Cours 1 - Introduction Flashcards
Pourquoi étudier la phytopathologie?
Touche plusieurs aspects (bio mol, microbio, agronomie, épidémiologie, etc.), parasites dans les plantes peuvent affecter plusieurs populations
Donnez 2 exemples de phytopathogènes dans l’histoire
- 70 millions d’Africains dépendent du manioc
- 1 milliards de personnes sont dépendants du blé entre l’Afrique du Nord, le Moyen-Orient et l’Inde
- Famine de la pomme de terre en Irlande (Phytophthora infestans)
Définition de la phytopathologie
Science multidisciplinaire qui étudie les causes parasitaires et les conditions environnementales
qui provoquent des maladies, ainsi que les méthodes pour prévenir ou contrôler les maladies
Comment se produit la résolution des problèmes phytopathologiques?
Anomalies du phénotype → Diagnostic → Définition des méthodes de lutte
Qu’est-ce que la symptômatologie?
Les symptômes (manifestations) des maladies
Qu’est-ce que l’étiologie?
Les causes des maladies
Qu’est-ce que l’épidémiologie?
La distribution spatio-temporelle des maladies
Qu’est-ce qu’un symptôme?
Modification du phénotype par rapport à celui qui est attendu
Comment remarquons nous une anomalie aka des symptômes? (Étapes)
Génotype mis en culture (Environnement biotique et abiotique) → Phénotype observé vs phénotype attendu = symptôme
Temps d’incubation définition?
Période entre infection et l’expression des symptômes
Symptômes primaires définition?
symptôme directement responsable de l’anomalie observée
Symptômes secondaires définition?
- symptôme qui est la conséquence du symptôme primaire
- souvent les premiers signes d’un problème
Quels sont les 8 types de symptômes?
- Modifications de couleur
- Altérations d’organes
- Modifications anatomiques des rameaux
et des tiges - Modification au niveau des feuilles
- Modifications touchant les fleurs
- Anomalies de croissance
- Anomalies internes
- Excroissances pathologiques
Manifestation Fonctions normales de la plante des maladies
Anthocyanose définition?
Excès de pigments rouge violacé
Albinisme défintion?
Absence de pigmentation
Chlorose définition?
Pâleur de la coloration du feuillage pouvant aboutir à une jaunisse
Mélanose définition?
Production de substances foncées (mélanine)
Mosaïque définition?
Alternance de zones de coloration vert pâle ou vert foncé et de zones chlorotiques ou jaunâtres
L’anthocyanose est le résultat de :
- Destruction de la chlorophylle qui révèle les anthocyanes normalement présentes
- Production anormale des anthocyanes
L’albinisme est génétique ou …?
Causé par des facteurs externes (herbicides)
La chlorose est une condition où les plantes manquent de ..?
Chlorophylle
La chlorose peut se traduire en une ____ (carotènes et xanthophylles) en cas d’absence prononcée
Jaunisse
Dans la condition de la mélanose, les tâches foncées représentent quoi?
Accumulation de la mélanine
Dans la condition de la mosaïque, il y a des marbrures ou ..?
Panachures si les spots sont diffus
Quelles sont les 5 conditions de modifications de couleur?
Anthocyanose Albinisme Chlorose Mélanose Mosaïque
Quelles sont les 3 conditions de la catégorie “Altérations d’organes”?
Nécrose
Flétrissement
Pourriture
Nécrose définition?
Altération résultant de la mort des cellules
Flétrissement définition?
Perte de turgescence provient d’un manque d’eau ou d’un dysfonctionnement
de la conduction du xylème (trachéomycoses)
Pourriture définition?
Altération résultant d’une
décomposition des tissus
Quelles sont les 4 conditions de la catégorie “Modifications anatomiques des rameaux et des tiges”?
Balai de sorcière
Chancre
Fasciation
Gonflement
Balai de sorcière définition?
Prolifération abondante des
ramifications d’une tige
Chancre définition?
Altération localisée de l’écorce
Fasciation définition?
Morphologie anormale par la perte de symétrie radiale
Gonflement définition?
Tiges et rameaux présentent des zones enflées (= swollen shoot)
Quelles sont les 2 conditions de la catégorie “Modifications au niveau des feuilles”?
Frisolée
Énations
Frisolée définition?
Boursouflure et gaufrement du limbe foliaire
Énations définition?
Excroissances tissulaires au niveau des nervures foliaires (causées souvent par des virus)
Quelles sont les 2 conditions de la catégorie “Modifications touchant les fleurs”?
Virescence
Chloranthie/phyllodie
Virescence définition?
Pièces florales restant vertes
Chloranthie définition?
Transformation de certicilles floraux en organes foliacés
Quelles sont les 2 conditions de la catégorie “Anomalies de croissance”?
Nanisme et atrophie
Déformation d’organes
Nanisme et atrophie définition?
Réduction de la taille de la plante ou de ses organes
Déformation d’organes définition?
Déformation d’organes lolz
Quelles sont les 3 conditions de la catégorie “Anomalies internes”?
Thyllose
Callose
Bouchon
Thyllose définition?
Expansion vésiculeuse se formant dans le xylème à partir de cellules
Callose définition?
Dépôts anormaux de la callose (polysaccharide)
Bouchon définition?
Obturation des vaisseaux par des microorganismes
Quelles sont les 3 conditions de la catégorie “Excroissances pathologiques”?
Gale
Galle
Tumeur
Gale définition?
Altération superficielle de l’épiderme de la plante
Galle définition?
Excroissance dues aux insectes, bactéries et champignons
Tumeur définition?
Prolifération anarchique des tissus suite à une modification génétique de ses cellules végétales
Les maladies chez les plantes peuvent être causées par des agents non parasitaires, et par des agents parasitaires. Quels sont les 3 types d’agents non parasitaires (physico-chimiques)?
Climat
Nutrition
Pollution
Les maladies chez les plantes peuvent être causées par des agents non parasitaires, et par des agents parasitaires. Quels sont les 2 types d’agents parasitaires?
Molécules
Organismes
Exemples de climats qui ont des impacts sur plantes?
Froid, chaud, sécheresse, excès de précipitation, grêle, foudre, vent, neige
Exemples de nutritions qui ont des impacts sur plantes?
Déséquilibres, carences, excès, pH, salinité, toxiques naturels
Exemples de pollutions qui ont des impacts sur plantes?
Atmosphérique (SO2, F etc), sols, eaux (nitrate, pesticides), poussières industrielles (Pb, Zn), pesticides (herbicides)
Exemples de molécules qui ont des impacts sur plantes?
Virus, viroïdes (les acides nucléiques non codants)
Exemples d’organismes qui ont des impacts sur plantes?
Bactéries, champignons, oomycète, phytoplasmes,
protozoaires
En bref, les maladies non-parasitaires résultent d’une inadéquation des conditions ______.
Écologiques
Les agents parasitaires sont généralement _____ (ils envahissent l’hôte et s’y multiplient) et _____ (ils se transmettent d’une plante infectée à une plante saine).
Infectieux
Contagieux
Les agents parasitaires peuvent être biotrophes, ____ et ____
Nécrotrophes
Herbivores
Les plantes ont évolué avec des pathogènes, ils ont donc des mécanismes de .____
Défense
2 types de défenses des plantes?
Constitutive
Inductible
Le processus d’infection d’une plante par un agent pathogène débute par ..?
L’établissement d’un CONTACT entre les deux aka un trou dans l’armure
En quoi constitue la défense constitutive?
Écorce, lignine, cire de cuticule, parois cellulaire, les métabolite secondaires
Caractéristiques des racines?
- Extrémités fonctionnelles: coiffe, zone pilifère, poils absorbants
- Échanges avec la rhizosphère
- Zone fragile (moins de protection(
- Zone privilégiée d’infection
3 blessures des racines?
Naturelles
Morsures
Piqûres
Caractéristiques du collet?
- Sensible aux stress abiotiques
- Les jeunes plantes sont + sensibles
Types de blessures sur les parties lignifiées des organes aériens?
- Cicatrices d’abscission foliaire
- Craquelures ou fentes provoquées par des anomalies thermiques (gel, chancre de chaleur) ou hydriques (sécheresse)
- Divers (chablis, élagage, chocs divers, incendies, insectes, rongeurs, oiseaux, etc.)
La partie herbacée des organes aériens peut se faire attaquer par…? (3 façons)
Par la voie des ouvertures naturelles (stomates et hydathodes)
Par percement direct de la cuticule
Par des blessures/piqûres
Les pectines, les hémicelluloses, la lignine, la cire, la subérine et la cellulose sont des composés ____ qui peuvent se ____
Phénoliques
Polymériser
Comment ces composés phénoliques aident à la défense des plantes? (2)
Créent une barrière imperméable à l’eau et une zone de défense contre les invasions des pathogènes
Jouent un rôle déterminant dans la croissance des plantes et contrôlent la flexibilité/rigidité des organes
Ces composés phénoliques semblent être synthétisés de façon systématique pour ..?
Réparer les blessures d’origine physique ou microbienne (subérine)
Les agents pathogènes attaquent quelle partie des plantes et de quelle façon?
Les parois cellulaires
Par les enzymes pectinolytiques
Quels polymère représente les constituants principaux des parois?
Les pectines
Qu’est-ce que la pectine?
Un polymère d’acides galacturoniques associés par des liaisons alpha-1,4
Polygalacturonase (PG) définition/rôle?
Sont des hydrolases qui clivent les liaisons alpha-1,4 entre acides galacturoniques en fixant une molécule d’eau
Pectase-lyayses (PL) définition/rôle?
Sont des lyases qui clivent les liaisons α-1,4 entre acides galacturoniques par une réaction de β élimination
Les métabolites primaires (sucres, lipides, acides aminés, acides nucléiques) sont impliqués dans..?
Le développement et la reproduction des plates
Les composés intermédiaires peuvent être utilisés pour la _____ et la _____
Communication
Défense
Que sont les protéines PR?
Pathogenesis-related proteins; Sont des protéines produites dans les plantes en cas d’attaque (Une infection par un microorganisme active un gène dans la plante qui produit la protéine)
Combien y a-t-il de familles de protéines PR?
14
Quelles sont les 3 protéines PR les plus importantes et leurs caractéristiques?
PR-2 → Tabac → β-1,3-glucanase
PR-3 → Tabac → chitinase type 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7
PR-6 → Tomate → inhibiteur de protéinase (ex: endo-polygalacturonases)
Les protéines PR sont stables à pH ___
Acide
Les protéines PR sont très résistantes à quoi?
À l’action des protéases produites par la plante elle-même ou par les microorganismes pathogènes
Les propriétés des protéines PR leur confère une grande ____ dans les environnement défavorables où elles s’____
Stabilité
Accumulent (les vacuoles et les espaces intercellulaires occupés par le pathogène)
Dans les métabolites secondaires, nommez des exemples de composés
Terpènes (capsaicine, menthol, campfor, eucalyptol), phénoliques (lignine, flavanoïdes), alcaloïdes (caféine, nicotine)
Les métabolites secondaires sont ___ à produire en énergie et en nutriments
Coûteux
Qu’est-ce que le modèle zig-zag?
Modèle qui représente les étapes successives entre une plante et son pathogène
Étapes du modèle zig-zag?
1- La plante reconnaît les molécules inconnues, ce qui active une réponse chez la plante
2- Pathogène développe des éliciteurs qui inhibe la reconnaissance des pathogènes chez la plante
3- Ces éliciteurs deviennent des Avr-R (facteurs avirulents) une fois que la plante a développé des protéines de résistance, qui mène à une immunité
4- Le pathogène développe des nouveaux éliciteurs et/ou perd ses facteurs Avr-R, alternance entre seuil de résistance effective et seuil de réaction hypersensibilité
Que sont les DAMPs?
Damage-associated molecular patterns; ce sont des molécules libérées lors d’un stress cellulaire ou d’une lésion tissulaire et sont considérées comme des signaux de danger endogènes, car elles induisent de puissantes réponses inflammatoires en activant le système immunitaire inné lors d’une inflammation non infectieuse
Que sont les MAMPs?
Les MAMPs sont des molécules reconnues par des récepteurs de reconnaissance de formes (PRR), localisés à la surface des cellules végétales
Que sont les LRR?
Leucine rich-repeats; répétitions riches en leucine extrêmement bien conservé
Qu’est-ce qu’une sensation d’hypersensibilité?
L’hypersensibilité caractérise une réaction nécrotique qui se manifeste précocement chez des plantes résistantes, lors de l’infection par des agents pathogènes fongiques, bactériens ou viraux
Exemples d’induction des défenses?
Renforcement de la paroi cellulaire (lignine, subérine, callose), accumulation des PRs proteins, métabolites secondaires (phytoalexins, phytohormones, formes activées de l’oxygène )
En bref, dans le système de défense inductible, ce sont les métabolites secondaires (phytohormones, formes activées de l’oxygène) qui agissent, ce qui induit un changement dans l’expression ..?
Des gènes
