Cours 10 : Réplication et réparation de l'ADN Flashcards
Séparer les bazes azotées en purines et pyrimidines
Purines : A, G
Pyrimidines : U, T, C
Qu’est-ce qu’un nucléoside? Comment les nomme-t-on
Base azotée et son pentose, sans phosphates
Purines : “…osine” (adénosine, guanosine
Pyrimidines : “…idine” (cytidine, uridine, thymidine)
Quelles sont les règles de Chargaff?
1) Ratio purines/pyrimidines est toujours 1
2) Nb A = nb T et nb G = nb C, donc A+G = T+C
Combiens de liens H font chacun des appariements de bases azotées?
A-T/U : deux liens H
C-G : trois liens H
Quelles sont les trois conformations de l’hélice d’ADN, et les conditions qui les font apparaître?
ADN-B : Hélice droite (respectant la règle de la main droite), favorisée en milieu aqueux, forme normale
ADN-A : Hélice droite, déshydratée, sillons égaux
ADN-Z : Hélice gauche, si bcp de G et C, pas de sillons
Quelles forces maintiennent l’ADN-B ensemble, en ordre d’importance?
1) Effet hydrophobe (paires de bases)
2) Ponts-H (entre bases, de forces différents)
3) Van der Waals
4) Liens ioniques (P négatifs et cations Mg2+)
Quelles sont les deux fonctions de l’ADN?
1) Stabilité de l’information
2) Transmission de l’information
Pourquoi dit-on que la réplication de l’ADN est semi-conservatrice?
Pcq un vieux brin est apparié à un nouveau brin, donc on conserve à moitié l’ADN.
Quel est le rôle d’une origine de réplication?
Recruter soit des hélicases (procaryotes) soit servir de charpente pour l’ORC, le complexe de reconnaissance de l’origine (eucaryote), qui recrute les hélicases.
Bref, lieu d’ouverture du double brin d’ADN
Qu’est-ce qui permet à la réplication eucaryote d’avoir une vitesse proche de celle des procaryotes malgré un ADN beaucoup plus long?
Multiples origines de réplication par chromosome, décuple la vitesse.
TRÈS IMPORTANT
Pourquoi l’hélicase déroule-t-elle les régions riches en A-T?
Pcq A-T fait slm deux ponts H, donc constitue une liaison plus facile à briser que G-C, qui en fait 3
Quel problème peut découler du déroulement de l’ADN, et quelles protéines y remédient?
Des surenroulements (enroulement très serré de l’ADN devant l’hélicase, comme lorsqu’on tord trop une corde).
Topoisomérases peuvent sectionner l’ADN, ce qui la désenroule, et la réattacher après.
Comment s’appelle le complexe de réplication procaryote, et combien sont actifs durant la réplication?
Réplisome, on en a un par fourche de réplication, donc deux.
Schématiser grossièrement la réplication du génome procaryote
Correction diapo 50 PDF assemblé 10
Nommer les 3 avantages de l’amorce d’ARN
1) Ajoutées sans contrôle qualité
2) ARN facilement différenciable de l’ADN, facilite dégradation
3) Conservation de l’ADN slm, dupliqué très fidèlement
Nommer les 3 polymérases procaryotes et expliquer leur rôle respectif
ADN pol I : répare ADN et prend part à synthèse d’un des brins pendant réplication
ADN pol II : contribue à réparation ADN
ADN pol III : composant clef du réplisome, enzyme principale de polymérisation d’ADN
Nommer les 4 polymérases minimales eucaryotes et expliquer leur rôle respectif
ADN pol a (alpha) : débute la polymérisation d’ADN à l’amorce au début de la réplication
ADN pol o (sigma) : poursuit la polymérisation d’ADN après la pol a
ADN pol B (bêta) : participe à la réparation dans le noyau
ADN pol y (gamma) : réplique l’ADN mitochondrial
Dans quelle direction les polymérases progressent-elles? Pourquoi
5’ vers 3’ du brin naissant, pcq attachent nouveaux ND sur 3’-OH.
Qu’est-ce qui explique qu’un brin est polymérisé de manière discontinu lors de la réplication?
Comme les deux brins matrices sont antiparallèles, la synthèse d’un des nouveau brin (de 5’ vers 3’) peut se faire dans le sens de la progression de la fourche de réplication. Mais celle de l’autre ne peut pas, pcq l’extrémité du nouveau brin vis à vis la fourche de réplication est le 5’, donc la polymérisation doit se faire dans le sens opposé de la progression de la fourche, ce qui crée des brins discontinus nommés fragments d’Okazaki
Schématiser une fourche de réplication ; doit contenir polymérases, brins discontinu et continu, extrémités 5’ et 3’, et amorces.
Correction diapo 60 PDF assemblé 10
Quelle enzyme synthétise les amorces d’ARN?
Primase
Comment les fragments d’Okazaki sont-ils liées ensemble?
RNase H digère l’amorce d’ARN par hydrolyse, puis ADN pol I (procaryotes) ou o (eucaryotes) la remplace par ADN, et ligase relie les fragments adjacents
Qu’est-ce qui permet à la polymérase de reculer et d’enlever un ND en cas de mésappariement?
Son activité exonucléase 3’, qui lui permet de cliver l’ADN en 3’
Comment se termine la réplication procaryote?
Site de terminaison composé de séquences pouvant être liées par protéine tus et permettant la séparation des chromosomes père et fils.
Protéine tus inhibe l’activité hélicase du réplisome, ce qui arrête la fourche de réplication.
Pourquoi la réplication eucaryote demeure-t-elle plus lente que celle procaryote?
Parce que l’ADN eucaryote est condensé en chromatine, ce qui fait en sorte que les nucléosomes doivent être déconstruit devant la pol et reconstruit derrière, avec la synthèse de nouvelles histones.
Pourquoi la cellule répare-t-elle son ADN et pas ses autres macromolécules?
1) Lésion dans l’ADN sont plus dangereuse que les pertes énergétiques liées à sa réparation
2) La réparation des autres macromolécules n’apporte aucun avantage à la cellule
En quoi l’ADN endommagé menace l’organisme? Nommer 3 risques
1) Lésions touchant gènes codants pour protéines essentielles peuvent mener à la mort.
2) Perte de fonctions cellulaires
3) Croissance anarchique (cancer)
Nommer les 5 voies de réparation de l’ADN et leur cible
1) Photoréactivation : dimères de thymine
2) Par excision de base (BER) : corrige bases altérées
3) Par excision de ND (NER) : corrige erreurs dues aux radicaux libres et aux radiations
4) Recombinaison homologue (HR) : bris de l’ADN double brin en escalier
5) Jonction des extrémités non-homologues (NHEJ) : bris de l’ADN double brin droites (dites franches)
Schématiser et expliquer le mécanisme de photoréactivation
Correction diapo 76 PDF assemblé 10
Schématiser et expliquer le mécanisme BER
Correction diapo 77 PDF assemblé 10
Que forme la désamination hydrolytique de la cytosine, et quelle enzyme est impliquée?
Un uracile, par l’uracile-ADN glycosylase
Schématiser et expliquer le mécanisme NER
Correction diapo 79 PDF assemblé 10
Schématiser et expliquer le mécanisme NHEJ
Correction diapo 80 PDF assemblé 10
Schématiser et expliquer le mécanisme HR
Correction diapo 81 PDF assemblé 10
