Cours 10 - Cycle du citrate Flashcards
Que représente le cycle du citrate métaboliquement?
C’est le centre des voies anaboliques, elle est également la voie oxydative de l’Acétyl-CoA
À quoi servent le NADH,H+ et le FADH2 produits dans le cycle du citrate
À alimenter la CTE en électrons pour produire de l’ATP en grande quantité.
Pourquoi dit-on que c’est une voie aérobique?
Parce qu’elle se déroule dans la mitochondrie et pour la production d’ATP c’est nécessaire d’avoir de l’O2 comme accepteur final d’électrons.
Combien y a t-il de réactions d’oxydation dans le cycle du citrate?
4 réactions réalisées par des déshydrogénases.
D’où provient l’acétyl-CoA dans le cycle du citrate?
Il peut provenir de tous les nutriments consommés, autant les acides-aminés que les glucides ou lipides ou corps cétoniques par b-oxydation
Quelles sont les trois voies anaboliques permises du cycle du citrate et à partir de quels produits peuvent elles être exploitées?
Malate qui possède un transporteur hors de la mitochondrie qui est retransformé en OAA pouvant participer à l’anabolisme des acides aminés ou la néoglucogenèse.
Citrate qui possède un transporteur hors de la mitochondrie qui est transformé en Acétyl-CoA pour former des acides gras ou des isopréinoïdes
À partir du Succinyl-CoA il peut y avoir production de porphyrines qui constituent le noyau basal de l’hème
Qu’est-ce qu’implique la possibilité de faire de l’anabolisme dans le cycle dy citrate?
L’anabolisme fait qu’on utilise des produits du cycle, impliquant qu’il doit y avoir une production accrue de OAA
Qu’est-ce qui permet de faire la liaisont entre la glycolyse et le cycle du citrate?
Le transporteur du pyruvate sur la membrane interne de la mitochondrie permet de le faire entrer et de le transformer en acétyl-CoA par la pyruvate déshydrogénase
Quels sont les sous produits de la réaction par la PDH?
L’enzyme utilise la Coenzyme A lié à un groupement thiol CoA.SH ainsi que du NAD+ pour les transformer en Acétyl-CoA, NADH,H+ et en CO2
Est-ce que la réaction caltalysée par la PDH est irréversible?
OUI elle est irréversible en raison de la décarboxylation
Comment est constitué l’enzyme PDH?
Un complexe de 3 enzymes
Si on résumait l’activité de la PDH et le nombre d’étapes nécessaires pour réaliser son activité?
C’est la catalyse de la décarboxylation oxydative du pyruvate et le transfert de l’acétyl au Coenzyme en 5 étapes
Comment se déroule la première étape du cycle du citrate ?
La citrate synthase utilise les deux carbones de l’acétyl-CoA et les joint à l’OAA en utilisant une molécule d’eau pour former le citrate, le CoA.SH est ensuite relâché.
Pourquoi une molécule d’eau est-elle nécessaire à l’étape 1?
Parce que c’est une hydrolyse du lien thioester qui est utilisé pour catalyser la réaction.
Est-ce que la réaction 1 est irréversible?
Oui
Quel enzyme catalyse la réaction 1
Citrate synthase
Pourquoi ne considère t-on pas la réaction 1 comme un perte d’énergie?
Parce qu’elle permet l’alimentation de réactions payantes par la suite
Qu’est-ce qui est fait de la CoA.SH suite à la réaction 1?
Elle est recyclée en acétyl-CoA à nouveau
Comment se déroule l’étape 2 du cycle du citrate ?
Le citrate est transformé en Isocitrate par aconitase en bougeant un groupement OH par isomérisation et hydratation et déshydratation successive afin d’être oxydé lors de la prochaine étape.
Existe t-il un produit intermédiaire à la réaction 2 du cycle du citrate?
Oui
Est-ce que la réaction 2 du cycle du citrate est réversible ?
Oui
Quelle enzyme catalyse la réaction 2 du cycle du citrate?
Aconitase
Que se passe t-il à la réaction 3 du cycle du citrate?
L’isocitrate est transformé en alpha-cétoglutarate par l’isocitrate déshydrogénase en passant du NAD+ en NADH,H+ avec du CO2
Est-ce que l’étape 3 est limitante et irréversible?
Oui en raison de la nécessité d’avoir du NAD+ et de la décarboxylation
Quel enzyme catalyse la 3e réaction?
Isocitrate déshydrogénase
En quoi consiste l’étape 4 du cycle du citrate?
L’alpha-cétoglutarate est transformée en Succinyl-CoA par l’alpha-Cétoglutarade DH par l’utilisation du NAD+ et le CoA.SH en les transformant en CO2 ainsi qu’en NADH,H+
Quelle molécule à la réaction 4 possède un haut potentiel énergétique?
Le succinyl-CpA
L’étape 4 est-elle limitante et irréversible?
Oui, pour les mêmes raisons que l’étape 3.
Quelle enzyme catalyse la réaction 4?
L’alpha-cétoglutarate déshydrogénase
Comment se déroule la réaction 5 du cycle du citrate?
Le succinyl-CoA est transformé en Succinate par la succinate thiokinase qui transforme le GDP+Pi en GTP (qui sera transformé en ATP) et libère le CoA.SH
Comment le GTP est-il formé à la réaction 5?
Le transfert de liaison riche en énergie du CoA.S au GDP le permet
Est-ce que la réaction 5 dans le cycle du citrate est irréversible?
Non, elle est réversible
Quelle est l’enzyme qui catalyse la réaction 5 du cycle du citrate?
Succinate thiokinase
Comment se déroule la réaction 6 du cycle du citrate?
Le succinate est transformé en fumarate (qui possède une liaison trans) par la succinate déshydrogénase par le biais du FAD+ qui est transformé en FADH2
Comment est utilisé le FADH2 par la suite?
Il est envoyé dans le complexe II de la CTE de la mitochondrie
Quelle enzyme catalyse la réaction 6 du cycle du citrate?
Succinate déshydrogénase
La réaction 6 du cycle du citrate est-elle réversible?
Oui elle est réversible
Comment se déroule la réaction 7 du cycle du citrate?
Le fumarate est transformé en L-malate par la fumarase par le biais d’un hydratation
Quelle enzyme catalyse la réaction 7 du cycle du citrate?
Fumarase
La réaction 7 du cycle du citrate est elle irréversible?
Non, elle est réversible
Comment se déroule la réaction 8 du cycle du citrate?
Le L-malate est transformé en OAA par la MDH via l’utilisation du NAD+ en NADH,H+
Quel enzyme catalyse la 8e réaction du cycle du citrate?
Malate déshydrogénase
Est-ce que la réaction 8 du cycle du citrate est réversible?
Oui, lorsquelle est inversée elle est davantage utilisée dans la voie de la néoglucogenèse.
Que permettent les réaction de remplissage dans le cycle du citrate?
De combler la demande énergétique quand l’apport de OAA doit augmenter? Bref synthéthiser de l’OAA.
Quelles sont les trois enzymes qui permettent les réactions de remplissage dans le cycle du citrate et où se trouvent t-elles ?
- Pyruvate carboxylase (mitochondrie)
- PEP carboxykinase (cytosol)
- Enzyme malique (cytosol vers mitochondrie via malate)
Quelles sont les deux enzymes qui sont considérées comme des voies mineures dans les réactions de remplissage?
- PEP carboxykinase
- Enzyme malique (permet une gradation entre cycle du citrate et la néoglucogenèse)
Quelles réactions de remplissage créent de façon directe de l’OAA?
- Pyruvate carboxylase
- PEP carboxykinase
