Cours 2 Flashcards

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1
Q

Le nouveau brin est synthétisé de quoi à quoi?

Comment se fait la lecture du vieux brin?

Quelle sont les différences entre le génome procaryote et eucaryote?

A

5’ à 3’

3’ à 5’

Largeur: eucaryote>procaryote

ADN linéaire: eucaryote

ADN circulaire: procaryote

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Q

Qu’est-ce qui nécessite une fourche de réplication?

Qu’est-ce que l’ORI?

Combien d’ORI dans une cellule procaryote et eucaryote?

Dans une cellule procaryote, ou se lie l’initiateur?

A

séparation des deux brins en ADNsb

l’origine de réplication; site ou commence la réplication cellulaire

1/ plusieurs

à l’ORI

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3
Q

Qu’est-ce que le réplicateur?

Que forme le réplicateur?

A

Tout les séquence nécessaire permettant le début de la réplication

l’ORI, les sites 9 et 13 mères

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4
Q

Qu’est-ce qu’un site 9-mères?

Qu’est-ce qu’un site 13-mères?

Les sites 13-mères sont riches en quels séquences d’ADN?

Vrai ou faux, il existe plusieurs protéines qui peuvent se faire recruter par les séquences de l’ADN

A

Site capable d’appeler la protéine initiatrice

La protéine initiatrice va appeler les autres protéines qui viendront se lier aux sites 13-mères

A:T

Faux, juste une

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5
Q

Quels sont les trois fonctions des protéines initiatrices chez les procaryotes?

et chez les eucaryotes?

A

Se lier à l’ORI, appeler les autres protéines nécessaires pour la réplication et ouvrir l’ADN

Se lier à l’ORI et appeler les autres protéines nécessaires pour la réplication

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6
Q

Comment ouvre-t-on l’ADNb chez les eucaryotes pour permettre la réplication?

Qu’est-ce qui permet de faire cette modification post-traductionnelle?

Comment faisons-nous pour ne pas commencer une deuxième réplication lorsque nous avons répliquer l’ORI?

A

On phosphoryle le complexe ORC afin qu’il puissent commencer leur travaille

kinases dépendantes des cyclines

Kdc viendra dégrader les enzymes afin qu’il ne puissent pas faire cette fonction

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7
Q

Quels sont les motifs structures des cellules eucaryotes pour reconnaitre ORI (3)?

Vrai ou faux, nous avons besoin de séquence spécifique pour commencer la réplication?

Vrai ou faux, les ORI sont déclenché en même temps

A

Séquence riche en A:T ou CG, Structure d’ADN particulière, région libre en nucléosome

Faux

Faux

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8
Q

Quelle est la forme de l’hélicase?

Vrai ou faux, l’hélicase se lie à de l’ADN double brin?

A-t-elle besoin d’ATP pour fonctionner?

Quel est son rôle?

A-t-elle une haute processivité?

A

anneau

faux, simple brin

Oui

sépare les brins en monocaténaire

Oui

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9
Q

À quoi servent les protéines fixatrices?

À cause de l’hélicase, que va-t-il se passer sur l’ADN?

A

Permettent de garder les brins monocaténaires dissocier et de ne pas laisser le brin monocaténaire de s’associer sur lui-même (boucle ou épingle)

de l’enroulement

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10
Q

Comment l’ADN fait-il pour diminuer cette source de tension?

Où se forme les œils de réplication et elle est causé par qui?

A

Grâce à la topoisomérase I et II.

Aux origines de réplications

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11
Q

L’ADN Pol a besoin de quoi pour commencer?

Qui va pouvoir faire cela et comment?

A

d’une amorce avec un 3’-OH libre

La Primase va faire une courte séquence d’ARN avec l’ARN Pol

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12
Q

L’ARN poser va être reconnu par qui?

Quel est sa fonction?

A

Le poseur d’anneau coulissant

rechercher un anneau coulissant, l’ouvrir et insérer l’ADNdb à l’intérieur

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13
Q

Pourquoi l’anneau coulissant va-t-il s’en aller après que l’ADN Pol viendra s’y attacher?

Vrai ou faux, un anneau coulissant est composé de plusieurs sous-unités différentes?

Quel est son rôle?

A

L’affinité de Pol est plus gande

Faux, identiques

Augmenter la processivité de Pol

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14
Q

Quels sont les fonctions de la Pol 1 et 3 chez les procaryotes?

Quels sont les fonctions de la Pol alpha, delta et epsilonne?

Combien d’amorce avons-nous chez les eucaryotes?

A

Pol 1: remplace les amorces d’ARN

Pol 3: réplique le chromosome

delta: s’occuper de répliquer le brin discontinue
e: s’occuper de répliquer le brin continue
alpha: fait des petites synthèses d’ADN après l’amorce d’ARN

2

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15
Q

Qu’est-ce que la sélectivité cinétique?

Dans notre cellule, avons nous plus de ribonucléotide ou désoxyribonucléotide?

Qu’est-ce que l’exclusion stérique?

A

Notre ADN Pol prend des nucléotides au hasard dans notre environnement et les assembles s’il y a une complémentaritée.

ribonucléotide

le groupement OH du ribo ne pourra pas s’intégrer dans la zone catalytique

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16
Q

Qui amène l’énergie pour la Pol?

Qu’elle est l’enzyme qui permet la pyrophosphate?

L’énergie net de la réaction est de combien?

Vrai ou faux, la réaction est hautement favorable et irréversible

A

Les nucléotides venant en groupement 3 phosphate seront hydrolyser pour garder seulement un phosphate. Les 2 autres serviront à la Pol de faire son taff

la pyrophosphatase

0 parce que toute l’énergie est utilisé pour le fonctionnement de la Pol

Vrai

17
Q

Quels sont les 3 domaines de la Pol?

Quels sont leurs fonctions?

Quel est le rôle des ions métalliques?

A

paumes, doigt et pouce

Paume: fait le site catalytique et regarde s’il n’a pas fait d’erreur

Doigt: permettent de plier l’ADN matrice afin d’exposer un seul nucléotide à la fois

Pouce: important pour la processivité

permettent la stabilisation des bases complémentaires

18
Q

Quels est le complexe qui maitient toutes les protéines de la réplication cellulaire?

A

réplisome

19
Q

Vrai ou faux, le réplisome va dans le sens contraire de la fourche de réplication dans le brin discontinu

Les ADN pol doivent toujours suivre le meme sens que le réplisome

Vrai ou faux, en règle général, nous avons 3 ADN Pol qui travaille en même temps avec le réplisome

Qu’est-ce que l’ADN Pol 3 holoenzyme?

A

Faux, il va toujours dans le même sens de la fourche de réplication

Faux, l’ADN pol du brin discontinu va dans le sens contraire du réplisome

Faux, nous en avons 2 en majoritée, mais nous pouvons en avoir 3

laisons physiques d’une enzyme (A) avec d’autre enzyme (B,C,..) qui ont pour rôle d’assurer sa fonction (A)

20
Q

Chez e.col, que forme l’ADN Pol 3 holoenzyme?

l’holoenzyme et le autres protéines essentielles à la réplication forme quel structure?

Vrai ou faux, le poseur d’anneau reste dans la réplication chez les eucaryotes?

Que se passe-t-il de Pol lorsqu’il finit un fragment d’okazaki?

A

3 Adn pol + leurs anneaux coullisant avec leur poseurs d’anneau aussi

le réplisome

Faux, seulement ches les procaryotes

il se détache du brin matrice et commence la synthèse d’un nouveau brin rapidement grâce au réplisome

21
Q

Que forme le réplisome?

A

holoenzyme+ hélicase+primase

22
Q

La liaison entre la primase et l’hélicase est-elle forte ou faible?

Qu’elle est la conséquence?

A

faible

Plus le lien est faible, moins la primase voudra se rattacher avec l’hélicase, donc causera des fragments plus long

23
Q

Qu’elle est la différence entre le replisome d’un procaryote et celui d’un eucaryote?

A

Le poseur d’anneau est remplacé par une autre protéine parce que celui-ci est retirer du réplisome

24
Q

Comment change-t-on les amorces d’ARN causé par les primases?

A

1- La RNase H vient dégrader toutes les nucléotides sauf le dernier

2- l’exonucléase 5’ viendra dégrader le dernier nucléotide

3- L’ADN pol vien synthétiser la séquence d’ADN

4- la ligase viendra lier les deux brins d’ADN ensemble

25
Q

Vrai ou faux, la Pol 1 des procaryotes peut faire le rôle de l’exonucléase 5’

À quoi servent l’activité 3’ des ADN Pol?

A

Vrai

permet de corriger en cas d’erreur

26
Q

Que se passe-t-il si nous avons fait une erreur dans notre ADN pol?

Que se passe-t-il avec les nucléosomes lors de la réplication cellulaire?

Vrai ou faux, les histones ont une préférence pour un des deux brins

A

la vitesse de catalysation ralenti et elle vient cliver le lien avec l’erreur

Ils se détachent de l’ADNdb et reste près du site catalytique pour se réassembler lorsque tout est fini

Faux, distribution aléatoire

27
Q

Que se passe-t-il avec les brins qui ne reçoivent pas les nucléosomes?

Quel intermédiaire va vouloir s’associer avec le réplisome?

Quelle protéine du réplisome permet de faire cette association?

Quel intermédiaire va s’associer avec l’ADN en premier?

A

Ils devront en créer des nouveau

le tétramère

l’anneau coulissant

le tétramère

28
Q

Qu’elle est la conséquence de l’amorce d’ARN de l’extrémité de l’ADN eucaryote?

Si rien est fait, cela va causé quoi?

Quelle est la solution?

A

Il causera une partie monocaténaire à cause du manque du coté 3’

raccourcissement progressif du chromosome

les télomérases

29
Q

Quel est le rôle de la télomérase?

Comment fait-elle son rôle?

Quelle est le but?

Vrai ou faux, celle-ci va créer une structure codante

Vrai ou faux, plus le télomères est court, plus la télomérase devra faire son taff

A

Elle viendra allonger l’ADN non raccourcit

grâce à sa propre matrice d’ARN qui viendra synthétiser une amorce d’ADN répétitives

d’ajouter un fragment d’okazaki sur le nouveau brin

Faux, non codante

vrai

30
Q

Qu’est-ce que le complexe shetrein?

Comment pouvons-nous savoir si nous sommes sur le brin matrice ou le nouveau brin?

Comment se passe la séparation des chromosomes circulaires procaryotes?

A

Complexe protéique permettant de faire une loupe sur notre brin monocaténaire contenant notre télomère afin de ne pas subir la dégradation des exonucléases

Le complexe shetrein se pose toujours sur le brin matrice

grâce a la topoisomérase II.

31
Q

Comment se fait la séparation cellulaire chez le procaryote?

A

la topoisomérase II vien couper le lien ADNdb entre les deux chromosomes circulaire pour les séparer l’un de l,autre