Cours 12 : Traduction et ARN recombinants Flashcards
Donner les 3 caractéristiques principales des codons du code génétique
1) Tout codon ne code qu’un seul a.a (code génétique n’a pas d’ambiguïtés)
2) Un a.a peut être codés par plusieurs codons différents, dits synonymes (code génétique est dégénéré)
3) Slm 3 codons ne codent pas d’a.a, il s’agit des codons STOP (UAA, UGA et UAG)
Quelle est la différence entre un cadre de lecture et un cadre de lecture ouvert
Cadre de lecture : point de départ potentiel d’une suite de codon.
Cadre de lecture ouvert : partie d’un cadre de lecture ayant le potentiel d’encoder une protéine, N’INCLUT PAS LE CODON DE TERMINAISON.
Donner tous les cadres de lecture possibles de la séquence :
…CAUGCAUGCAUG…
1) …C-AUG-CAUGCAUG…
2) …CAUGC-AUG-CAUG…
3) …CAUGCAUGC-AUG-…
Décrire les 4 types de mutations génétiques et leurs conséquences
1) Silencieuse : changement d’un ou plusieurs nucléotides d’un codon sans changer l’a.a. Ont slm un effet lorsque codon fait partie d’un élément de réponse ou autre site de liaison.
2) Faux-sens : changement d’un ou plusieurs nucléotides d’un codon qui change l’a.a. Ont un effet surtout lorsque nouvel a.a. très différent du normal
3) Non-sens : changement d’un ou plusieurs nucléotides d’un codon qui le transforme en codon STOP. Ont un effet la plupart du temps.
4) Continuation : changement d’un ou plusieurs nucléotides d’un codon STOP qui le transforme en codon d’a.a. Donne protéine avec extension C-terminale, mais toujours fonctionnelles
Schématiser et annoter la structure 2D d’un ARNt ; doit contenir tous les lobes
Correction diapo 12 PDF assemblé 12
Quel est l’appariement codon-anticodon supplémentaire possible?
G-U en 5’ de l’anticodon/3’ du codon
Qu’est-ce que le wobble?
Flexibilité de conformation de la position 5’ de l’anticodon découlant des appariements supplémentaires possibles. On dit conséquemment que l’extrémité 5’ de l’anticodon est la position de flottement.
Nommer tous les appariements de bases possibles avec l’inosine (I)
A, C et U
Donner le ou les codons (séquence 5’ vers 3’) correspondants aux anticodons suivants :
1) 5’–A-C-G–3’
2) 5’–I-C-A–3’
3) 5’–G-U-U–3’
NE PAS OUBLIER QU’ILS SONT ANTIPARALLÈLES
1) 5’–C-G-U–3’
2) 5’–U-G-A/C/U–3’
3) 5’–A-A-C/U–3’
Qu’est-ce qu’un ARNt isoaccepteur?
Des ARNt qui portent tous le même a.a, s’applique aux ARNt de même anticodon ou non, mais qui reconnaissent le codon encodant le même dit a.a
Qu’est-ce qu’un aminoacyl-ARNt
Un ARNt lié par liaison covalente riche en énergie à un a.a. Aminoacyl-ARNt sont aussi appelés ARNt chargés ou activés
Comment les aminoacyl-ARNt sont-ils synthétisés?
En deux étapes, grâce à des aminoacyl-ARNt synthétases (AAS) et deux équivalents ATP.
1) Formation d’un intermédiaire réactionnel
a. a + ATP —> aminoacyl-adénylate + PPi
2) Liaison de l’a.a activé à l’ARNt
aminoacyl-adénylate + ARNt —> aminoacyl-ARNt + AMP
Quelle est la proportion ARN/protéines d’un ribosome?
2/3 ARNr et 1/3 protéines
Décrire brièvement les 3 étapes de la traduction
1) Initiation : assemblage des sous-unités ribosomales autours du codon AUG de l’ARNm
2) Élongation : ajout d’a.a sur la chaîne peptidique en formation. Progression du ribosome de 5’ vers 3’ de l’ARNm, synthèse du peptide de l’extrémité N-terminale à C-terminale
3) Terminaison : dès complétion protéine, appareil de traduction se désagrège suite à la dissociation du complexe ribosome-ARNm
Quels sont les deux types d’ARNtmét, et leur rôle?
1) ARNt initiateur : ne reconnaît que l’AUG d’initiation
2) ARNtmét standart : ne reconnaît que les AUG dans la séquence codante
Quel est la différence entre l’ARNt initiateur procaryote et eucaryote?
ARNt initiateur procaryote est une fMét-ARNtmét (N-formylméthionine-ARNtmét) formée par l’ajout d’un formyle à l’a.a méthionine par la formyltransférase.
ARNt initiateur eucaryote est une Mét-ARNtmét non formylé.
Qu’est-ce que la séquence Shine-Dalgarno?
Région riche en purines (A et C) juste en amont du codon initiateur de l’ARNm que la sous-unité 30S peut lier. Elle est complémentaire à un segment riche en pyrimidines (G, T, U) de l’ARNr 16S. Fait en sorte que le complexe d’initiation s’attache toujours au bon AUG.
Analogue à la séquence RBS de BIO1101
Vrai/Faux : séquence Shine-Dalgarno présente slm chez procaryotes
Vrai
Schématiser et expliquer le rôle de EF-Tu, EF-Ts et EF-G dans la traduction ; doit contenir en plus les 3 étapes de l’élongation, et le bilan ATP
Correction diapo 46 PDF assemblé 12
Comment fonctionne la terminaison?
1) Lorsqu’on arrive au codon STOP, un des trois facteurs de relargage (RF1 à 3) le lie au site A du ribosome. RF1 lie UAA et UAG, RF2 reconnaît UAA et UGA et RF3 a une activité GTPase.
2) Liaison du complexe RF1/2-RF3-GTP à l’ARNm au site A modifie l’activité de la peptidyltransférase qui hydrolyse alors la liaison ester peptidyl-ARNt.
3) RF3 hydrolyse son GTP, ce qui cause le départ des facteurs de relargage et des sous-unités ribosomales
Quel est la différence de la terminaison chez les eucaryotes?
Même mécanisme, mais un seul facteur reconnaît les trois codons STOP possibles
Quels sont les analogues des facteurs de relargage procaryotes chez les eucaryotes?
RF1/2 est eRF1, et l’équivalent de RF3 est inconnu
Résumer le rôle de tous les facteurs procaryotes impliqués dans la traduction par étape
Initiation :
1) IF1 : aide à la liaison de IF3
2) IF2 : lie l’ARNt initiateur et un GTP ensemble
3) IF3 : libère l’ARNr 30S du ribosome inactif et aide sa liaison à l’ARNm
Élongation :
1) EF-Tu : lie un aminoacyl-ATP et un GTP ensemble
2) EF-Ts : débarrasse EF-Tu de son GDP
3) EF-G : favorise la translocation en liant un GTP au ribosome
Terminaison :
1) RF1 : lie codons STOP UAA et UAG
2) RF2 : lie codons STOP UAA et UGA
3) RF3 : stimule liaison de RF1/2 et relargage de RF1/2/3 et sous-unités ribosomales
Nommer les deux inhibiteurs du site P
Chloramphenicol et Linezolid
