cours 2 Flashcards
donne moi un exemple où la chaine latérale est impliquée dans le lien peptidique.
Glutation (lien atypique avec le carboxyle du carbone Y avec l’amine du groupe cystéine).
V ou F - les chaines latérales ne sont habituellement pas impliqués dans les liens peptidiques.
V (habituellement) sauf quelques contres exemple.
V ou F les liens peptidiques sont planaires
V
Cis ou trans la forme la plus abondande dans les proteine? PK?
trans est plus étiré moins d’encombrement stérique,
CIs ou trans que les C alpha peptidique occupent les côté opposé au groupe peptidique ?
Trans
Quel acide aminé est une exception consernant l’énergie cis ou trans ?
Proline, autant d’énergie en trans ou cis
comment se nomme l’angle entre le carbone alpha et son amine
phi
comment se nomme l’angle entre le carbone alpha et son carbonyle
psy
quel acide aminé les angles psy et phi sont fixes ?
proline
definition de structure secondaire
repliment local de plusieurs acide aminés pour former des motif
les formes des structures secondaire sont maintenue par des liens covalent (V OU F)
F
quels sont les deux motifs les plus courant au niveau secondaire?
Feuillet plissé beta
helice alpha
Dans l’helice alpha, quest ce qui permet la formation de l’hélice?
Des ponts H entre le H de groupe amine (n) et le O du carboxyle en position (n-4)
36 acides aminés donnent environ combien d’hélice alpha?
10
les helices sont plus left-handed ou right-handed ? Pk?
right-handed, moins d’encombrement stérique
Les angles des angles phi et psy des helices alphas rights-handed?
-60 degre et -50 degré
quels acides aminées sont favorables et défavorables au helice alpha ?
favorable = méthionine, alanine, leucine, lysine, acide glutamique
défavorable = glycine et proline
pour quels raisons la glycine est proline sont défavorables aux helices alpha ?
Gly = faible contrainte en raison de l’absance de chaine latérale, très flexible
Pro = forte contraite forme une distorsion de l’hélice et pas de H sur le lien peptidique donc pas de pont H possible.