Cours 1A : Le monde microbien Flashcards
Vrai ou faux, la microbiologie est la science qui étudie les organismes microscopiques.
vrai, au sens large : Science qui se définit par les techniques qu’elle emploie
Vrai ou faux, la taille d’une bactérie (comparativement aux virus) se trouve dans les nanomètres.
faux, c’est l’inverse
Quels sont les 5 domaines d’études de la microbiologie?
bactériologie, mycologie, phycologie (algues), protozoologie, virologie
Quels sont les impacts des moo sur les activités humaines (5)? juste les gros titres
agriculture, énergie/environnement, aliments, maladies, biotechnologie
Vrai ou faux, l’agriculture ne serait pas possible sans bactérie.
vrai
Quel est l’impact des moo sur l’agriculture?
Fixation de l’azote qui est faite grâce à certaines bactéries dans le sol (elles ont la capacité de capter l’azote dans l’air et le transformer jusqu’au stade de nitrate = source d’azote pour la croissance des plantes!)
Sert à la production animale ==> permet aux animaux de consommer la cellulose
Quel est l’impact des moo sur l’énergie et l’environnement?
permet de former des biocarburants (ex : fermentation du maïs en éthanol)
Quel est l’impact de moo sur les aliments?
dégradation des aliments (pour contrer = techniques de conservations)
effets positifs : aliments fermentés = fromage + bière/vin
permet de produire des ADDITIFS ALIMENTAIRES!
Quel est l’impact des moo sur les maladies?
identification de nouvelles maladies
traitement, soin et prévention (ex : vaccin)
Quel est l’impact des moo sur les biotechnologies?
production pharmaceutique (permet de produire de l'insuline et le vaccin contre l'hépatite B par la fermentation de levures) organismes génétiquement modifiés thérapie génique (permet de corriger les immunodéficiences et les cancer = très prometteur)
Quels sont les impacts positifs des moo chez l’Homme?
Microbiote, source de nourriture (fromage), production d’antibiotiques et autres molécules, biotechnologie (production pharmaceutique, thérapie génique, etc.)
Quels sont les impacts positifs des moo dans la nature?
décomposition (recyclage), balance écologique, biodégradation et la bioremédiation (utilisation de microorganismes souterrains pour dégrader les pollutions liées à des substances organiques telles que les hydrocarbures)
Quels sont les impacts négatifs des moo chez l’Homme et dans la nature?
infection, détérioration des aliments, corrosion (ex du titanique et des bactéries qui mangent le métal), mauvaise odeur
Quels sont les types des moo?
algues, protozoaires, mycètes (champignons), bactéries, virus (pas vivant), prion (pas vivant et cause des maladies neurodégénératives)
Vrai ou faux, les mycètes sont seulement unicellulaires.
Faux, elles sont aussi pluricellulaires
Quel est le plus petit dénominateur commun de la matière vivante?
la cellule
EXAM : Quelles sont les propriétés de la cellule? Métabolisme, reproduction, différentiation, communication, mouvement et évolution.
Métabolisme : prélève des nutriments dans l’environnement, les transformes en déchets qui sont éliminés = système ouvert (nutriments entrent et les déchets sortent)
Reproduction : les éléments chimiques de l’environnement se transforment en nouvelle cellules sous la conduite de cellules PRÉEXISTANTES
Différentiation : formation d’une nouvelle structure cellulaire
Communication : communiquent par des échanges de molécules CHIMIQUES
Mouvement : certaines sont mobiles (elles peuvent se déplacer et/ou mouvements internes)
Évolution : elles contiennent des gènes et évoluent ce qui leur permettent d’avoir de nouvelles propriétés biologiques au fil des décennies
Quelle est la différence entre une cellule eucaryote et procaryote?
Eucaryote : avec noyau, (contiennent parois cellulaire sauf chez les animaux), le cytoplasme contient les mitochondries, l’appareil de Golgi, d’un réticulum endoplasmique, membrane cytoplasmique
Procaryote : pas de noyau (le matériel génétique est dans le nucléoïde), plus petite, le matériel génétique est composé d’un seul chromosome circulaire bicaténaire, cytoplasme ne contient que les ribosomes, entourée d’une membrane cytoplasmique ET d’une paroi ET d’une capsule
Quelle est la particularité des cellules eucaryotiques des animaux?
elle ne contient pas de paroi cellulaire comme c’est le cas chez les procaryotes
Vrai ou faux, les cellules eucaryotiques des champignons et des plantes ne contiennent pas de parois cellulaire.
faux, ce sont les cellules eucaryotiques des animaux qui n’en contiennent pas
Quels étaient les problèmes avec le système de classification des organismes vivants de Carl von Linné?
Carl Von Linné était le premier à classifier les organismes vivants en 2 règnes : les plantes (immobiles et photosynthétiques) et les animaux (mobiles et non-photosynthétiques)
Problème : suite à la découverte du monde microscopique les champignons sont classés parmi les plantes parce qu’ils sont immobiles alors qu’ils sont non photosynthétique.
L’euglène (algue verte) possède des flagelles et utilise la photosynthèse : classé comme animal par les zoologistes et plante par les botaniste LOL
Vrai ou faux, au tout début de la classification des organismes vivants les bactéries étaient considérées comme des plantes car elles possèdent une paroi cellulaire rigide.
vrai, système de Carl von Linné
Quel a été le rôle de Haeckel?
il a ajouté un 3e règne à la classification des organismes vivants : protistes (algues, champignons, bactéries et protozoaires)
Quels sont les 5 règnes de Whittaker? Ces 5 règnes sont fondés sur quoi?
Monères (bactéries) Protistes (algues et protozoaires) Mycètes (champignons) Plantes Animaux fondé sur : type de cellule (eucaroyote/procaryote), organisation biologique (unicellulaire, solitaire, en colonie ou pluricellulaire), type de nutrition (autotrophe et hétérotrophe)
Quelle est la différence entre autotrophe et hétérotrophe?
auto : source de carbone provient principalement du CO2 de l’atmosphère
hété : source de carbone provient principalement des molécules organiques réduites = ex. glucide)
Comment classe-t-on les virus?
dépend de leur matériel génétique (ADN ou ARN) et entouré d’un manteau protéique (capside)
ce sont des parasites intracellulaires OBLIGATOIRES (pas considéré comme cellule)
ils sont non vivants, MAIS quand même considérés comme des moo
Dans quel règne se retrouve les procaryotes?
les monères (les bactéries)
Les eucaryotes se retrouvent dans quels règnes?
mycètes, plantes, animaux et protistes
Vrai ou faux, tous les protistes sont des cellules eucaryotes unicellulaire.
FAUX! quelques unes sont pluricellulaires
Vrai ou faux, toutes les mycètes sont des cellules pluricellulaire.
faux, quelques unes sont unicellulaires
Vrai ou faux, toutes les monères sont des cellules unicellulaires.
vrai
Quel est le type cellulaire, le niveau d’organisation, la nutrition et les représentants des monères et protistes?
monères : procaryote, unicellulaire, autotrophe ou hétérotrophe
protistes : eucaryote, unicellulaire (quelques unes pluri), autotrophe ou hétérotrophe, algues/protozoaires/myxomycètes
Quel est le type cellulaire, le niveau d’organisation, la nutrition et les représentants des mycètes, plantes et animaux?
mycètes : eucaryote, pluricellulaire (quelques unes unicellulaires on pense aux LEVURES), hétérotrophe
plantes : eucaryote, pluricellulaire, autotrophe, invasculaires et vasculaires
animaux : eucaryote, pluri, hétérotrophe, invertébrés et vertébrés
Vrai ou faux, les myxomycètes font parties du règnes des mycètes.
faux, protistes (piège)
Tous les organismes vivants seraient issus d’un ancêtre commun, lequel?
le progénote
Vrai ou faux, selon la classification basée sur des caractères moléculaires,. tous les organismes vivants pourraient être classés en trois grands règnes.
vrai, les eubactéries (bacteria), les archéobactéries (Archaea) et les eucaryotes (eucarya)
Quelle est la particularité de la classification basée sur des caractères moléculaires? (Woese, 1990)
tous les organismes vivants seraient issus d’un ancêtre commun nommé le PROGÉNOTE.
tous les organismes vivants pourraient être classés en trois grands règnes : eubactéries, archéobactéries et eucaryotes
Les mitochondries et les chloroplastes proviendraient, par endosymbiose, de bactéries aérobie et photosynthétiques
Les archaea seraient phylogénétiquement plus proches des Eukarya que des bacteria
Vrai ou faux, les bacteria et les archea sont des cellules eucaryotes.
FAUX, ce sont des cellules procaryotes, seul les eukarya sont eucaryotes (plantes, animaux, mycètes, protistes)
Description comparative entre les cellules procaryotes (bacteria et archaea) et les cellules eucaryotes (eucarya). Au niveau de la paroi cellulaire, membrane cellulaire, organelles et au niveau de l’ADN.
paroi cellulaire (grosse distinction): Procaryote --> peptidoglycane ou pseudopeptidoglycane Eucaryote --> polysaccharides (plantes) ou chitine (mycètes)
membrane cellulaire se ressemble = chaîne d’AG liés au glycérol par des liaisons ester
organelle :
Procaryote –> peu d’organelles, pas noyau, ribosomes, flagelles et pili
Eucaryote –> noyau, mitochondrie, chloroplaste, réticulum endoplasmique, appareil de golgi, lysosomes et peroxysomes
ADN : dans les 3 cas l’ADN est bicaténaire
Procaryote : circulaire et dans le nucléoïde, pas d’introns, plasmide (matériel génétique autonome qu’on retrouve dans le cytoplasme), génome petit
Eucaryote : très long et linéaire et contient bcp d’introns (régions non codantes), chromosome linéaire, génome important
Comment fonctionne la structure hiérarchique en taxonomie des moo?
Domaine, phylum, classe, ordre, famille, genre et espèce
–> plus général au plus précis –>
Quel personnage historique a permit au humains de découvrir le monde des moo?
Anton van Leeuwenhoek (1676), invention du microscope
Qui est le premier scientifique a attaquer la théorie de la génération spontannée (la vie peut apparaître à partir de rien du tout)? Quelle était son expérience6
Lazzaro Spallanzani, il prend un ballon de verre, il le chauffe, il le laisse comme témoin, il refait l’expérience avec un bouchon il n’y a pas de croissance, lorsqu’il enlève le bouchon il y a croissance
Qui est Louis Pasteur?
considéré comme le père de la microbiologie, il réfute la théorie de la génération spontanée, en faisant sensiblement la même expérience que Lazzaro Spallanzani, mais avec un ballon de verre et un col de cigne
Quel est l’âge d’OR de la microbiologie? Quelles ont été les découvertes?
60 années (1857 - 1914)
découverte et identification de plusieurs moo
fermentation/pasteurisation
métabolisme microbien a été caractérisé
amélioration des techniques d’isolement des moo pour pouvoir les étudier en laboratoire en culture pure
découverte de l’importance du rôle de l’immunité (découverte des vaccins pour prévenir les infections)
EXAM : Quelle méthode a utilisé Robert Koch pour établir un lien entre moo et maladie? (POSTULAT DE KOCH)
il fallait prouver qu’un moo précis causait une maladie précise, il a mis au point des méthodes pour cultiver les moo en culture pure.
- L’organisme suspecté pathogène doit être présent chez tous les animaux malades et absent chez les animaux sains. (prélèvement du sang de ces animaux et on cultive le sang ou les tissus sur un pétris)
- L’organisme suspecté pathogène doit être cultivé en culture pure.
- Les cellules issues d’une culture pure d’un organisme doivent provoquer la maladie chez un animal sain.
- L’organisme doit pouvoir être isolé à nouveau et s’avérer identique à l’original.
Quelle a été la contribution de Joseph Lister?
il a mit en place des méthodes antiseptiques : se laver les mains et stériliser les outils avant les opérations = avant 50% des patients mourraient car après l’opération car ils ont contracté une maladies
Quelle a été la contribution de Hans Christian Gram?
la coloration de Gram pour classifier des bactéries
Quel personnage historique introduit le vaccin contre la variole?
Edward Jenner
premier exemple de vaccination
origine du mot vaccin = vacca = vache
Vrai ou faux, Edward Jenner est le premier scientifique a avoir vacciné un humain contre la rage.
faux, c’est Louis Pasteur
Quelle a été la contribution d’Alexander Fleming?
découverte accidentelle de la PÉNICILLINE
Les antibiotiques ont été découvert en quel année?
1940 (hypothèse : par Alexandre Fleming qui a découvert la pénicilline)
Quelles sont les caractéristiques des bactéries?
monère, petite cellule (1-10 micro mètre), s’adaptent facilement, paroi bactérienne, peu d’organelles, petit génome, domine en nb et par leur activité métabolique la biosphère, grande majorité inoffensive, décomposent les organismes morts et recyclent ainsi les éléments chimiques vitaux
Vrai ou faux, les procaryotes ont besoin des eucaryotes pour vivre.
faux, par contre, l’inverse est vrai! Les procaryotes étaient sur terre bien avant les eucaryotes
Que peux tu dire de la morphologie bactérienne? Taille, forme et arrangement.
Taille : 0,05 à 500 micromètre
Forme (très diversifiée) : sphérique/ovale/allongée (bâtonnet)/ hélice/spirale/bactéries filamenteuses
arrangement : isolé, amas, paire, chaîne, etc…
Quelle est l’importance de l’agar?
L’agar provient des algues, c’est un agent solidifiant.
Poudre d’agar qu’on ajoute dans un milieu liquide, on chauffe, l’agar se solidifie et forme un gel. L’agar est non toxique et non métabolisable = les bactéries ne se nourrissent pas de l’agar, mais les éléments nutritifs du milieu liquide que l’on inclut dans l’agar.
Koch et ses collaborateurs on eu cette idée pour faire des cultures pures! (important pour le postulat de Koch)
Quelle a été l’idée de Julius Richard Petri?
mettre l’agar dans un contenant circulaire pour isoler les cultures bactériennes
Qu’est-ce qu’une gélose sang?
gélose nutritive à laquelle on a ajouté des globules rouges de moutons
On observe une hémolyse complète des globules rouges, comment se nomme cette hémolyse?
hémolyse bêta (ceci indique que le patient a surement une pharyngite)
Quelle est la différence entre une hémolyse (sur gélose sang) entre hémolyse bêta, alpha et gamma?
bêta = hémolyse complète alpha = incomplète gamma = absence
Quels peuvent être les aspects macroscopiques des colonies?
taille, forme, couleur, relief (hauteur), contour, texture et odeur
Qu’est-ce qu’une culture pure?
une seule espèce de moo, l’isolement se fait toujours sur gélose et non en milieu liquide
Qu’est-ce que l’isolement par striation?
pour faire culture pure : à l’aide manche de Koch stérile, moo sont étalés par des mouvements de va-et-vient à la surface d’une gélose. L’épuisement de l’inoculum produira normalement des colonies isolées dont chacune constituera une culture pure.
Quelles sont les deux méthodes pour avoir une culture pure?
isolement par striation et isolement par dilution en milieu liquide (dilution successives en milieu liquide afin d’obtenir une dilution de l’inoculum permettant la croissance de colonies isolées sur une gélose = très long)
