cour 1 Flashcards

1
Q

ckoi dNTP

A

: désoxyribonucléotides triphosphate.
Monomère

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Q

ckoi ADN monocatenaire

A

simple brin d dadn

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3
Q

par koi est maintenu l adn monocatenaire

A

par des
liaisons phosphodiesters.

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4
Q

L’orientation des
nucléotides dans la chaîne crée koi

A

la polarité du brin.

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5
Q

ckoi ADN bicaténaire

A

: association de deux brins complémentaires via des
liaisons hydrogènes entres les bases
azotés.

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6
Q

double helice stucture..

A

structure tertiaire créée par
l’angle des liaisons chimiques entre les
nucléotides.

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7
Q

a koi ser la structure tertiaire

A

Cette forme minimise
l’exposition des bases au milieu aqueux.

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8
Q

ki contribuent à la stabilité
globale de la double hélice

A

Les forces d’empilement

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9
Q

Les propriétés d’un atome et sa capacité de former des liaisons dépendent

A

de sa dernière couche électronique : les électrons de valence

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10
Q

atome stable=

A

Pour être stable, l’atome cherche à compléter sa dernière couche avec 8 électrons

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11
Q

ckoi la liaison cov

A

C’est le partage d’une ou plusieurs paires
d’électrons de valence par 2 atomes

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12
Q

difference entre liaison cov nn polaire et polaire

A

nn pol: Les électrons se répartissent
également
pol: Les électrons mis en commun sont plus
fortement attirés autour d’un des 2
atomes. La molécule présente ainsi d’un
côté une charge partiellement négative,
celui où se situent plus souvent les
électrons et de l’autre côté une charge
partiellement positive.

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13
Q

liaiosn ionique represente koi

A

Représente la tendance ultime de l’attraction d’un électron décrite dans
la liaison covalente polaire.

L’atome le plus électronégatif attire si fortement les électrons de l’autre atome qu’il en capture un ou plusieurs.

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14
Q

liaison hydrogene sont forte?

A

fau, Liaison 20 fois plus faible que la liaison
covalente. E

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15
Q

kan survienne les liaison d hydrogne

A

Elle survient lorsqu’un atome H
déjà lié par une liaison covalente à un
atome plus électronégatif se voit attirer par
un autre atome électronégatif

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16
Q

liaison hydrog permet koi

A

Permet de brefs contacts entre les
molécules et est mise grandement à profit
dans la chimie de la vie

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17
Q

la liaispn phosphodiester ds l adn role

A

Relie les nucléotides d’un même brin via des liaisons covalentes entre le groupement phosphate (PO4) d’un nucléotide

et les carbones des 2 sucres
voisins (C5’ et C3’).

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18
Q

La fonction ester désigne

A

un groupement caractéristique formé
-d’un atome lié simultanément à un atome
d’oxygène par une double liaison
covalente,

ainsi qu’à un groupement
alcoxyle du type -O-R

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19
Q

role liaison hydrogene ds l adn

A

Relie les nucléotides des
brins complémentaires
via les bases azotées

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20
Q

liaison hydro ds adn necessite koi

A

Nécessite des groupements fonctionnels
donneurs (avec H) et accepteurs

Oblige la formation de couples de nucléotides complémentaires entre
les deux brins d’ADN

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21
Q

cmb de H entre les duo des base azoté

A

Thymine : Adénine = 2 liaisons H
Cytosine : Guanine = 3 liaisons H

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22
Q

compare liaison phospho et liaison hydrogene

A

Liaisons phosphodiesters entre les
nucléotides : polymérisation de la
charpente sucre-phosphate.

Liaisons hydrogènes : formation de la
structure secondaire bicaténaire de
l’ADN

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23
Q

explique 1ere regle de chargaff

A

1ère règle : Peu importe la source, la composition de l’ADN double brin comporte une égalité entre les résidus adénine (A) et les résidus thymine (T), ainsi
qu’entre les résidus guanine (G) et les résidus cytosine (C).
%A = %T et %G = %C.

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24
Q

explike la deuxieme regle de chargaff

A

Le rapport de purines sur pyrimidines est toujours approximativement égal à
1, dans chacun des brins.

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25
% guanine + cytosine reste le mem chez les espece?
no ke ds une mem espece c constant entre les individu
26
La polymérisation d’ADN nécessite (par liaion phospho)
e un apport en nucléotide triphosphate
27
cmt ya un apport en/ke fait le nucléotide triphosphate
Libération d’un pyrophosphate lors de la polymérisation du brin d’ADN. .
28
La réaction d’hydrolyse des groupements phosphates libère
l’énergie nécessaire à la polymérisation
29
prk adn a une charge negatif
La présence d’une charge négative à pH neutre sur le groupement phosphate confère une charge globale négative à l’ADN une fois la molécule polymérisée (en solution, au pH de la cellule).
30
donne les troi autre fct des nucleotide hor de l adn
i. Source d’énergie chimique via la liaison entre les groupements phosphate facilement hydrolysable. Ex. ATP, GTP ii. Association avec différents groupements chimiques pour former des coenzymes. Ex. Coenzyme A (CoA) iii. Molécules de signalisation intracellulaire ou second messager. Ex. AMP cyclique
31
ckoi les 3 caracteristique physic de l adn
Complémentarité des brins  Chaînes antiparallèles  Hélicoïdale
32
Les deux brins vont être associés ensemble via
la complémentarité des bases azotée
33
kel sont les condition pr former des liaison d hydro entre les base azoté
1) il faut avoir un couple compatible a-t=2h c-g=3h 2) les liens H ne se forment que si l’orientation des nucléotides est antiparallèle. A ne peut lier que T (avec 2 liens H) G ne peut lier que C (avec 3 liens H)
34
avoir un couple compatible permet koi
la relication de l adn
35
orientatiom des nucleotide anti parallele permet koi
Oblige la polarité inversée des deux brins d’ADN = chaine antiparallele
36
Étant donné la séquence suivante : 5’ ACCGGTCGTAA 3’ Quelle sera la séquence du brin complémentaire
inverse?
37
Les 2 chaînes dadn sont
hélicoïdales et les bases sont situées vers l’intérieur de la molécule d’ADN
38
info adn loge ou
L’information loge dans le nombre et l’ordre précis de bases.
39
cmt on pe travailler sur gene d adn
Pour pouvoir travailler sur un gène précis, il faut donc avoir accès aux bases
40
commen on a acces au base de l adn
-l faut ouvrir la molécule en détachant les liens H entre les base -ss ouvrir adn Due à la présence de la charpente sucre + phosphate, les protéines ne peuvent entrevoir (et reconnaitre) la séquence qu’à travers les sillions (majeur et mineur)
41
Les sillons majeurs et mineurs sont formés
suite à l’angle entre les 2 liens glycosidiques d’un couple de nucléotides
42
le sillom mineur fourni plus d info ke le sillon majeur
fau, inverse
43
Le sillon mineur permet de distingue
entre les paires A:T (AHA) et C:G (ADA).
44
Le sillon majeur permet de distingue
entre les paires A:T (ADAM), T:A (MADA), C:G (HDAA) et G:C (AADH)
45
donne les trois forme de la double helice
1- Forme A. Hélice à droite. Plus compacte. La torsion des bases provoque une migration plus loin de l’axe central 2-La forme B est la forme classique que l’on retrouve en solution aqueuse (donc les conditions physiologiques) 3-Forme Z. Hélice à gauche. Plus allongée. Charpente sucre + P forme un zigzag. Unité de base en doublet (purinepyrimidine) ex. (CpG) Concentration élevée en ions positifs (ex. Na+) ou dans des régions de l'ADN surenroulées négativement.
46
ckoi la caracteristique commune entre les forme des double helice
la charpente désoxyribose + P est toujours vers l’extérieur et les bases azotées sont toujours vers l’intérieur
47
role des caract physic de l adn
Permettent à l’ADN d’être la base de l’information génétique et de pouvoir être transmise de génération en génération cellulaire
48
par kel phenomem les brin d adn se separe et se reassocie
Les brins de l’ADN peuvent se séparer (dénaturation) et se réassocier (hybridation).
49
ckoi la denaturation
: perte de la structure quaternaire, tertiaire ou secondaire présente dans la forme « native » de la molécule
50
cmt se fai la denaturation
En fournissant de l’énergie sous forme de température ou en modifiant le pH vers une solution plus alcaline, les liaisons hydrogènes seront brisées, sans que les liaisons covalentes le soient. C’est la dénaturation de l’ADN.
51
cmt se fai l hybridation
Lorsque les conditions sont ramenées à la normale, la complémentarité des bases permet aux brins de se réassocier. C’est l’hybridation
52
prk on fai une hybridation
On utilise cette propriété pour détecter la présence d’une séquence spécifique dans un échantillon (hybridation d’une sonde complémentaire à une séquence spécifique
53
La spécificité de l’hybride est régie
par la température d’hybridation : plus la température est élevée (et donc proche de la température de la dénaturation) – plus l’hybride est spécifique
54
Plus la température est élevée
(et donc proche de la température de la dénaturation) – plus l’hybride est spécifique.
55
a tm kesku spasse
À t° élevée (~Tm), peu de liens H résistent. Les fragments hautement similaires (spécifiques) seront plus stables que les fragments moins spécifiques
56
tech hybridation sur filtre
SPÉCIFICITÉ : caractère de similitude entre deux séquences complémentaires. La formation de l’hybride est régie par la température d’hybridation.
57
hybridation in situ utilisé prk
On utilise cette propriété pour détecter la présence d’une séquence ou d’un gène spécifique dans un échantillon (hybridation d’une sonde complémentaire à une séquence spécifique
58
cmt se fai la tech d hybridation in stiu
On fabrique in vitro (en laboratoire) la sonde complémentaire au gène recherché. Par la suite, on hybride cette sonde avec l’ADN de l’échantillon – un résultat positif indique que la séquence d’intérêt est présente
59
check technic
60