Cours 1 Flashcards
Qu’elle force permet la stabilité de l’ADN?
Quelle est la structure protéique de l’ADN?
Qu’est-ce que forme un nucléotide?
Qu’est-ce que forme un nucléoside?
Ou se fait la liaison phosphodiester?
les liaison hydrogène assure que structure protéique de l’ADN?
Qu’est-ce qui résulte la stéréochimie de base et cela implique quoi?
Force d’empilement et les liaisons hydrogènes
tertiaire
Groupement phosphate-Monosaccharide-Base azotée
Groupement phosphate-Monosaccharide
entre le carbone 5 et 3
secondaire
l’aspect antiparallèle implique la complémentaritée
Sur le sucre de l’ADN, quel carbone est lié à la base azotée?
Sur le sucre de l’ADN, quel carbone est lié au phosphate?
Quel carbonne permet de definir sur le sucre est une ribose ou une desoxyribose?
Quel carbonne va permettre de faire la deuxieme liaison ester avec le phosphate?
1
5
2
3
Quel est la classe des purines?
Quelle est la classe des pyrimidines?
Quels sont les règles de Chargaff?
Quelle est la règle de (C+G)%?
A,G
T,C
1- peu importe l’organisme, le nbr de A avec T et C avec G sont égaux
2- le rapport entre purine et pyrimidine est de 1
Dépendament de l’espèce, ce pourcentage est constant
Pourquoi l’ADN a un aspect acide?
Nomme moi des fonctions des nucléotides autre que pour l’ADN?
Vrai ou faux, l’ADN se forme seulement lorsqu’il y a une complémentarité entre les bases
Étant donné la séquence suivante, 5’ACCGGTTCG3’. Quelle serrait la séquence complémentaire?
Dû à la charge négatif du phosphate
AMPc, ATP et coenzyme A
Faux, il faut aussi que les chaines soit anti-parralèle
Tu retranscrit sa et tu inverse pr mettre 5’ 3’
Comment fait-on pour avoir accès aux bases de l’ADN?
En dénaturant l’ADN ou grâce au sillon
Comment forme-t-on les sillons majeurs et mineurs?
Quels sont leurs angles?
Quel sillon donne plus d’information?
Quelle différence pouvons-nous voir dans le sillon mineur?
Quelle différence pouvons-nous voir dans le sillon majeur?
Pourquoi est-il important de connaitre ces informations?
Grâce au lien glycosidique des bases complémentaire
240 et 120
Majeur
entre un couple A:T et C:G
entre les couples A:T, T:A, G:C et C:G
Afin que la protéine puisse s’insérer dans l’ADN sans la dénaturer
Quels sont les trois conformations possibles d’ADN?
Laquelle est left handed?
Laquelle retrouvons-nous en plus grande abondance dans notre système?
forme A, B et Z
Z
B
Entre une série de CG et de AT, laquelle demande le plus d’énergie pour la dénaturation?
Qu’est-ce qu’une sonde d’ADN?
Qu’est-ce qu’une sonde spécifique?
Pourquoi la spécifier de l’hybride est régi par la température d’hybridation?
CG
ADN complémentaire au gène recherché que nous pouvons suivre avec la fluorescence
Sonde étant à 100% complémentaire avec notre gène recherché
Lorsque nous dénaturons complètement l’ADN, si nous devons baisser beaucoup notre température pour que la sonde puisse faire c’est lien, elle est non-spécifique.
Qu’est-ce que l’immunocytochimie?
Technique de visualisation direct des séquences de génome condenser
Comment fait-on la technique de visualisation Southern?
1- Des enzymes de restrictions viendront détruire l’ADN en fragment
2- Les fragment d’ADN sont séparer sur le gel selon leur taille
3- les fragments d’ADN vont migrer vers la cathode et les petits fragments vont migrer le plus vite et loin
4- L’ADN est ensuite transposé sur une membrane ou nous utilisons une sonde radioactif
5- Cette sonde viendra se lier a son gene complémentaire et grâce à sa radioactiviter, nous pourrons la voir au rayon X
Quelle sont les différences entre la technique Nothern et Southern
Vrai ou faux, nous utilisons une sonde ARN pour le nothern
Nothern: Utilisation d’ARN, pas d’enzyme de restriction
faux, une sonde d’ADN
Partie en haut=enzyme restriction, partie en bas = sonde
Sommes-nous dans le southern ou le nothern?
De quelle nature protéique sommes-nous?
Comment peut-on voir se qui nous intéresse?
Que veux-nous dire lorsque nous avons deux barres?
Southern
ADN
Si nous avons la sonde, nous avons notre gène recherché
l’enzyme de restriction à couper notre gène rechercher en deux
Sommes-nous dans le southern ou le nothern?
De quelle nature protéique sommes-nous?
Comment peut-on voir ce qui nous intéresse?
Nothern
ARN
L’intensité nous dit ou se situe notre gène dans les différents tissus
Ou se situe notre génome et celui des bactéries?
Un grand génome peut nous apporter quelle information?
Qu’est-ce que l’ADN intergénique?
Vrai ou faux, dans un organisme simple, nous avons beaucoup de partie codant que non codant
dans un noyau/ nucléoide
Beaucoup de gène et qu’on est dans un système complexe
ADN non-codant
Vrai
Le génome de l’ADN bactérien est répartie sur combien de chromosomes?
Le génome de l’ADN des eucaryotes est répartie sur combien de chromosomes?
Où retrouve-t-on les plasmides?
Quels sont leurs particularités?
1
plusieurs
chez les procaryotes
Ils ont leur propre ADN et peuvent être transmis d’une bactérie à une auter
Vrai ou Faux, les bactéries ont des protéines permettant le compactage de l’ADN
À quoi sert les plasmides pour les bactéries?
Vrai ou faux, les bactéries peuvent s’échanger leur ADN génomique
Vrai
Avoir des caractères afin de s’adapter à son environnement
Faux
Sous quelle forme de ploïdie les cellules eucaryotes sont en majorité?
Quels sont les autres niveaux de ploïdie possible?
Qu’est-ce que la ploidie?
Quelle est la particularitée des chromosomes triploide?
Diploide
Haploide et polyploide
Nbr de copie du même chromosome dans un organisme
Ne peuvent pas se diviser
Quelles sont les deux organites eucaryotes qui ont leur propre génome?
Vrai ou faux, elles peuvent survire sans le génome de la cellule
Quels sont leurs particularités (4) ?
Qu’elle transcription fait un opéron et expliquer son fonctionnement?
Quel type de transcription se fait pour les eucaryotes et expliquer son fonctionnement ?
Mitochondrie et chloroplaste
Faux
Existent bcp de copies dans une seul cellule, se réplique de façon indépendante, transmission aléatoire à sa prochain génération et génome circulaire
transcription polycistronique, 3 gène codent 1 arn pouvant faire les 3 protéines
transcription monocistronique; 1 gène = 1 ARN= une protéine
Qu’est-ce que la densité génique?
Entre les procaryotes et les eucaryotes, lequel à la plus grande densité génique?
Pourquoi?
Le nombre de gènes par mégabase d’ADN
Procaryote
les eucaryotes ont beaucoup plus de partie non codante
Qu’est-ce que l’épissage dans les ARN matures?
Quel type d’ARN sort de la cellule eucaryote?
Élimination des introns de l’ARN prémessager pour faire l’ARN messager
ARN messager
Nomme-moi les séquences uniques de l’ADN intergénique et leur fonction
Nomme-moi les séquences répéter dans l’ADN intergénique?
Les séquences régulatrices: augmente ou diminue l’expression d’un gène
ARN régulateur: assure le bon fonctionnement
Les origines de réplications: initiation de la réplication
Pseudogène: Gène devenu inactif
Transposons
Comment se fait le compactage de l’ADN chez les procaryotes?
Vrai ou faux, le compactage chez les procaryotes est dynamique
Chez les eucaryotes que dépend l’état de l’ADN?
Vrai ou faux, les protéines représente le 1/3 de la masse du chromosome
Surenroulement de l’ADN avec des protéines
Vrai
du cycle cellulaire: (interphase: chromatine et mitose: chromosome)
Faux, moitiée
Quelle sont la majorité des protéines des chromatines?
Quelle sont les deux formes de chromatine?
Laquelle est la plus condensée?
Histone
Hétérochromatine et euchromatine
Hétérochromatine
Quelle est la première forme de compaction de l’ADN
Le noyau du nucléosome est composé de combien d’histone?
Comment nomme-t-on l’ADN entre deux nucléosomes?
Formation de nucléosome
8
adn intercalaire
Quels sont les histones qui forment le nucléosome?
Quelle histone est hors du nucléosome?
vrai ou faux, les queues des histones se trouvent à l’extérieur
2 dimères H2A et H2B avec un tétramère H3/ H4
H1
Vrai
Comment est l’affinité des histones avec l’ADN?
Quelle région d’ADN rend la liaison avec les histones plus facilement?
Les histones préfèrent quels sillons?
Comment appelle-t-on les histones des nucléosomes lorsqu’ils ne sont pas lier entre eux?
Entre le tétramère et les dimères, lequelle viendra se lier à l’ADN en premier?
Combien de point de contact entre l’ADN et le nucléosome?
Combien de lien d’hydrogènes?
grande et non-spécifique
A:T
Les sillons mineurs
des intermédiaires
tétramère
14
40
À quoi servent les queues des histones?
Quels sont les modifications post-traductionnelle?
Ou émerge les queues des histones H3 et H2B?
ou émerge les queues des histones H4 et H2A?
Quelle pourrait être les conséquences des nucléosomes si une protéine se liant à de l’ADN?
Garder l’ADN enroulé et d’interagir entre les nucléosomes
Acétylation, méthylation et phosphorylation
entre les 2 brins d’ADN de deux sillons mineur se faisons face
en haut et en bas de deux hélices
Permettre de garder une région dépourvue de nucléosomes ou bien de favoriser le nucléosome a se positionner à cet endroit précis
Quelle est le rôle de l’histone H1 dans l’euchromatine?
Quels sont les deux modèles des hétérochromatines?
Lequel des deux est le plus compacter?
Quelle forme de compaction vien après l’hétérochromatine?
Par quel agrégat de protéine celle-ci va se stabiliser?
Quels sont les protéines de cet agrégat?
Permettent de garder un plus grand compactage du nucléosome
solénoïde et zig-zag
Zig-zag
boucles
échafaudage nucléaire
la topoisomérase II et SMC
Le dynamisme de la condensation de l’ADN est fait par quel complexe protéique?
Les complexes remodelant de la chromatine et les modifications post-traductionnelle des queues des histones
Comment les facteurs remodelant de la chromatine sont-ils recrutées?
Ils ont beaucoup de quoi pour fonctionner?
Comment font-ils le dynamisme de condensation?
Les queues des histones et les facteurs de transcription
ATP
Glissement ou transfert du nucléosome
Quel complexe remodelant permet le transfert ou l’éjection du nucléosome?
Quel complexe remodelant permet le glissement du nucléosome?
Quel complexe remodelant permet l’échange de nucléosome?
SNF/SW1
tous
INO80
L’ajout d’un méthyle aux queues des histones permet quoi?
L’ajout d’acétyle ou du P permettent quoi?
Comment se fait-elle?
Augmente la compaction et permet la formation de la forme hétérochromatine
diminuer la compaction/ neutralise la charge plus de l’histone
Qu’est-ce qu’une modification épigénétique?
Répond aux deux questions
Changements stables causés par l’activation et la désactivation des gènes, sans altération des séquences de nucléotides.
L’ajout d’acétyle transférase neutralise la charge (+) de l’histone et elle intéragit moins bien avec l’ADN. On a plus accàs à l’ARN Polymérase et transcription.
CBP muté: sans groupement Ac, la chromatine reste condensé et
/ Ne permettent pas la transcription de la protéine en lien avec La mémoire.
Comment savoir si c’est réellement une acétyhlation?
??
Quelle est la différence entre une histone conventionnelle et une histone varier?
Vrai ou faux, les variants d’histones sont spécifiques à certaines espèces, type cellulaire ou phase cellulaires?
Leur fonction parce que quelques a.a change
Vrai
Quel est le rôle de L’histone H2A.Z?
Quelle serrait la conséquence si elle n’existait pas?
Permet les réponses thermosensibles de la plante
Ne peux pas détecter la température
