimal car l’environnement est trop extrême.

36
Q

Est-ce que la variation phénotypique par la plasticité est environnementale ou génétique?

A

Elle est environnementale, mais la capacité de faire de la plasticité est héritable (génétique).

37
Q

Est-ce que la sélection peut favoriser les génotypes qui ont une plus grande plasticité phénotypique?

A

Oui.

38
Q

Qu’est-ce que le polyphénisme?

A

La production de deux ou quelques phénotypes discrets selon l’environnement

39
Q

Quelle est la différence entre la plasticité et le polyphénisme?

A

Le changement phénotypique pour un trait se fait de façon continue pour la plasticité et de façon discrète pour le polyphénisme.

40
Q

Donnez un exemple de polyphénisme et expliquez

A

La chenille du papillon Nemoria arizonaria. Au printemps, les chenilles vont se nourrir des fleurs de chênes et les ressemble, et en été, elles se nourrissent de feuilles car les fleurs ne sont plus présente, et donc l’apparence de la chenille change.

41
Q

Expliquez la stratégie de “Bet hedging”

A

Capacité d’un génotype de produire des phénotypes différents de façon aléatoire, et donc indépendamment de l’environnement. Les phénotypes non-performants seront éliminés.

42
Q

Dans quelle circonstance est-ce que la stratégie de “Bet hedging” est favorable?

A

Lorsque les environnements sont imprévisibles, soit lorsque l’environnement au moment de la production du phénotype et lors de la sélection du phénotype est différent.

43
Q

Donnez un exemple de “Bet hedging” et expliquez

A

La grenouille Pseudophryne australis. Les oeufs de la grenouilles sont censé éclore lors de la première pluie car cela signifie habituellement que des marres seront formées et les têtards pourront s’y développer. Cependant dans un environnement ou les pluies sont imprévisibles, les temps d’éclosion sont très variés pour assurer qu’au moins certains têtards ont des marres remplies par la pluies pour se développer.

44
Q

En quoi sont riches les îlots CpG?

A

En cytosine et guanine.

45
Q

Quelle partie de l’ADN est méthylée lors de la méthylation de l’ADN?

A

la cytosine.

46
Q

Qu’arrive-t-il lorsque l’ADN est méthylé?

A

Il n’y a pas de transcription.

47
Q

Qu’est-ce que l’acétylation des histones?

A

Lorsque les histones sont acétylée, il y a transcription, mais si il y a désacétylation des histones alors il n’y a pas de transcription.

48
Q

Qu’arrive-t-il lorsqu’un micro-ARN est ajouté à un ARN messager?

A

Il n’y a pas de production de protéine, pas de traduction.

49
Q

Qu’est-ce qui est important lors de l’étude des stratégies écologiques?

A

Choisir les bons traits (ceux qui sont importants pour la valeur adaptatives des organismes dans les milieux étudiés)

50
Q

Quelle est l’utilité d’un organisme aux stratégies mixtes?

A

Avoir plusieurs traits qui présentent des stratégies différentes

51
Q

Quelles sont les caractéristiques d’un modèle d’étude idéal? Pourquoi?

A
  • Se retrouve dans plusieurs environnement, alors ont peut savoir quels sont les changements dépendament des environnements et ceux qui demeurent les mêmes
  • Organisme à reproduction asexuée ou à faible diversité génétique
  • Courte durée de vie/reproduction rapide
  • Connaître la fonction des traits étudiés
  • Organisme qui se déplace peu, donc reste toujours dans le même environnement
52
Q

Pourquoi est-il difficile de savoir si on est en présence de plasticité ou de Bet-hedging en milieu naturel?

A

Parce que le résultat sera le même.

53
Q

Définissez “norme de réaction”.

A

Changement phénotypique lorsque l’individu est changé d’environnement.

54
Q

Qu’est-ce qui est très important lors d’étude des mécanismes épigénétiques via les tissus?

A

Utiliser le même tissus.

55
Q

Que faire lorsque les mécanismes épigénétiques sont inconnus?

A

Analyses transcriptomiques, soit les quantités d’ARN messagers