Cours 2 Flashcards
Le nouveau brin est synthétisé de quoi à quoi?
Comment se fait la lecture du vieux brin?
Quelle sont les différences entre le génome procaryote et eucaryote?
5’ à 3’
3’ à 5’
Largeur: eucaryote>procaryote
ADN linéaire: eucaryote
ADN circulaire: procaryote
Qu’est-ce qui nécessite une fourche de réplication?
Qu’est-ce que l’ORI?
Combien d’ORI dans une cellule procaryote et eucaryote?
Dans une cellule procaryote, ou se lie l’initiateur?
séparation des deux brins en ADNsb
l’origine de réplication; site ou commence la réplication cellulaire
1/ plusieurs
à l’ORI
Qu’est-ce que le réplicateur?
Que forme le réplicateur?
Tout les séquence nécessaire permettant le début de la réplication
l’ORI, les sites 9 et 13 mères
Qu’est-ce qu’un site 9-mères?
Qu’est-ce qu’un site 13-mères?
Les sites 13-mères sont riches en quels séquences d’ADN?
Vrai ou faux, il existe plusieurs protéines qui peuvent se faire recruter par les séquences de l’ADN
Site capable d’appeler la protéine initiatrice
La protéine initiatrice va appeler les autres protéines qui viendront se lier aux sites 13-mères
A:T
Faux, juste une
Quels sont les trois fonctions des protéines initiatrices chez les procaryotes?
et chez les eucaryotes?
Se lier à l’ORI, appeler les autres protéines nécessaires pour la réplication et ouvrir l’ADN
Se lier à l’ORI et appeler les autres protéines nécessaires pour la réplication
Comment ouvre-t-on l’ADNb chez les eucaryotes pour permettre la réplication?
Qu’est-ce qui permet de faire cette modification post-traductionnelle?
Comment faisons-nous pour ne pas commencer une deuxième réplication lorsque nous avons répliquer l’ORI?
On phosphoryle le complexe ORC afin qu’il puissent commencer leur travaille
kinases dépendantes des cyclines
Kdc viendra dégrader les enzymes afin qu’il ne puissent pas faire cette fonction
Quels sont les motifs structures des cellules eucaryotes pour reconnaitre ORI (3)?
Vrai ou faux, nous avons besoin de séquence spécifique pour commencer la réplication?
Vrai ou faux, les ORI sont déclenché en même temps
Séquence riche en A:T ou CG, Structure d’ADN particulière, région libre en nucléosome
Faux
Faux
Quelle est la forme de l’hélicase?
Vrai ou faux, l’hélicase se lie à de l’ADN double brin?
A-t-elle besoin d’ATP pour fonctionner?
Quel est son rôle?
A-t-elle une haute processivité?
anneau
faux, simple brin
Oui
sépare les brins en monocaténaire
Oui
À quoi servent les protéines fixatrices?
À cause de l’hélicase, que va-t-il se passer sur l’ADN?
Permettent de garder les brins monocaténaires dissocier et de ne pas laisser le brin monocaténaire de s’associer sur lui-même (boucle ou épingle)
de l’enroulement
Comment l’ADN fait-il pour diminuer cette source de tension?
Où se forme les œils de réplication et elle est causé par qui?
Grâce à la topoisomérase I et II.
Aux origines de réplications
L’ADN Pol a besoin de quoi pour commencer?
Qui va pouvoir faire cela et comment?
d’une amorce avec un 3’-OH libre
La Primase va faire une courte séquence d’ARN avec l’ARN Pol
L’ARN poser va être reconnu par qui?
Quel est sa fonction?
Le poseur d’anneau coulissant
rechercher un anneau coulissant, l’ouvrir et insérer l’ADNdb à l’intérieur
Pourquoi l’anneau coulissant va-t-il s’en aller après que l’ADN Pol viendra s’y attacher?
Vrai ou faux, un anneau coulissant est composé de plusieurs sous-unités différentes?
Quel est son rôle?
L’affinité de Pol est plus gande
Faux, identiques
Augmenter la processivité de Pol
Quels sont les fonctions de la Pol 1 et 3 chez les procaryotes?
Quels sont les fonctions de la Pol alpha, delta et epsilonne?
Combien d’amorce avons-nous chez les eucaryotes?
Pol 1: remplace les amorces d’ARN
Pol 3: réplique le chromosome
delta: s’occuper de répliquer le brin discontinue
e: s’occuper de répliquer le brin continue
alpha: fait des petites synthèses d’ADN après l’amorce d’ARN
2
Qu’est-ce que la sélectivité cinétique?
Dans notre cellule, avons nous plus de ribonucléotide ou désoxyribonucléotide?
Qu’est-ce que l’exclusion stérique?
Notre ADN Pol prend des nucléotides au hasard dans notre environnement et les assembles s’il y a une complémentaritée.
ribonucléotide
le groupement OH du ribo ne pourra pas s’intégrer dans la zone catalytique
Qui amène l’énergie pour la Pol?
Qu’elle est l’enzyme qui permet la pyrophosphate?
L’énergie net de la réaction est de combien?
Vrai ou faux, la réaction est hautement favorable et irréversible
Les nucléotides venant en groupement 3 phosphate seront hydrolyser pour garder seulement un phosphate. Les 2 autres serviront à la Pol de faire son taff
la pyrophosphatase
0 parce que toute l’énergie est utilisé pour le fonctionnement de la Pol
Vrai
Quels sont les 3 domaines de la Pol?
Quels sont leurs fonctions?
Quel est le rôle des ions métalliques?
paumes, doigt et pouce
Paume: fait le site catalytique et regarde s’il n’a pas fait d’erreur
Doigt: permettent de plier l’ADN matrice afin d’exposer un seul nucléotide à la fois
Pouce: important pour la processivité
permettent la stabilisation des bases complémentaires
Quels est le complexe qui maitient toutes les protéines de la réplication cellulaire?
réplisome
Vrai ou faux, le réplisome va dans le sens contraire de la fourche de réplication dans le brin discontinu
Les ADN pol doivent toujours suivre le meme sens que le réplisome
Vrai ou faux, en règle général, nous avons 3 ADN Pol qui travaille en même temps avec le réplisome
Qu’est-ce que l’ADN Pol 3 holoenzyme?
Faux, il va toujours dans le même sens de la fourche de réplication
Faux, l’ADN pol du brin discontinu va dans le sens contraire du réplisome
Faux, nous en avons 2 en majoritée, mais nous pouvons en avoir 3
laisons physiques d’une enzyme (A) avec d’autre enzyme (B,C,..) qui ont pour rôle d’assurer sa fonction (A)
Chez e.col, que forme l’ADN Pol 3 holoenzyme?
l’holoenzyme et le autres protéines essentielles à la réplication forme quel structure?
Vrai ou faux, le poseur d’anneau reste dans la réplication chez les eucaryotes?
Que se passe-t-il de Pol lorsqu’il finit un fragment d’okazaki?
3 Adn pol + leurs anneaux coullisant avec leur poseurs d’anneau aussi
le réplisome
Faux, seulement ches les procaryotes
il se détache du brin matrice et commence la synthèse d’un nouveau brin rapidement grâce au réplisome
Que forme le réplisome?
holoenzyme+ hélicase+primase
La liaison entre la primase et l’hélicase est-elle forte ou faible?
Qu’elle est la conséquence?
faible
Plus le lien est faible, moins la primase voudra se rattacher avec l’hélicase, donc causera des fragments plus long
Qu’elle est la différence entre le replisome d’un procaryote et celui d’un eucaryote?
Le poseur d’anneau est remplacé par une autre protéine parce que celui-ci est retirer du réplisome
Comment change-t-on les amorces d’ARN causé par les primases?
1- La RNase H vient dégrader toutes les nucléotides sauf le dernier
2- l’exonucléase 5’ viendra dégrader le dernier nucléotide
3- L’ADN pol vien synthétiser la séquence d’ADN
4- la ligase viendra lier les deux brins d’ADN ensemble
Vrai ou faux, la Pol 1 des procaryotes peut faire le rôle de l’exonucléase 5’
À quoi servent l’activité 3’ des ADN Pol?
Vrai
permet de corriger en cas d’erreur
Que se passe-t-il si nous avons fait une erreur dans notre ADN pol?
Que se passe-t-il avec les nucléosomes lors de la réplication cellulaire?
Vrai ou faux, les histones ont une préférence pour un des deux brins
la vitesse de catalysation ralenti et elle vient cliver le lien avec l’erreur
Ils se détachent de l’ADNdb et reste près du site catalytique pour se réassembler lorsque tout est fini
Faux, distribution aléatoire
Que se passe-t-il avec les brins qui ne reçoivent pas les nucléosomes?
Quel intermédiaire va vouloir s’associer avec le réplisome?
Quelle protéine du réplisome permet de faire cette association?
Quel intermédiaire va s’associer avec l’ADN en premier?
Ils devront en créer des nouveau
le tétramère
l’anneau coulissant
le tétramère
Qu’elle est la conséquence de l’amorce d’ARN de l’extrémité de l’ADN eucaryote?
Si rien est fait, cela va causé quoi?
Quelle est la solution?
Il causera une partie monocaténaire à cause du manque du coté 3’
raccourcissement progressif du chromosome
les télomérases
Quel est le rôle de la télomérase?
Comment fait-elle son rôle?
Quelle est le but?
Vrai ou faux, celle-ci va créer une structure codante
Vrai ou faux, plus le télomères est court, plus la télomérase devra faire son taff
Elle viendra allonger l’ADN non raccourcit
grâce à sa propre matrice d’ARN qui viendra synthétiser une amorce d’ADN répétitives
d’ajouter un fragment d’okazaki sur le nouveau brin
Faux, non codante
vrai
Qu’est-ce que le complexe shetrein?
Comment pouvons-nous savoir si nous sommes sur le brin matrice ou le nouveau brin?
Comment se passe la séparation des chromosomes circulaires procaryotes?
Complexe protéique permettant de faire une loupe sur notre brin monocaténaire contenant notre télomère afin de ne pas subir la dégradation des exonucléases
Le complexe shetrein se pose toujours sur le brin matrice
grâce a la topoisomérase II.
Comment se fait la séparation cellulaire chez le procaryote?
la topoisomérase II vien couper le lien ADNdb entre les deux chromosomes circulaire pour les séparer l’un de l,autre
