cours 2 Flashcards
Quelle est la molécule dans le gelée royale à un effet épigénétique et qu’elle est l’Action de cette molécule?
10-HDA est un inhibiteur de déacétylation d’histone = dé-inhibe des gènes de croissance (lève la répression)
Quels sont les mécanismes épigénétiques de répression de l’expression génique par la méthylation de l’ADN?
1) Encombrement stérique par le groupement méthyl sur l’ADN qui empêche la liaison de protéines régulatrices
2) Répresseurs qui reconnaissent un patron d’ADN méthylé spécifique (protéine nommé MBP : methyl binding proteine et MBD : methyl binding domain).
3) MBP qui recrutent d’autres effecteurs de modification de la chromatine (ex. : histones déacétylases, méthylation de H3K9)
Est-il possible d’une structure ne réagisse par à un groupement méthyle?
oui, certains facteurs sont sensibles à la méthylation mais certains facteurs sont insensibles et vont agir avec ou sans groupement méthyl
Quel est le désavantage de tester les facteurs qui se lient ou non à l’ADN méthylé in vitro?
Ben c’est pas in vivo, so we don’t really know
Est-ce que MeCP2 a toujours le même effet et comment il fonctionne?
Une MBP très étudier, c’est une HDAC qui peut interagir avec …., dépendamment du gène qui est ciblé les régulation sont très différentes.
Quels sont les mécanismes épigénétiques de régulation de l’expression génique par les modifications post-traductionnelles des histones?
1) Acétylation et déacétylation des queues N-terminales des histones.
2) Méthylation des queues N-terminale des histones
Décrire l’acétylation et la déacétylation des queues N-terminale des histones?
Un signal qui dit de reconnaitre un code d’histones. Plus est acétyle = plus est instable = retire l’histone = expression. Acétylation charge négativement les queue d’histone.
* HAT et HDAC : Les deux agissent en tant que complexe, donc d’autres protéines sont nécessaires
Quelles sont les deux enzymes liées à l’acétylation / déacétylation et quels sont leur rôle?
*HAT : histone acétyle transférase = favorise expression génique
*HDAC : histone déacétylase = favorise répression génique, utilisé en thérapies contre les cancers
Que font les readers, writers et erasers?
*Writers : établi la marque épigénétique; acétylase, méthylase, kinase
*Erasers : enlève la marque épigénétique; déacétylase, méméthylase, phosphorylase
*Reader : li la marque, reconnaissance de la modification par géométrie
Que reconnait les bromodomains?
reconnait acétylation
Que reconnait les chromodomains?
reconnait méthylation
Quelles sont les deux choses / facteurs, qui influencent la réaction entre deux molécules biochimiques?
- affinité + charge (conformation créant l’interaction)
- concentration des molécules
est-ce que les marques épigénétiques positives coexistent avec les marques épigénétiques négatives?
Nan.
Comment peut-on déterminer quelle partie du gène est modifié par des modifications épigénétiques?
Distribution des modifications post-traductionnelle des histones au niveau génique (les graphiques), correspond à la distribution des probabilités d’avoir une modification à un endroit. Réalisé à partir d’expérience Chip-seq (fige tout dans une condition précise – fragmente la chromatine – ensuite utilise anticorps ciblant la protéine d’intérêt – immunoprécipité – séquence à haut débit. Peut cibler anticorps contre une méthylation (peut cibler une lysine précise, peut différencier entre type de méthylation)
À quel moment il y a la plus grande expression d’histone?
lors de la réplication du génome
