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cour 3 Flashcards

1
Q

La synthèse de l’ADN est catalysée par

A

enzyme appelée ADN POLYMÉRASE.

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Q

outes les ADN polymérases ont
besoin

A

d’une amorce présentant un 3’-
OH libre.
Elles ne peuvent pas commencer
la synthèse d’un brin de novo

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3
Q

c est koi la primase

A

:ARN polymérase consacrée
à la fabrication de courtes amorces ARN (5 à 10 nucléotides) en face d’une matrice
d’ADN monocaténaire

donc la primase synthetise une amorce d arn par fourche

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4
Q

keski arrive au ribonucleotide de l amorce

A

seront
ensuite remplacés par des
désoxyribonucléotides.

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5
Q

par ki est reconnu l amorce d ARN

A

par le poseur d’anneaux
coulissants (ii)

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6
Q

c est koi la fct de le poseur d’anneaux
coulissants (ii)

A

qui y
installe un anneau coulissant et une ADN
polymérase

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7
Q

d ou se fai la synthese de l adn ou arn par ki et ds kel sens

A

toute les polymerase ajoute des nucleotide en 3 prime OH
et se fai du 5 prime au 3 prime

donc la lecture du brin parental se fai ds le sens inverse 3 prime ver 5 prime

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8
Q

Quand il est lié à l’ATP, le poseur d’anneaux fai koi

A

peut se lier à l’anneau coulissant et l’ouvrir en provoquant la rupture des contacts entre deux
sous-unités adjacentes

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9
Q

ou se fai la de poseur anneau et anneau

A

ds noyau

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10
Q

anneau role

A

se joint a la polymerase et la polymerase lie le brin parental et ajout un nucleotide et l anneau suit la polymerase et la pousse/guide

et permet a polymerase de rester reveiller, colle

 Lie à l’ADN au niveau de l’amorce, s’associe
ensuite avec la polymérase et glisse avec elle.
 Permet de maintenir l’ADN polymérase sur le
brin matrice

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11
Q

kan lanneau est lie a la polymerase , il pe reetre lie de nouveau par le poseur d anneau vrai ou fau

A

fau

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11
Q

redi les etape anneau et polymerase et poseur d anneau

A

poseur anneau attacher a l anneau
pose l anneau sur brin
polymerase vien

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11
Q

si ya pa anneau keski spasse avec la polymerase

A

la polymerase se detache de l adn mai avec anneau sa devien iper long pr kel se dissocie

ADN pol. se détache au bout
de 20 à 100 pb et s’éloigne

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11
Q

commen anneau et poseur anneau relier

A

par enzyme

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12
Q

de koi sont composé les anneau coulissant

A

de plusieurs sous-unités
identiques assemblées en forme de « beignet ».

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13
Q

le trou des annaeau coulissan role

A

Le trou central est suffisamment grand pour encercler la double hélice sans y toucher.

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14
Q

l anneau doi etre presen prk

A

ADN pol. se détache encore, mais
son association avec l’anneau
coulissant l’empêche de
s’éloigner.

Aide la pol. à rester concentrée sur
sa tâche actuelle

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15
Q

c est koi ADN polymerase, a koi elle sert

A

Ajoute des
dNTP à l’extrémité 3’-OH d’un brin
déjà formé

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16
Q

selon koi fct l adn poly

A

é selon la complémentarité
des bases azotées

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17
Q

adn poly a besoin de koi

A

Elle a besoin d’une amorce (ARN
ou ADN)

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18
Q

compare l adn polymerase chez les pro et eucary

A

slide 20

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19
Q

la synthese d and par adn polymerase se fai au niveau de

A

du site actif de l adn polym

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20
Q

ke fai le site actif de l adn poly

A

enregistre l’aptitude du
nucléotide entrant à former
une paire A:T ou une paire G:C

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21
Q

kan se fai laction de la polymerase

A

uniquement kan on a une paire de base compatible est formé

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22
si les lien hydro A et T se fon pas car maybe c A ki revien, keski spasse
yora A ki kitte site actif enzyme et pas lien = selectivité cinetique= pas stabilité nucleotide
23
c est koi les deu element inclu pr polymerisation et leur position
e le 3’-OH de l’amorce et le phosphate α du nucléotide triphosphate entrant se retrouvent en position optimale pour que la catalyse ait lieu
24
keskil ya pluss RNTP ou DNTP
DNTP
25
PRK YA MOIN DE rntp
Cette discrimination est due à l’exclusion stérique des rNTPs du site actif de l’ADN polymérase.
26
PRK YA exclusion des RNTP
car sur ribose on a un oxygene supplementaire, donc on discrimine le rntp
27
l ajout des nucleotide demande koi
demande de l energue
28
ki apporte energie pr la polymerase
Chaque nouveau dNTP apporte cette énergie
29
commen l energi es liberer par dntp
 la rupture du lien avec le premier P pour former le lien phosphodiester avec la chaîne naissante  la rupture du lien du pyrophosphate libéré par la pyrophosphatase (Pi + Pi )
30
le total de l energie emit par le dntp permet koi
une réaction fortement favorable et irréversible
31
c est koi la forme de l adn polymerase
e est comme une main droite qui tient l’ADN au niveau de la paume
32
site les 3 domaine de l adn polymerase
-la paume -les doigts -le pouce
33
kel est le plus imp parti de adn polymerase
la paume car c est le site catalytique et permet vérification de l’appariement via le sillon mineur (ralentissement en cas d’erreur)
34
le site catalytique de l adn polymerase est formé de
d’ions métalliques qui favorisent l’interaction entre l’amorce et le nouveau nt et stabilisent le Pi
35
les doigts et pouce de adn poly role
les doigts: plient l’ADN matrice pour exposer un nucléotide à la fois et referment la main en cas du bon appariement dans le site catalytique.  le pouce: aide à maintenir le tout ensemble en s’attachant à la charpente sucre-phosphate. Joue un rôle dans la processivité de l’enzyme.
36
chake fourche de replication a deu brin leskel
un brin d’ADN synthétisé en continu et l’autre brin synthétisé de façon discontinue.
37
prk on di un brin continu
car synthese avance en mem tem ke l ouverture , avance ds le sens de la fourche de replication Brin qui peut être synthétisé en continu par l’ADN polymérase qui avance en même temps et dans la même direction que la fourche de réplication.
38
le brin continu necessite koi
une amorce
39
prk c=on di brin discontinu
brin de queue, tardif, retardé, en retard
40
commen se fai la synthese du brin discontinu
La synthèse du nouveau brin antiparallèle est plus complexe. La polymérase se déplace sur le brin matrice 3' → 5‘, s’éloigne de la fourche de réplication en synthétisant un court fragment d’ADN (fragments d’Okazaki). A
41
au fur et à mesure que l’œil de réplication s’agrandit keski spasse avec le brin discontinu
la synthèse d’un nouveau fragment démarre
42
la synthese du brin discontinu necessite une amorce
fau, plusieur
43
fragment d okazaki c est koi
decouvert par un mec appeler okazaki et c est
44
par koi son maintenu ensemble les ADN polymerase des deux brin
via le complexe de réplication ou réplisome
45
ds kel sens avance le replisome
Le réplisome AVANCE DANS LE SENS DE LA FOURCHE DE RÉPLICATION, malgré le caractère antiparallèle de l’ADN
46
L’interaction des ADN polymérases au réplisome leur permet de ?
travailler dans des sens opposés alors que le complexe entier avance dans une seule direction
47
action de cmb de polymerase chez E coli
Action coordonnée de 2 ou 3 polymérases sur le brin continu et le brin discontinu
48
c est koi l’ADN Pol III holoenzyme
 Liaisons physiques à l’intérieur d’un gros complexe multiprotéique CHEZ E. COLI
49
defini Holoenzyme
terme général décrivant un complexe multiprotéique dans lequel une enzyme « noyau » est associée à des partenaires qui renforcent son activit
50
keski forme l ADN polymerase holoenzyme
L’association de - trois ADN polymérases (ou 2, selon les modèles) -+ leur anneau coulissant à un poseur d’anneau
51
a koi sa ser davoir 2 polymerase ou + ki travail ds le mem sens
sa donne de l efficacité et c rapide, travail coordonné sur les deu brin antiparralele
52
via koi ya la formation de ADN polymerase holoenzyme
complexe de protéines γ (formé lui-même de 2 exemplaires de la protéine τ)
53
le replisome chez le procaryote est fai de koi
L’holoenzyme + les autres protéines essentielles à la machinerie de réplication (avec helicase, toposiomerase..) = réplisome
54
lien du replisome for
fau , par de faible lien ki peuve se dissocier
55
ds brin discontinu grace au li faible keski spasse avec poly
la polymerase se detache du replisome et demeure ds l environnemen du replisome comme sa kan on ve refaire la boucle c rapide
56
kan ya 3 polymerase les troi travaille?
non ya ke 2 et la troiseme est en stand by
57
Le brin discontinu forme
boucle d’ADNsb (recouverte par les SSB).
58
Quand l’ADN polymérase du brin discontinu termine la synthèse du fragment d’Okazaki précédent, keski spasse
elle se détache de sa matrice. Elle reste toutefois toujours associée au réplisome et peut débuter la synthèse d’un nouveau fragment rapidement
59
avantage de replisome
slide 33
60
caracteristic de synthese chez les eucaryote
ya bcp plus de proteine
61
le poseur d anneau chez les eucaryote keski spasse
se dissocie du replisome
62
la synthese de nv brin chez eucaryote et procaryote est la meme, keski change
ke chez eucaryote ya + de proteine
63
comment se fait le retrait des amorces
1) La RNASE H dégrade les hybrides ARN/ADN. Retire tous les nucléotides de l’amorce, excepté le dernier 2) Une EXONUCLÉASE 5’ retire ce dernier nucléotide. 3) L’ADN polymérase comble la brèche. 4) L’ADN LIGASE attache ensemble deux fragments d’ADN en reformant une liaison phosphodiester entre deux nucléotides adjacent
64
keskel possede ADN POL 1
*Chez les procaryotes, l’ADN POL I possède une fonction exonucléase 5’ (permet d’enlever rNt ou dNt situé immédiatement en amont du site de synthèse)
65
L’amorce d’ARN doit être remplacée par
des dNTPs
66
GRACE akoi pe ajouter nucleotide
grace a la breche, trou
67
keski permet de editer les seq d adn
L’activité exonucléase des ADN polymérases
68
L'ajout d’un nt incorrect induit
un ralentissement de la catalyse
69
commen on correct une erreur
La pol. clive le lien et retire ce nt.
70
cmt on reduit le taux derreur final
grace a La réparation de l’ADN postréplicative
71
difference entre exonuclease et endonuclease
Exonucléases : nucléases qui ne peuvent dégrader l’ADN qu’à partir d’une extrémité Endonucléases : nucléases qui peuvent couper l’ADN en cours de chaîne
72
keski spasse avec les nucleosome lors de la synthese du nv brin
Les NUCLÉOSOMES sont partiellement désassemblés lors du passage du réplisome
73
keski spasse avec les histone lors de la synthese d adn
Les histones sont réutilisées et sont distribuées de manière aléatoire entre les deux brins (distributive inheritance)
74
les nucleosome apre la polymerisation font koi
et s’assemblent de nouveau aussitôt qu'une séquence suffisamment longue est polymérisée
75
commen se fai la chromatine lors de la synthese du brin
Les modifications post-traductionnelles sont ensuite reproduites sur les nouveaux nucléosomes et ceci permet de maintenir les différentes informations associées à l'état de la chromatine.
76
commen se fai la dessassemblation des nucleosome et son assemblation
 Maintien de H3-H4 au réplisome.  Recrutement par les anneaux coulissants.  Assemblage complet avec de nouveaux H2A-H2B.  Transfert des marqueurs post-traductionnels sur les histones
77

biomol (3 decks)

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