Cours 1 : ADN; Isolement, purification et visualisation Flashcards

1
Q

Avec quoi faut-il traiter les cellules afin de dégrader le peptidoglycan de la paroi bactérienne?

A

Le lysozyme

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2
Q

Avec quoi faut-il traiter les cellules pour dissoudre les lipides de la membrane cellulaire?

A

Un détergeant tel que le SDS

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3
Q

Le SDS peut dissoudre les lipides, mais aussi _____

A

Dénaturer les protéines

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4
Q

Lors de l’extraction de l’ADN de cellules bactériennes, comment l’ADN est purifié?

A

Par centrifugation et extraction chimique (phénol)

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Q

Comment l’ADN est extraite des cellules bactériennes sans l’utilisation de phénol?

A

Passage sur une colonne contenant une résine (silice) qui ne lie que de l’ADN

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6
Q

Que fait la ribonucléase A?

A

Elle dégrade l’ARN mais pas les macromolécules d’ADN

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7
Q

Qu’est-ce qui permet la précipitation des macromolécules d’ADN?

A

L’ajout d’un volume égal d’alcool

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8
Q

Quelle est la méthode physique la plus utilisée pour visualiser et analyser l’ADN?

A

L’électrophorèse

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9
Q

Vrai ou faux : Lors de l’électrophorèse, le tampon ayant servi à faire le gel est différent du tampon pour la solution

A

Faux, il doivent être de compositions identiques

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10
Q

Est-ce que la porosité du gel de polyacrymalide est plus ou moins dense que celle de l’agarose?

A

Plus dense (donc filtre des fragments plus petits)

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11
Q

Quel est le but de l’EGCP?

A

Forcer l’avancement du fragment dans quelque chose où il ne devrait habituellement pas passer

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12
Q

Vrai ou faux : Avec l’EGCP, on peut visualiser les cassures qui sont générées par des mutations

A

Vrai

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13
Q

Que veut dire DGGE?

A

Électrophorèse sur gel en gradient dénaturant

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14
Q

Que fait le DGGE?

A

Il sépare les molécules d’ADN ayant seulement un nucléotide de différence dans leur séquence

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15
Q

Vrai ou faux : Lors du DGGE, le profil de dénaturation de l’ADN avec une seule mutation sera identique à celui de l’ADN sauvage

A

Faux, il sera considérablement différent

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16
Q

Quels sont les deux facteurs pour lesquels est dû le DGGE?

A
  1. Une température modérément élevée mais constance

2. Une dénaturation chimique avec un mélange d’urée et de formamide

17
Q

Vrai ou faux : Lors d’un DGGE, le gradient de dénaturation chimique peut-être disposé en parallèle ou perpendiculairement par rapport à la direction de migration

A

Vrai

18
Q

Quelle est la différence entre le DGGE et le SSCP?

A

Alors que le DGGE se fait en conditions dénaturantes, pour le SSCP, l’échantillon est d’abord dénaturé et l’électrophorèse se déroule en conditions non-dénaturantes