cours 2 Flashcards

1
Q

donne moi un exemple où la chaine latérale est impliquée dans le lien peptidique.

A

Glutation (lien atypique avec le carboxyle du carbone Y avec l’amine du groupe cystéine).

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1
Q

V ou F - les chaines latérales ne sont habituellement pas impliqués dans les liens peptidiques.

A

V (habituellement) sauf quelques contres exemple.

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2
Q

V ou F les liens peptidiques sont planaires

A

V

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3
Q

Cis ou trans la forme la plus abondande dans les proteine? PK?

A

trans est plus étiré moins d’encombrement stérique,

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4
Q

CIs ou trans que les C alpha peptidique occupent les côté opposé au groupe peptidique ?

A

Trans

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5
Q

Quel acide aminé est une exception consernant l’énergie cis ou trans ?

A

Proline, autant d’énergie en trans ou cis

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6
Q

comment se nomme l’angle entre le carbone alpha et son amine

A

phi

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7
Q

comment se nomme l’angle entre le carbone alpha et son carbonyle

A

psy

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8
Q

quel acide aminé les angles psy et phi sont fixes ?

A

proline

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9
Q

definition de structure secondaire

A

repliment local de plusieurs acide aminés pour former des motif

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10
Q

les formes des structures secondaire sont maintenue par des liens covalent (V OU F)

A

F

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11
Q

quels sont les deux motifs les plus courant au niveau secondaire?

A

Feuillet plissé beta
helice alpha

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12
Q

Dans l’helice alpha, quest ce qui permet la formation de l’hélice?

A

Des ponts H entre le H de groupe amine (n) et le O du carboxyle en position (n-4)

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13
Q

36 acides aminés donnent environ combien d’hélice alpha?

A

10

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14
Q

les helices sont plus left-handed ou right-handed ? Pk?

A

right-handed, moins d’encombrement stérique

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15
Q

Les angles des angles phi et psy des helices alphas rights-handed?

A

-60 degre et -50 degré

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16
Q

quels acides aminées sont favorables et défavorables au helice alpha ?

A

favorable = méthionine, alanine, leucine, lysine, acide glutamique
défavorable = glycine et proline

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17
Q

pour quels raisons la glycine est proline sont défavorables aux helices alpha ?

A

Gly = faible contrainte en raison de l’absance de chaine latérale, très flexible
Pro = forte contraite forme une distorsion de l’hélice et pas de H sur le lien peptidique donc pas de pont H possible.

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18
Q

V ou F on retrouve parfois la glycine et proline au extremité de l’hélice?

A

V

19
Q

feuillet plissé beta ou les helices alpha qui sont formés de plusieurs chaines polypeptidiques ?

A

feuillet plissé beta

20
Q

les feuillets plissé parrallèles sont plus sable que les antiparrallèle (V OU F)

A

F

21
Q

les chaines latérales sont projetés du même plan que le plan du feuillet (V OU F)

A

F

22
Q

en général les feuillets beta sont formés de combien de segments polypeptidiques et ils ont combien d’acide aminés.

A

(2 à 15) et (6 en moyenne)

23
Q

quel sont les A.A composant la fribroine de la soie ? et ses caractéristiques ?

A

Gly-ser-gly-ala-gly-ala, feuillets beta anti-parrallèle, lien covalent (résistant) et pont H (souple)

24
Q

sachant que les formes feuillets beta et helice alpha correspondent 50% de la proteine, c’est quoi qui correspond au 50% autre.

A

solénoide et boucle

25
Q

quel boucle prend moins d’espace les boucles entre les feuillets parallèle ou les feuillet anti parrallèle ?

A

anti-parrallèle

26
Q

definition de struture tertiaire ?

A

repliment du polypeptides en 3 dimensions, assemblage de plusieurs motif

27
Q

les repliments en structure tertiaire depend de quoi ?

A

pont H, liaison électrostatique, effet hydrophobe et liaison covenlatente (pont disulfure)

28
Q

Le tonneau alpha/beta est composé de quoi ?

A

8 feuillet beta et 8 helice alpha

29
Q

comment se nomme les proteines de liaison de l’ADN et ARN ?

A

motif a doigt de zinc

30
Q

quel est la principale force de repliment de la protéine ?

A

l’effet hydrophobe

31
Q

les liaisons covalentes dans la structure tertiaire se fait grace à quel acide aminé?

A

cysteine

32
Q

les liaisons covalents se font uniquement entre différent polypeptides. (V ouF)

A

F aussi à l’intérieur même d’un polypeptide

33
Q

c’est une réduction qui permet les liaison covalente (V ou F)

A

F oxydation, c’est réversible

34
Q

les pont disulfure sont catalysé par quel enzyme ? et ouo se trouve cette enzyme?

A

disulfure isomérase, réticulum endoplasmique

35
Q

quels conditions pour dénaturer une proteine ? est-elle encore fonctionel? et est-ce réversible ?

A

1- PH, concentration saline, température inadéquat 2- non 3- oui

36
Q

Définition des chaperonnes ?

A

ce sont des molécules ayant besoin d’atp qui s’assur au bon repliment de la proteine. ils existent plusieurs type. (elles replient la proteine)

37
Q

quel est le nom de l’enzyme qui assure la dégradation des proteine mal replié?

A

protéasome

38
Q

comment les protéasome font pour detecter les proteine à détruire ?

A

enzyme ubiquitine ligase E3 -> lie une ubiquitine avec la chaine latéral des lysine -> protéasome peut reconnaitre

39
Q

structure quaternaire (protomère), définition

A

assemblage de plusieurs polypeptides identique (monomère) ou différent (hétéromère)

40
Q

la kréatine kinase est impliqué dans quoi ?

A

la génération des molécule énergitique

41
Q

nommes les 3 types de kréatines kinases et leur emplacement.

A

MM = squelettique
MB = cardiaque
BB= digestif et cérébrale

42
Q

les maladies causé par des dépots amyloide ont un point en commun, c’est quoi?

A

forme des feuillets B indestructible pour les protéase , tres résistent.

43
Q

exemple de maladie de structure de la proteine

A

anémie falciforme en position 6 la valine remplace la glutamine ce qui modifie la structure de la proteine

44
Q

exemple de complémentarité moléculaire

A

antigène/ anticorps

45
Q

les molécules complémentaire sont principalement lié par des liens covalents ( V OUF )

A

F, non covalent

46
Q
A