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biomol > cour 1 > Flashcards

cour 1 Flashcards

1
Q

ckoi dNTP

A

: désoxyribonucléotides triphosphate.
Monomère

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Q

ckoi ADN monocatenaire

A

simple brin d dadn

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3
Q

par koi est maintenu l adn monocatenaire

A

par des
liaisons phosphodiesters.

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4
Q

L’orientation des
nucléotides dans la chaîne crée koi

A

la polarité du brin.

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5
Q

ckoi ADN bicaténaire

A

: association de deux brins complémentaires via des
liaisons hydrogènes entres les bases
azotés.

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6
Q

double helice stucture..

A

structure tertiaire créée par
l’angle des liaisons chimiques entre les
nucléotides.

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7
Q

a koi ser la structure tertiaire

A

Cette forme minimise
l’exposition des bases au milieu aqueux.

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8
Q

ki contribuent à la stabilité
globale de la double hélice

A

Les forces d’empilement

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9
Q

Les propriétés d’un atome et sa capacité de former des liaisons dépendent

A

de sa dernière couche électronique : les électrons de valence

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10
Q

atome stable=

A

Pour être stable, l’atome cherche à compléter sa dernière couche avec 8 électrons

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11
Q

ckoi la liaison cov

A

C’est le partage d’une ou plusieurs paires
d’électrons de valence par 2 atomes

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12
Q

difference entre liaison cov nn polaire et polaire

A

nn pol: Les électrons se répartissent
également
pol: Les électrons mis en commun sont plus
fortement attirés autour d’un des 2
atomes. La molécule présente ainsi d’un
côté une charge partiellement négative,
celui où se situent plus souvent les
électrons et de l’autre côté une charge
partiellement positive.

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13
Q

liaiosn ionique represente koi

A

Représente la tendance ultime de l’attraction d’un électron décrite dans
la liaison covalente polaire.

L’atome le plus électronégatif attire si fortement les électrons de l’autre atome qu’il en capture un ou plusieurs.

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14
Q

liaison hydrogene sont forte?

A

fau, Liaison 20 fois plus faible que la liaison
covalente. E

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15
Q

kan survienne les liaison d hydrogne

A

Elle survient lorsqu’un atome H
déjà lié par une liaison covalente à un
atome plus électronégatif se voit attirer par
un autre atome électronégatif

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16
Q

liaison hydrog permet koi

A

Permet de brefs contacts entre les
molécules et est mise grandement à profit
dans la chimie de la vie

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17
Q

la liaispn phosphodiester ds l adn role

A

Relie les nucléotides d’un même brin via des liaisons covalentes entre le groupement phosphate (PO4) d’un nucléotide

et les carbones des 2 sucres
voisins (C5’ et C3’).

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18
Q

La fonction ester désigne

A

un groupement caractéristique formé
-d’un atome lié simultanément à un atome
d’oxygène par une double liaison
covalente,

ainsi qu’à un groupement
alcoxyle du type -O-R

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19
Q

role liaison hydrogene ds l adn

A

Relie les nucléotides des
brins complémentaires
via les bases azotées

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20
Q

liaison hydro ds adn necessite koi

A

Nécessite des groupements fonctionnels
donneurs (avec H) et accepteurs

Oblige la formation de couples de nucléotides complémentaires entre
les deux brins d’ADN

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21
Q

cmb de H entre les duo des base azoté

A

Thymine : Adénine = 2 liaisons H
Cytosine : Guanine = 3 liaisons H

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22
Q

compare liaison phospho et liaison hydrogene

A

Liaisons phosphodiesters entre les
nucléotides : polymérisation de la
charpente sucre-phosphate.

Liaisons hydrogènes : formation de la
structure secondaire bicaténaire de
l’ADN

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23
Q

explique 1ere regle de chargaff

A

1ère règle : Peu importe la source, la composition de l’ADN double brin comporte une égalité entre les résidus adénine (A) et les résidus thymine (T), ainsi
qu’entre les résidus guanine (G) et les résidus cytosine (C).
%A = %T et %G = %C.

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24
Q

explike la deuxieme regle de chargaff

A

Le rapport de purines sur pyrimidines est toujours approximativement égal à
1, dans chacun des brins.

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25
Q

% guanine + cytosine reste le mem chez les espece?

A

no ke ds une mem espece c constant entre les individu

26
Q

La polymérisation d’ADN
nécessite (par liaion phospho)

A

e un apport en
nucléotide triphosphate

27
Q

cmt ya un apport en/ke fait le
nucléotide triphosphate

A

Libération d’un pyrophosphate lors
de la polymérisation du brin d’ADN.

.

28
Q

La réaction d’hydrolyse des groupements phosphates libère

A

l’énergie nécessaire à
la polymérisation

29
Q

prk adn a une charge negatif

A

La présence d’une charge négative à pH neutre sur le groupement phosphate
confère une charge globale négative à l’ADN une fois la molécule
polymérisée (en solution, au pH de la cellule).

30
Q

donne les troi autre fct des nucleotide hor de l adn

A

i. Source d’énergie chimique via la liaison entre les groupements phosphate
facilement hydrolysable.
Ex. ATP, GTP

ii. Association avec différents groupements chimiques pour former des coenzymes.
Ex. Coenzyme A (CoA)

iii. Molécules de signalisation intracellulaire ou second messager.
Ex. AMP cyclique

31
Q

ckoi les 3 caracteristique physic de l adn

A

Complémentarité des brins
 Chaînes antiparallèles
 Hélicoïdale

32
Q

Les deux brins vont être associés
ensemble via

A

la complémentarité des bases azotée

33
Q

kel sont les condition pr former des liaison d hydro entre les base azoté

A

1) il faut avoir un couple
compatible
a-t=2h
c-g=3h
2) les liens H ne se forment que
si l’orientation des
nucléotides est antiparallèle.
A ne peut lier que T (avec 2 liens H)
G ne peut lier que C (avec 3 liens H)

34
Q

avoir un couple compatible permet koi

A

la relication de l adn

35
Q

orientatiom des nucleotide anti parallele permet koi

A

Oblige la polarité inversée des
deux brins d’ADN = chaine antiparallele

36
Q

Étant donné la séquence suivante :
5’ ACCGGTCGTAA 3’
Quelle sera la séquence du brin
complémentaire

A

inverse?

37
Q

Les 2 chaînes dadn sont

A

hélicoïdales et les bases sont situées
vers l’intérieur de la molécule d’ADN

38
Q

info adn loge ou

A

L’information loge dans le nombre et l’ordre précis de bases.

39
Q

cmt on pe travailler sur gene d adn

A

Pour pouvoir travailler sur un gène précis, il faut donc avoir accès aux bases

40
Q

commen on a acces au base de l adn

A

-l faut ouvrir la molécule en détachant les liens H entre
les base
-ss ouvrir adn
Due à la présence de la charpente sucre + phosphate, les
protéines ne peuvent entrevoir (et reconnaitre) la
séquence qu’à travers les sillions (majeur et mineur)

41
Q

Les sillons majeurs et mineurs sont formés

A

suite à l’angle entre les 2 liens glycosidiques d’un couple de nucléotides

42
Q

le sillom mineur fourni plus d info ke le sillon majeur

A

fau, inverse

43
Q

Le sillon mineur permet de distingue

A

entre les paires A:T (AHA) et C:G
(ADA).

44
Q

Le sillon majeur permet de distingue

A

entre les paires A:T (ADAM), T:A
(MADA), C:G (HDAA) et G:C (AADH)

45
Q

donne les trois forme de la double helice

A

1- Forme A.
Hélice à droite.
Plus compacte.
La torsion des bases provoque une migration plus loin de l’axe
central
2-La forme B est la forme classique
que l’on retrouve en solution aqueuse (donc les conditions physiologiques)
3-Forme Z.
Hélice à gauche.
Plus allongée.
Charpente sucre + P forme un
zigzag. Unité de base en
doublet (purinepyrimidine)
ex. (CpG)
Concentration élevée en
ions positifs (ex. Na+) ou
dans des régions de l’ADN
surenroulées négativement.

46
Q

ckoi la caracteristique commune entre les forme des double helice

A

la charpente désoxyribose + P est toujours vers l’extérieur et les bases azotées sont toujours vers l’intérieur

47
Q

role des caract physic de l adn

A

Permettent à l’ADN d’être la
base de l’information
génétique et de pouvoir être
transmise de génération en
génération cellulaire

48
Q

par kel phenomem les brin d adn se separe et se reassocie

A

Les brins de l’ADN peuvent se séparer (dénaturation) et se réassocier
(hybridation).

49
Q

ckoi la denaturation

A

: perte de la structure quaternaire, tertiaire ou secondaire
présente dans la forme « native » de la molécule

50
Q

cmt se fai la denaturation

A

En fournissant de l’énergie sous forme
de température ou en modifiant le pH
vers une solution plus alcaline, les
liaisons hydrogènes seront brisées,
sans que les liaisons covalentes le
soient. C’est la dénaturation de
l’ADN.

51
Q

cmt se fai l hybridation

A

Lorsque les conditions sont ramenées
à la normale, la complémentarité des
bases permet aux brins de se
réassocier. C’est l’hybridation

52
Q

prk on fai une hybridation

A

On utilise cette propriété pour
détecter la présence d’une
séquence spécifique dans
un échantillon (hybridation
d’une sonde complémentaire à
une séquence spécifique

53
Q

La spécificité de l’hybride est régie

A

par la température d’hybridation :
plus la température est élevée (et
donc proche de la température de la
dénaturation) – plus l’hybride est
spécifique

54
Q

Plus la température est élevée

A

(et donc proche de la température de la dénaturation)
– plus l’hybride est spécifique.

55
Q

a tm kesku spasse

A

À t° élevée (~Tm), peu de
liens H résistent. Les
fragments hautement
similaires (spécifiques)
seront plus stables que les
fragments moins spécifiques

56
Q

tech hybridation sur filtre

A

SPÉCIFICITÉ : caractère de similitude
entre deux séquences complémentaires.
La formation de l’hybride est régie par la
température d’hybridation.

57
Q

hybridation in situ utilisé prk

A

On utilise cette propriété pour détecter la présence d’une séquence ou
d’un gène spécifique dans un échantillon (hybridation d’une sonde
complémentaire à une séquence spécifique

58
Q

cmt se fai la tech d hybridation in stiu

A

On fabrique in vitro (en laboratoire)
la sonde complémentaire au gène
recherché. Par la suite, on hybride
cette sonde avec l’ADN de
l’échantillon – un résultat positif
indique que la séquence d’intérêt
est présente

59
Q

check technic

A
60
Q
A

biomol (3 decks)

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