Cours 1 - Structure de l'ADN et ARN Flashcards
Faire un résumé de l’historique de la génétique (de -400 à la pas encore mort de Watson)
-400: les grecs (dont Hippocrate) se questionne sur la transmission des gènes (petits bouts de corps qui se transmettent lors du fun (xd)(lol))
Mendel (19e siècle): expérimentation avec les pois qui a permis de déterminer les notions de dominance/récessivité.
Darwin (19e siècle): Origine des espèces
Victoriens = #panique #lesfaiblessontmajoritaires
Galton: “concierge de la science”. Il entreprend des croisades génétiques afreuses et appelle ça l’Eugénisme.
Davenport: Meneur du mouvement au USA, entreprends des expériences désastreuses dans son lab à long island
Grant: Riche qui publie le déclin de la grande race en 1916, Hitler s’en inspire poru Mein Kampf
1933: Loi sur la stérilisation
1939: Holocauste
L’eugénisme disparait au millieu du 20e siècle, la génétique se retrouve confronté à un problème publique majeur.
1930: ADN a 4 bases
1944: Watson est inspiré par un roman de Shrödinger
1950: Watson entrepent un projet qui tombe à l’eau
Il rencontre Wilkins à Copenhague
–> Le reste à voir dans le schéma de concept là
1962: PRIX NOBEL LOL
Expliquez pourquoi l’information contenue dans les sillons est plus importante dans le grand sillon.
On ne peut pas faire la différence entre A/T et T/A dans le petit sillon.
Dans le grand, oui.
Qu’est ce qui augmente la température de fusion (2) ?
- La concentration en ions (une augmentation en sels). Explication: Les sels neutralisent les grp phosphates ce qui diminue les forces de répulsion entre les brins.
- Une augmentation du nombre de paires de bases G/C
Qu’est-ce que la tétra-boucle ?
C’est une structure particulière de l’ARN qui permet de stabiliser la structure secondaire de l’ADN. Séquence C(UUCG)G qui a des interactions très particulières d’empilements de bases en son sein et des liaisons G/U.
Expliquer pourquoi il est possible de générer des structures assez complexes avec de l’ARN.
- Elle forme souvent des doubles hélices
- Elle forment de nombreuses structures secondaires de type tige-boucle (épingle à cheveux, hernies, simples boucles)
- Certaines boucles ont des propritétés spéciales (tétra-boucles, pseudo-noeuds)
- L’ARN peut se replier pour former des structures tertiaires complexes (triplets de bases) (les ribosomes peuvent aussi aider à stabiliser des structures tertiaires en neutralisant les phosphates)
Expliquez le fonctionnement du ribozyme à tête de marteau des viroïdes.
Le viroïde se réplique lorsqu’il infecte les plantes en faisant une très longue molécule d’ARN contenant plusieurs copies de lui-même qui sera coupé par le ribozyme à tête de marteau (séquence de trois boucles près du site à couper). Le ribozyme, en général, fonctionne à pH élevé en déprotonant les grp 2’-OH ce qui permet l’attaque nucléophiles sur les O- par les phosphates en 3’ adjacent (coupe la chaîne et produit un grp 2’,3’ phosphate cyclique d’un sens et un grp 5’-OH de l’autre). Chaque ribozyme assure son clivage une fois (turnover = 1).
Quels configurations existent chez les purines et les pyrimidines ? Comment appelle-t-on leur état préférentiel pour l’appariement ?
Purine : Céto/Énol
Pyrimidine : Amino/Imino
Les états préférentiels s’appellent les états tautomériques (amino et céto).
Nommez et expliquer les mécanismes de stabilisation de l’ADN (3).
1: L’entropie (un lien H contient de l’énergie qui a créé le désordre de détruire une molécule d’eau entre les deux brins de l’ADN, ce qui augmente l’entropie et stabilise).
2: L’empilement des bases (Les bases s’empilent perpendiculairement à l’axe de l’hélcie) (Forces de Van der waals; interactions π-π; l’interaction entre les nuages électroniques sont délocalisés dans les noyaux aromatiques)
3: Les influences hydrophiles/hydrophobes (L’armature sucre-phosphate préfèrent H2O, donc à l’extérieur. La partie intérieur, la rencontre des bases, est la partie hydrophobe) (Dualité et force hydrostatiques qui “colle” la double hélice)
Expliquez et nommez les fonctions (3) du pivotement des bases ?
Propriété des bases de ressortir de la double hélice par des protéines qui se déplacent le long de la molécule d’ADN (méthylation, réparation de l’ADN, recombinaison homologue)
Nommez et expliquer les différentes conformations de la double hélice.
Forme B: La plus courante, hélice droite/lien glycosyle en anti, 10pb/tour.
Forme A: Dans les solutions pauvre en eau, hélice droite/lien glycosyle en anti, 11pb/tour, grand sillon plus étroit et petit sillon plus large et moins profond.
Forme Z: Hélice à gauche / doublet de pruine-pyrimidine style d(GC)n / anti pour les pyrimidiques et syn, présence élevé en ions positifs, réalité physiologique discutable, région d’ADN Z corrèle avec région transcrite (relâchement de torsion).
